Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19925 LG5 15135166 15138693 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase CDL1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 15135382 intron_variant
A/G 15135391 intron_variant
G/T 15135594 intron_variant
C/A 15135617 intron_variant
C/T 15136143 intron_variant
A/T 15136190 intron_variant
T/A 15136243 intron_variant
G/A 15136312 intron_variant
A/T 15136835 synonymous_variant p.Ala101Ala
A/G 15137031 intron_variant
G/T 15137032 intron_variant
T/A 15137158 intron_variant
A/C 15137959 intron_variant
A/T 15138262 intron_variant
G/T 15138517 missense_variant p.Val362Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19925.1
MGSSCPCFGPRKKGKEKSDKGRDELNKNCKSVKNTNDVSESSSGNGPEENPVQEGENSHKARIFTFRELATATKSFRDETFIGQGGFGIVYKGIIGENQVVAVKRLDTTGVQGEKEFLVEVLMLSLLRHPNLVNMIGYCAEGDQRLLVYEYMALGSLESHLHDVSPDEEPLDWNTRMIIACGSAKGLHYLHDEAKPSVIYRDLKASNILLDEDFHPKLSDFGLAKFGPTGDQSYVATRVMGTQGYCAPEYATSGKLTKRSDIYSFGVVLLELITGRKAYDDKHGPEKLLVDWARPMLRDKRSFQRLVDPRLQGKYPGSCLPMVIELTAMCLREEPRQRPNAGDIVAALEFLSSKQYSPKVSNTVNNTTEMESGESPNETTAILPKESVRERAVAEAKLWGETWRQRRQSEQNSPKEPHIEL*


CDS Sequence:
>Vu_19925.1
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Promoter Sequence:
>Vu_19925::LG5:15133166-15135166(+)
GCACTGCTCCAAAATAATACATCTTATATATAGGTTATTTATATGTAGAATGTCCATTTTGAGTGAGTGATAAAGAAATGAATTTATATTTTATGTTTTTATTCTATTAATTTATTTTCTCTTCTTGGGTAGACATCACAAGCCCATAAATCCAAATCCCTAACTCAGCAAGAAATTTACAGAGCTAAATCTTAATACAAAAACAAAAATCACAAGGAAATTTTTTATTACTTCAATGTAAAGTGGCGTGAGGATGAATTAAAGCAAAGAAAACTATATCTGAATTGGAATCCTAAGACAAAAAGATATAAAATTTAAGACTTTTCTTTACTAATTATAATAATTGTTTTGAATTTTATTTTTCTTTTCATAAGATTTTTTTCCCAAATTTTTATTGCGTTAATTGTTTTTCTACATAAGAAATATCATTGTTTTAATTAAATAAATTCTATGAAGTATATTTTTCTATTTTATGAAGATTGAAAGATTTAAGATTTAGTTTAAAAATTAAAATTTTATTGTTATTATTCTTCTTCCAAATATTAATTATTAACGTTTAGAAAAATATTACAGTATCATCAAATGGTAAATTTTCATTGATGTTATTTTTAAGTTAATTATTATGAAAACCTTTTCATTTGATTTTTTTTTCATTTTATAAAATATCTAATAATTTTATAATAATTAAGAATTTTTTAATCCGATCTAAATTATACCACAAATATTTATTTTATTTATTTATTTATTTAAAATTAAATTAAACTAATAGAAATTATATTTTATGTTTATCACAAAATTATATTTTTTTTCTGTCTATCAAAGAATTTATTATATTAAGTATATTTTTCTCCTCAAATATAAAACTCACCACATCTCATATAAACTAGTCAAATATTGCACGTTCAACCCAATCAATTAACTTATAATTTATAATATATTCATCAATTATATTTCATATTTTCAGTTTCAAAAACAGCATCTTTTTACAAATAAACATATTTATTATAAATATGTATATTTATAATTGATTGATGAATGTAAGCTTAACCCAACACATTTATTTTATACAAATTTGAATGATATTAACTAAATCAACTTTTTACATAGTATTTCAATATGTAGTTTTTGTCCACGTACAATTTTAACAGCATATTATTTGGGTATTCTAAGTTTACAAAATTAAACACTTTTAGTTCAAACTTAACATATGTCTCTCCTTAATAAATTTATTAATTTTGTTGTCATAAAAATTATTAAAATTTATAATTAAACATTATTATTATTATCATAGCTACTTTATATGTAAAATAATGTTTGAAATGGAAAAACATATTAATTTTAGAGAATTGATAAAATTACATATTTTTAGTGTAGCTTGAGCTGACTAAAGAAAACATGCATGACCCACCCAGCAACCTTAAATTGAGCACCCAATTGCAAGAGCATGAGAGACAAATGTGGCATATAGCAGGGAGAACAGGTTTTGAGAGAAAGTACACGTAAGTCAGAAACTCAATAGACATGCATGTCATTGTACAAACAAACTCTTCTCTTACCCTACACACAATTTCCTTCTAAGGAAACAAATAAATATTTAATATCATTACTGGAATTAATTAAAATCTATGTGCAATTCAACCAGTTATTTTTATTTTTCCATTTATATTAAACTACCATTCTCATTTTGTGAATTCTTTTCCTTTTTCACCAAGAAACCACACCAGCACACTTAGCATGGTTGCTGCAACGTGTGTGTGATGCCAGAGTGGGGCAGATTCCGTTGAGATCCGTGTGAGCACGCATTCGTTTTTCGCCGTCGTTCTTTTCTAAACAAGAATATTCTTCTTTTGTGATGTTCTGGGAATTGAACTGAATTTCAATAAAACCCCTCTGTTTGTTTGGTTTTCTCTTTCTTCTCTGTCTCCGTGCCTACTGTTTCATGTGACTGGGGACACTAAAAAGCAAAAAATTTGCATTTTGGCTTAGAATTCTCTGATAGA


Gene Sequence:
>Vu_19925(+)
ATGGGTAGTAGCTGTCCTTGTTTCGGGCCGAGGAAGAAGGGCAAAGAGAAGAGTGACAAGGGACGGGACGAGCTAAACAAGAATTGCAAATCTGTAAAGAACACCAATGATGTCTCTGAAAGTTCTTCAGGTTATCTTTTTTTCCAAAGATTCAATCTTTCAAAAAGAATTCTTTAATTTTTTGCCAATTTTTTTTAATGGGTTTGGGTTTTAAGTCACCATAGGAGACAAATTGGTTTTTAGGTGATGTCTCTTGTGATTATTGCTTATAGTTCTCATCTCATTTGATTCTTATCTTAGGGTGAAAGAAAAAAGGTCTTGGATGAATGTTGTCTTCTTGGAGTATTTCTTATTTGAAAATTGAAGTTCTGATTATGTACACTGCATAAAGCTTAGTACCTTATTCCCAAAATCAATTAAAAAACTAAGGGGGCTGTTCAAATTTCATACCCCCGCCTAAATGCCTTTTTCTGAGTTGCTACTGTGTTGTTTTTCACTCTAGTCTTGGAGAAGCAAAAGCATGCATGTTAAATTCTGGAAGAAATTTTTATGTGGAAATTTTGTGAATTGATTGTCACTAGCCTGAGAGTGTTTGCTTCATGTGGAAATGCGTTCTTTCAACCTGGTCTGCACAATTGAGTGGTCTCATTTCTGTATCAAAAGAATATCACATCAGCCTCTGTTGCATAGAACCTCCTGCACACTTTGAAATCAATTTAGTAGAATACCACAGTTGTTGGCTACAAATTCTGCTAGGAAAATAAATCATCTCCCTCCTTTTTATATAGGCAACTTAGAAAATCACTATGGTCTAACCAAAGGAATGGTCCTTTTTTATGAATTCATTGAGGTGGCCGCCCTGTTTTCACAGGAACTGATTATAGATAGTTTTTCGTGGTAATTGAACACATACTGATTATCAGAATTTCCTTCATTCTCTTCTAATAACTCCTTTCCCAAGAGGGGAGATAGATGTCCTGAGTTTTTCTTGGCTTAGTTTGATTTTGTTTAGCAATTCTTTGACATGATAATTTTACAAAGATTATCACTTGTTTATAAGCTGCTGAAGGAAAGCTCTGTCGATTAATTGAGTAGTTATTTTTTAAGAGAAAATTTTATATCTTCTATGCATCTCTTTAGAAAAAAGTATATAGAGATTTTCACTTTTACAAGTTAATATTATACTCGTCACCTAGATATGTAGGCACATATATAGTTAGTCCAGATTACTCAATAGGAACTTGTGTATTTTGGAGTGTCTAAGTTTCACATTGAGCATTATGCTTGTGTAAAAAACGTTGTTATAGTATTAAAAGCGAGATCTCTATTGTTTTTTGCTTTGCTTGTATACTCTACTGATCATAACTTGGTTTGATACAGGGAATGGACCAGAAGAAAACCCAGTACAGGAGGGCGAAAATTCTCATAAGGCCCGGATATTTACCTTCCGAGAGCTTGCAACAGCAACAAAAAGTTTTAGAGATGAAACCTTTATTGGGCAAGGAGGATTTGGCATTGTTTACAAGGGAATAATTGGGGAAAATCAGGTATAACTTGATGGATAGATTTTCTGTGTGCCTGTTTCTTCATTTACAATACCCATCAGTATGCTACATTGCTGTGAAATATAGTTCTTTTAACAAGCTACGGGATTTGATCAGGTTGTAGCAGTTAAAAGACTTGATACTACAGGAGTGCAAGGGGAGAAAGAATTTCTGGTGGAAGTTCTCATGCTTTCCCTTCTACGCCATCCCAACCTTGTTAATATGATTGGTTACTGTGCAGAAGGGGATCAACGTCTTCTTGTGTATGAGTACATGGCTTTGGGATCCCTAGAATCTCATCTTCATGGTATAATACTATAAAGCAACCTTTTTCTTCAATGCCAAATTGTAATCAGTTACCAGTTACTCCATGTATCTTTTTCCTGCCTTCTTTTCTGCCCATGAGTTGGAGGAAATTATGAAAAGCCTTATAGTTTATTCCTATCTGTGGGGATTGTACATGATTTACTGAGCTGAAGAGGGGTGCTACTAATTAGTTCAATAAGGCCATGTTTAGTATCACATGTTAATGCTTTATAGCTTAAAGTAACTACTGCTGTATCTTCTCTGTTCTTGACGTGCGTCTTTATTCACCAAAAGTACATTTAGATCTTTGTATCTTTAATATTTGTTTATGGTTATTTGCAGATGTTTCTCCTGATGAAGAGCCACTTGATTGGAATACCAGAATGATTATAGCTTGTGGATCAGCAAAAGGGCTACATTATCTCCACGATGAAGCAAAGCCTTCAGTTATATACAGGGATCTTAAAGCATCCAATATACTATTGGATGAAGATTTCCATCCAAAACTTTCTGATTTCGGGCTTGCAAAATTTGGTCCAACCGGAGATCAATCATATGTTGCCACAAGGGTCATGGGGACACAAGGTTACTGTGCCCCTGAATATGCCACCAGTGGAAAATTAACGAAGAGATCTGACATATACAGTTTTGGGGTTGTGTTATTGGAACTAATTACTGGACGCAAAGCATATGATGATAAGCATGGCCCTGAAAAGCTTCTAGTAGACTGGGTAAATTCCTATATTGATTGTATTTTGTTTCATTTCTTGCCAATGATGAATAACACAAAACGTTACTTTCTCCTTTTTCTCTCAGTTGAATCATATACATCAGATTAATTAACATTTTGGATTTGCTCTGTTTGCATTTCCTTGGCAGTCTCAGCGGAATGCTATCATCACTCTTGGTTTTTCCAAGTTTTCATTGTGTACTTGAAATAGGAAGAAGCTGAGTTATAAATCAGCTCTTGTTAATCAATGAATGTGGTGTGGTCTTCTAATGTTGAAAAGAGGAATATAATGATACCTTATAATTTGAACTTAAATTCCAGTTTGGTACATGGTTTCTGGAGAACGTCATTGCATTGCTTGTGATCTAACCCTTCTCTCAGAATATTACGTGATTTTTCTACTTTATCCAAAATGGCTAAATGCCATCCAATGTCTTAATTTTGAGAACTTTATCATTGTTTAAGGAACCACAATTTGAGAAAACATAATGGTTTCAGTTGACCATGAGAGAACATAAGACTTACACAGTGAAGGTTGTTTTTTCCTAACATATGTAGGCACGTCCAATGCTGAGAGACAAAAGAAGTTTCCAAAGATTGGTAGATCCACGGCTTCAAGGGAAGTACCCAGGATCATGTCTACCGATGGTGATTGAATTGACAGCCATGTGTCTTCGTGAAGAGCCACGTCAACGGCCTAATGCAGGAGATATAGTGGCAGCTCTGGAATTCTTGTCATCCAAGCAATATTCCCCAAAAGTGTCGAACACAGTCAACAACACAACTGAGATGGAGAGTGGAGAGTCCCCAAATGAAACAACAGCCATTTTGCCAAAAGAATCAGTGAGAGAGCGAGCTGTTGCAGAAGCCAAGCTGTGGGGGGAGACATGGAGGCAGAGACGACAAAGTGAGCAAAACAGTCCTAAGGAACCCCACATAGAGTTGTGA