Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19453 LG5 6770770 6773148 PREDICTED: putative receptor protein kinase ZmPK1
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 6771457 missense_variant p.Glu564Asp
T/C 6771557 missense_variant p.His531Arg
T/A 6771708 missense_variant p.Ser481Cys
A/G 6771806 missense_variant p.Val448Ala
T/C 6772146 missense_variant p.Arg335Gly
T/G 6772413 missense_variant p.Asn246His
T/A 6772418 missense_variant p.Tyr244Phe
T/A 6772437 missense_variant p.Asn238Tyr
A/T 6772745 missense_variant p.Leu135Gln
G/T 6772943 missense_variant p.Pro69His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19453.1
MGFSISLFFLLLPLSFQSSSSLSSLNKGSSLSVEKQAQHFILSPNQMFCAGFFQVGENAFSFGIWFNDPHSHNPINVVWMANRDQPVNGKLSKLSLLNSGNIVLVDAGQITTWSSKTESHAPVKLHLQDDGNLVLDEPQGTILWQSFDFPTDTLLPDQPLTRFTQLVSSRSFTNHSSGFYKLLFDDNNVLSLIYDGPDVSSTYWPPPWLLSWQAGRFNYNSSRVAVFNSLGSFLSSDNYAFSTYDNGTVMPRRLTLDSDGNVRMYSRNEALKKWYVSWQFIFDTCSIHGICGANTTCSFDPERGRRCSCLPGYRVKNRSDWSYGCEPLFDITCNRNESTFLEIQGVELYGYDHNFIQNSTYMNCLNLCLQDCNCKGFQYRYDEGQGFSCYTKLQLRNGRHSPGFSGTISLRLPKGNNFSKEESVRAEDHVCLVQLQKGYVTKPENRYVRFFLWFATAVGVLELICLSMVWGFLTRTRQKSSADQQGYHVAAVGVRKYSYSELKKATKGFSEEIGRGGGGVVYKGILSDERHAAIKRLNEAKQGEGEFLAEVSIIGRLNHMNLIEMWGYCAEGKHSIDGEESYNGRLVTWVKEKRSGTYSSWLEQIINPAIETNYNKFKMDLLVTVALACVEESKDLRPTMSQVVEMLQSHESNPKS*


CDS Sequence:
>Vu_19453.1
ATGGGTTTCTCAATCTCACTCTTTTTCCTTCTCTTGCCTCTTTCTTTTCAGTCTTCATCTTCCCTCTCCTCGTTGAACAAGGGGTCCTCTCTCTCAGTGGAGAAACAAGCACAACACTTTATTCTCTCACCTAATCAAATGTTTTGTGCTGGTTTCTTTCAAGTTGGCGAAAATGCTTTCTCCTTTGGCATATGGTTCAACGATCCTCACTCTCACAACCCCATCAATGTGGTTTGGATGGCAAACCGTGATCAACCCGTAAATGGGAAGCTCTCAAAGCTTTCTCTTTTGAACAGTGGTAACATCGTCTTGGTTGATGCTGGTCAAATCACCACTTGGTCATCAAAAACAGAATCACATGCCCCAGTAAAGTTGCATCTCCAAGATGATGGTAATCTTGTGCTAGATGAGCCCCAAGGAACCATTTTGTGGCAAAGTTTTGATTTTCCAACGGATACTCTGCTTCCTGATCAACCTCTTACCAGATTCACACAACTTGTGTCTTCAAGAAGCTTCACAAATCATTCCTCTGGCTTCTATAAGCTGCTATTTGACGATAACAATGTTCTTAGTCTCATTTATGATGGCCCTGATGTTTCAAGCACATACTGGCCTCCCCCTTGGCTACTCAGTTGGCAAGCTGGAAGATTTAATTACAATAGCAGCAGAGTTGCAGTGTTCAATTCTCTTGGCAGTTTCCTTTCATCAGATAATTATGCTTTTTCCACCTATGATAACGGCACGGTTATGCCCAGAAGATTAACACTGGACTCTGATGGTAACGTTCGTATGTACTCTAGAAATGAGGCTTTGAAGAAATGGTACGTTTCCTGGCAATTCATATTTGATACTTGCAGCATTCATGGGATTTGTGGAGCTAACACCACTTGCAGCTTTGATCCTGAAAGGGGAAGGAGATGCTCGTGTTTACCGGGATACAGAGTGAAAAACCGTAGTGATTGGTCTTACGGGTGTGAACCCTTGTTTGATATTACTTGCAATAGAAATGAGTCTACCTTTTTAGAGATACAGGGCGTTGAGTTATATGGCTATGATCATAATTTTATCCAAAACAGTACGTACATGAACTGTTTGAATTTGTGCTTGCAAGATTGTAACTGCAAAGGGTTTCAGTATAGATATGATGAGGGGCAAGGATTTAGCTGCTACACAAAGTTACAGTTGAGGAATGGAAGGCATTCACCAGGATTTAGTGGAACAATTTCGCTGAGACTGCCAAAAGGAAATAACTTCTCCAAGGAGGAATCTGTGAGAGCAGAAGATCATGTTTGTTTGGTGCAGCTTCAAAAGGGCTATGTTACAAAACCAGAAAATCGTTATGTGAGATTCTTTTTGTGGTTTGCTACTGCAGTTGGAGTTTTAGAATTGATTTGTCTTTCCATGGTTTGGGGTTTCTTGACGAGGACGCGCCAAAAGTCTAGTGCAGATCAACAAGGGTACCATGTTGCTGCAGTGGGAGTTAGAAAATATAGTTATTCAGAGTTGAAGAAGGCGACGAAGGGGTTCAGTGAAGAGATTGGAAGGGGTGGAGGAGGGGTTGTGTACAAAGGTATTTTATCAGATGAAAGACATGCAGCAATTAAGAGACTGAATGAAGCTAAACAAGGAGAAGGAGAATTCCTTGCTGAAGTGAGCATCATTGGAAGGCTTAACCACATGAACTTGATTGAAATGTGGGGATATTGTGCTGAGGGAAAGCATAGCATTGATGGAGAAGAATCATACAATGGAAGGTTGGTAACATGGGTGAAAGAGAAAAGGAGTGGCACCTACTCCTCTTGGCTGGAACAAATCATTAATCCTGCAATTGAAACAAACTACAATAAATTTAAGATGGACCTTTTGGTTACAGTGGCTTTGGCTTGTGTTGAGGAAAGTAAAGATTTGAGACCCACCATGAGTCAAGTTGTCGAAATGCTTCAAAGCCATGAAAGTAACCCTAAATCATAA


Promoter Sequence:
>Vu_19453::LG5:6773148-6775148(-)
GCTACATTCAATTGAAGTATGGTCAAAAAATGGTATATACAAGACATCGAAAATTCCTTCTTTAGAATCACCCTTACCACTGTAGATTGAAAAAAACATTTAATGAAATTGTTAAGGATGATGTTGTATCCAAACCCTGCTATGGTAAAGAAGTGTACAACGAAGTTGAAAAGATTGACATTGTCTTCAGAAAACATCAAAAAAAGACCATTGAGAAAAACATTTTGGAAGAAACAATCAATATTTTTTAATCTTCCATATTAGTGTAAACTTGATGTACAACATTATATAGATGTGATGCATGTTGGAAAAAATGTTTGTGATTGTGTCATCGAAACTTTATTAAACGTCAAAGGGAAGACCAAAGAGGGAATAAAAGCAAGACAAGATTTGGCTGACATGAGAATTCGTTCTAAGTTACATCCACAATCAATTGGAAGACGCACATATCTGCCCCCAACTTGTCACACTCTTTCTAAAAAAGAAAAACAAAGTTTTTTTTAAGTCTTTAAGTAGTGTGAAGGATCTACAAAGTTATTCTTCAAATATTAGTAACCTTGTTTTTATGCAAGAGATAAAGTTAATTGGTTTAAAGTCTCACGATTGTCATGTATTGATGCAAAAATTGTTACCAATTGTTATTCGAGGCATATTACCCACTTCTGTTAGAGGTATTGTGACACATCTGAGTTTGTTCTTTAATGTCATTTGAAGGAAAGTTGTTGACCCTCTAGTTTTAGATGATTAGGAAAATAAAGGAATCAGACTATTGTGCAACTTAGAAATGTATTTTCCACCTTCTCTTTTTATATCATGATTCATTTGATTGTTCGTCTAGTCAGAGAAATTTGGATATATGGACCGGTATTCTTAAGGTGGATGTACCTTGTTGAGAGATACATGAAAATCTTAAAACAACTTGAAACAATTGAGGTTAACCCAACACAACCTAACCTAGGTTTAACACAACTTGAAACAACTTGTCTTAATCCACCTGAGTTTACTCAAACTATAATCAACCTAAATTAAATCGAGCCAAACTTAAGTCTGACCCAACTCAACATAACTTGAGTTTGACCCAACTTAACTTAAGTTTGACCCAACTTAACCTAAGTTTGATTCGACTAATCTTTACCTTATTTAGACTCAATCTTATTTGATGTGATTTATGTTCAACTCGACCAAATTGACATCCTCCTAACCTAACTTAATTTGAGCTTGACGTGACCATGACTATAGTAACTTGAGTTTGAATTTGGATTGAGTAAATATGTTTCACATGCATAACAAACTTTTGAATAACTTATTAATTGCCATTCTTAAGAAAAAATGTACTTTAAAAATTGGTTTATTTGTTATCTCTATAACAAAAGACTTTATAAACCATTTTTTATCATTTCGGTCTTATGACCTTTGTCACTTTTTGTCATATTAACTTCATTTTAACATGATCCATAAGTTGGGTCAATTTAACGGACTAATTTTCATTTATGAAAGTAGGTGTGACAAGAGTTTACTTTATATAATATGTATTTTGAGGCAATTATTATACTCTGTCCTTAGACGCGTCAACTATTGCTATTTGTAACTGAGTATGACTTTGTAATGGATTACGACTTGGCGGCTAAAATTTACCAAATGATGCTATTATTTTATTTGTAATATTTAAATCTTCACATATGCACAAAATTTTATATTCCTTTCTTAATGTTTATATTATTTTATATATAGTTTCTTTTTTCATGGTTTCCTTCATCCATTTTTACTTTTAAAAAATCTATTAGCATTCTTTATTTCCCTTTCCCACCACATGTTATCCAGATAAGAGAGCGTGTACAATTTCTTTTCTTAAATTAGTCTTCCAATCACACAGGAATAGCTTTCCATAAAGGAAAAAGGAAAAATATTCGTGCAACTGAACATTCTGGTACTTCTTTACATATAAACAGCACAGCATCATCATTCACATTCTCAAGAATTTGGTCTGCAGCAGTTCGATC


Gene Sequence:
>Vu_19453(-)
ATGGGTTTCTCAATCTCACTCTTTTTCCTTCTCTTGCCTCTTTCTTTTCAGTCTTCATCTTCCCTCTCCTCGTTGAACAAGGGGTCCTCTCTCTCAGTGGAGAAACAAGCACAACACTTTATTCTCTCACCTAATCAAATGTTTTGTGCTGGTTTCTTTCAAGTTGGCGAAAATGCTTTCTCCTTTGGCATATGGTTCAACGATCCTCACTCTCACAACCCCATCAATGTGGTTTGGATGGCAAACCGTGATCAACCCGTAAATGGGAAGCTCTCAAAGCTTTCTCTTTTGAACAGTGGTAACATCGTCTTGGTTGATGCTGGTCAAATCACCACTTGGTCATCAAAAACAGAATCACATGCCCCAGTAAAGTTGCATCTCCAAGATGATGGTAATCTTGTGCTAGATGAGCCCCAAGGAACCATTTTGTGGCAAAGTTTTGATTTTCCAACGGATACTCTGCTTCCTGATCAACCTCTTACCAGATTCACACAACTTGTGTCTTCAAGAAGCTTCACAAATCATTCCTCTGGCTTCTATAAGCTGCTATTTGACGATAACAATGTTCTTAGTCTCATTTATGATGGCCCTGATGTTTCAAGCACATACTGGCCTCCCCCTTGGCTACTCAGTTGGCAAGCTGGAAGATTTAATTACAATAGCAGCAGAGTTGCAGTGTTCAATTCTCTTGGCAGTTTCCTTTCATCAGATAATTATGCTTTTTCCACCTATGATAACGGCACGGTTATGCCCAGAAGATTAACACTGGACTCTGATGGTAACGTTCGTATGTACTCTAGAAATGAGGCTTTGAAGAAATGGTACGTTTCCTGGCAATTCATATTTGATACTTGCAGCATTCATGGGATTTGTGGAGCTAACACCACTTGCAGCTTTGATCCTGAAAGGGGAAGGAGATGCTCGTGTTTACCGGGATACAGAGTGAAAAACCGTAGTGATTGGTCTTACGGGTGTGAACCCTTGTTTGATATTACTTGCAATAGAAATGAGTCTACCTTTTTAGAGATACAGGGCGTTGAGTTATATGGCTATGATCATAATTTTATCCAAAACAGTACGTACATGAACTGTTTGAATTTGTGCTTGCAAGATTGTAACTGCAAAGGGTTTCAGTATAGATATGATGAGGGGCAAGGATTTAGCTGCTACACAAAGTTACAGTTGAGGAATGGAAGGCATTCACCAGGATTTAGTGGAACAATTTCGCTGAGACTGCCAAAAGGAAATAACTTCTCCAAGGAGGAATCTGTGAGAGCAGAAGATCATGTTTGTTTGGTGCAGCTTCAAAAGGGCTATGTTACAAAACCAGAAAATCGTTATGTGAGATTCTTTTTGTGGTTTGCTACTGCAGTTGGAGTTTTAGAATTGATTTGTCTTTCCATGGTTTGGGGTTTCTTGACGAGGACGCGCCAAAAGTCTAGTGCAGATCAACAAGGGTACCATGTTGCTGCAGTGGGAGTTAGAAAATATAGTTATTCAGAGTTGAAGAAGGCGACGAAGGGGTTCAGTGAAGAGATTGGAAGGGGTGGAGGAGGGGTTGTGTACAAAGGTATTTTATCAGATGAAAGACATGCAGCAATTAAGAGACTGAATGAAGCTAAACAAGGAGAAGGAGAATTCCTTGCTGAAGTGAGCATCATTGGAAGGCTTAACCACATGAACTTGATTGAAATGTGGGGATATTGTGCTGAGGGAAAGCATAGGTTGTTGGTGTATGAGTATATGGAGAATGGTTCTTTGGCAAAAAATCTCTCATCCAACTCTCTTGATTGGAGTAAGAGATACAACATTGCCCTTGGAACTGCAAGAGTTCTGGCATATCTTCATGAAGAATGCTTGGAGTGGATTTTGCACTGTGATATAAAGCCACAGAACATACTTCTTGACGCTAATTATCAACCCAAGGTAGCAGATTTTGGGCTATCGAAGCTAGTGAACAGGAACAACCTGAATAACAGTTCAAGGTTTTCAATGATAAGAGGAACAAGAGGGTACATGGCACCTGAGTGGGTTTACAATTTACCAATCACTTCGAAAGTGGATGTTTACAGCTACGGAATTGTTCTTCTGGAGATGGTAACTGGAAAAAGTCCAACAATTGGCGTTCAAAGCATTGATGGAGAAGAATCATACAATGGAAGGTTGGTAACATGGGTGAAAGAGAAAAGGAGTGGCACCTACTCCTCTTGGCTGGAACAAATCATTAATCCTGCAATTGAAACAAACTACAATAAATTTAAGATGGACCTTTTGGTTACAGTGGCTTTGGCTTGTGTTGAGGAAAGTAAAGATTTGAGACCCACCATGAGTCAAGTTGTCGAAATGCTTCAAAGCCATGAAAGTAACCCTAAATCATAA