Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19612 LG5 9910570 9911599 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 9910870 intron_variant
T/A 9911014 missense_variant p.Leu45His
T/A 9911018 synonymous_variant p.Leu46Leu
C/T 9911311 missense_variant p.Ala144Val
G/A 9911418 missense_variant p.Glu180Lys
C/A 9911521 missense_variant p.Ser214Tyr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19612.1
MSGREGEVGRLQVKDLIVRVPRVGCITSHNKLSLLAFSGNISTSPPFPYLNWSDSLDCCAWEGITCDGDLRVTHLLLPSRGLTGFISPSLTNLSSLSHLNLSHNRLSGGLQHQLFSLLNHLVVLDLSYNHLSGELPPFGIDNSGKNSNGAGIQELDLSSNFFNGTLPNSLLQKLAAAAAGGSLVSLNVSNNSFIGHIPTSLFCINDRNSSSLRFLDYSSNDFDGAIQPGLGACSKLERF*


CDS Sequence:
>Vu_19612.1
ATGAGTGGAAGAGAGGGAGAGGTTGGTAGGTTGCAGGTGAAGGACTTAATAGTGAGAGTGCCTCGGGTTGGGTGTATAACCAGCCATAACAAACTGTCCCTCTTGGCTTTCTCTGGGAACATATCAACCTCTCCTCCTTTTCCTTATCTCAATTGGTCTGATTCTCTTGACTGCTGTGCTTGGGAAGGCATTACTTGTGATGGGGATCTTAGAGTCACACATCTTTTGCTACCTTCTAGAGGCCTCACTGGCTTCATCTCCCCCTCTCTCACAAACCTCTCTTCTCTCTCTCACCTTAATCTCTCCCATAACAGATTATCTGGTGGTCTCCAGCACCAGCTTTTTTCATTGCTCAATCACTTGGTGGTTCTTGATTTGAGCTACAATCATCTGTCTGGTGAATTGCCACCTTTTGGGATTGATAACAGTGGCAAAAATAGCAATGGTGCTGGTATCCAGGAGCTGGATTTGTCCAGCAATTTTTTCAACGGGACACTTCCAAATTCTTTGCTCCAGAAGTTGGCAGCTGCTGCAGCTGGAGGAAGTTTGGTGTCTTTGAATGTTAGTAATAACAGCTTCATAGGTCATATTCCCACTTCCCTGTTTTGCATTAATGACCGTAACTCCTCCTCTCTAAGATTCTTGGATTATTCCTCCAATGATTTTGATGGTGCCATTCAGCCTGGACTTGGAGCATGTTCCAAGCTGGAGAGATTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_19612::LG5:9908570-9910570(+)
AAGACGAAAATTAAATATGTATGCATGAAGTTTTGATCAATGGCAAAAGCAAAAGATAAACACTTTCAATGAAATATATGTATGAATATGTTGTTGGGGGTCAATTTCATCTTATCCACTCTCATATATTTTAGGAATTCAACATTCAAATCATCATTGTTAATGCCACTCTCTAAAGTACCTTTCAAGAAGGCTTCTCCCTAATCACGAGTTCATACAATTCCTAGCATTCCTAATGATTAGTTCATAAGTGCAGGAGCTTAACGACAACCAATATAATATTGGGAGAAATTCCCCGGATCTAGACTTCCCCGTACGCGCCCGTATCGACAAAACCAATAATCATGCATCGAATGAGTTAAACAATGCAAGCATTATGCAAAGAGGAAAAACCCTAACTAATGATGAAAGAAAGCATAGATCTTAAATAAAAGATGTAAAAACAAATTCCATATATGAGAGCTTCAAAAGATTACATTGATTCCCCAACAAACATACAGAGTTTAGTTCACCATATTCATGGTGAACCTAGATGAATAACAATGAAAGAATGAAAGATAAAACCCTAAAAAGGTGAAGAGGAAGCCTCAGCATCTAAGATCCTCCTTCAAAGGGGTGGAAGAGAGAGTGTTTTCTTCGTTCCAGCCAAAGATACCTAACCCTAGGAAACCCTAAAGCTTATATATTACACTACAAGAAAAAAGTGTATTACATACGGAATATTATATACGGATCTAGAGTTGTATGTAAAGTGGGAATTATATACGGAAATTATGTACGGATGTTAAAGAAAGGCGTTATATACGGATATTATATACGGAATTTTATATACGGATAATCCGTATATAATATCCGTATATAATGTTGGCGCGGGGTGGCGGGAAAATTACCCAAGGATAGGATCTGTATATAACCTGTATTATCCGTATGTAGTTGGAACCAAATTTTATCTGCAGATATTACATACGGATTTGGGAAATAATATTAGAAAAATGTATTTCTAATTACGCTGAAGCTGGAACCCTACACTCTCAGCTCGAGCTTTCCTCTCATTCGAACCTGGTGCTTTGTTTTCACTTGAATCGTGGTGCATTCTTATCTCTCTCGAACCCTGTCGTATCCCTTCTTTCGAGCCCTTTCGGTCTGGTTGTTGTTGTCTCCATCCCTCTTTGGTGTGGCTTTGGTTCTTCGTCGTCTCTCTGTTTCGAACTGTGACTTTCATCAATCCTTCATCAAACACTGTCGTTGGGCCTCATTGTTCGGTGCGGTGCCGTAGTTGGGCGCTGAAAGAGTAGCTTCATCTGGTAAGTAAATTGTAATGCTTAGTAATTGTTTAATGGTGAAAATCGTGAACCCTAATCTCATTTTTGTGTGTTTTATTTGTCACATCTATGGTTCGGGTCGCAAGCCGTGGTTGGAGTGTTTGGAAGCATCGATTGAGGCTACTGTGTGGCGGGTTAAGTAGATTCGTACTGGTTTTATGGACTGAGACATATAGCATCTGGAGTTGCGAATGTGAGTGAGTTCGTTTGCATTTAAAGTTTGTTAGATGTAGAAAAATGATTTGTACTATGTTATTTTGCTTCGTTTGGTAAACAATATGTTGTTTTGTATTTGAATTGTATAGACTGGTACGATTCTTTCTTCTTTAGTGTCACAGTGACTAAGTCTCTTTCCTTGTCAAGTGGCTGGGCCTGTAAATATTTAATGCAGTGCTAGAATGTTCTATATCAAAATTTAGTATTGCAACGTACTGAAGTAAGCTTAAGTCCCTTTTGAGGTTGTCATAATTGGTGTGGGTTGGTAGTAAAGGAAGAAGTTGGTTTCATGCATAAGTTCTTTGTATCAAGTACTGTTTAGGTTATATATATATCACATAGTTGGAAGAAAAAGGAAAGAAGGGTAGAGTGAGGTGTGAACATTGAAGGGAATGAGAGTCGATTGGTAGAATAATTATGGAGAAAGGAGGTGGTGGGTGTAGGTGTTGTGGAAAAGGAGTA


Gene Sequence:
>Vu_19612(+)
ATGAGTGGAAGAGAGGGAGAGGTTGGTAGGTTGCAGGTGAAGGACTTAATAGTGAGAGTGCCTCGGGTTGGGTAGCATGAATGAAATAATGTGTGAAGGGCTTAGTTTCTCATCGTGGTTATGTTGGGAAAGAAAGATAATAAGAAAGGGTTCGGCATGTGCAGGGAACATGCAAGGAATATTGTAACTAGGAAATATAGTTGGTTTTAGGGTGGAGATGATTCCAGGGGTCATAGTGAGTTTAAGGGTAAATTATTTGGGAAGAATAATGGTGGTATAGGGGTATAAGGGATTATAGAAGGGTTGAGCAGGGAATGGGTATACACATTCATTATATTGTACTAACTAACCCTAAACATATATATAACTAAGCTTAATTAGGTGTATAACCAGCCATAACAAACTGTCCCTCTTGGCTTTCTCTGGGAACATATCAACCTCTCCTCCTTTTCCTTATCTCAATTGGTCTGATTCTCTTGACTGCTGTGCTTGGGAAGGCATTACTTGTGATGGGGATCTTAGAGTCACACATCTTTTGCTACCTTCTAGAGGCCTCACTGGCTTCATCTCCCCCTCTCTCACAAACCTCTCTTCTCTCTCTCACCTTAATCTCTCCCATAACAGATTATCTGGTGGTCTCCAGCACCAGCTTTTTTCATTGCTCAATCACTTGGTGGTTCTTGATTTGAGCTACAATCATCTGTCTGGTGAATTGCCACCTTTTGGGATTGATAACAGTGGCAAAAATAGCAATGGTGCTGGTATCCAGGAGCTGGATTTGTCCAGCAATTTTTTCAACGGGACACTTCCAAATTCTTTGCTCCAGAAGTTGGCAGCTGCTGCAGCTGGAGGAAGTTTGGTGTCTTTGAATGTTAGTAATAACAGCTTCATAGGTCATATTCCCACTTCCCTGTTTTGCATTAATGACCGTAACTCCTCCTCTCTAAGATTCTTGGATTATTCCTCCAATGATTTTGATGGTGCCATTCAGCCTGGACTTGGAGCATGTTCCAAGCTGGAGAGATTTTGA