Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_18986 LG4 70897267 70900495 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase PBS1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 70898421 upstream_gene_variant
T/A 70898665 upstream_gene_variant
C/T 70898979 upstream_gene_variant
C/T 70899303 upstream_gene_variant
G/A 70899325 upstream_gene_variant
G/C 70899490 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_18986.1
MGCFSCFDSSSSSRENHNLRSHHHPQPNSNSNPNPNINLSLPSQISKLPSGADKLRSRSNGGSKRELPPSNTKEGHGPAVQIAAQTFTFRELAAATKNFRPESFVGEGGFGRVYKGRLETTGQIVAVKQLDKNGLQGNREFLVEVLMLSLLHHPNLVNLIGYCADGEQRLLVYEFLPLGSLEDHLHDVPPDKEPLDWNTRMKIAAGAAKGLEYLHDKANPPVIYRDFKSSNILLDEAYHPKLSDFGLAKLGPVGDKSHVSTRVMGTYGYCAPEYAMTGQLTVKSDVYSFGVVFLELITGRKAIDSTQPHGEQNLVTWARPLFNDRRKFSKLADPRLQGRFPMRGLYQALAVASMCIQESAATRPLIGDVVTALSYLANQGYDPNNAGHGYRGSSDDKRNRDDKGGRILKNDEAGGSGRRWDLEGSEKDDSPRETARMLNRDLDRERAVAEAKMWGENLRQKRQQSLQEGSYGST*


CDS Sequence:
>Vu_18986.1
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Promoter Sequence:
>Vu_18986::LG4:70900495-70902495(-)
ATACATTTCTCTATTCCCCAGTTAAATCTCTCATTGTATTCTATTTTATTCCAATTACAACTTCTTAATATTCTTCTCCTGTCATCATTATCTAACCACTTTTCAGATATACCTTTTTTTTTTTTTAATCTCTATGCCAATGCATAACTAATTGTCAGCTAGTTTCATTTATTAAATATTTAATAATAATCTCCACAATTTTAAGTCAATGCCAATTTTTTTTTAATAATATCGACACATTTTAAAAAAATTATTACCAATGAGATTCTGCTACGCCTACAACCTTTTCTTCAAAAAAAATATTGTTAAACTTTTTTCTTCTCCCTTATTGTCACTCTAAATATATAGACAGATATAAGAGTAAGTCAAAGTATAAATAAACTAATGTCAATGAGCAACATTTAATTTTAGTGCGAGTTAATAGGTATATATGATGATAAGTTTGGTAATTACTTAAATTATTTACTTTCCAATCTTTTTAATATTTATAACTAATATATTTTTTTTTTTGTGAATTATTATGTTACTATAACACTTATGGTTATAGTTAAATAGGTTACTAATATATTTTTTAATATTTTTATAGAGAAATAATAGTCCGATCTGACTTGAAAAAAATGAAGTCATTAACTAAAAAGTCTTATATAATAATAATTGACTCCCAACAAGTAACATATAAAAAGATAATTCTAACTTTTAATTAATCCAGTAATAGTACTAAATGAAAACTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACGTATTATGTTATTTTTACTCAACAAGTATCTGACTAAGCCAACATTAAATTTATGAACATAAATAAGAAAGAAAAATTTTTCTGAGGGAGTGAACTCTTGCAATGTATAGAGCTTTTTGGATACTTACATTTCAAAGCCTTTGTAATTTAATTTCTTTGCTTTAAACTTTGTTTTAGTAAAATTTGATGTTAATCTACATTTAACATAAATAGTTAGAGGTGATATCTATATCTTATACGAATTTAATTCTTATATTATTCAGTAAATTTTACATTTTCTTACTCATTTCTTGGACTAATCAACCAATCTTCTATTTATTGGAATAAGATGTAATAAAATTTGCTTATAATAATATAATTGTGATAATACCCAATAATACAATCTTGATGTTTCTGCTAGTATATATTGAAATAGTCATAAAAAAACTTTGATATTGATATTTTTGCCATGTTATATAAAAAGAAAAAAGTTAAAATATTAAACAAAGTAACTCGTACAATAAACTGTCAAAGAAAAATCAAATATGAAAAGAGTACTAAAGAGAAACAAAATAATTTTAATATTTAATGCATGGTCTATTTATAAAAGAACAACAGATAATGTATTCACTATCAATAAAATTTGTCCATAATCAAACTAAAATCGTATATGCTTTACCTAAATATTATAACTTGGCACAAAAATACTCAACAAGGGTAATTATTATTTTTTTTAGATTTTGAAACTAAAATTATCGAACAAGTGTTTTTCTTTTCAAACTTATTCTCAAGATCAATTATTACCAAAACTGTTTTCAAAACTGAAACAAAATAGAACAGTGTAAAAACTTAGAACGAGAAAAAACAAAAGTAAGACTGAGATGATGTTGGAAAATATGAAAATGGAGTGTGTTTATAATATAATATATGAAGGATGAGTGGCATTGGTAAGATGAATGAAGAAATTAGTAATGGAGCGTGGAAGGTGATTGGGAAGATTGGGTGTCTTGGGTTTCATAATTAGTGGAGTTTGGTGGACTTCACCAAATTCTTTCACTACAATCTGTTTGTTTGTAAATAAAATAATATTAATAGAGAATAGAATAGAAACTCTAACCCTTACTGTTGCTATGTGTTTTGATTCCCTTGCAGTTGATTGCGTTGAGTTGCAGTTGCAGTTGCAGTTGCAGTTGCAGGTGTATTGTTAACTCTGAATTTCACTGAGTGATTGATCATTGATTGGAATTTGGGGATAAACATTAG


Gene Sequence:
>Vu_18986(-)
ATGGGTTGCTTTTCCTGTTTCGATTCGAGTTCAAGTTCGAGGGAGAATCACAACCTCCGTTCTCACCACCACCCACAACCCAATTCCAATTCCAATCCCAATCCCAATATCAATCTGTCTCTCCCTTCTCAGATTTCCAAGTTGCCATCTGGTCAGTCTCTTACTTTTTTTTCATCTCATTTCAAGCCATCAAATCAATTAGCTATTTAATTAGTTGAATTCTAGGGGATCCACAACACAATTCATATGAATTCTTTCTGTTGCAATTGGAATTGCAGGAGCAGACAAGTTACGGTCCAGAAGTAATGGAGGTTCCAAAAGGGAATTGCCTCCTTCCAACACCAAGGAAGGACACGGACCCGCCGTCCAAATCGCTGCTCAAACTTTTACTTTCCGTGAACTTGCTGCTGCAACCAAAAACTTCAGGCCAGAATCCTTTGTAGGGGAAGGTGGTTTTGGAAGGGTCTACAAAGGCAGGCTTGAAACCACTGGTCAGGTACAGTCACCACTTTTCACTCTCTCCACACATGGGGAAGAAACAGAGTAAATCATCACTAATCACTGTGCTTTCTTGGAATCAATGGTTCTGGTCCACTGTCAGAATATCAAAATTATTTCTTATCTTAGACATGATCTTTGATTTGGTTCCACTTCCACCAAGACCAATGAATTTGATTTTCCTTGGTCCATCGTTTTACAAAAATGCTTTTATCACTCTCGATAATGCTATACAGAGATCCATGGTGATTGATATATATCATCATATACTACCATCTATTCCAAGGGGATAAGGCCTGGTTATAAAATAGGGAAATAAAGATAGTTTTTATGATTATTTGGATGAACTTAATTCCGTAGATGTTCTGAAGATGTTGAATCATCTGTGTTTAAATCTGAAATATCTATTATTGTGCTCTGCCAAATATTTATGTTATGTTCACAAGTTTGTATTTGGCCGTTGTCTTCTGAATGATCAAGTATACATTTAAATTCATGTTTCTTCTTCATCAGATAACTTAACATTTACCACCCCCTGTGCAGGGGCCCACATTTCATTAGGTTCTTTTTGCACCAATTGAAATGCTTTACCTTTCACACCACTAAAGTTCTGTCTAAAATTATAACTCTCCTTTTCAAAGAGACCATTCTTAATTGTAAATGCAGAGTAATCAAAGAGTTTTTATGTGGTTGAGACCTCTAGTTATTAGTGAGTCCTAACATCTGATCATTTGGCTGTGCAGATTGTTGCAGTCAAACAGTTAGACAAAAATGGTCTACAGGGTAATCGGGAATTCCTTGTAGAGGTTCTCATGCTCAGTCTTCTGCATCACCCTAACCTTGTGAATCTCATTGGATACTGTGCGGATGGGGAACAACGCCTCCTTGTTTATGAATTTTTGCCTTTGGGATCATTGGAAGATCACCTTCATGGTATGGTTGTTTAACTCTCTTCTTAGTTCTTTGATTGAAGGTTTTAGGTTAATGTTTCTCAGATATTTAAAATTCCCTGAAAACCGAAATCAATAGCTGATATATTATTTGAGACTCTAAACAGTATGCAATACTTATACGAGAAAGAAAAATATTAGAAGTTATTGCAATTTTATCATTTCCGATATTGTCAAATATCACAGAAACTTATATCCTTTAATGAAATGATCAAAACATGTAAACTACTTTATGTGTTTTGGGATGCATAAAACTGTAAATACTGCTGTGCAGAAAATACTGAAATGACATTAAATTCTGATACTGGTCACTGTATTCTTTGACACACTTTACTTTCTCTTGTATAATGACATTTCTAGGTAGTGAGTGAGCCGTTCTGCCACGCCAATATTGCCTATCTTCTTCTATTTCCCTACAATGCATGTTGTTTGTTTGTTTTCTTACGTATCTACTTAAATTGATAGAGCCCTTACTCTTGCAATGGTTTTTTGTTGTCTTTGTATCATGATTAAGATTTATATGCGGCTTTTACACCCTGGCATGAGAACATCCATGCTCGTTATGTTATGCCCATCTAATTTTTATATTCCAAGCATTGCCTCTCTAATACATAATTACTCTTTAAAGGGTGAGTACGTCCACAAAGTAGCATAACACAACATAGGTAATTTATACACTCCTAACCATGTAATTTTTTGATAGAAAATTACTTATGGTTTGCATGCTATATGTAGACTGCCTTCTTAAACAATATGTAGTTGTCATAATTACAGTTGATGTTTAAATTTGTTTATTGATCTCTGTGCAGATGTTCCCCCTGATAAGGAACCACTAGATTGGAACACCAGAATGAAAATAGCTGCTGGTGCTGCAAAAGGATTAGAATACCTGCATGACAAGGCAAATCCTCCTGTCATTTATAGAGACTTCAAGTCGTCTAACATATTACTTGACGAAGCATACCACCCTAAGCTTTCTGACTTTGGTCTTGCGAAGCTTGGTCCTGTTGGTGACAAATCACACGTTTCTACCCGAGTCATGGGAACTTATGGTTACTGTGCTCCTGAGTATGCTATGACTGGACAGCTGACAGTGAAGTCTGATGTATATAGCTTTGGGGTTGTCTTCTTAGAGCTTATTACTGGCCGCAAAGCAATCGACAGCACCCAGCCCCATGGAGAACAGAATCTTGTCACATGGGTTTTGCTCTATTCTCTCTCTCGTCATTATAGTTAGTTCAGACTGCATAAACTCTTGTAAATTAAAACGGTGTGGTGATTGTGGTTTTAGTTGTATGTTTGTGCAGGCACGTCCACTTTTTAACGACCGCAGGAAGTTTTCAAAGTTAGCTGATCCTAGGCTGCAGGGACGGTTTCCCATGCGTGGTCTTTACCAGGCTCTAGCTGTTGCGTCAATGTGCATTCAAGAATCAGCTGCCACACGCCCTCTGATTGGAGATGTGGTGACAGCCCTCTCTTATCTGGCCAACCAGGGATATGACCCCAACAATGCTGGCCATGGTTATAGAGGATCTAGCGATGACAAAAGGAACAGAGATGATAAAGGTGGAAGGATACTTAAAAATGATGAAGCTGGGGGATCTGGACGCAGATGGGACTTGGAAGGATCCGAGAAAGATGACTCCCCACGAGAAACTGCTAGAATGTTAAATAGAGATCTAGATAGAGAACGTGCTGTGGCTGAAGCCAAGATGTGGGGAGAGAACTTGAGACAAAAAAGACAACAAAGTTTGCAGGAGGGCAGTTATGGTTCTACCTAA