Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_19882	LG5	14534742	14537288	hypothetical protein LR48	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
T/A	14535165	synonymous_variant	p.Val343Val
T/A	14535465	intron_variant

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19882.1

MLQQQPQQPQPQPPQLDSYFNFNINSAIPIPFVPTMESFPPLDPFSPSLSSSPFFNNSNNTSMPFDPGFDLGLDNGLHSSCPPLFSQVQPGFEFGELEALTAAPGHVPFMEGPKGENPLERVQPTLYRKRRGTAEIPGLETVRRKGRKWEEGEAEEGSSADVDGSGLNYESDENDNGNNGLKRSENGEDHKGKRKGLPAKNLMAERRRRKKLNDRLYMLRSVVPKISKMDRASILGDAIDYLKELLQRINDLHNELETTSAGSSLLPSASTSFQPLTPTLPTLPCRVKEELYPGTLPSPKNQPAKVEVRAREGRAVNIHMFCTRRPGLLLSTMRALDNLGLDVQQAVISCFNGFALDVFKAEQCREGQDVLPEQIKAVLLDSAGFHGMM*

CDS Sequence:
>Vu_19882.1

Promoter Sequence:
>Vu_19882::LG5:14537288-14539288(-)

CATTCTTATTTCTAATTGTGGGATTTACCTCTTTTACTAATTTTCTTAATATATAAATATTTAATTGACTGATAAATATTGTTAAATATATTATTTTTAGTTAATTTATTATTATTTTTTATTTATATTTTAGGTTTAATTTATATTTTTTCAATTATAAATAAAAAAGCTAAGTATTTAACTTCATATATAATTTCTCATAATATATATTTAGTATAAAAGATGATTAACTTCATATATAATTTTTCATAATATATATTCAGTATAAAGGATGATTAACTTAATACATAATTTTTCATAATATTTAACTAACATAATATTTAATTAATTGATTGGACTGTTTATTTAGAATTATTGAAAATTTAAAAGCAATGCAAGTGTTTAAAGAAAAACTTACATAGGTATTAAAAGTTATTGATTAAAATTAAGATAACAAAAAATTTAACGATTAATTATAGATTGTTTAAGTATTCAGCTAACCTACAAATTTGACCATATTTAATTTTACCAGAAAAATATTGATTTAGATTTAAGATATTGTGGATCTGAATTCGACCTGACTGGCTGCTTATATTAAAGATGTTTAACTAGAGTAATGAGTTTTTGATTTTGAATTCCCAAAGTACATGTTCAAAACAATTTTTTTCTAAACTTTATTAGCTTGATCAAAACTAACTCATTATTGATTTAGTTTATTTGATTAAACTTTAATAGATCAAATTCAAAACTCCACTGGTATTTAAATCGGGTTGGATAGAAAAATTAATTAAATTCAAGACCGTTAATTAATTAATTTAAATATAATTTTAGGCAACGATCCTTCTTTTTTATATGTATAATAAATACTCTGTCCATTTTAAACCAATGATACGATTTTAGGATTTTTTTTATACAAATTAAGAAATATTTAACTTGTATAAATTATCCACTCTTGTCGTTTATATTTTTCTATGCATTCCAACTAATTTATTTATATTCATATAAACATTTTTTATATTAGTTTTTACTAAAAAAAATAAAATTTAGTTGCAATCTAAATACCTTGTAAAACTCGAAATAATTAATATATGTAAAAATACATACAACCATAAATTTTTCTGTAAAGTTAAAATATCAAATTTAGGATTGAGGAAGAAGGAAGTACACAGTGATTGGACATTATAAGTATTTATTACAGATTATAATAAATTTAATGTATATGAAAGTTTATTTCAAAGAGAAATGCTTTAACCATATTAGATGAATACAAAAATAGTGAGAAAACAACAAAAGTGAATAACGGTAGTAGTACATTGAGAAGGGTAACTTCTAGAAAACGTAGGCCTTTTGTTTTTATTTGTAATATACAAATGGCAATATATATGTAGATTTTGATATTATAATTTTCTACTTTAAATATAAATATTATTATAAAAAGTTGAAAGAAATGAGATTTTGTAAAGTAGTGATAAACGAAATTAAAAGTTAAGAGAGTATAGAAAAGGACAGAATCAAAGGTTTTAGCTGCAAATGTTGTTACAGGAAAGAAGATTGTTTGGTGTAGCAATAATCATGAAACTTTAACAGAACACAGTTACCACTTCCTTCCTTAGGAACTTTACCATAACAGAAGGCACACATCACACTCTGATGCGATAACAAGAGTTAAAGCAGAGAGTTTAAGTTTTGTCCAAATAAAAAAATCACGACACACACTCTCACACACATGGATAAACCACACCCTTTCAACCGTTTCCCACTCCATTCATTTTCTCACCACAACAGACAAATATAAATTTCATTCGCTCACACACACTCACACACAACATAACCATTCTCACTCACTTTCCCACCTTCTTCTCCGTTCTCTCATCATCATCATCATCATCATCATGATGGAGGGCTATTCTCTTCCACCACCGCCCGGTGAAGAGGACGCGCCACCACCGTCATGGGGTAGGCCCAATTCACAGGAAGAGGACATTGCCATTGCCTTGGGTGCCCCTCTTTCCTTTAAATCC

Gene Sequence:

>Vu_19882(-)

ATGCTTCAACAACAGCCTCAACAACCACAACCACAGCCACCACAACTTGACTCTTACTTCAACTTCAACATCAACTCTGCTATTCCCATTCCCTTTGTTCCTACTATGGAATCTTTTCCCCCTCTGGACCCCTTCTCACCTTCACTTTCATCGTCTCCTTTTTTCAACAACAGCAACAACACCAGCATGCCCTTTGACCCGGGCTTTGACTTGGGCCTCGACAACGGGCTTCACTCTTCGTGCCCCCCTCTTTTCTCCCAGGTTCAGCCGGGCTTCGAGTTTGGAGAACTGGAAGCTCTTACTGCTGCACCTGGGCATGTGCCCTTTATGGAGGGACCGAAGGGGGAGAATCCTCTTGAGAGGGTGCAGCCGACCCTTTACAGGAAGAGGAGGGGAACGGCGGAGATTCCGGGGCTGGAGACGGTGAGGAGGAAGGGGAGGAAGTGGGAGGAGGGGGAGGCTGAGGAAGGGAGCAGTGCTGACGTGGATGGTTCTGGGCTGAATTATGAGTCTGATGAGAATGATAATGGAAATAATGGTTTGAAGAGAAGTGAGAATGGTGAAGATCACAAGGGGAAGAGAAAGGGGTTGCCTGCCAAAAATCTCATGGCGGAGAGGCGCCGCCGGAAGAAGCTCAATGATCGGTTGTACATGCTCAGGTCTGTTGTGCCCAAGATTAGCAAGGTATGAAAAACCAAAACAAAAAAGAACTAAATTTTTCATAAATTGTTCTTCATTGTTCTTGATTATTGGTTTGTTTCAATGTTCATTGTGTTTTGTTTTGTTTTGGGGGTGACTGGTTTTATCTTACAAAAGTAGAAATGGAACAAAATTTATATGTAATTTTTAAGTATTTTTGGTGTTATATTTTGTTAATCCGAGTAATTAAAGTTTATATTAGATGTTAATGTACATTATTGAGGTGGAGTTTTGATTTTGGTAGAAGAATTCTACCAAAAGAATCTAATTTTGGGGTTGTGCTTGAGGAGAAATATAAAAGTTGTTTATGAAAGAATTGTTTCTGGAGAAAATTTTCTAAACATGATATTATTCTGAGGTTCTCTATTTCCGGTTGTTGTCTCCTATGCTGATAAATGTCATTTTGTGACTTATGTTTGGTGGAGAATCTGGTGTGTGGTTGTGCATATTGATGACAGTTTTGAAGAATTTGTAGTTCATTCGTGTTAGGAGCTTAGGAAGGGTGCATGCTGATGTTCTTGTATTTGTTTGCAGATGGATAGGGCTTCAATACTTGGGGATGCAATTGACTACCTGAAGGAGTTGCTGCAGCGGATCAATGATCTCCATAACGAGCTGGAGACGACTTCGGCGGGCTCGTCACTGCTGCCGTCTGCTTCTACAAGCTTTCAGCCTCTAACACCCACCCTGCCAACTCTTCCCTGCAGGGTCAAGGAGGAACTGTATCCTGGCACCTTGCCAAGCCCTAAAAATCAACCTGCAAAGGTAATTTTTTTTGTTGATTTAATTGCAGAATGGTGATTGTACAAGGTTGAAAATGCAGCTTGTTGTACGTAGACCATGTGAACTATGCTGCAATTGAAACTTTTAGAAAGATAACTTCTGAAAATTTTCAAAAATTTTGAAACTGAGTGATGCACAGAAGTTTCTTAGTCACATATTTGTATGCTTCAAACAGAAGTTTCTCTGGACTTTGAAACACATTTATATGCTTCAAACAGCAAGAGTGAACTCAAATTTGAAACTAGGAGACGCTAAGGTGTAGCGAAAGATCCTGGTATAAAAATTGGTATACTAGGAACTAAGAAAAAGTGTGGGTGAGAATGCTCCAATTTGAGTTGTGAAAGCAGAGAAAAATTTACTCCTACTACTCCTGTGTCTTCCATTGCAGTTGTATACCATTCAGAGTCTAAGAAGAAACCAGTGATGGCCAATTAGATTGATACACATTTTTACTCTGACAGAACTTAATTGCATGGTGATTGAGAAATTGTTTTAAAGTGACTTTGGTACTTCTGATATTATATATAGGTTGAAGTTAGAGCAAGAGAAGGGAGAGCTGTGAACATTCACATGTTTTGCACCCGCCGACCAGGCCTTTTGCTGTCTACCATGAGGGCTTTGGACAACCTCGGATTGGATGTACAGCAGGCTGTAATAAGCTGTTTCAACGGCTTTGCTTTAGATGTGTTTAAAGCTGAGGTATAATTTTCTCTCCTTTTCCAATAACTATTATTTAACTAACTTTTGCATTGTGATGCTTGTCATTGCTCTTAAGGCTCAGTGATGCCACACAGTGCATGTTCAGTATTGATTTCTGGTGCCTACATCTGTTCTGTGGGATAAATTTGATTAGTTATGCTCAGAATCTTGCAGCACTAAAATCATTAAAAATTTATGTTTGAGTTTGTGAGTTGCATTTGGTATTGAGTATATGAATCTGAAGTTTTTAGGTTTGATGTAGTGTTTGTTGTTTGTTAGCAGCAATGCAGAGAAGGGCAGGATGTGCTACCTGAGCAAATCAAAGCAGTGCTCTTGGATTCAGCAGGGTTTCATGGTATGATGTGA