Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19953 LG5 15687965 15690448 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 15688271 missense_variant p.Pro103Thr
T/C 15688378 intron_variant
T/A 15688473 stop_gained p.Leu130*
G/T 15688484 missense_variant p.Val134Leu
T/A 15689344 intron_variant
T/A 15689758 intron_variant
A/T 15689760 intron_variant
T/C 15689811 intron_variant
T/A 15689816 intron_variant
T/C 15689817 intron_variant
A/G 15689824 intron_variant
G/T 15690001 missense_variant p.Gly215Trp
A/C 15690047 stop_lost p.Ter230Serext*?
G/C 15690051 missense_variant p.Trp231Cys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19953.1
MDWDGKEFAWDPRGLELANGEGQRNEAASVDLGLGEEKSLPDVAKDPRDSKTVSSPSGSSKRSRLQNGSQNMCCSVDGCTSDLSDCREYHRRHRVCEKHSKTPVVLVGGKQQRFCQQCSRFHSLGEFDEVKRSCRKRLDGHNRRRRKPQPPSLFMAAEKFMYNYKGPRILHFGSPETYVNPIMRSMWSATAKTGAESGYDPPRLLYRIDKHKQDKGHPLWQENDPIVSNANGAILGAPICQPIHGTITPSTGGKSSRKHSSDAKPGSFDSGCALYLLSTLQSQSPESSMVQSSITCPMQSPSGSVHFDTVNEYAYSETEKDKPSGQVLVLDNTTNLHYNGMLQMGLDGLVENDDPLTLPFLWE*


CDS Sequence:
>Vu_19953.1
ATGGATTGGGACGGGAAAGAGTTTGCCTGGGATCCACGTGGGCTGGAGCTGGCTAATGGTGAAGGACAGAGGAATGAAGCTGCTTCAGTGGATTTGGGGCTTGGTGAGGAAAAATCACTCCCTGATGTTGCTAAGGACCCTAGAGACTCAAAAACTGTGTCTTCACCATCTGGGTCATCAAAAAGATCCCGCCTTCAGAATGGATCACAGAATATGTGTTGTTCTGTTGATGGATGCACCTCTGACCTCAGTGATTGCAGAGAGTATCATAGGCGCCATAGGGTCTGTGAAAAGCACTCCAAGACCCCAGTTGTGTTGGTGGGGGGCAAACAACAACGGTTCTGCCAGCAATGCAGCAGGTTTCACTCACTTGGGGAGTTTGATGAGGTTAAGAGGAGTTGTAGGAAAAGGCTTGATGGGCATAACAGGCGCAGGAGGAAACCTCAGCCTCCCTCTCTTTTCATGGCTGCTGAGAAATTCATGTACAATTACAAAGGACCTAGAATCCTGCATTTTGGAAGCCCGGAGACATATGTCAACCCTATTATGAGGAGTATGTGGTCTGCCACTGCAAAAACTGGAGCTGAATCTGGTTATGATCCACCTCGACTGTTATACAGAATTGACAAGCACAAGCAAGACAAGGGACATCCTCTGTGGCAAGAAAATGACCCTATTGTAAGCAATGCTAATGGAGCAATACTTGGAGCTCCCATTTGTCAGCCTATTCATGGCACCATCACCCCATCAACCGGTGGAAAGAGCAGCCGAAAGCACTCTTCAGATGCAAAACCTGGATCCTTTGACTCAGGTTGTGCTCTCTATCTTCTGTCAACACTTCAATCACAAAGTCCAGAGTCGAGTATGGTACAATCTAGCATCACATGTCCAATGCAATCTCCATCAGGATCTGTGCATTTTGATACTGTCAATGAATATGCATACTCAGAAACGGAAAAAGATAAGCCTAGTGGTCAAGTATTGGTTCTTGATAACACAACCAACCTTCATTACAATGGAATGCTGCAAATGGGGTTAGATGGTTTGGTTGAAAATGACGACCCACTTACACTTCCCTTCTTGTGGGAGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_19953::LG5:15685965-15687965(+)
ATCAATAATAATTCGTCATCTTAAACCAGCACCAAAACCAAAAGTTATACCAATTAACCAATCCCTAAAGTGTGGAGAATATGCACTAATCATTTCTAATGAACTAAAACATTGTTGTTTTTTTCACCTACGCTTCATCCCTTGGAAAAAATAACCTGAGCCTGTTCAAGTCCAATTCTACCCACAAAAACCAAAACCAACAACTCAACTCCCAATTCTATGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTGTCATTCTTACTTTTTCATTTGTTACTATTGCTTATTATCTGGAAAGTTGCATGTACAGTCCAAAGTTGCAGTCACTTTCTCCACCTTACTGTATTTCCATTTGCCCACAACCATTATTCATTCTAGATACATTATTTTTAGGAGTGTTAACTCATCGTGTCATCATCAATTAAAATTTAGAAAGTTTTAAAACCAGAACAAGAACCTTATTTAATTAAAAGTGAAATCCATCATCTGTATGTTTTCTAATAAATCATAATTAATAATAAATCGAAAGCACCATACAAAAGGGTGTTATTATATTGCAAATAAAGAACAAAAAGAAATAGACATGTGATTTTGTTTTTGACATATGGTATATTTGAAGTTTTACTTGTAACTTTAGGATGAGACAAATATGAAGTATTTTATAACTTGGGGTTCATTCCTTCTTCTAGATTTTGTTAATAAGGTTTATTACTATTATTGTTACCTTGAAAGGTTTATTTAATATATTGGGAGGCCTATTTTGAAAATTTTTCATTAGGTCCTTAAACTAATGTTTTAATTATTTCTCAAATTTTTACGATGTTTTATGATTAGATCTGCTAGTGAATTCGCCTTAAATTTTTATTTTCTGACAATTTAAACCACTATAAACTAATTTCAAAAACGCAATTATAAAAATTTTACAAAATCAAATAAATGGTTGCAATTTTTTAATTTAAAGACCTCGTTAAATTATTCAAAATATTCGAGATTTAAGGATGAATTAAACCAAACTTTAACTAATATGTGAGTTAAATTCGTTTATAAGTGTCAAATTTCTATAAATAAAGAAGTAAAGTTTTTTTATCGTTACTTTAACGAAGAATGACCTAAAAAAGAAAGTCAAAAATGAAAGACCAGTGAAACTTACAGGTAAGAAAACAACAGGAAAACAAAGGGAAAGAAAAAGAACAGTGTTTTGCATAATTTTTTGTTGAGTAAAGGTAATTCCTTCCAATTGATCCAGATTGTGTCCCCTACTCCACATCTAGAGCTCATTGAATTGGAGTTGGTGAGCCACTTTTTCACTCCAAGTTTTTTCTCTTCTCAGAGACAAAAACACGACATGTGTCTTGCACCTTCTGTGCCCATTTTCTTGGAGGCCTATCTGCAGCTTTGAGAATTTAAGGGGTTTAAGATTTGCATAACTATGTGAGTTTGGTGAAGTTTCTCTCTGCGTTTATTTTTAAATGTGAAAGCTTTGTGTGTTATTTTTATATTCTCTCACAGAAAACAACAAAAGTCCTTGAATTGACATTAATTTCTTTTCAACCCCTTTGAGGGTCAAGTTGCATTTGAGGTTGAGGTGACGTTCATGTCTATAGTCTTTCAGAATATCTTCCAATATCCATCTCTTTTTATTTTTTCTTTCAATTTTTTGCAATCTTTTCAGTTAATGCATTGATTCTTTTGGCTTCCTCTGGGAACCCAATTCTGATTTCCATCTTGGTGTCGTTGATTGACCCATTTATCCTGCTTTGGTTCCTAAGTCAAAGTCTTCTTCAGCTTGTGGTGATAACACAAGGGGATTCAAGTTCTGATTCCTGTGTGAGTGAGTGCCTTACAGGTTTGGCTTTGGCATCTTAAAAGGGACATAAAGCATCATAGTTTGTGGGAGCAACTAACTGTTGGTTA


Gene Sequence:
>Vu_19953(+)
ATGGATTGGGACGGGAAAGAGTTTGCCTGGGATCCACGTGGGCTGGAGCTGGCTAATGGTGAAGGACAGAGGAATGAAGCTGCTTCAGTGGATTTGGGGCTTGGTGAGGAAAAATCACTCCCTGATGTTGCTAAGGACCCTAGAGACTCAAAAACTGTGTCTTCACCATCTGGGTCATCAAAAAGATCCCGCCTTCAGAATGGATCACAGAATATGTGTTGTTCTGTTGATGGATGCACCTCTGACCTCAGTGATTGCAGAGAGTATCATAGGCGCCATAGGGTCTGTGAAAAGCACTCCAAGACCCCAGTTGTGTTGGTGGGGGGCAAACAACAACGGTTCTGCCAGCAATGCAGCAGGTATGGTTCGGAGTTTGGTTATGTGGGAGTTGGAGATTTAGGGATTGGAATTTGTCCCCTTCTGTCGTTTGGTTTGATGTGTTTTGTAACATGGGGTGTTGCTAATTGTTGTTGTGTAGGTTTCACTCACTTGGGGAGTTTGATGAGGTTAAGAGGAGTTGTAGGAAAAGGCTTGATGGGCATAACAGGCGCAGGAGGAAACCTCAGCCTCCCTCTCTTTTCATGGCTGCTGAGAAATTCATGTACAATTACAAAGGTTTGTGCCAATATGGCCTTATCTATATCATTGTCAAATTGATCTCAGTTGTGTGATTGAATTGGAGTAAGTGTAAAAGGATAAGCCCCCAATTGAAAAGAAACAACAAAACCCTCCTGCCACCAAACTATAACCCTTTAGTTTTAAGCTGCTTAGTGCTGTGAACCTTTGTGAAAATGGAATTAGAACATTGCTTAAGGTTATTTTACTCTGAATTAGATTATTCTAAGCCAATACTATTTGGATGTTGTCATGATAAAGCTAAGTTATTATCAATCTTTGACTTTTACTAGAAACTTAGTGTTGGAACATGACATTTAGATCATACATGGTTCCCATGGAGTTCAATTGTTCGTTAAGTTTGTTGGTGGAAAAAAAAGAAGTAGAAGAGGATTTCTATTTCTTGAAACTCTTATGAGAGCAGAGACCTTTGCTTATGCTATAGTTACCTGTAGGCTGTCGGTCTATTTCGTATATTGACATATTCAATGTTTTGAGCTATACTTTGAAAACTAAATGCAATGTGCATAACATTTCATAAAACAATAAGTCACTCCTAATTCCGTTGTCATGAATACATAACCCTTTTATTTTTAATTAAAGAAAAGAAAAGGCCTCAAAAGCATTATTTAAGGAATTACAAGTAGAAATGTATAATGAGAAATTGTAATATTTAATGTTATAAAGCAAGTAGGAGGATTAGCAGAAGAATATTGTAGGAAGATATAGAATTGAACAAAGCTAAGGTTTGAAGTTGGAACCTATGACTTCATGCAAATTACCTAAACTTGCTAGGCCAACCCAAGCGAGTTACCAAAAGTGCCTATATAAATGCATTTAAATTTTGTCCTTCAGAATTATTCGTCTTAGTTAGTGCATTGTGAGTACTTCTTAAGGAGACACTTAGTTAAGTTAAAAAAAGTGTTATTCTCCTCCTGTCTTGGAAAGAAATTATTAAATGAAAATGTAAATGGATTCATTTTGGAAGTATAAGACCAAGTCAATATTTACCATACAGTGGAAGGGAAGTAGAAGGATATAAACTTAAATCACTGGTTTTAGACTGATATTACAGATACAAAAGTGAAAATCATCTATTACATCTGAAATACAGAATTCATTTACTTCCTTTCTTTGATATTAACAAAACTTGTTAACCTATTCTTAACAGTTTCATGTCATTTTTTTCATTAACAACAGTTACTTGTCATTATTTCCCATCTTCCACTAGTGTAATTAATGTGAACTTTTGCACTGCCTTTCTGCAACTTAGGACCTAGAATCCTGCATTTTGGAAGCCCGGAGACATATGTCAACCCTATTATGAGGAGTATGTGGTCTGCCACTGCAAAAACTGGAGCTGAATCTGGTTATGATCCACCTCGACTGTTATACAGAATTGACAAGCACAAGCAAGACAAGGGACATCCTCTGTGGCAAGAAAATGACCCTATTGTAAGCAATGCTAATGGAGCAATACTTGGAGCTCCCATTTGTCAGCCTATTCATGGCACCATCACCCCATCAACCGGTGGAAAGAGCAGCCGAAAGCACTCTTCAGATGCAAAACCTGGATCCTTTGACTCAGGTTGTGCTCTCTATCTTCTGTCAACACTTCAATCACAAAGTCCAGAGTCGAGTATGGTACAATCTAGCATCACATGTCCAATGCAATCTCCATCAGGATCTGTGCATTTTGATACTGTCAATGAATATGCATACTCAGAAACGGAAAAAGATAAGCCTAGTGGTCAAGTATTGGTTCTTGATAACACAACCAACCTTCATTACAATGGAATGCTGCAAATGGGGTTAGATGGTTTGGTTGAAAATGACGACCCACTTACACTTCCCTTCTTGTGGGAGTAG