Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19496 LG5 7777642 7778922 PREDICTED: dof zinc finger protein DOF2.4-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 7777719 intron_variant
C/T 7777819 intron_variant
G/A 7778008 missense_variant p.Gly67Ser
T/C 7778172 synonymous_variant p.Arg121Arg
G/T 7778176 missense_variant p.Gly123Trp
G/A 7778265 synonymous_variant p.Ala152Ala
G/T 7778315 missense_variant p.Gly169Val
T/C 7778346 synonymous_variant p.Leu179Leu
T/C 7778352 synonymous_variant p.Gly181Gly
G/A 7778364 synonymous_variant p.Pro185Pro
A/G 7778640 synonymous_variant p.Ser277Ser
C/T 7778653 missense_variant p.Pro282Ser
T/G 7778739 synonymous_variant p.Ser310Ser
C/A 7778805 missense_variant p.Asn332Lys
T/A 7778820 missense_variant p.Asp337Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19496.1
MVYTSIPAYIDPANWQQQHPNHQQQPNNTAVSSHLILPPPIQPPPPPPPSQPHGLGGSATAGSIRPGSMADRARMANIPMQEAQQKCPRCDSSNTKFCYFNNYSLSQPRHFCKACRRYWTRGGALRNVPVGGGCRRNKRSRGSSGSSARSPANSDRQTASAGSASTTSGSSSADMVAGLGGTGVPSSLRFMAPLHHLGDHHLGGGGGGGGGGGEIGLNYGLNYGSISGPMGGIGDLNFHIGNALNGGGGSVLSGLDQWRMPQTHQFPFLSGLEASSSHGLYPFDGASGSDGYGGTPIKVSTSGVMSQFASVKMEDNHQELGLPRQFLGVNNNPNTNDQYWSGGAGAGAGATSAWTDLSAFSSSSTTSNPL*


CDS Sequence:
>Vu_19496.1
ATGGTTTATACTTCCATCCCAGCATATATTGATCCAGCCAACTGGCAGCAACAGCACCCAAATCATCAGCAGCAACCCAACAACACTGCTGTCAGCTCCCACCTTATTCTTCCACCACCAATACAACCGCCGCCGCCGCCTCCACCATCGCAACCCCATGGACTCGGTGGTAGTGCCACTGCCGGCTCCATCAGGCCCGGTTCCATGGCGGATAGAGCCAGGATGGCCAACATACCCATGCAGGAAGCTCAACAGAAGTGTCCAAGATGTGACTCCAGCAACACAAAGTTTTGCTACTTCAACAACTACAGCCTCTCTCAGCCCCGCCACTTCTGCAAGGCTTGCAGAAGGTACTGGACTCGTGGCGGGGCCTTGAGGAACGTCCCTGTTGGTGGCGGCTGCCGGAGGAACAAGAGGAGCAGAGGAAGCTCCGGCAGCAGCGCCAGGTCGCCTGCGAACTCGGATCGCCAAACGGCGAGTGCCGGCTCCGCTTCCACAACCAGTGGCTCCTCTTCTGCTGACATGGTGGCAGGCCTTGGCGGTACCGGAGTGCCGTCGTCTCTTAGATTCATGGCTCCATTGCATCATCTTGGCGATCACCACCTCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAGGAGAGATAGGATTAAACTATGGTTTGAACTATGGGTCGATTTCAGGTCCAATGGGAGGAATAGGGGACTTGAATTTCCATATTGGAAACGCTTTGAATGGTGGTGGTGGTTCTGTGTTGTCTGGTTTGGACCAATGGAGGATGCCACAAACTCACCAATTTCCCTTCTTGTCTGGTTTGGAAGCTTCTTCATCACATGGGTTGTACCCATTTGATGGTGCTAGTGGTAGTGATGGCTATGGTGGCACTCCCATTAAGGTTTCGACTTCTGGGGTGATGTCTCAGTTTGCTTCTGTCAAAATGGAAGATAATCATCAGGAACTTGGTTTGCCTAGACAGTTCTTGGGAGTCAACAATAACCCTAATACAAATGATCAATATTGGAGTGGTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTACTTCTGCTTGGACTGATCTTTCTGCTTTCAGCTCTTCTTCCACTACTAGTAATCCCCTATAG


Promoter Sequence:
>Vu_19496::LG5:7775642-7777642(+)
ACGTGAGAATCAAACATTCGGACATAAGTTATCATTTCATAAGGGAAAAATTGAAATATAAAGACATCATCACTAAATTGTCAACTCTAATATTCACAAAATATAAGAAAACCAATAATTAATTATATTTCCAACAAGTTAAACACATAAAAATAATATATTTTAGTTTAAAGCTATAATTATACAAATAAGTAGTTAATTTTATATAATCATAAATATATATGATAATGTATTAATTGAAACATTTTTATTTCTTCCTGTATCATATATTTATTATTAGAATATATTAAATTTCTTCTATTTTTTATTATTTTTTCAATATAAGTAAAATACTGTATTGTCTCGTAATCGCAATTTCATTCTAAGGTTTTTCTCTTCCTTAGAATTTAGCACCTTTGTCAAATTTATTCTCTTCGCCACATTTGTTAATATTTTGATATTCTAGATACATGTGAATTAAAAAACAATTTATTTTATATGTTTTGAAATAAACTTATAAACTCTGAAAATATAAACTCAAATAAATTATATTTAAAAAAATATTAATTTTTAAATAAATTTTTACTCTGAAATATAAGTCCAGAAAATAAAACTTAAATATAAGTTTAAACAAATAGTAGTCAAAACATATAGTTAACGGATAGTAAATTTATCTATCCTTAATCCATTTTACGGATCCAAGGGTCGAAAGTTTTTTTTTTCAACCCTAATTATGTTTAACCATTACGTCGATTTATTAGGTTATGGTCTTATCAGAGTTGAACTTAACTGAATTTCATTCTTGTATACATAACTGAAAATGAGAATAATAAAAAAAATATAAAACATATTTTTAATTTCTAAATTTTGATAAAATTTGTTTTTTTTATAAAACTTTTGATATATTTTAGTTTTCAAATTTAAAAAATAAATGAATAAAGTTATTTTTATCTAATTAAGTTAAATGTTTTAGAGGTGTGAAATGTATTTTATATTAAGATAATTAGATTACACGTTATTGCTTCATGTCTGTTAAAAAACATTTAACAGGTTAAAAAGTTTAAGATAATTAGATTAAAAGATAATTTGTTTTTAAAGTTTAAAAATTAAAATATATAAAAGAATTTCTACATAAAAAAAAATTCACCTTAAAATTGAAAAACTAAAAACGTTAAAAGGAAAGTGTAAACAGTTAGTTTTGGATGATTGGCCTCCCTCTAAGGTACTCTGGGACATTGGACATATGAGTTTTAGTGGATGTTGTGATGTGGCGCGTGAGATGCAAGGATAAATGTTTCCATGCAAAAAGAAAGAGGAGTGGGGAAGGGAACAGACCTGACCAAGAAAAGGTTCACTCGGTCGGGACACACTAAAGCACAAATGGACACCTTTTCTTTTTTTCAACCCAATATAAAAAAAAACTTACACATTATTTCTTTACCATAATCTATCATTCATTCACCAATAAACTAATCTTATATATATTTTATTTATAATACAATCATAATTAAAGTTTCCTTTGCCCATTCCACACCAAATTCCTACTATACTATCATGAATCTACGGCTGTCTGGCTAGGCTGGTTAGCACACATGACATATCAGACTCAACACTTAGCTTTTTTTCATGCACAATAACATAGTATCTCTTTTTTCTAACCACACTGCTTACAGAGCGTCAAAAAGAAGCTTATGGGTTAAGAAACATCGCCTTCTCAAAATCCTGAAAAGCAAAAAAACAAAAAGAGTGCTATCGGGGGGGAATTCAACAACAAACTAAAATTATATATAAATACTCAAAAGCACTTCCTTTATTTTTGCTTCTCATTACCTCTTCTCCCAAACCCTTCCCTCTCTTCTTTCTTTCTTTTGCTTTCTCTCTTTTCCTTTCTCTCTTCTATGCATCAACCATTCTCTCTCTCTCTCTCTAACTGTTTGATGTGATTATTCTCTCCACTTGTATTTCCTCCCAAAAAATTAAACCATCAACCTTTACAAAAGAGAAAGCTCCGAGAGGAACCA


Gene Sequence:
>Vu_19496(+)
ATGGTTTATACTTCCATCCCAGCATATATTGATCCAGCCAACTGGCAGCAACAGGTAAAAATATTCAAGGGTTCTTCCGTTTGCTTCTTTCTCATTTAATTTCTCAGTTCAAAAGGCAAAATTCAAAAGATACATATTCTTCCTACACTTTTGTTTATACCCTTCTCCTGAATATACCACATATTTGATTTCTTTGCTCCTTCCAACTTTATGTTACTGCAGCACCCAAATCATCAGCAGCAACCCAACAACACTGCTGTCAGCTCCCACCTTATTCTTCCACCACCAATACAACCGCCGCCGCCGCCTCCACCATCGCAACCCCATGGACTCGGTGGTAGTGCCACTGCCGGCTCCATCAGGCCCGGTTCCATGGCGGATAGAGCCAGGATGGCCAACATACCCATGCAGGAAGCTCAACAGAAGTGTCCAAGATGTGACTCCAGCAACACAAAGTTTTGCTACTTCAACAACTACAGCCTCTCTCAGCCCCGCCACTTCTGCAAGGCTTGCAGAAGGTACTGGACTCGTGGCGGGGCCTTGAGGAACGTCCCTGTTGGTGGCGGCTGCCGGAGGAACAAGAGGAGCAGAGGAAGCTCCGGCAGCAGCGCCAGGTCGCCTGCGAACTCGGATCGCCAAACGGCGAGTGCCGGCTCCGCTTCCACAACCAGTGGCTCCTCTTCTGCTGACATGGTGGCAGGCCTTGGCGGTACCGGAGTGCCGTCGTCTCTTAGATTCATGGCTCCATTGCATCATCTTGGCGATCACCACCTCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGAGGAGAGATAGGATTAAACTATGGTTTGAACTATGGGTCGATTTCAGGTCCAATGGGAGGAATAGGGGACTTGAATTTCCATATTGGAAACGCTTTGAATGGTGGTGGTGGTTCTGTGTTGTCTGGTTTGGACCAATGGAGGATGCCACAAACTCACCAATTTCCCTTCTTGTCTGGTTTGGAAGCTTCTTCATCACATGGGTTGTACCCATTTGATGGTGCTAGTGGTAGTGATGGCTATGGTGGCACTCCCATTAAGGTTTCGACTTCTGGGGTGATGTCTCAGTTTGCTTCTGTCAAAATGGAAGATAATCATCAGGAACTTGGTTTGCCTAGACAGTTCTTGGGAGTCAACAATAACCCTAATACAAATGATCAATATTGGAGTGGTGGTGCTGGTGCTGGTGCTGGTGCTACTTCTGCTTGGACTGATCTTTCTGCTTTCAGCTCTTCTTCCACTACTAGTAATCCCCTATAG