Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19237 LG5 2421606 2425598 receptor-like protein 56
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   signal transduction
Cellular Component   located in   extracellular region
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 2421684 missense_variant p.Cys874Ser
C/T 2421848 missense_variant p.Cys844Tyr
A/T 2423124 missense_variant p.Ser419Thr
G/T 2423740 intron_variant
A/G 2423762 intron_variant
C/T 2424549 intron_variant
C/T 2424617 missense_variant p.Cys166Tyr
G/T 2424701 splice_region_variant&intron_variant
A/C 2424704 intron_variant
A/C 2425084 intron_variant
A/T 2425085 intron_variant
G/T 2425116 intron_variant
A/T 2425178 intron_variant
G/A 2425339 missense_variant p.Ala45Val
G/T 2425514 intron_variant
G/A 2425545 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19237.1
MVGCWKHEKEALVNINSVYFENNLPWVDTTDCCKWDRVECNSTTGRVVKLDLSDGTDYHHGLWILNYSHFLVFQDMRNLNLSGNDISSCVETQALGLNNLEVLDLSYNFGTDNILSCVLESSSLKVLYLQINKFDATSYRGLFSMLVNLEVLDLTMCEFRDDDVASALSALPSLNVYEVGFSKLRTLEILNLAMVELDDSNLRLTSSNLEILDFSQNDITNFVVNQDWSGLKTLKELNISHNKFKGPLQPYFSDFSSLRKLDLSNNDFTGNIVSRLASLTSLEYLGFERNQFEVPISFTPFFKHSNLKFIYGNGNKVILDSHSSMKNWVPKFQLQVLSLSSTTESHSHPIPSFLHYQYNLTHLDFTGCKLKGEFPKWLLENNTKMTNLVLKNCSFTQFQVPSHPHLHLAEMIVSDNAISGQISSHNISSFFPNLETLDMSENAISGSIPREFGLMNLLQTLDLSNNQLSGEIPRELINISSLQTLDLSDNQLTKVIFGVGHKHTGSVSSLDISNNQLVGKIPSLIKNMSGLEHLSMSNNHFEGSIPLELAELKNLVYLDLSQNNLTGEIPPFISSSVKSIHLNNNHLSGLSKRTFRGGSSLELLELSHNEVTHSIQDMVEDLSFIDLKILLVKGNHFNGDIPSELCKLKGLTILDLSHNNLTGVIPKCLGRMPFYNVYPEELRRLFYGIIPIEHNSRFEKRLPDVEERANFTTKGRTDTYMGSILAYMSAIDLSHNKLKGNIPSELGNLESIQSLDLSNNDFTGKIPTTFSKLRQTESLDLSFNELSGQIPSQLSELTFLSSFNVSYNNLSGAIERKGQFLTFEESCFRGNPLLCGPPLATICNPAPVIFPSDSDSGNNAALYINPYWRQLSFYYAELVSLNCYYFIEDNMCKLCNLGNV*


CDS Sequence:
>Vu_19237.1
ATGGTAGGGTGTTGGAAGCATGAGAAAGAAGCTCTCGTTAATATCAACAGTGTCTACTTCGAAAACAATTTACCTTGGGTAGACACCACTGACTGTTGCAAATGGGACAGGGTTGAGTGTAACTCCACCACAGGGCGAGTGGTGAAACTTGATCTTTCTGATGGGACTGATTATCATCATGGCTTATGGATTCTCAATTACTCCCATTTTCTTGTGTTTCAAGACATGAGGAATCTCAACTTGTCAGGCAATGACATATCGAGCTGCGTTGAAACCCAAGCATTAGGACTAAATAATCTGGAGGTCCTGGATTTGAGTTATAATTTTGGCACCGACAATATCTTATCATGCGTGCTTGAGTCTTCATCTCTTAAGGTTCTATACTTACAAATCAACAAATTCGATGCAACTTCATACCGAGGTTTATTCTCCATGTTGGTAAATCTCGAGGTTCTTGACTTGACCATGTGCGAATTCAGGGACGATGACGTTGCATCTGCTTTGAGTGCTCTTCCATCTCTCAATGTGTATGAAGTAGGTTTTTCAAAACTGAGGACATTGGAGATCCTTAACTTGGCTATGGTGGAGTTGGATGACAGTAACTTAAGATTGACATCAAGCAATTTGGAAATTCTTGATTTCAGTCAGAATGATATCACAAATTTTGTAGTCAACCAAGATTGGTCTGGGCTTAAGACGTTGAAGGAGTTAAACATAAGCCATAATAAATTCAAGGGGCCACTTCAACCATATTTTTCTGACTTCTCATCCCTTAGGAAGTTGGATCTTTCTAATAACGACTTCACTGGTAATATTGTTTCTAGGCTTGCAAGTCTTACATCCCTAGAATATCTTGGTTTTGAAAGAAACCAATTTGAAGTCCCTATTTCATTCACACCATTTTTTAAGCATTCCAATCTCAAGTTCATCTATGGCAATGGGAACAAAGTCATACTGGACTCACACTCTTCTATGAAAAATTGGGTTCCGAAATTTCAATTGCAAGTGCTCAGTTTGTCTTCAACGACTGAGTCGCATTCTCACCCTATTCCTAGCTTCCTTCATTACCAATACAATTTGACACATCTGGATTTCACTGGATGTAAACTAAAGGGAGAGTTTCCAAAATGGTTGCTGGAAAACAACACAAAAATGACAAACCTTGTTCTTAAAAATTGTTCCTTCACTCAATTCCAGGTGCCATCTCATCCCCATCTCCACCTTGCAGAAATGATTGTATCCGACAATGCTATATCAGGTCAAATCTCGAGCCACAATATCAGTTCATTTTTTCCAAATTTGGAAACTCTAGATATGTCTGAAAATGCAATCAGTGGTTCAATTCCTCGTGAATTTGGCCTAATGAATTTACTGCAAACACTGGATCTCTCAAATAATCAATTGTCAGGAGAAATTCCCCGTGAGCTAATCAACATTAGCTCATTACAAACATTGGATCTTTCTGATAATCAGTTAACAAAGGTCATATTTGGAGTTGGTCACAAGCACACAGGAAGCGTTAGTTCATTGGATATAAGCAATAATCAATTGGTGGGGAAAATTCCAAGCCTCATTAAAAATATGTCAGGATTGGAGCATCTTAGTATGTCCAATAATCATTTTGAAGGATCTATTCCGCTGGAATTGGCAGAACTTAAAAATCTAGTTTATCTAGATCTCTCCCAAAATAATCTGACTGGTGAAATTCCACCTTTTATAAGTTCTTCAGTTAAGAGTATCCATTTGAACAACAATCATTTAAGTGGGCTGTCCAAAAGAACGTTCCGAGGAGGTTCTTCACTGGAGTTGCTAGAACTTAGCCACAATGAAGTAACCCATAGCATTCAAGACATGGTAGAAGACCTTAGTTTTATAGATTTGAAGATTCTTCTTGTGAAAGGTAATCACTTCAATGGAGATATACCAAGTGAGTTATGCAAGTTGAAAGGTTTAACCATACTAGACCTTTCTCACAACAATTTAACTGGTGTGATACCCAAATGCTTGGGTAGAATGCCTTTCTACAATGTATACCCTGAGGAACTACGTAGATTGTTTTATGGCATCATTCCTATTGAGCACAATTCTAGATTTGAGAAACGGTTACCAGATGTGGAAGAGAGAGCAAATTTCACTACAAAGGGGAGAACTGACACTTACATGGGGAGTATCCTTGCTTACATGTCTGCAATTGACTTATCCCACAATAAACTTAAGGGCAATATCCCATCTGAGCTTGGAAACTTGGAAAGTATTCAATCATTGGATTTGTCGAATAATGATTTCACGGGGAAAATTCCAACTACATTCTCCAAGTTGCGTCAAACAGAGAGTTTAGATCTTTCATTTAATGAGTTGAGTGGCCAAATTCCTTCACAATTGAGTGAATTAACCTTTCTTTCTTCATTCAATGTATCTTACAATAACTTGTCTGGTGCAATTGAGAGAAAAGGACAATTTCTGACGTTTGAAGAAAGCTGCTTCAGGGGTAATCCATTACTCTGTGGACCTCCACTAGCAACAATTTGCAATCCTGCACCTGTTATTTTCCCAAGTGACTCGGACAGTGGAAACAATGCAGCTTTGTATATTAATCCTTACTGGAGGCAATTATCCTTTTACTATGCAGAACTGGTGAGCCTGAATTGCTACTACTTTATCGAGGACAACATGTGCAAGTTATGTAATCTTGGAAATGTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_19237::LG5:2425598-2427598(-)
TCAATAACGACGTATCAAATTGTTTCTATCATAGATTTAATTATTTTTACTTCTTTTTTATATTTTTATTTGTTTCTCAATTTTATCATGCAGAATACTTAATATTTTTTATAAATTATTTAAGTTTAAAGGATGAAGTTAAATTTTATCACCATCCAACATTATTTAAGTTTAAAGGATGAAGTTAAATTTTAATTATTATTACTATAAAAATTTATTAAAGTTTAAAGAATAAGTATAAAGAGACATTTAAAATTTAAATTTGAATATCTGTTTTCTTTTTCTAATCTTTTAAAAATATTTTTAAAATATATTAATTTTGTAAGTTTTGAAAATTTAATATAATTTTAGTTTCCATAAAATTTTATTCAGTATTTTAATTTGAAATATATACCAATATTATAAGATTTTAAAAAATATTTGATATTAAAAAAATGACAATATGTTGAATATTTGATAATATTATCTTTTCTTTATTTATTTTACAATTTTTTAAAAATCAATTAATTGATATTAAAACTGTAAAAAAACAAATATGTGTATCAATATCTATATTTCACTGTATAACAAGTTACTAACCACATTGAAATCTTAAAAATACACATATATCCCAATAAAGAAAAGAAAAAAAAAAAGAGAAAGAGTGACTTAAAATAGTGGAGTGAAGAGTGAACTTGAAATAAATTTAATAAGTTATTACTGAAAAGAGAAAACACATAATGTAAAGAATGTGAAGGAATAATTTTTAGTTTATGAAATATATTTAATGTGCATTTGAGTTATTAATTAGTACTAAATTGAATTAAATTATAAATTATTTATTATATAATATTAACAAAATATATTAAAAAAATGTGAGATGTGACTAAAAGAAAGAAGAAATTAATACAAGAAAAAAAAATTACAGAAGTAAAAGGAAGGAGACTTGTTTTATACATTTCTTCATAACCTGACCTTTTTTTTATGAAATATAATTCTTTTTATAATTGTAAAACATATTCAATTCTTTCTATGCTTTGTTGCATTCCATATTTATTTTTATATATAACACACACACACATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATGTGTGTGTGTTAAATTTTATTTTTTTCATGAAAAAGAAATTGAATACACTTATTTTTTAATTATTCTTAACTTCTAATTAAAAACTAAATAAAAAAAATTAAGAGTAATCAAATGAATCTATACTCTTATATATATAAATATTAGAATAAGAAAATACTTTAGTTCGGATAAATAATTTCATAATTTTAAGATATTTAAATATGTTAAATAAAAATTCATCTTATTTCAAATTATTTTATTTTTTAAATATTTCACTTGCATCAATTAATTTAATTTTAGAAAAATCTATTTTTTATTTAAATAAAATATGTTTTTATTAAATGTAAATAATTATTTTTTAAATAAAAATTAATATTAATAATTTTCTAGTTGGTCTTGATATTATTTTTCAGTTAAAATTTATCAAGATTTTTCAATTGATATTAAGAAATTACAGAAGTAAAAGGAAGGAAACTTGTTTTATACATTTCTTCGTAACTTGACCTTTTATTTTTTTTTATGTAATATAATTTTTTTTTATAATTGTTAAATATGTCAATAAGAAAGTGTGAAAATTGTATTTTCAATTCTTTTATGCTTTGTTGCATTCCATATTATATTTATTTATAATTTTTTCAATGAAAAAGAAATTGAATACACTTTATTTTTTTTAATTAGTCTTAACTGCTAATTAAAAGCAAAATTTTAAGAGTAATCAAACGAATCTATACCAATACCAATACCAATACCAATACTACACTTTATATATATTAATTAGAACAATACAATACCACATTCGTAAAAGACAACTTCTTTGAAGGTTGATGTGGTACCTTTGTAACTATTGCAATCATTGAGAATCAGAAG


Gene Sequence:
>Vu_19237(-)
ATGGTAGGTACGATCTTACATATATAAACCCGAATTCGTTATGTCAAAAAACACACAGACAACAATGAAGAAGATCAGTGTCTTCGCTTTTTGGTTGATTTTGGTTTTGGTGGGAGTGTTATGTTGTGAAGGGTGTTGGAAGCATGAGAAAGAAGCTCTCGTTAATATCAACAGTGTCTACTTCGAAAACAATTTACCTTGGGTAGACACCACTGACTGTTGCAAATGGGACAGGGTTGAGTGTAACTCCACCACAGGGCGAGTGGTGAAACTTGATCTTTCTGATGGGACTGATTATCATCATGGCTTATGGATTCTCAATTACTCCCATTTTCTTGTGTTTCAAGACATGAGGAATCTCAACTTGTCAGGCAATGACATATCGAGCTGCGTTGAAACCCAAGGTTCCATCTTTTTCTTTTACAGAATCAAACAACGTCTTGTATCAGAAAGTTTGATGTTATATGCTACTATAATATTGACTAATTTAGAACAAATCATAAATATGCAGTGTTGAATTCGTGTTAATTTAAGTCTCGTCTCTTGTCTTGCAGCATTAGGACTAAATAATCTGGAGGTCCTGGATTTGAGTTATAATTTTGGCACCGACAATATCTTATCATGCGTGCTTGAGTCTTCATCTCTTAAGGTTCTATACTTACAAATCAACAAATTCGATGCAACTTCATACCGAGGTAAGCTTCTATACATATTTTTCTAAGTAGTGGAACGTGGAAGAGATTGATAATCATATATTTGAAGTTAGATTGAAGATAACATCATTAACATGACATGAGTGGTAATATTCCTGATCAACTGATCATGCATCGCTAGTGGATTGAATGATATAGTAGGAGAAATATTTGTTGAGGAAAAAGAGCTAACATAATGTTGTTTCTTGTAGGTTTATTCTCCATGTTGGTAAATCTCGAGGTTCTTGACTTGACCATGTGCGAATTCAGGGACGATGACGTTGCATCTGCTTTGAGTGCTCTTCCATCTCTCAAGTCTCTAAATTTAGAATTTTGTACTCAATTGAATTGGAGACCGCTTCATAGTAATGTCACACTTTGCACTTCATATTCTTTCCTTTCCTTATTTATGATTAGTTAATTAACTGTCATCAGTGTGTATGAAGTAGGTTTTTCAAAACTGAGGACATTGGAGATCCTTAACTTGGCTATGGTGGAGTTGGATGACAGTAACTTAAGTAAGGTCTTTAAGTATTGCTTTTAACATCTTCCATTAAATGTTTTCTTAAACATGGTTCACGAGTCTTATGAGAATATGCTACGTCATCATATAACAACTATTAATAACTGGATGATGTATCATGCAGAGAAAGAAGAATTCGCATGGCCATCCAATCTGCAATTCCTTGGACTAAGTGGAAATAGTTTCAGTAAAAAGGTTTTTTCTTCTCTAAAGGGGCTTCGACATCTCAAATCTCTTGATATAAGCAGAAACCAATTGGAAGGATATTTGAATATTAGTGGTTTGTACTTAAATTATCAAGGATTTTTCTTTCCTTTCAGCGTGGCAATCCTTTGTCTGTATTTCTATATATATGTATCTGAACTTGTACCTTTAATTTAACTAAAGAAAGAATTTTATTGTATATATTCTATGCTCAACGAGTGAATAATACTATTAAAATCTACAAATGGTATTTTCAATCTAACCTTTCTTTGTCCCTGGCAGGATTGACATCAAGCAATTTGGAAATTCTTGATTTCAGTCAGAATGATATCACAAATTTTGTAGTCAACCAAGGTATATGTGCAATTGGTGTTTCGTACTCTTAATGTTTAGTTTATATTTCAATGTATTTGTAAATTTTTTCATTTTGTCATCTCTTCTAATTTAGTACTTTTCTCCAAATATAATTTCTCAGATTGGTCTGGGCTTAAGACGTTGAAGGAGTTAAACATAAGCCATAATAAATTCAAGGGGCCACTTCAACCATATTTTTCTGACTTCTCATCCCTTAGGAAGTTGGATCTTTCTAATAACGACTTCACTGGTAATATTGTTTCTAGGCTTGCAAGTCTTACATCCCTAGAATATCTTGGTTTTGAAAGAAACCAATTTGAAGTCCCTATTTCATTCACACCATTTTTTAAGCATTCCAATCTCAAGTTCATCTATGGCAATGGGAACAAAGTCATACTGGACTCACACTCTTCTATGAAAAATTGGGTTCCGAAATTTCAATTGCAAGTGCTCAGTTTGTCTTCAACGACTGAGTCGCATTCTCACCCTATTCCTAGCTTCCTTCATTACCAATACAATTTGACACATCTGGATTTCACTGGATGTAAACTAAAGGGAGAGTTTCCAAAATGGTTGCTGGAAAACAACACAAAAATGACAAACCTTGTTCTTAAAAATTGTTCCTTCACTCAATTCCAGGTGCCATCTCATCCCCATCTCCACCTTGCAGAAATGATTGTATCCGACAATGCTATATCAGGTCAAATCTCGAGCCACAATATCAGTTCATTTTTTCCAAATTTGGAAACTCTAGATATGTCTGAAAATGCAATCAGTGGTTCAATTCCTCGTGAATTTGGCCTAATGAATTTACTGCAAACACTGGATCTCTCAAATAATCAATTGTCAGGAGAAATTCCCCGTGAGCTAATCAACATTAGCTCATTACAAACATTGGATCTTTCTGATAATCAGTTAACAAAGGTCATATTTGGAGTTGGTCACAAGCACACAGGAAGCGTTAGTTCATTGGATATAAGCAATAATCAATTGGTGGGGAAAATTCCAAGCCTCATTAAAAATATGTCAGGATTGGAGCATCTTAGTATGTCCAATAATCATTTTGAAGGATCTATTCCGCTGGAATTGGCAGAACTTAAAAATCTAGTTTATCTAGATCTCTCCCAAAATAATCTGACTGGTGAAATTCCACCTTTTATAAGTTCTTCAGTTAAGAGTATCCATTTGAACAACAATCATTTAAGTGGGCTGTCCAAAAGAACGTTCCGAGGAGGTTCTTCACTGGAGTTGCTAGAACTTAGCCACAATGAAGTAACCCATAGCATTCAAGACATGGTAGAAGACCTTAGTTTTATAGATTTGAAGATTCTTCTTGTGAAAGGTAATCACTTCAATGGAGATATACCAAGTGAGTTATGCAAGTTGAAAGGTTTAACCATACTAGACCTTTCTCACAACAATTTAACTGGTGTGATACCCAAATGCTTGGGTAGAATGCCTTTCTACAATGTATACCCTGAGGAACTACGTAGATTGTTTTATGGCATCATTCCTATTGAGCACAATTCTAGATTTGAGAAACGGTTACCAGATGTGGAAGAGAGAGCAAATTTCACTACAAAGGGGAGAACTGACACTTACATGGGGAGTATCCTTGCTTACATGTCTGCAATTGACTTATCCCACAATAAACTTAAGGGCAATATCCCATCTGAGCTTGGAAACTTGGAAAGTATTCAATCATTGGATTTGTCGAATAATGATTTCACGGGGAAAATTCCAACTACATTCTCCAAGTTGCGTCAAACAGAGAGTTTAGATCTTTCATTTAATGAGTTGAGTGGCCAAATTCCTTCACAATTGAGTGAATTAACCTTTCTTTCTTCATTCAATGTATCTTACAATAACTTGTCTGGTGCAATTGAGAGAAAAGGACAATTTCTGACGTTTGAAGAAAGCTGCTTCAGGGGTAATCCATTACTCTGTGGACCTCCACTAGCAACAATTTGCAATCCTGCACCTGTTATTTTCCCAAGTGACTCGGACAGTGGAAACAATGGTAATTGGGTGGACAAGTTCGTTTTTTGTGTGACCTTTGCCGTGTCATACGCATCATTTTTGTTGGTAACTGCAGCAGCTTTGTATATTAATCCTTACTGGAGGCAATTATCCTTTTACTATGCAGAACTGGTGAGCCTGAATTGCTACTACTTTATCGAGGACAACATGTGCAAGTTATGTAATCTTGGAAATGTGTAA