Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_19106 LG4 73564961 73573181 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108336080
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 73565238 missense_variant p.Leu93Ser
T/A 73565278 missense_variant p.Phe106Leu
C/T 73565287 synonymous_variant p.Tyr109Tyr
T/G 73565449 upstream_gene_variant
T/G 73565506 upstream_gene_variant
T/A 73565512 upstream_gene_variant
A/G 73565558 upstream_gene_variant
G/C 73566642 intron_variant
A/G 73566762 intron_variant
G/A 73571369 synonymous_variant p.Leu809Leu
T/C 73571424 synonymous_variant p.Leu828Leu
C/G 73572929 stop_gained p.Tyr932*
C/T 73572977 synonymous_variant p.Leu948Leu
C/T 73573037 synonymous_variant p.Gly968Gly
C/T,* 73573043 synonymous_variant p.Gly970Gly

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_19106.1
MMTTMTTASRTIWPRSPEPAGLLSQAPKIILPPKTEFRRRTRPLTPAPPLFRLPPTRTQTARTTLNVSRECRASTSLYPFFRRLALSDDDDDLDDLETVRAIMRRFGDYNEGLHEDGKKVLVEEDQTSSMGCEGDVANGSTHNESDGGKLYPISQDPKEAATEELIENIEMQLSEFVESSEPDAGESSRLPQKRLSFPPVVQCFIDAIKKNRDLQRFLRGRKGNLLKGIKQQFQEMVLQLSLSIDRTSSEELLREADDMDNIIASVKDLEVTPERIRKFLPKVNWDMIASMYVGGRTGAECESRWLNYEDPLINQGAWTKEEDKSLLLIVQDTGIRNWFEIAASLGTSRTPFQCLSRFQRSLNPSMLNSEWTEEEDAQLYSAVTYFGDGNWQYVASVLERRTGTQCSNRWKKSLCPEKKGSFTQEEDMRLTVAVMLFGRKWNQIAKYVPGRIQSQCRDRYLNSLDPSLKWGGWTEEEDLRLEAAIAKHGYCWSKIAEEVPPRTDSQCRKRWKVLCPEQVPLLQEARKKQRSIISCNFVDRESERPTITLDDFMPLIALAPKSDIGASKLPKKRKSSNVSKKTSSKKRAKRTRRCAKEVQDTEVYNDDEFYAESACSDLPKKNTRSKRHAKRSKICPQELVDISCSDKVETCIEGSENQSTCIANSENQDWDSMTLSSFIRNKSNEILSRFTKKLSQTSFSSRITDVPEQVESQNPSHDQSGSSESCDTVGTINLFVPPNIVSDGRVRNREDTNALTGDDNDDHMTLASFLGNKPKKKCQPKGHHVCSSKLKTGSALLNEEHCASKPTIISDDSGSMSYHVEAMETVLHVVLINQWIPLWKKRMMSFLLPTCKTGQGGNENVPVDFWFQEIKKKKKMSYLLPHLHSGWAVDQAILAEEERLVIIRFGHDWDETCMQMDEVLASVAETIKNFAVIYLVDITEVPDFNTMYELYDPSTVMFFFRNKHIMIDLGTGNNNKINWALKDKQEFIDIVETVYRGARKGRGLVIAPKDYSTKYRY*


CDS Sequence:
>Vu_19106.1
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Promoter Sequence:
>Vu_19106::LG4:73562961-73564961(+)
CCAAATAGACAACTTGAAACCAGAGGAAGCACCTAGTTCTCTGTAACACTTCTACCCAACACAACCCTACCCTTCAACACAACACACATAACCTTAACAATAATCTTCTCTTTCCTATCTTCTGTACACTTTACTCAACCCAAACTCCTCTTCTAGTTCAAAACACAATCCATTTTACACAATCCATATCACACCACCCAAGGCTCTCCTCATAACCACAACCAACATCGATTGCCTCTCCAAAGGCAAACACATATAAAGAATCAAAGTTGTTTTCCAAGGTTTAAACATGTTTTTCAAACAATTACAAGTATTAGGATACCAATTTAGTCATTTGGAAATGACTTGATACACATATATCAAGAATCAAAGTTGTTGATTTTCTGGTACGGTGTCAAGGGCTTGGAGTGGCGTTGAGAGGGCCATTGGACTACAAAATGTTGAGTGTTGCGAAAATAGTGAGCTCTTTGTGTATGAACGCTGGGGTACTCTGAGTTGCTGAGCATTGTGTTGTTTGTTTGGGGGACGTTGAGTGGTAAGAAGTAGTGTTGAGCGTCACTTTGTGTTGCAGGTCTGGGCTTTTGTTTATTTCGCTGGGTGGGTGACTTGCTACTGAGTCTAGTATAGGGAAGTTTTGGGTTTTTCTTTAAGTTTTATGTATGTTTGTTTAGAATGTTTTATATAGATTAATCATATTGTTGTGGATATTGTATATGTTAATGGTTGATGAATATGGTGATGTGTATGATGATATTTCAAGTATGATATAAAAGTAATAATGAATTATGTTGTTGGTATGGTATCAATGTTTGGCTTAATTCCTTGGACCTCATGGTGAGACTCTATGGTGGTGTTTAGTAGTGTGCTGTATTGAAGTAAAGACTCAGTCTTGGAAGTTATCTGAGACTCCATTAATCATCCTATCTCAAGTAAAGAATGAGGGTTATGTGGTAAGGAGTAGTAGAAGGTCCTAGTCTATGGTTTGATTCTTTGGCCATAAGTGGTAAACAGACTAACCTTGTGTGGTAACTTGGGGAAGCCGACTATTCCACCACTACAAGTGTATAACTTACCATAGTTTGACTTTAGTATACACATCTAGATGGTTAGGTCTAAATGTTATGAATTTGGTTAAGTTTTGTTTTGGATTGAGAATGAAATTATTATGTATGGTTGAATTAAATTGTGATTGTTTCTTTATAAAAGTTAGTTTACCCATCTATTTTTTTTATGTTCACTTGTAGTTCTTTTTTGTAATAACTACCTGATTGATGTGAGCAAATGATGATGTTTCAATGGAGCACGTACTAGGTGGCGTTATAAATAATAATTAGTTCTTATGTATATTTGAAGTTTGAAAAATAATTCAAAAATTTATTTTATTTATAGGTATTTTTGGTTTTCAAAACTCGTTATATATAAAAATTGGTTTTGTGGTTAGGTTTGAATAATTGTAATGTTCTTATCTATTAAATATGTGATTATTCTATAATAATGTTAAAATTATTAAAATATTCAAAGAATTTTCTTTTTTAAATTAAATTTTTAATTTAAAAATATGTATTTTAAAATTTAAATTTACTAAAAAAAATAGTAGTCAAATTTAAGTATTCAAATAATATTTAGATGTATATAATATGTATGAAGAAAAATAATTAATTTTTTATTTGTTTAAATAAATTTTAAATGTTTTTACTTTAATTATTTAAAATACCTTTTTAAATTTTTTAAATTTTAATTTATTCATTCAAATAACTCCTTTTATCTCAAAAAAAGAAAAATTAAATTTACTAAATAAATAAATTACTTTCATGAAAATGATTATAATAGGATTTGATTATTTTTAGAATAATTTAATCAGTGCAGCGGGAAATTCAGAAGAACCCTTGCGTGAAATCCAAATTCAGAGTGAAATTCGGAAGAAACCTTGGTGAATTCAGAAGAAATCCCAATCTAATGACTCCTCGCGTCGACGATTTCGGCAATCTCTCCTCCACCGA


Gene Sequence:
>Vu_19106(+)
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