Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19748 LG5 12225326 12227656 "PREDICTED: BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1-like, partial "
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   cytokinesis, cellular localization, meiotic cell cycle process, regionalization, cellular component biogenesis, cytokinesis, macromolecule localization, meiotic cell cycle process, protein phosphorylation, anion transmembrane transport, protein localization to organelle, meiotic cell cycle process, nitrogen compound transport, microtubule cytoskeleton organization, microtubule cytoskeleton organization, anion transmembrane transport, tissue development, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   plasma membrane
Cellular Component   located in   plasma membrane
Molecular Function   enables   protein binding, protein kinase activity, ATP binding, protein binding, protein binding, protein kinase activity, protein binding, protein kinase activity, protein binding, ATP binding, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 12225925 synonymous_variant p.Glu163Glu
T/C 12226218 intron_variant
G/A 12226371 missense_variant p.Gly266Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19748.1
MCMILLKLLLFLTWISSPSLSTSMTQLDTLLAIRDSLDPENRLLLSWTPHSDPCSSVSFEGVACNEQGLVTNISLQGKGLYGRVPEALAALKSLTGLFLHFNALTGILPKEISTLTELSNLYLNVNNLSGDIPREIGNMSNLQVLQLCYNKFSGSIPTDLGRLRKLSVLALQYNQLNSAIPASLGEVGTLARLDLSFNNLFGPIPVTLANAPNLQTLNIRNNSLSGRVPTALIRLRGGFQYMNNPGLCGTGFADLGSCKGVSTSEPVRPEPYEPGDISTKDLPASMEPQRESCGGGHCKRTSKSSKIGLVFTVIGLVFASTVAGLLLLFWRRSQIQKIGSSDNRLKQVCKKSAFPLISLEYSDGWDPLDKGRCGYSQEFLESFMFNLEEVERATQIFSEVNLLGKSDSSAVYRGVLRDGSAVTIKCIAKTSCKSDEGEFLKGLKILTSLRHENLVRLRGFCCSKGRGECFLIYDSLSNGSLLQYLDVKRNSGRVLDWSTRVFIIRGIAKGIDYLHRKKGSKHGIVHQNISAENVLLDAGYKALLADSGLHKLLEDDVVFSALKASAAMGYLPPEYTKTGRLTEKSDVYAFGVIVFQLLTGKRDITQLNCQSGILKDIVDENLEGMFSESEATKLRRVAVLCTHESPHLRPSMDTLMLELDDNV*


CDS Sequence:
>Vu_19748.1
ATGTGCATGATCCTTCTGAAACTGCTACTCTTCCTCACATGGATTTCTTCTCCATCTCTTTCCACCTCCATGACCCAGCTTGACACTCTCTTGGCCATCAGAGACTCTCTAGACCCAGAGAACCGCCTGTTGCTCTCATGGACTCCCCATTCTGACCCCTGTAGTAGTGTCTCTTTTGAGGGTGTGGCTTGCAATGAACAAGGCCTCGTTACCAATATTTCACTGCAAGGAAAGGGTCTATATGGAAGAGTACCTGAAGCTTTGGCTGCTCTCAAGAGCTTGACGGGTCTCTTCCTTCACTTCAATGCCCTCACTGGGATATTACCAAAGGAAATTTCCACTTTGACTGAGCTAAGTAATTTGTATCTCAATGTCAATAACCTCTCTGGTGACATCCCTCGCGAGATTGGCAATATGTCAAATCTTCAAGTTTTGCAGCTTTGCTATAACAAGTTTAGTGGGAGTATACCGACTGACCTGGGAAGGTTGAGGAAGCTCAGTGTTCTTGCACTGCAATATAATCAATTAAATAGCGCTATTCCTGCTAGTTTGGGTGAAGTGGGGACATTGGCACGATTGGATCTGAGCTTCAATAACCTTTTCGGTCCTATTCCGGTCACATTGGCTAATGCACCTAATCTCCAAACTCTGAATATTCGTAACAATTCTCTCTCTGGCCGTGTACCTACAGCTCTGATAAGACTCAGAGGTGGGTTTCAGTACATGAACAATCCGGGTTTATGTGGGACTGGATTCGCTGATTTAGGTTCTTGCAAAGGAGTAAGCACTTCAGAACCGGTTAGACCCGAACCGTATGAACCTGGTGATATTTCTACAAAAGATCTTCCTGCATCAATGGAACCACAGCGTGAAAGCTGCGGCGGTGGTCATTGTAAAAGGACATCGAAATCTTCAAAAATTGGTCTGGTTTTTACCGTCATTGGACTCGTTTTTGCTTCAACTGTTGCTGGGCTGCTTTTGCTATTCTGGCGACGTAGTCAGATTCAGAAAATTGGAAGTTCTGATAACCGGCTTAAGCAAGTGTGTAAGAAAAGTGCGTTTCCTCTTATCAGTTTGGAGTATTCTGACGGTTGGGACCCATTAGACAAAGGTCGATGTGGGTATTCCCAGGAATTTCTTGAGAGCTTTATGTTTAATCTTGAAGAAGTAGAACGCGCAACTCAAATCTTCTCAGAGGTAAATTTATTGGGGAAGAGTGATTCTTCAGCTGTGTACAGGGGGGTTTTGAGAGATGGTTCTGCTGTGACTATAAAATGCATCGCCAAAACAAGTTGCAAATCAGATGAAGGTGAGTTCTTGAAAGGTTTGAAGATATTGACCTCGTTAAGGCATGAAAATCTAGTTCGGTTGAGAGGGTTTTGCTGTTCAAAAGGCCGCGGGGAATGTTTTCTGATCTATGACTCTCTCTCTAATGGGAGTCTGTTGCAGTATCTTGATGTTAAGAGAAACAGTGGTAGGGTACTTGATTGGTCGACCAGAGTGTTCATCATTCGTGGTATTGCCAAAGGTATCGATTATCTGCATAGGAAAAAAGGAAGCAAACATGGGATCGTTCACCAAAATATATCAGCTGAAAACGTACTTCTGGATGCTGGGTACAAGGCTTTACTTGCAGATTCGGGATTGCACAAGCTCCTTGAAGATGATGTTGTTTTTTCCGCCCTCAAAGCTAGCGCTGCCATGGGATATCTGCCTCCAGAGTACACCAAAACTGGTCGTTTGACTGAAAAGAGTGATGTGTATGCCTTTGGAGTGATTGTTTTCCAGCTTCTCACCGGAAAACGTGACATCACCCAGTTAAATTGCCAAAGTGGCATTTTGAAAGATATAGTTGATGAGAATCTTGAAGGGATGTTCTCAGAATCAGAGGCCACCAAGCTGAGAAGAGTTGCTGTGCTTTGCACTCACGAGTCCCCACATCTTCGACCATCTATGGATACCCTAATGCTAGAACTGGATGATAATGTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_19748::LG5:12223326-12225326(+)
TTTAACTTTTTAGTGATAGTAGTGGAGTAGGGAGTTAAAATTTTAGCAAACAAGTTTTAATAGATAAGAAAAACTAATTAAATTTTTTTTTAATAATATCTTAGGATGGATGATCTAGATATGATCACAATATTTTATTTTATGCAGATATTATGTTTTAATAATTAGTGTAATAAAACTCACAAACAATGATTATACACAAAATTTGAAAGGGCATCGGACGTGTGTGTTGCATTGAGTGAAAGTATAGGAGTATAGTGCTAAAATTCTTAGACTCTAATTGTTTAATTAATATTGAATATGTTTATGGTGGTAACATATATGTTAATGAATGTTGTCGTATATTGAAAGTGATAGTGATAACTGCGTAGGGATTCATAAGGAGTATTAAATTGAGATTCTCGAAGGAAATTATTTTTAAATGAAAATACTTAATAATGAAAGTTGAAGAAGGTCTTTACATTAAGTATGAGAAAGAAAACCCGAATATAATTAGTGTACATATTTGTCATGTTATATTTGCTTGATGAGAAATTAGGTTCTATTATCTTTGAGTATAATTATAGTCTTTATTGTTGTTATTAAAGGTCAAATGATGACAAGTACAATGTTTCTTAATCTATTCAATACATTAAATTTTCGGAATTGAAAGTAGCTTTTGTTGGTATCTTATGTTTAGAAAAGCTATGAAGATTATGTATATTTGATAGTTTAGAAAAAGTGAATTATAATGCTTGAGTTAATGTTTTTGTGTGAATGTAATAATTATATTAATTTTTACATATAAAATTTTAACACATTTATAATTTATTCTAGCTTCTCTTATATTTTGTAATTGTGATAATCCACTTGTAATTATCACATGTACATAAAATTATGCAAGTTTAGGAAAGGAGAAGAAGAGACTCTGTAAATAAAGTAAGTATGTATTTAAAGTTTAGATATCTAAAAATCATTTTGTATTTTGATAATAGTTTATAACGAGTTTAGAAAAAATAATTTGAAATAATTTTATATAGCTTGAATTGTTATGGAAAACCGTGCAAATTATAATTTATTATGCTTTAAACTTTTATTGTGTTTTAATATTAATCTTATAGTAAATAGATTTTATGTCCTATAATTGGATTCTTAGAATTGATGTTGAAATTAAAGGACAAAAAATTGGCTTGAGAATTCCGAGTGAATGTAAACCATCAACAAGTTTATTTAGATATATATTTTGCCATTTAATTTGTATAAACAATGTAAACTATTGAATTTTCCTTTTTTTTAATTTGGATTTAACATGGGAAAGAAAAGAAAAACATTTATGGACTTAATTAATAATTATTTTCCTGTTTTTATGTTTATGGTGTCTATATTATTTTTTACTACTTTTCACTCTTCTAATAACATCGATTTGGTCTTATAATTAATAAAGTTTAAAAAGTGTGTCAAATGTTTTAAAATGTCACATGTCCGAAAAGTGTTAGAAGATATAAGTGTTATACTAAAAAAAGTCTCCAGATAAAAAATAATTTATAAATGGCTTTTTCACACCAAATTAATGTCAATTTAATATTAAAAAAAGCTACTAGTTATTTAGAAAATAAATGAAAAACTAAAACGAATAATAATTTTAAAGTAATGAACAATTTACAAATTAAACCTAAAAGAAATATATAAAAGAATAAATAATAAATTTATGATGTAATAAAAGAAAAGAGATAAAAAATAAATATAGACAAAATTAAAGTATATCTGTATCGTTGCTGGAAAGAAAATCCAACTCTTGGTTTCGCATATTTCCTGTCTTCTCTGGCTCATATTTTATTGTGAATAAACATCTATCAGACCACAAACCAGACACGTTCTGACATTTTCTCAGTCTAAAAACACAGTGTTTCATCTGCTTCAATTCACGTGCGTGCTGTTTCTCCTGCTTCCACACCCTTCATCTGCTAAGACATCACAGCATAACTGCTACACCAAGGACTCAACTTCCCTGGAACTGATCA


Gene Sequence:
>Vu_19748(+)
ATGTGCATGATCCTTCTGAAACTGCTACTCTTCCTCACATGGATTTCTTCTCCATCTCTTTCCACCTCCATGACCCAGCTTGACACTCTCTTGGCCATCAGAGACTCTCTAGACCCAGAGAACCGCCTGTTGCTCTCATGGACTCCCCATTCTGACCCCTGTAGTAGTGTCTCTTTTGAGGGTGTGGCTTGCAATGAACAAGGCCTCGTTACCAATATTTCACTGCAAGGAAAGGGTCTATATGGAAGAGTACCTGAAGCTTTGGCTGCTCTCAAGAGCTTGACGGGTCTCTTCCTTCACTTCAATGCCCTCACTGGGATATTACCAAAGGAAATTTCCACTTTGACTGAGCTAAGTAATTTGTATCTCAATGTCAATAACCTCTCTGGTGACATCCCTCGCGAGATTGGCAATATGTCAAATCTTCAAGGTGCTTTCTTCTTCAAAAACTATTACAAATTTCTCATCTTTGCTCCCCTTCACTTCAGTGTTTATCTTGCTTATTTCTACTTTCAGTCTAATTTGTTAAGAGTTTACAGTTTTGCAGCTTTGCTATAACAAGTTTAGTGGGAGTATACCGACTGACCTGGGAAGGTTGAGGAAGCTCAGTGTTCTTGCACTGCAATATAATCAATTAAATAGCGCTATTCCTGCTAGTTTGGGTGAAGTGGGGACATTGGCACGATTGGATCTGAGCTTCAATAACCTTTTCGGTCCTATTCCGGTCACATTGGCTAATGCACCTAATCTCCAAACTCTGAATATTCGTAACAATTCTCTCTCTGGCCGTGTACCTACAGGTAATTCATCAACCTTATTGATTTTGACAAATTGGTTTATTTTTCTTGAAAATGAGGTTCGTAGAGGTAAATCCTAGATTAAATTCCAAAACTGCACTTAATTATGTGCTAATTCAATTTGTGTGTGTGCTTGGTGCAGCTCTGATAAGACTCAGAGGTGGGTTTCAGTACATGAACAATCCGGGTTTATGTGGGACTGGATTCGCTGATTTAGGTTCTTGCAAAGGAGTAAGCACTTCAGAACCGGTTAGACCCGAACCGTATGAACCTGGTGATATTTCTACAAAAGATCTTCCTGCATCAATGGAACCACAGCGTGAAAGCTGCGGCGGTGGTCATTGTAAAAGGACATCGAAATCTTCAAAAATTGGTCTGGTTTTTACCGTCATTGGACTCGTTTTTGCTTCAACTGTTGCTGGGCTGCTTTTGCTATTCTGGCGACGTAGTCAGATTCAGAAAATTGGAAGTTCTGATAACCGGCTTAAGCAAGTGTGTAAGAAAAGTGCGTTTCCTCTTATCAGTTTGGAGTATTCTGACGGTTGGGACCCATTAGACAAAGGTCGATGTGGGTATTCCCAGGAATTTCTTGAGAGCTTTATGTTTAATCTTGAAGAAGTAGAACGCGCAACTCAAATCTTCTCAGAGGTAAATTTATTGGGGAAGAGTGATTCTTCAGCTGTGTACAGGGGGGTTTTGAGAGATGGTTCTGCTGTGACTATAAAATGCATCGCCAAAACAAGTTGCAAATCAGATGAAGGTGAGTTCTTGAAAGGTTTGAAGATATTGACCTCGTTAAGGCATGAAAATCTAGTTCGGTTGAGAGGGTTTTGCTGTTCAAAAGGCCGCGGGGAATGTTTTCTGATCTATGACTCTCTCTCTAATGGGAGTCTGTTGCAGTATCTTGATGTTAAGAGAAACAGTGGTAGGGTACTTGATTGGTCGACCAGAGTGTTCATCATTCGTGGTATTGCCAAAGGTAAGTTTTTCTTCTGTCTCTTCAAATAAATCTTAGGAAATTAAATCAGTTCCTCTGTAAACTAAAATTAAACGATTCTATCTTTATCCAGGTATCGATTATCTGCATAGGAAAAAAGGAAGCAAACATGGGATCGTTCACCAAAATATATCAGCTGAAAACGTACTTCTGGATGCTGGGTACAAGGCTTTACTTGCAGATTCGGGATTGCACAAGCTCCTTGAAGATGATGTTGTTTTTTCCGCCCTCAAAGCTAGCGCTGCCATGGGATATCTGCCTCCAGAGTACACCAAAACTGGTCGTTTGACTGAAAAGAGTGATGTGTATGCCTTTGGAGTGATTGTTTTCCAGCTTCTCACCGGAAAACGTGACATCACCCAGTTAAATTGCCAAAGTGGCATTTTGAAAGATATAGTTGATGAGAATCTTGAAGGGATGTTCTCAGAATCAGAGGCCACCAAGCTGAGAAGAGTTGCTGTGCTTTGCACTCACGAGTCCCCACATCTTCGACCATCTATGGATACCCTAATGCTAGAACTGGATGATAATGTGTAG