Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_19445	LG5	6639613	6640269	hypothetical protein LR48	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect	Amino acid change
G/A	6639794	missense_variant	p.Cys61Tyr
C/A	6639871	missense_variant	p.Leu87Ile

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19445.1

MMKETTLTRLPDSFGMLRNLVELDMKRMPYLNGAGNNMSTGTIIPEIREQPSSEAILTSFCNLSLLEKLNAHGWGIYGKIPDEFEKLSSLQTLSLGHNNICSLPASMTGLSCLKNLLLSDCRELMFLPPLPSSLEELNLENCFAVQYIHDISNLERLEEFNLTNCEKVVDVPGLEHLKSLRRLYMSGCIGCSLAVKRRFSKVCHFFVCSTPQNHILLS*

CDS Sequence:
>Vu_19445.1

ATGATGAAGGAAACAACACTTACACGATTACCAGATAGCTTTGGAATGCTCAGAAACCTGGTAGAACTAGACATGAAAAGAATGCCCTATCTTAATGGGGCTGGAAACAACATGTCTACAGGGACAATTATTCCTGAAATACGAGAACAACCTAGTTCAGAGGCAATATTAACTTCTTTTTGCAATTTAAGCTTGCTGGAAAAGCTAAATGCTCATGGATGGGGAATATATGGAAAAATTCCAGATGAGTTTGAAAAGCTATCATCACTACAAACTTTAAGTTTAGGTCACAACAATATTTGCAGTCTTCCAGCCAGCATGACGGGTCTCTCCTGTCTCAAAAATCTTTTGTTGTCAGATTGCAGGGAGCTCATGTTTCTGCCTCCTCTTCCCTCTAGCCTAGAAGAGCTAAATCTGGAAAACTGTTTTGCAGTGCAGTACATACATGATATTTCAAACTTGGAGCGATTAGAGGAGTTCAACCTTACAAATTGTGAAAAGGTGGTGGATGTCCCAGGTCTTGAACATTTGAAGTCCTTAAGAAGGTTGTACATGAGTGGTTGCATTGGATGCTCCCTTGCCGTAAAGAGAAGATTTTCCAAGGTTTGTCATTTCTTTGTTTGTTCCACGCCCCAAAATCACATCCTTCTGTCTTGA

Promoter Sequence:
>Vu_19445::LG5:6637613-6639613(+)

ATCATACTTGAGTTTACACTTACAAATTTTTTTTAGCATTCAAAGTGCTATATAAAATACAAATTTTCTCTCTAACTCCTCTTATAATTCTAACAATAAATTCAACAAGAATCTACATATAGTTTAATCCAAACAACCTTGAATAAATTGGTTCACTTTATTCTTGCATTATTTAGTTATAAAAACTCCAAAACAACTCAAACAAAAATTCACAACCCTACTTGAAACACCATTAGAAAAACAAAAACAAAGTATTGCACTCAAATAATTATATCCACACCACTCTGGTGTATAAAAATTACAAAATAAAGAAAAGATATAACCTAGAGTGACATATATTCTTTAATATAATTACATAAAAAAAACTTATATCATTTCTTATCTTAATTGATCATACTAAGTGATGAAGTTTATTTAAAATATAAAAGATGATTATGATTATAAAAAAAACTTGTTTAAAAAAGAAACTAAAACTTTCAAAAATATTTAAAAAGAGTTCTAAAACTATTAGAATACTTTCATCTAAAAAAAAGTTTGAAAACTAAAGGGGTTATACTAACTAAGATAATAGACTAGTTTTTATTAGAATAAATTATTTTATTCTTAAAGTAATCTTAAAAAGTATTTTGAGCTGTATAATAGATTATTATTAATCATAATTAGTTATTCGTGAAAGCGTAAATTTTTAGATTGTATAATATTATCAATTACTGTTTAAAATAATCAATTATTAGCGAAAATAATTAATATTATGATTATTATTATGACTCATCGAATAATTTGGAAACATTGAACAACAAATTTTTAACCACATATAATAATCAATTGTTATTTGAGATAATAAATTGTTTGCAAACTAAATAAAATCCATATTTAGTTAAACTTAAGATATATAATCATTATAAACTTAATATAATTAGTTAAATGTTTGTAAAAAACCATCAAACTAATTTGTTCAACACTTTATAGAGATTAATTCGTATTTTATGATCATATTAAGACAAGAAAGAAATGGAGAGTAAAACCATTAACCATTAACTAGAGGAGCAATCATCATTAAAAGATTAATACATTATGCTTATTAACAATAACTATATATCTTACAAAAAACACTTTATATACATTATATAAATATATAATAAGCTATAAATTCTTTAGTTTATATATATAGTAAAATTTTTATAAATTTATATAATAAAGCATATATACATTTATAAAACAAAAACAAAAAATAAAAAATTAGATAAATAGTTGATTGAGCATAATAAATATTGATATATTTTAGTTTTTAGTATAACAATTTTTTTTAAATCTTAATAAAAACTTTAATTCCATTAATTTTATTTAATTATAATTTAACTTTATTTTTTTAATTGAATATATGTTTGATCTTTAATAATTACTACGTATGTTTATTAAAGAAAAATTAAGAATAATTACATAATAGTTTTAATTTTTTCTTTAATAAACATAGATAAAAGTATTAAATAATAAAAACTTGATTAATTATATTAAGGTTTAATACCTCTTTTGGTCCCTCGAAAGGGGGTAAATGTTCAATTGTGTCCTACGTTTTTTAAGAAGTTCAATGTGGTCCCAACTTGTGTAAAAAGTGTGCAATTAAATCATTTTTGGTAACGGCGTTAATTTTTTAACGGGCCAGCTGACAGGGTGTACTGAAGTTTGCAACGTGTCTGGGGAAGGTTAATATGTGGCTGTGTGAGGTTAATACGTGGCTGTGTGAGGGTAAACGTGTGTATATTACTGTGGTTAACAAATCAGATGTTAGGGTTTGGGTTGCAGAGAATTGGTCATTGAGATACGAATGGCTTCTTCCGAAGGGTGTTTGTCGTGTTCGAAAAGTTGGGGCAAAGGATCTTCTCGGTCGTCCCATGGTTGTGGTGTGTTGGAAAATCTTATTCGGCTGAGGTTAGACAAGTGCAAACAGCTCCAAAGGCTTCCAGACTCCATTGGAAATTTGAAATCTTTGCGATGGCTAA

Gene Sequence:

>Vu_19445(+)