Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19825 LG5 13578757 13581976 PREDICTED: cysteine-rich receptor-like protein kinase 42
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 13578966 missense_variant p.Lys70Asn
C/T 13579068 synonymous_variant p.Cys104Cys
G/A 13579425 synonymous_variant p.Gly223Gly
T/C 13579603 intron_variant
T/G 13579609 intron_variant
C/T 13579901 intron_variant
T/G 13580151 missense_variant p.Ser278Arg
T/G 13580154 missense_variant p.Asn279Lys
A/T 13580155 missense_variant p.Ser280Cys
T/A 13580462 missense_variant p.Phe343Tyr
T/G 13580763 intron_variant
G/C 13581420 missense_variant p.Leu534Phe
A/G 13581533 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19825.1
MISDPEMNTKSITSNLSHHHNNPSSWVLFATLFLSSLSFSLSDPRITEAGLYCGTAKAPLKANYIPSFTKEMESLSQLVTNQNWGTHFVNTSGSSIPIYGFAQCFKDLSNTDCLLCYAASRTKIPRCLPSVSARIYLDGCFLRYDNYSFYAEVSDPLRDTVNCTSQHGTVVDKTERLELEESVGRVVETVTNRALANGGGFGVGEVEGVYALAQCWNTIGSDGCRECLRKAGKEVRGCLPKRDGRALNAGCYLRYSTNMFYNEDGDADGKNGFLRRGGVIVAEVLAAAAILVLSLSASYIAFTKLTRIKKENNNVGQIPSSITKSSLNYKYETLEKATDYFNSSRKIGQGGAGSVFKGILPNGKVVAVKRLIFNNRQWVDEFFNEVNLISGIEHKNLVKLLGCSIEGPESLLVYEYLPKKSLDQFIFEKNRTQILNWKQRFNIILGTAEGLAYLHQGTKIRIIHRDIKSSNVLLDENLTPKIADFGLARCFGADKSHLSTGIAGTLGYMAPEYLIRGQLTDKADVYSFGVLVLEVVTGRRNNVFREDSGSLLQTVWKLYRSNTLTEAVDPCLGDDYPATGASRVFQIGLLCTQASASLRPSMSQVVYMLINSNEDVPTPNQPPFLNTGMLDSDSSIKSYSTNSFISNALKKIGASSYSYSESSCSRNSDGPSRSEESIVQV*


CDS Sequence:
>Vu_19825.1
ATGATATCAGACCCAGAAATGAACACCAAAAGCATCACCTCAAATCTAAGCCACCACCACAACAACCCGTCATCATGGGTTCTCTTCGCCACACTTTTCCTCTCGTCTTTGTCCTTCTCACTCTCCGATCCAAGAATCACCGAAGCAGGGCTCTACTGTGGAACCGCCAAGGCCCCTCTGAAAGCCAACTACATCCCAAGTTTCACCAAGGAAATGGAGAGCCTCTCGCAGTTGGTGACCAACCAAAACTGGGGCACTCACTTTGTGAACACTTCAGGCTCGTCGATTCCCATTTATGGCTTTGCACAATGCTTCAAGGACCTGTCCAACACCGATTGTCTTCTCTGCTACGCAGCAAGCCGTACCAAGATTCCACGCTGTTTACCTTCTGTCTCTGCGCGCATCTACCTTGATGGCTGCTTCTTGCGCTATGACAACTACAGCTTCTATGCGGAGGTCAGTGACCCTTTGAGGGATACAGTGAACTGCACCTCACAGCATGGAACGGTTGTTGATAAAACTGAAAGGTTGGAACTTGAGGAAAGCGTTGGAAGGGTGGTTGAGACTGTGACCAACAGGGCTCTGGCAAATGGTGGTGGCTTTGGTGTGGGAGAGGTTGAGGGGGTTTACGCATTGGCACAGTGCTGGAATACCATTGGGAGTGATGGGTGCAGAGAGTGTTTGAGGAAAGCTGGGAAGGAGGTGAGAGGGTGCTTGCCTAAGAGGGATGGGAGGGCCTTGAATGCTGGCTGTTATTTGAGGTATTCGACAAACATGTTCTACAATGAAGATGGCGATGCCGATGGGAAAAATGGATTCTTAAGAAGAGGAGGAGTAATAGTAGCAGAAGTGTTAGCAGCAGCTGCAATTTTAGTGCTTAGTCTCTCTGCCTCCTATATAGCCTTCACAAAATTAACTAGGATTAAAAAAGAAAACAATAATGTTGGTCAGATTCCCTCTTCCATAACCAAATCTAGCTTGAATTACAAGTACGAAACTCTTGAGAAGGCCACGGATTATTTTAACTCTTCAAGAAAAATAGGCCAAGGTGGAGCTGGCTCAGTTTTCAAAGGTATTCTCCCAAATGGGAAAGTTGTTGCAGTTAAAAGATTGATCTTCAATAACAGGCAATGGGTGGATGAGTTCTTCAACGAAGTGAACTTGATTAGCGGTATTGAACACAAGAACCTTGTCAAACTATTGGGATGTAGCATTGAGGGCCCTGAGAGCCTCCTTGTGTATGAGTACTTGCCCAAAAAGAGTTTAGACCAATTTATCTTTGAAAAAAACAGAACTCAGATTCTAAACTGGAAGCAGAGGTTTAATATCATTCTTGGAACGGCAGAGGGGCTTGCATATCTTCATCAAGGTACCAAAATAAGAATCATTCATCGAGATATCAAAAGCAGCAATGTTCTTCTGGACGAGAATCTCACTCCCAAGATTGCAGATTTCGGCCTTGCCCGGTGTTTTGGAGCAGATAAGTCACATTTGAGCACTGGAATTGCTGGAACACTAGGTTACATGGCTCCTGAGTACCTAATTAGAGGACAACTCACAGATAAAGCTGATGTGTATAGTTTTGGAGTACTTGTTCTTGAGGTTGTAACTGGGAGGAGAAACAATGTCTTCCGAGAGGACTCTGGCTCGCTACTACAAACTGTTTGGAAACTTTACCGATCAAACACATTAACTGAAGCTGTTGATCCTTGCTTGGGAGATGATTATCCTGCAACTGGAGCATCAAGGGTATTTCAAATTGGGTTGCTTTGCACACAAGCTTCTGCCTCCCTAAGACCATCCATGTCTCAAGTTGTTTACATGCTGATTAATTCAAATGAAGACGTTCCTACACCGAATCAGCCCCCATTTTTGAACACTGGAATGCTGGACTCAGATAGCTCCATTAAGTCTTATAGCACTAACAGCTTCATATCCAATGCCTTGAAGAAGATTGGAGCATCATCCTACAGCTACTCAGAGTCCTCTTGTTCACGCAACTCAGATGGGCCATCAAGAAGTGAAGAATCAATTGTTCAAGTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_19825::LG5:13576757-13578757(+)
TCGTATTTGTCTCTTCTTAGACAGATAGCGTTTAGCTTGTTTCAAGCTTTCTTTTGTATTTTAATCTTTAAATGTTTTAGATTGTTTTGCCAAAGACATCGTCTTGACTTGTTTTGATTTCGAGAGCTAAGTTAAATACCTTTTTCAGGTATGATAAGCATCAAACGTTTAACTCCAACTATCTTAGATGTTTTAGGCATAATAGCCTTTAGTCCTACGTCTGACTGTTTTGACCTAGATGTTTTCCTATTTCTTAAGAACCTAAGTGTTTTCCTAAGCTTTTCTATGTTGAGGATTCAAGCTCTAAGTGTTTTTGTAGGTTTTCTATGTTGGGGATTCAGGTTCTAATTTTTTTGTTTTCACCCTAAGTTACTTTCCAATTATTTTCCCGTTTTAATGTTATTTGATTAAACTTCAAAACATGAGAACGTTTAGGCGCATAGATAATTTTGTCTTAACAAAGTTAACCAAAAATGGAGGATAGACTTATCGCTTGAAGAAACTGATAGCAATCATGGCTCTAGATACTAAATAATGAGCTTCCTCCAAGTTTGCTTACATCCATGGTGAACGATGATGAAGACATGATGATGGGTGGCGTGAAAGCTAAGAGAATGTGTTGAGCCTTTTCTGTTATTATAATATTCTCTGATTATCTTCTAAATAATCCAATATCTTCGAGATATATTTGATTATTATGGAAATCTAAAAAGATTTAAGAAGATATTACGATATTAAAAAGATTTGACAAATATTATCTTTTGATATTTAGTGATATAGTTAAATAAGATAATTATTTAAAAATATCAAATAAAATATCTAAAGATGTATTTGGCTCAAATTATCTTTTATCATAAAGATTTATCAATTATCAACTTCCTCTTTCATATAAAGTTAGAGAGAATCATAAGGTCCAATTTTTGTTTCCTATTTTCAATTCTTAACTTGGCCAAATTAAGATTGACTCAGCGAAACCTTTTCACCTTTTTATTTTTTTCTTGCTTTCTTATTGTAATGTTTGACTTGACTTTTTATGATTTTGATAATTTACTATTATTGATTTTATGTTTATTAAACTTTAAATGATTTATTTTTATGCTTTCATAAACTTAATTAGCTTCATTTTTAAAATTTCATGAAGTTTTAACCACTTTATTTTCCAACTATATAAACTTAACTTAGCTACTATAGTTACACTCCATATTAATGTTATTGAATTAATTCAACAAATTATTAACCTTAGGTTGGAATAATCTTTTCATTTTTATTATATATATCTTTTAAACTATTGAAAGAAATTGTGTTTTTTACCTTTTTTTAATCTATAGATTTATTTGATTATTAAGGATTTTATTTTGAATATCAATTATTTTATTATCAGCCATATATATTGAAATCTAAACTATAAAATTATATTGTCTTCAATTTTGTTCTTTTTTTTATATATTAATAATGATAAAAAAAATTAATTTACGTTTAATTTATTAAATTGCATTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTCTCTGGTCATTGCTCTAATATATTGGTAGGATAATTGACTGCATTCATGTTCACATTACTTTTTAAAACCCATCAACAATTTTCTTTTGGATGGCAAAAGAATGGAAATCCGTTGTAAGAAGCGATTATCGGCTATGTTGTTCACACAGAAGATCTAGGAACAATCACTCTTCTAGTAGGCCATTCCACAAATACGGGAAAACAGCAATAAAGCATCAATAAATTTTAAAGTTGCCAATTGTAACTATTCTAATTTTTCCCATGCTTTCTCTCTGTCATGCCTCTTCTTTCAACACTCATTCTTGCACGCAGCAAGGAAGAAAATAACACGTTATAATAACTCCCACCCATACATGGTTGGCAATAAAAAAAGTAGTTAGCCA


Gene Sequence:
>Vu_19825(+)
ATGATATCAGACCCAGAAATGAACACCAAAAGCATCACCTCAAATCTAAGCCACCACCACAACAACCCGTCATCATGGGTTCTCTTCGCCACACTTTTCCTCTCGTCTTTGTCCTTCTCACTCTCCGATCCAAGAATCACCGAAGCAGGGCTCTACTGTGGAACCGCCAAGGCCCCTCTGAAAGCCAACTACATCCCAAGTTTCACCAAGGAAATGGAGAGCCTCTCGCAGTTGGTGACCAACCAAAACTGGGGCACTCACTTTGTGAACACTTCAGGCTCGTCGATTCCCATTTATGGCTTTGCACAATGCTTCAAGGACCTGTCCAACACCGATTGTCTTCTCTGCTACGCAGCAAGCCGTACCAAGATTCCACGCTGTTTACCTTCTGTCTCTGCGCGCATCTACCTTGATGGCTGCTTCTTGCGCTATGACAACTACAGCTTCTATGCGGAGGTCAGTGACCCTTTGAGGGATACAGTGAACTGCACCTCACAGCATGGAACGGTTGTTGATAAAACTGAAAGGTTGGAACTTGAGGAAAGCGTTGGAAGGGTGGTTGAGACTGTGACCAACAGGGCTCTGGCAAATGGTGGTGGCTTTGGTGTGGGAGAGGTTGAGGGGGTTTACGCATTGGCACAGTGCTGGAATACCATTGGGAGTGATGGGTGCAGAGAGTGTTTGAGGAAAGCTGGGAAGGAGGTGAGAGGGTGCTTGCCTAAGAGGGATGGGAGGGCCTTGAATGCTGGCTGTTATTTGAGGTATTCGACAAACATGTTCTACAATGAAGATGGCGATGCCGATGGGAAAAATGGTGAGTATGTGTCATTTTATTTCAAACAAGGTTTTCAATTGCAATCATTGTCACGATTTCCTCGCGATCTTTGAAGGGAAATTGTGGATGAACGTAGTGATCTTTTAGTTTCAAGCAAGCTTTTAAATTGCAGTTGCAGGCACGGTTTTCTCACGATCTTTTATGAGAAATTGCAGATGAATGTGGCCACAATTATTGTTGAGTCAATAGTTGTTTTCTACAGCCTTGGTTTCAAGTTTTTCCCTTTTGTTTGTCAAATGGGAATTGAAGCTTATCTTAGAACTTTCATATACTTTCATCTACTTTGATTTTAGTACGCAATTTTAAGTACACTTTTTGTTGTCAGCAAAAATTCTGTCACACTTAAGTCATTATAATTATGACTCGAATGCTTTTCAATGTTTCTACACTGGCCTATATAGAACCCAGATCTTAATTCATAGACGGCGCTCTGAGTGGGGGAAAATTTGCTTCGTTACAGTAATTTTCTTTTTCAACAACCAAACAACTAGTGTTATTTTGAAGTATTGATCTCATTGCCTGATTTTTAATTTTTCAGGATTCTTAAGAAGAGGAGGAGTAATAGTAGCAGAAGTGTTAGCAGCAGCTGCAATTTTAGTGCTTAGTCTCTCTGCCTCCTATATAGCCTTCACAAAATTAACTAGGATTAAAAAAGGTGAACATTCTAAAAAAGGGTTTATCATTACTACTTACTACACACTATAAAGTCAAATTTGTGAATTGTTAGGTCTTCACTTTCTTATGCTGTGTTTCTTTTCTCCTGCGTCACCAGAAAACAATAATGTTGGTCAGATTCCCTCTTCCATAACCAAATCTAGCTTGAATTACAAGTACGAAACTCTTGAGAAGGCCACGGATTATTTTAACTCTTCAAGAAAAATAGGCCAAGGTGGAGCTGGCTCAGTTTTCAAAGGTATTCTCCCAAATGGGAAAGTTGTTGCAGTTAAAAGATTGATCTTCAATAACAGGCAATGGGTGGATGAGTTCTTCAACGAAGTGAACTTGATTAGCGGTATTGAACACAAGAACCTTGTCAAACTATTGGGATGTAGCATTGAGGGCCCTGAGAGCCTCCTTGTGTATGAGTACTTGCCCAAAAAGAGTTTAGACCAATTTATCTTTGGTATGTTCCTATTATTTTATTATATTGTGAAGTCATTTTTTGTTTTAATTTCAAATTCTTATCTATAATTTCATGAAGGTGACGTACTAATCTGCTTTGTAGAAAAAAACAGAACTCAGATTCTAAACTGGAAGCAGAGGTTTAATATCATTCTTGGAACGGCAGAGGGGCTTGCATATCTTCATCAAGGTACCAAAATAAGAATCATTCATCGAGATATCAAAAGCAGCAATGTTCTTCTGGACGAGAATCTCACTCCCAAGATTGCAGATTTCGGCCTTGCCCGGTGTTTTGGAGCAGATAAGTCACATTTGAGCACTGGAATTGCTGGAACACTGTAAGTGCTTGGATTTAGCATGTGATATTGAGCATGTTCCATACAACATTTAGAACTTCGTTGTATTTTCCATTATTTGGGTAACATCAGCTCCGTATTTCAATTTCGGTTAGTCAATCTTCACATAAACAGAAATTCCTAACATTAGATATAAAAGTAAAACAACTTTTTCCCATAACAATCACAATAGATCTTGTAAGAGGGTCAAATGGAAATAATATCATTGGCCAATTACATCCCATAATCTTAATTCGTACCTGAATTTTTATTTTTGGATTAGAGGTTACATGGCTCCTGAGTACCTAATTAGAGGACAACTCACAGATAAAGCTGATGTGTATAGTTTTGGAGTACTTGTTCTTGAGGTTGTAACTGGGAGGAGAAACAATGTCTTCCGAGAGGACTCTGGCTCGCTACTACAAACTGTAAGATTTGTATGCCTAACTTGCACAAAAATTGAAACAACCTTTTTCATTTTCTGAGCTACTGGTTTCAACACTTTCTATTTGAAATTACTCTAAATTATCATTTTTGACACCAGGTTTGGAAACTTTACCGATCAAACACATTAACTGAAGCTGTTGATCCTTGCTTGGGAGATGATTATCCTGCAACTGGAGCATCAAGGGTATTTCAAATTGGGTTGCTTTGCACACAAGCTTCTGCCTCCCTAAGACCATCCATGTCTCAAGTTGTTTACATGCTGATTAATTCAAATGAAGACGTTCCTACACCGAATCAGCCCCCATTTTTGAACACTGGAATGCTGGACTCAGATAGCTCCATTAAGTCTTATAGCACTAACAGCTTCATATCCAATGCCTTGAAGAAGATTGGAGCATCATCCTACAGCTACTCAGAGTCCTCTTGTTCACGCAACTCAGATGGGCCATCAAGAAGTGAAGAATCAATTGTTCAAGTTTGA