Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19576 LG5 9306293 9308311 PREDICTED: L-type lectin-domain containing receptor kinase S.4-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 9306404 missense_variant p.Leu542His
G/A,* 9307346 synonymous_variant p.Tyr322Tyr
G/A 9307392 missense_variant p.Ala307Val
G/T 9307460 synonymous_variant p.Val284Val
C/T 9307587 missense_variant p.Ser242Asn
G/A 9307602 missense_variant p.Thr237Met
T/A 9307697 synonymous_variant p.Pro205Pro
A/G 9307707 missense_variant p.Val202Ala
C/A 9307763 synonymous_variant p.Gly183Gly
A/G 9307793 synonymous_variant p.Val173Val
G/A 9307913 synonymous_variant p.Ile133Ile
G/C 9308148 missense_variant p.Thr55Ser
A/T 9308214 missense_variant p.Val33Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19576.1
MTTLLKLLSLLVFLLIPVSSQVEQLLYAGFKDVGASNLTLNGVAEIEKNGILKLTNETSRLMGHAFYPSPFQMKNSTTGKVVSFSSSFALAIVPEYPKLGGHGLAFTIATSKDLKALPSQYLGLLNSSDNGNISNHIFAVEFDTVQDFEFGDINDNHVGIDINSMQSNKSANVSVVGLNLKGGKPILAWVDYDSELSVISVVLSPNSSKPNTPILSFNVDLAPVFHDTMYVGFSASTGLLASSHYILGWSFKINGPAPPLDLSSLPMLPQPKKKQTSLIVGVSVSVAVIVLLAIAIGIYFYRKMRNADVIEAWELEIGPHRYSYQELKKATRGFKDKELLGQGGFGRVYKGTLPNSKIQVAVKRVSHESKQGLREFVSEIASIGRLRHRNLVQLLGCTTRVVGTLGYLAPELPRTGKATTSSDVFAFGALLLEVACGRRPIEPKALPEELVLVDWVWDKYKQGRILDVVDPKLNGNFDEKEVLVVLKLGLLCSNDVPAARPSMRQVMRHLDGEVEVPEDLKKPGDISQQEGFDEFLHSLASSSFDKMSSGSNFGNRDMDSFLSFANSPHSLLHRGETR*


CDS Sequence:
>Vu_19576.1
ATGACCACCCTTTTGAAATTGTTGTCTCTTTTGGTGTTTCTTCTGATCCCAGTTTCATCCCAGGTTGAGCAGCTTCTCTATGCTGGATTCAAGGATGTGGGTGCTAGCAACCTGACATTGAATGGGGTGGCTGAGATAGAGAAAAATGGAATACTCAAATTGACTAATGAAACCAGCAGGTTAATGGGTCATGCCTTTTACCCATCTCCTTTTCAGATGAAGAACTCCACCACCGGTAAAGTTGTTTCCTTTTCTTCCTCGTTTGCTCTGGCTATTGTTCCTGAGTACCCCAAGCTAGGTGGCCATGGCTTGGCTTTCACAATAGCAACTTCCAAGGATCTCAAGGCTCTACCTAGCCAGTACCTTGGCCTTCTTAATTCCAGTGATAATGGCAACATCTCCAACCATATCTTTGCTGTTGAGTTTGACACTGTGCAAGACTTTGAGTTTGGGGATATTAATGATAACCATGTTGGAATAGACATCAATAGCATGCAGTCCAATAAATCTGCTAATGTTAGTGTGGTGGGTCTCAATCTCAAAGGTGGGAAACCGATTCTGGCTTGGGTTGATTATGATTCTGAATTAAGTGTTATCAGTGTTGTACTTTCCCCAAATTCATCCAAACCCAACACTCCAATCTTGTCCTTTAATGTGGATCTCGCACCCGTTTTTCATGACACTATGTATGTTGGGTTCTCTGCATCAACGGGTTTGCTTGCCAGCTCCCATTACATCTTGGGTTGGAGCTTCAAAATCAATGGACCAGCACCACCCCTTGATCTCTCTTCTCTCCCGATGCTTCCACAGCCAAAGAAAAAGCAGACATCTTTGATAGTTGGGGTTTCAGTCTCAGTTGCTGTTATTGTGTTATTAGCCATCGCCATTGGCATTTACTTTTACAGAAAAATGAGGAACGCCGATGTGATTGAAGCATGGGAGCTTGAAATCGGGCCACATAGGTACTCCTACCAAGAGCTCAAGAAGGCCACCAGAGGCTTCAAGGATAAAGAACTCCTTGGGCAGGGTGGTTTTGGCAGAGTTTACAAAGGAACATTGCCAAACTCCAAGATCCAAGTAGCCGTCAAGCGAGTTTCTCACGAATCTAAGCAGGGACTGAGGGAATTCGTGTCGGAAATTGCCAGCATAGGCCGGCTTCGCCACCGGAATTTGGTTCAATTACTGGGATGCACCACAAGAGTGGTGGGAACATTAGGCTATCTGGCTCCTGAGTTGCCTAGAACAGGAAAGGCAACTACAAGCTCTGATGTTTTTGCATTTGGGGCACTTCTGCTTGAGGTGGCTTGTGGGCGCAGGCCAATTGAGCCTAAGGCATTGCCAGAAGAGTTGGTTTTGGTGGATTGGGTGTGGGACAAGTACAAACAAGGGAGAATACTCGATGTGGTGGACCCAAAACTAAATGGAAATTTTGATGAGAAAGAGGTGTTGGTGGTGTTGAAATTGGGGTTGTTGTGCTCAAATGATGTGCCTGCTGCTAGGCCTAGCATGAGGCAAGTGATGAGGCATTTAGATGGGGAAGTTGAAGTGCCGGAGGACTTGAAAAAACCAGGAGATATAAGTCAGCAGGAGGGGTTTGATGAGTTCTTGCACTCACTTGCATCTTCTTCCTTTGACAAGATGAGTTCAGGCTCTAATTTTGGAAACAGAGACATGGATAGTTTTCTCTCTTTTGCTAATTCACCTCATTCCCTTCTCCACAGAGGAGAAACAAGGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_19576::LG5:9308311-9310311(-)
AAACAACAAGAAGAACCGATCGACAGAGATGAAACATTCCCAAACAGAAGGAGCAGAAATTTTTCTCGTCCCAACAGCAAAAACATCTAGTTTTCTAGTTTCAATTTGGTGTACCCAATGTTCTTTACCCTTTCCATCACGATAGTCGAAACTAGGTCATAACTTGTTTTCTTAATCTTGGTTTAGATTAACACGATAAGATTTAACATATATCTTTTTCTTTTATCTTCTTTTGGATTACCATCATAAGATTTGACGTATGGCATCTACATTGATTGGAGAAGAATCTTCAATAGTCAAGAAGCAAATACAGATAAATAGGTTCTCGATATTGATTTTAAAAATGTTTAAAATAAGTTGGGTTGAATTTTGTGATTTAATTAATTAATTTGTGTATTTCAATTTATATAAGGGTGGGAGATGGGATGGTCCTTTGATTTTATATATAGATATTCTATTTTGAAGGATGGTTTAGTTAAATATTTTGTTTATATACGATGATGTTTTGTAAATTATTATAGATTATTGAGTAGAAGAATATTCTTAAGTGATTTATATTATTTATATCTATTTATGTAGTGAGCCAATTTATAAAGTCATCTAGTTTTATGTTGGCGGATTTGGGTTCACATTTTCAGTTCAATCTTAAACTAGATTTAGCTTAATCCTATAGGTTAAAAGCACTTTAGATTGAGTTAATATTTCCAATCACCTCAAGCCAAATATCAACAAAATAAAGACGGATTAAGTTAGGTTAACTCTTTTTACCCTCTAGTTTTTATATTGTTTTTTTCGTCAAAACTGCTAAAACTTTTTTGTGCATAAGATAATTTTGCTTAAAACCTATGAAACAATTGATTAAACATAAACAATCATATTCATTTCACATGTGGGCGTATAACCATGAAACACCTGTTTCTTCTCCATTAAATTAATAATTGATTGACAAATGATAGCACAACACATCAAACTGCTTCATAACTTCGTAATATTCATAGATATTTGACTTTTTATCTTAATATATAACTGTACTAAAATAAAAGTAATAAATTTATAATTTCTCATCAATTTATGACTATGCAACTACACAATTATATAAAAAAAGTACACACTTATAAATTTGCCCAGTAAAGTGAAAAAGAAAAGGACAGGAAATAAAATATAATTAGAGGTTTCTCGTAAACAAAAAATAGAATCTTTCATTTGTTTCTTTTTCATCTCAATATCTAGAGCATGCAGTAATACTATTGTTACCATGAAAGATGACAGGAAATAGAGTAAATGAAAAATAAATGAATTATCCAGTGAACATTCTTTAGAGAATCTTTGGGTCCTTCCCATTTGAAAATGACAGTACGAAATCCAGAAGATAAAATTATACGAAGCAGCCAAAGGCATTGATGCCCAATTTCCCCACTCTTTTTGTATTTTTTCCGAGTCTTCCTTCCAGATTTTCTACTAAATCGGCTTGATTGAGAAACCCAATTTTTAATTTTTTTAGCATAAAACTAATTTATTTTTTCTATCAGATTTTCACATTTTCCCATATCTCTCTAACCACAAAAATTTGGTGTAGGTGGGTTGGTTCATAATCTTTCCCAATTGCAAAGCCTAGTCACTCTCATGTTTCAACTTTGTTTTTGGGTTAGGGGTGTAAAAGAGGGATGGATGTTCCCTGTCTTGGCTCATGATGCTTCATGTGCTGTTTTTGTACATTTATTGCAAGGGGAGACTTTTGAACCCTTGCAATCCCCAACCCCTAAAGCTTCCACTTTTACTCTATCCTTTATAACTGCTTCTTCATCTTCTCTCATACCATTCCCTCTTTACTCTTTTGCCACCCTATTTCCTCCTCCAAGATCTATTTCACCAACTTTTCTATTCAATAAACAACCTGTTATGCTTTTTTCTTATCTCATTTTTCTCTATACTTCCACTAACTTTGTCATCTCACACTCCCTTCTTGTCTCTCTGATCTTTTGTATATTATCTTGTTCATC


Gene Sequence:
>Vu_19576(-)
ATGACCACCCTTTTGAAATTGTTGTCTCTTTTGGTGTTTCTTCTGATCCCAGTTTCATCCCAGGTTGAGCAGCTTCTCTATGCTGGATTCAAGGATGTGGGTGCTAGCAACCTGACATTGAATGGGGTGGCTGAGATAGAGAAAAATGGAATACTCAAATTGACTAATGAAACCAGCAGGTTAATGGGTCATGCCTTTTACCCATCTCCTTTTCAGATGAAGAACTCCACCACCGGTAAAGTTGTTTCCTTTTCTTCCTCGTTTGCTCTGGCTATTGTTCCTGAGTACCCCAAGCTAGGTGGCCATGGCTTGGCTTTCACAATAGCAACTTCCAAGGATCTCAAGGCTCTACCTAGCCAGTACCTTGGCCTTCTTAATTCCAGTGATAATGGCAACATCTCCAACCATATCTTTGCTGTTGAGTTTGACACTGTGCAAGACTTTGAGTTTGGGGATATTAATGATAACCATGTTGGAATAGACATCAATAGCATGCAGTCCAATAAATCTGCTAATGTTAGTGTGGTGGGTCTCAATCTCAAAGGTGGGAAACCGATTCTGGCTTGGGTTGATTATGATTCTGAATTAAGTGTTATCAGTGTTGTACTTTCCCCAAATTCATCCAAACCCAACACTCCAATCTTGTCCTTTAATGTGGATCTCGCACCCGTTTTTCATGACACTATGTATGTTGGGTTCTCTGCATCAACGGGTTTGCTTGCCAGCTCCCATTACATCTTGGGTTGGAGCTTCAAAATCAATGGACCAGCACCACCCCTTGATCTCTCTTCTCTCCCGATGCTTCCACAGCCAAAGAAAAAGCAGACATCTTTGATAGTTGGGGTTTCAGTCTCAGTTGCTGTTATTGTGTTATTAGCCATCGCCATTGGCATTTACTTTTACAGAAAAATGAGGAACGCCGATGTGATTGAAGCATGGGAGCTTGAAATCGGGCCACATAGGTACTCCTACCAAGAGCTCAAGAAGGCCACCAGAGGCTTCAAGGATAAAGAACTCCTTGGGCAGGGTGGTTTTGGCAGAGTTTACAAAGGAACATTGCCAAACTCCAAGATCCAAGTAGCCGTCAAGCGAGTTTCTCACGAATCTAAGCAGGGACTGAGGGAATTCGTGTCGGAAATTGCCAGCATAGGCCGGCTTCGCCACCGGAATTTGGTTCAATTACTGGGATGGTGCCGCCGCCGTGGCGACCTCCTGCTTGTGTATGATTTCATGGCCAATGGGAGCTTGGACAAGTACTTGTTTGATGATCCAAAGATGGTCCTAAGTTGGGAACACAGGTTCAAGATCATAAAGGATGTTGCTTCAGCTCTTCTGTATCTACATGAGGGGTATGAGCAGGTGGTGATACACAGAGATGTGAAGGCCAGCAATGTTCTGCTGGATTTTGAGCTTAATGGAAGACTAGGTGATTTTGGGTTGGCAAGATTGTATGAACATGGGGCTAACCCAAGCACCACAAGAGTGGTGGGAACATTAGGCTATCTGGCTCCTGAGTTGCCTAGAACAGGAAAGGCAACTACAAGCTCTGATGTTTTTGCATTTGGGGCACTTCTGCTTGAGGTGGCTTGTGGGCGCAGGCCAATTGAGCCTAAGGCATTGCCAGAAGAGTTGGTTTTGGTGGATTGGGTGTGGGACAAGTACAAACAAGGGAGAATACTCGATGTGGTGGACCCAAAACTAAATGGAAATTTTGATGAGAAAGAGGTGTTGGTGGTGTTGAAATTGGGGTTGTTGTGCTCAAATGATGTGCCTGCTGCTAGGCCTAGCATGAGGCAAGTGATGAGGCATTTAGATGGGGAAGTTGAAGTGCCGGAGGACTTGAAAAAACCAGGAGATATAAGTCAGCAGGAGGGGTTTGATGAGTTCTTGCACTCACTTGCATCTTCTTCCTTTGACAAGATGAGTTCAGGCTCTAATTTTGGAAACAGAGACATGGATAGTTTTCTCTCTTTTGCTAATTCACCTCATTCCCTTCTCCACAGAGGAGAAACAAGGTGA