Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19455 LG5 6821735 6824086 PREDICTED: putative receptor protein kinase ZmPK1
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A,* 6822149 downstream_gene_variant
C/T 6822746 synonymous_variant p.Arg447Arg
G/A 6822773 synonymous_variant p.Asp438Asp
G/T 6823218 missense_variant p.Pro290His
T/C 6823760 synonymous_variant p.Gln109Gln
T/G 6823833 missense_variant p.Asn85Thr
T/G 6823834 missense_variant p.Asn85His
C/G 6823835 missense_variant p.Glu84Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19455.1
MASSILLFLFLQFFSLHTSHSAFSSLTTDSSLSVEKPDDVILSPNGVFSAGFVAVGENAYSFAVCFTQTGSHNHPTIVWMANRENPVNGKRSKLSLSGAGNLVLDDAAQRTVWSSNTASLASPLLHLRDDGNLVLRDLQGTVLWQSFDFPTDTLLPGQPLTRRTQLVSARSDTNHSSGFYKLFFDDDNVLRLLFDGPDVSSVYWPYPWLVSWDAGRSTYNSSRSAVMDSLGRFISTDSFTFITSDYGAMKQRRLKLDSDGNLRVYTLHDGWFVSWQARGDPCNIHGICGPNSACSNDHEHGRKCSCLPGHRIKNHSDWSYGCEPVFVLSCNRSESAFLELLGVEIYGYDANFSEGNSYSHCENLCLEDCNCKGFQYSYNDAKNYYNCYIKMQLLNGRRSPSFRGTVYLKVPKNHSLFREESFRSNEHVCVVQIPRVYDKYHVKKIVRFFLWVAIVIGAIESVCVFVVWVFIVKTRRKSHADEHDYHPLTDRFRKYSYSELKKATKGFSEEIGRGAGGVVYKGILSDERHAAIKRLNEAEQGEGEFLAEVSIIGRLNHMNLIQMWGYCAEGKHRLLVYEYMENGSLAQNLSSNTLDWKSYNGRVVAWVREKKRGISWLEHIIDPAIQTNYDESKMEVLVKVALDCVEEDKDIRPTMSQVVEMLQSVPQ*


CDS Sequence:
>Vu_19455.1
ATGGCTTCCTCAATCTTACTCTTTCTTTTCCTACAATTCTTCTCTCTGCACACTTCACATTCTGCATTTTCATCACTCACCACGGACTCATCCCTCTCGGTAGAGAAACCCGACGACGTTATTCTCTCCCCAAACGGCGTTTTCTCCGCCGGCTTCGTTGCCGTCGGTGAAAACGCCTACTCTTTCGCCGTATGCTTCACACAAACCGGTTCCCACAACCACCCCACAATCGTGTGGATGGCGAACCGGGAGAACCCCGTCAACGGAAAACGTTCCAAACTCTCTCTCTCAGGAGCCGGTAACCTTGTCTTGGATGATGCTGCTCAACGAACGGTGTGGTCTTCGAACACTGCTTCGTTGGCTTCACCACTGTTGCATCTCAGAGACGATGGCAATCTCGTGTTGCGTGACCTCCAAGGAACCGTTCTGTGGCAAAGCTTTGATTTTCCCACCGATACTCTTCTTCCGGGACAACCCCTCACCAGACGCACGCAACTCGTGTCTGCAAGAAGCGACACTAACCATTCCTCCGGTTTCTACAAGCTCTTCTTCGACGATGACAACGTTCTTCGTCTTCTCTTCGATGGCCCTGATGTTTCCAGCGTTTACTGGCCATATCCATGGTTGGTGAGTTGGGACGCTGGAAGGTCTACTTACAATAGCAGTAGATCGGCAGTAATGGACTCACTCGGAAGATTCATTTCAACTGATAGTTTTACTTTTATTACATCTGATTATGGCGCTATGAAGCAAAGAAGATTGAAACTTGATTCTGATGGTAACCTTAGAGTGTATACACTGCATGATGGATGGTTTGTTTCGTGGCAAGCGAGAGGTGACCCTTGCAATATCCACGGGATTTGTGGACCTAACAGTGCGTGCAGTAATGATCATGAGCATGGAAGGAAGTGCTCGTGTCTTCCGGGACATAGAATCAAGAACCATAGCGATTGGTCTTATGGCTGTGAACCTGTGTTCGTTTTGTCTTGCAACAGAAGTGAGTCTGCCTTCTTGGAGTTGCTGGGTGTTGAGATTTATGGTTATGATGCTAACTTTTCTGAAGGTAATAGTTATAGTCACTGTGAGAATCTGTGCTTAGAAGACTGTAACTGTAAGGGGTTTCAGTACTCATACAATGACGCCAAGAACTATTACAATTGTTACATCAAGATGCAATTGCTTAACGGGCGCCGATCACCGAGTTTCAGAGGAACAGTATACTTGAAAGTGCCTAAAAATCATAGCCTTTTCAGGGAAGAATCGTTTCGTTCAAATGAGCATGTTTGTGTTGTTCAAATTCCCAGGGTGTATGACAAATATCATGTAAAAAAGATTGTGAGGTTTTTTCTTTGGGTGGCCATTGTAATTGGTGCTATTGAATCGGTTTGCGTTTTTGTCGTGTGGGTTTTCATAGTTAAGACGCGCCGAAAGTCTCATGCAGATGAACACGATTACCATCCTCTGACCGATAGATTCAGAAAATATAGTTATTCAGAGTTGAAAAAGGCGACAAAGGGGTTCAGTGAAGAGATCGGAAGGGGTGCGGGAGGGGTTGTGTACAAAGGTATTTTATCAGATGAAAGACATGCAGCAATTAAGAGACTGAATGAAGCTGAACAAGGAGAAGGAGAATTCCTTGCTGAAGTGAGCATCATTGGAAGGCTTAACCACATGAACTTGATTCAAATGTGGGGATATTGTGCTGAGGGAAAGCATAGATTGTTGGTGTATGAATATATGGAGAATGGTTCTTTGGCACAAAATCTGTCATCCAACACTCTTGATTGGAAGTCGTACAATGGAAGGGTGGTGGCATGGGTGAGAGAAAAAAAGCGTGGAATATCTTGGCTAGAGCATATCATTGATCCTGCAATCCAAACAAACTATGATGAATCTAAGATGGAGGTTTTAGTCAAAGTGGCTTTGGACTGTGTTGAGGAAGACAAAGATATAAGGCCAACCATGAGCCAAGTCGTGGAAATGCTTCAAAGTGTTCCTCAGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_19455::LG5:6824086-6826086(-)
CTTCTCCATAGGAAATTCCATATTCATTGGTCCAAATCTGTGGATTATGAATTCAACACCAACGACTCGATGAAAAAGACTTGAAGTTGGCCAATTTAATATAGTGCGCAAGTCATTTTGTAACGTACACGGCATTGAAAACTCTACTAATATTCATTATGCAAGGACCACGACAAAAAAAAGCAATGACGAACTTTTAACAATTCACACTTTAGTCTAATGGTAATAGTTTTTGTTCAGTACTCATGTTCAAAATTCATTTTTTCTTAATTTAATTATGTTTTAAGTTTTTCACAAATTCTAAAATTTATATTTTTCAATTGAATTATTGTCATTAGTTATTGTTTTCTTGGGTGGCATAAATATTATCTTGTCATTATTCAAAACTAACATTATTCAGTTTAAGATATTTATATTAATTGATTTTGACATTTAAAAGTACACTAATTTAATAAGTTATTTGTTGTGTACAAATAATTTAATTTTACTAAGTTCTATACTAGACACTCATTTCAATGTACATTTAACTTTTACAGAATGATTGGCTTATTCGAGATTGCAGGGAACACATATCGTCTCTAGAAAGAAGTTGTAGTTCTTGCGCCAATTATAAATAGTTAATATTTCAGACTATTGAAATACAATTATATAGTTTATGATACTTTATGATTTAACTTATGGGGCTCGTGTCAACTTGGTAGCTTTGAGTGCGAATATCATGCGATTAGGTACATGTAAAAAGTTATATCCACAAACATTGTTGACTTATAAAATTTGGTAACGTGAACATTTTATATCTAAAATTTAAGTATTTGTCATTATAAGTTGGCTTAAATTGTTCTTTGTCTAGATATTCGATAACATGTTTCCAATTAAACAAGAGGTCCTAAAGGATGTTCGTGAGTAGTGGATTGCATTTATTTTAAATGTTTATATATGATATTAGGTAAATATTAAATGTATTCATTATACATTGAGATTAAGTATTATTTGATGTGTAAATAATAGGAAGAGTTGTGATTATTTTGTTCCTTGTATATATATCTAGACTATCAGGGGATTTAATTTTATGAAGGTTTGTATGTGGTAAGTAGCACATATAGACCTAGTATTGAAAAAAAAAACGACACTTTTTATACTAATTAGTGTTAAAATAGGTATAAAAAGTGATCTTTTATATTTGTTGTAACACTAATAATATAAAAATTACGTTCTTTATATTGATTTTGGTTTTAACCGGATTAAAAAGTCAAATTTTTATACCAATTAACGCTCTAACCAGTATAAAAAATTTGTATTATATATAAATTTATTTCTTTTCTAGCAAACTTTTTATACCAATTTCAAAATCGATATAAAAATTTGACTTTTTATATCACTTTTGGAATCATTATAAGAAGTATAATTTTTATATTGATTTTATGATTACTATAAAATCTAGTGCTTTCTATAGCTCGTATATATAAAACTTTTTAATAGGTATAAAAAACTTTTTTTTCAATGTTGCATCAAGATCAATAGCTGATTTCTTTTGTGCGATATTGTTTAAATGTATGTAATCTTTATGAGTAATTTTAAATGCTAAAGACATCTATCTACGTGGCTTAGAAAACAAACGAACGAGGAAATTAATAACTTATTTCAATAAAGAATAAATTAGGATTAGTTTCCCCGTTCACTCTGTGCTTTCAGAAATTCTTCCTAGATTCCAAATGGAGAATAATTTAATGAAAAATGATATTTTTACACCCCTAAGAAATACTCCCACTAGATAACCCACTTAAATATATAATAATGTATATTAAAATATAAAGTTAAAAAGATAAAATAAATATAATTAAAATATTATTATTTTTAATTGCTAAGTGGAATCTTTTTTGTTTGATGGTGTGAAATTTCTGGAGTGTTTCCAAATTCCGTAGACCAGTTCGTCAACGAAACCAGTTTTATATAGAGCATCCATCAACACTCCACAAAACACATCGTTTACATGGTTGAAC


Gene Sequence:
>Vu_19455(-)
ATGGCTTCCTCAATCTTACTCTTTCTTTTCCTACAATTCTTCTCTCTGCACACTTCACATTCTGCATTTTCATCACTCACCACGGACTCATCCCTCTCGGTAGAGAAACCCGACGACGTTATTCTCTCCCCAAACGGCGTTTTCTCCGCCGGCTTCGTTGCCGTCGGTGAAAACGCCTACTCTTTCGCCGTATGCTTCACACAAACCGGTTCCCACAACCACCCCACAATCGTGTGGATGGCGAACCGGGAGAACCCCGTCAACGGAAAACGTTCCAAACTCTCTCTCTCAGGAGCCGGTAACCTTGTCTTGGATGATGCTGCTCAACGAACGGTGTGGTCTTCGAACACTGCTTCGTTGGCTTCACCACTGTTGCATCTCAGAGACGATGGCAATCTCGTGTTGCGTGACCTCCAAGGAACCGTTCTGTGGCAAAGCTTTGATTTTCCCACCGATACTCTTCTTCCGGGACAACCCCTCACCAGACGCACGCAACTCGTGTCTGCAAGAAGCGACACTAACCATTCCTCCGGTTTCTACAAGCTCTTCTTCGACGATGACAACGTTCTTCGTCTTCTCTTCGATGGCCCTGATGTTTCCAGCGTTTACTGGCCATATCCATGGTTGGTGAGTTGGGACGCTGGAAGGTCTACTTACAATAGCAGTAGATCGGCAGTAATGGACTCACTCGGAAGATTCATTTCAACTGATAGTTTTACTTTTATTACATCTGATTATGGCGCTATGAAGCAAAGAAGATTGAAACTTGATTCTGATGGTAACCTTAGAGTGTATACACTGCATGATGGATGGTTTGTTTCGTGGCAAGCGAGAGGTGACCCTTGCAATATCCACGGGATTTGTGGACCTAACAGTGCGTGCAGTAATGATCATGAGCATGGAAGGAAGTGCTCGTGTCTTCCGGGACATAGAATCAAGAACCATAGCGATTGGTCTTATGGCTGTGAACCTGTGTTCGTTTTGTCTTGCAACAGAAGTGAGTCTGCCTTCTTGGAGTTGCTGGGTGTTGAGATTTATGGTTATGATGCTAACTTTTCTGAAGGTAATAGTTATAGTCACTGTGAGAATCTGTGCTTAGAAGACTGTAACTGTAAGGGGTTTCAGTACTCATACAATGACGCCAAGAACTATTACAATTGTTACATCAAGATGCAATTGCTTAACGGGCGCCGATCACCGAGTTTCAGAGGAACAGTATACTTGAAAGTGCCTAAAAATCATAGCCTTTTCAGGGAAGAATCGTTTCGTTCAAATGAGCATGTTTGTGTTGTTCAAATTCCCAGGGTGTATGACAAATATCATGTAAAAAAGATTGTGAGGTTTTTTCTTTGGGTGGCCATTGTAATTGGTGCTATTGAATCGGTTTGCGTTTTTGTCGTGTGGGTTTTCATAGTTAAGACGCGCCGAAAGTCTCATGCAGATGAACACGATTACCATCCTCTGACCGATAGATTCAGAAAATATAGTTATTCAGAGTTGAAAAAGGCGACAAAGGGGTTCAGTGAAGAGATCGGAAGGGGTGCGGGAGGGGTTGTGTACAAAGGTATTTTATCAGATGAAAGACATGCAGCAATTAAGAGACTGAATGAAGCTGAACAAGGAGAAGGAGAATTCCTTGCTGAAGTGAGCATCATTGGAAGGCTTAACCACATGAACTTGATTCAAATGTGGGGATATTGTGCTGAGGGAAAGCATAGATTGTTGGTGTATGAATATATGGAGAATGGTTCTTTGGCACAAAATCTGTCATCCAACACTCTTGATTGGAGTAAGAGATATAACATTGCCCTTGGAACTGCAAGAGTTCTGGCATATCTTCATGAAGAATGCTTGGAGTGGATTTTGCACTGTGATATAAAGCCACAGAACATACTTCTTGACGCTAATTATCAACCCAAGGTAGCAGATTTTGGCCTGTCGAAGCTACAAAACAGGAACAACGTGAACAATTCAAGTTTTTCAATGATAAGAGGAACAAGAGGGTACATGGCACCTGAGTGGGTTCTGAACTTAGCAATCACCTCGAAGGTTGATGTTTACAGCTATGGAATTGTTCTATTGGAGATGATAACTGGGAAGAGCCCAACAACGGGTGTTCAAAACATTGATGGAGAAGAGTCGTACAATGGAAGGGTGGTGGCATGGGTGAGAGAAAAAAAGCGTGGAATATCTTGGCTAGAGCATATCATTGATCCTGCAATCCAAACAAACTATGATGAATCTAAGATGGAGGTTTTAGTCAAAGTGGCTTTGGACTGTGTTGAGGAAGACAAAGATATAAGGCCAACCATGAGCCAAGTCGTGGAAATGCTTCAAAGTGTTCCTCAGTAG