Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_18850 LG4 66471812 66476720 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108334234
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 66473642 intron_variant
C/A 66473927 intron_variant
T/A 66474540 intron_variant
T/A 66474644 intron_variant
A/T 66474685 intron_variant
A/G 66476050 synonymous_variant p.Ala594Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_18850.1
MENHQNHKGEAEPDRENNQNNNQAWGTWEELLLAFAVNRHGFKDWDTVAMEVQSRATRLLATARHCEQKFHDLSRRFADQCNDGVTPPQHDGEATGDNSDHVPWLDELRKLRVDELRREVQRRDDSIMSLQLEVKRLEEEKAKENDGKDGEKPDLAVPGEVRPENDKTGGEVEEVGPANSGPDRTANADKMLPTTGDESDRENQSVNESNSTGSRFDKTGEGDAKLKVEPDPVQTGSKEVDPVARKGKPVGEESNNGSYDALAKVPTCESVPPSGERKVEQDDDSSELHDSVAHSGEGGTRESSEVQSSASLTRKRKTRRRKDVSGGDGRGGGASTLPENEEVAVKSEPLVGILELIKGHEHCSLIESRLESQLESDRYKDIVKQPLDMETIQSRIQKGQYFSCTSAFFRDLLLLFTNATVIFPVDSPESQAARQLHRLVTTEMKNHGQAQSDPIPRKSDSLPPNIPVAKADSLLSKNKASGPILVCRKRSSMSAKPSSTNFGQKNDQPIFNDKKERAPSDSKPPTKPSSSDTDEDEPPKAKEKPVTGARSLRRSNKNLNNKKLPSNSTPKAGSSGNKPSESLKPEKSKAEGGADKKRSAAADFLKRIKRNTSVDAVKGGGAGGGGSSSSSKGGGGGVGAKEQKKMVNNVKGDKGKERASRHGVGGGSGSADKRNKNIENSSQSKRSVGRPPKKAAETNAGSSKRGRENSASAGKDKRPKKRSKK*


CDS Sequence:
>Vu_18850.1
ATGGAAAACCACCAAAACCACAAGGGAGAGGCAGAACCTGATAGAGAGAACAACCAAAACAATAACCAGGCGTGGGGCACGTGGGAGGAGTTGTTGCTAGCGTTCGCTGTGAACCGCCATGGCTTCAAGGACTGGGACACCGTCGCCATGGAGGTTCAGTCGCGCGCCACGCGCCTCCTCGCCACGGCGCGCCACTGCGAGCAGAAATTTCACGATCTCAGCCGCCGATTCGCCGACCAATGCAACGACGGTGTTACGCCGCCGCAACATGACGGCGAAGCCACCGGGGACAACTCCGATCACGTCCCTTGGCTGGACGAATTGCGTAAACTCCGTGTTGACGAGCTCCGCCGCGAGGTCCAGCGGCGCGACGATTCCATTATGTCGCTGCAGTTGGAGGTGAAGAGGCTGGAGGAGGAGAAAGCGAAAGAGAATGACGGTAAAGACGGCGAGAAACCAGATCTGGCGGTTCCCGGCGAAGTGCGGCCGGAAAACGACAAAACCGGCGGAGAAGTTGAAGAGGTTGGACCGGCGAATTCCGGACCGGACAGAACCGCAAACGCTGACAAGATGTTGCCAACAACGGGCGACGAATCCGACCGGGAGAATCAATCAGTTAACGAGTCTAACTCGACCGGTTCGAGGTTTGATAAAACCGGAGAAGGTGATGCAAAGTTAAAAGTCGAACCGGATCCGGTTCAGACCGGTTCAAAAGAAGTGGACCCGGTTGCGAGGAAGGGAAAACCGGTTGGGGAGGAATCGAATAATGGAAGCTACGATGCCTTGGCGAAGGTGCCAACGTGTGAGTCGGTGCCTCCGAGTGGCGAGAGGAAGGTGGAGCAGGATGATGACTCGTCTGAGTTGCACGACTCGGTGGCTCACTCCGGGGAGGGAGGGACGAGGGAGAGCAGCGAAGTGCAGAGCTCGGCCAGCTTGACGCGAAAGAGGAAGACGCGACGTAGAAAAGATGTTTCCGGCGGCGACGGTCGCGGAGGCGGCGCTTCTACACTGCCGGAGAACGAAGAGGTAGCGGTTAAATCAGAACCGTTGGTTGGTATTTTGGAGTTGATCAAGGGACATGAGCATTGTTCATTAATCGAGAGTCGTCTTGAGAGCCAGCTGGAGTCGGACAGATACAAAGACATAGTGAAACAGCCACTGGACATGGAAACCATACAATCAAGAATCCAGAAAGGTCAGTATTTCTCATGCACTAGTGCATTCTTCCGCGACCTCCTCCTCCTGTTCACCAACGCTACCGTCATCTTCCCCGTTGACTCTCCAGAGTCACAGGCGGCAAGGCAGCTGCACCGCCTTGTCACCACCGAGATGAAGAACCACGGCCAAGCACAATCCGACCCTATCCCCCGGAAGAGCGATTCACTCCCTCCAAACATACCAGTAGCCAAAGCAGATTCTCTCTTGTCCAAGAACAAAGCCTCTGGTCCCATATTGGTTTGCCGCAAACGCAGTTCAATGTCAGCGAAACCTTCCTCGACCAATTTTGGCCAAAAGAATGACCAACCCATCTTCAACGACAAGAAGGAAAGGGCACCTTCTGATTCAAAACCTCCTACGAAACCTTCTTCTTCTGATACAGACGAAGACGAGCCCCCCAAGGCCAAGGAGAAGCCTGTCACTGGAGCGAGAAGTCTGAGAAGGAGCAACAAGAACCTCAACAATAAGAAACTTCCCTCTAACTCCACTCCTAAGGCGGGGTCCTCGGGTAACAAGCCATCAGAGAGTCTTAAACCAGAGAAGAGCAAAGCAGAGGGAGGGGCAGACAAGAAGAGGAGTGCTGCTGCAGATTTCTTGAAACGGATAAAGCGAAATACTTCAGTGGACGCAGTGAAAGGTGGTGGTGCCGGAGGAGGAGGAAGTAGTAGCAGCAGCAAGGGAGGTGGAGGTGGTGTTGGTGCCAAAGAGCAGAAGAAAATGGTGAATAATGTAAAAGGGGATAAAGGGAAAGAAAGGGCATCAAGGCATGGCGTTGGAGGGGGATCAGGGTCTGCGGATAAAAGGAATAAGAACATCGAGAACAGCTCTCAGTCGAAGAGGAGTGTTGGTAGACCTCCAAAGAAGGCAGCAGAGACAAATGCAGGAAGTTCAAAGCGTGGGAGGGAAAATAGTGCTAGTGCTGGCAAAGATAAGCGACCCAAGAAACGTTCCAAGAAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_18850::LG4:66469812-66471812(+)
TTAATGATTTCACATCACATTAACAACTCAGCTTAATTTTAACCCGTTAACCCAATTTAACATCAGGGACCCAATTGTACTGATTTTGCATTTTTAGGGATCCAATTGAAAAAAAACAGAAAAAGAAACCTATTTGAGAAAACCCAACATAAATAGGAACTATCATGATTAAACCTTTATGTTTAAATGATATAATTTTGAACTATGGATAAAAAAAAAAGTTAAACTATTACAAGAAAATTTTACTAAGTTTATCAAGTGTAATACTCAATTAATAAGTTCTCCAAACAAAAAAAAAAGTTTATCATATATCATTGTACATTTTGGTGTAATATTGAAAAACACTTCTTAAATATATAATTAGTTGATTTAAAAGTGTATATGCGTATATAAGAGAAAAAACTAATTAAGAATTTTCAGAATATAAAGTTAATCCATTGATATAACTACTGATTATATTTAATTTTTAATAATACAATCAACAATCAATTATATATATACACTTTGATTTTTATAATAATGAACTAAATGCTAAAATCAATATATTTTTTATATTTATAAAATCCTAAACAAAAATATAATAATATAAATTGAACTTTTGTCAATAAACAAAATTTACAACCATATTTAATTTTTAGTTAAAATAATGAATTTATATTTTGAACAAAAAAAACATTGCTTACACCAGTTTCTCAAGCTATCACTCAAAAGTTTCACCGCACTTTGCTGATTATAATTTGTCTCGTTTCTACTTGAAGCTCGTCAATTAATTTCAGTGAACAAAAATGGTTATAATTTTATTCTACGTCTCACTTTTAATTATTTTTTTTAAGATGTAAGAACAGCCTGATATAATATTTTAGTACTCTAAAGTGAGCTAGCAGATTGATAAGTGGGGTTTTGTTAATACATTCTATATAAAATTATAAATACTATTTTATAAAATGTTTTTTTATCATTATTTTAAATGACTCCTTTTACATTTAGTGTCTTATTCAAGGTCCTAAATTTTAATTACATCACACAATTGAAAATAGGAACTATATGAAAACTTTAAACACTTGTAGAATGATTTTCTGAAGTAACCAACTTAGTTTTAAAGTAAACTAAGTATACTAATTATTGATGGAAAATTAATAAATAGTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACACATGTGTGTATGGATACTTTATGAATACTAATAGTAATATACGGTTTAGAGTAGATAAACCCTCCATAAACTGATTCATGGTGCAACATGGGCCGGACAACATTAATGGCAATACATTGTAATGAATTTATGATTAAAAAAAGAGTTTAGTTTTGAAAACAGTAACCACAAAATTTGTTTTACTTTTTGTTATTAAAAGGGACAGAACAGAATCATGTAACTCGTTTTACTTAATTACAACAGGGCTTCAGAGCTTTTATTGGAAGTACTAAAGATTGGGCCACTGAAGAGAGTACAGAAGGTAGAAGAAAAACCAAAAGCGGGTCAAGAGTCCAATTTGGAGGAGAACCCGAAGCACAAGGAGGGAGAGAAATTGGCGATTCAATTTGAAGGGTCAGTGTCGCAAGTAGAAAGCAAAATTCAATTCAGTGCTTCATTGGAGTAATGTGCTGAGGATAAGTAAGACCCGTGGAACGAAGACGTTAGTGCACAGTGTTGGTTTGGTACGTTACAATTTCTAATCTCGAACTATCACACACAAAACACTAGAGCACCACCACCGCGTCCAAAACCCCAGCCCCCAAGCCATGACACGATGAAGTTGGAAGATTTTTACCAACCAAAAGCCACAAACTCAAAGCACACCACCGCTTAGGAGAGATTTGTTAGGAGCCTTAAGCCATGGAAAAAGCAAGAAAAAACCCTAATGACTGCTTTTAATTTTATTTAATTAAAGTTAATTTAGTTTCTCAAAATAAATATTATTTTAAAAAATAATAATTAAGATATTGGATTTGAAGAGGTGTG


Gene Sequence:
>Vu_18850(+)
GAGAAGAGGAGGCGGGTGTTGGAAAGAGCCAGTTTATGGTTAAACCACAACATATTTTTCTTTTTCCTTCTTCTTTCTCGTAGCGTATGGAAAACCACCAAAACCACAAGGGAGAGGCAGAACCTGATAGAGAGAACAACCAAAACAATAACCAGGCGTGGGGCACGTGGGAGGAGTTGTTGCTAGCGTTCGCTGTGAACCGCCATGGCTTCAAGGACTGGGACACCGTCGCCATGGAGGTTCAGTCGCGCGCCACGCGCCTCCTCGCCACGGCGCGCCACTGCGAGCAGAAATTTCACGATCTCAGCCGCCGATTCGCCGACCAATGCAACGACGGTGTTACGCCGCCGCAACATGACGGCGAAGCCACCGGGGACAACTCCGATCACGTCCCTTGGCTGGACGAATTGCGTAAACTCCGTGTTGACGAGCTCCGCCGCGAGGTCCAGCGGCGCGACGATTCCATTATGTAAATCTCCGAAATTCTTCTGATAATATTTTATTCTTTTTAGGTTTTAGATCTAATTTTACCTTTTTCTTTAATTTTTGTTTTTTTTAATGGTCCGTTTTTTTTATACCAAGGTCGCTGCAGTTGGAGGTGAAGAGGCTGGAGGAGGAGAAAGCGAAAGAGAATGACGGTAAAGACGGCGAGAAACCAGATCTGGCGGTTCCCGGCGAAGTGCGGCCGGAAAACGACAAAACCGGCGGAGAAGTTGAAGAGGTTGGACCGGCGAATTCCGGACCGGACAGAACCGCAAACGCTGACAAGATGTTGCCAACAACGGGCGACGAATCCGACCGGGAGAATCAATCAGTTAACGAGTCTAACTCGACCGGTTCGAGGTTTGATAAAACCGGAGAAGGTGATGCAAAGTTAAAAGTCGAACCGGATCCGGTTCAGACCGGTTCAAAAGAAGTGGACCCGGTTGCGAGGAAGGGAAAACCGGTTGGGGAGGAATCGAATAATGGAAGCTACGATGCCTTGGCGAAGGTGCCAACGTGTGAGTCGGTGCCTCCGAGTGGCGAGAGGAAGGTGGAGCAGGATGATGACTCGTCTGAGTTGCACGACTCGGTGGCTCACTCCGGGGAGGGAGGGACGAGGGAGAGCAGCGAAGTGCAGAGCTCGGCCAGCTTGACGCGAAAGAGGAAGACGCGACGTAGAAAAGATGTTTCCGGCGGCGACGGTCGCGGAGGCGGCGCTTCTACACTGCCGGAGAACGAAGAGGTAGCGGTTAAATCAGAACCGTTGGTTGGTATTTTGGAGTTGATCAAGGGACATGAGCATTGTTCATTAATCGAGAGTCGTCTTGAGAGCCAGGTATTCCATTTACTATTTTCGTGGATAAAACCGGTAATTCACTTCTTTCAAATTTTAAATAATAATAATAATAATCTTTCATTCTTTTATTATTAAAACAAATTACTTTTTTTTAATACATGCACGTTGAATATATACAAAATGTTTCCTACACTAATAATTAACTAAAAGAAATTAAATATATTTTTTTAAATAAGTAAAATTTAATTGCAAGCAAGAGGTTTTAAAATCGTGACTGTCCAACGGAAGGGGACCACTTTTGAAACAGATTGGTTTTAATGGGTATGGAATTTGTGAATAGAAAAGAGCGAATCGAAAATAAAAATTGAAAGAGCATGATATATATTCAATTTCATCATAAAGAGAAAAACGAATGAGAGGATCCATTTCTAGTTTCTTTTTCTAGGACTAAAGTGAAGTTAAAGATTTGATAGTTTCCCACGGCCGAAAATGGTAGATAACACATGGCCGTGTTCGTATTGTTTCATGGCACTTATTTTAAGAAAGAGATGAATTTTTAATATCGTTAATATGTCAGAAGGTAAAATTAATTACATTATTTGGATAAATAATTTTATAAATTTCTTTCTACACCCGCCCATTATTATGAACATGGGAGTATAATCTGTCGGGTCTCAATGTGAAACCTGGAAGTCTTTTAATTTGGAAGATGTTTATTATAACTTCTCATTATCCCATGGCCAAAATAGAATCAATAAGGCCAATTTAATTTTCTCCCACGAGAAAATTACTTTATTTTACCCTAAATGTGGGAAGGAAAGTAAGTATCAATATTACCATATGTAGTTTTGTGAGCCCAGTATTTGAGTGCAGCCGCATGCAACGAGCTCACAAATTATTTTAGACCGAATCGTCATAAGCCCACTACTAGGAGAGCTTTTTGGGCTAAATCCTATTTACTACGACCCAAAATAAACAACTTGACCAAGACCAAGTTTATTTTTAATTATTATTCTGGTTAAACTTTTCTTTTTCGTTCCCTTTTCTTGCGCCCATGCTTCGCGGCGGTGACGTGTTTGTTCACGAGTCTTTGTCATCCAACTGTGTCTTCTCTGAATATTAAATTTGGATACTTTCTGTTTTTTAGAGTAAACCTGCTTATTGCAAGTTATTATTTGCATTTTTCATTCACTGTTTACTTTTTTTTTCTTTCTAAACATCTATTTTCCTTTATTATATATTTATGAATAATGAATTTCGCACAGATAGAGTAATAATTTTGTAATGATATTTATTTATCCATTTAGAATGCATCTATACCTATTTGATAGAGATTATTAGTTTTGTAACTGCCTCATGACATTTTTTTTGTCTACATGTTTTTACCTATTTTATCTTTATTAATATTAATACCCTTCTTAATATAAATTATTTTATTATTTTACTTTATAAATTTTATAATTACTTTTAAATTTTAATTAATTATCTATAATAAAATTATACTTATCTTTCTTAATATGAATAAATTTATTTTTCCTGTTTAAATTGTATAATTATTTTTTAATTAACTGCCTAGAATAAAATCATAAAAAGTATTTCTTTATTATATTATTATTTTTAATGATTATGATAAAACGTGGATATAGATGTGTTTCCACTGTTATATAAAAATGTAAATATCAACTAAGTTAATATAATAATATAATTATAATTAGTATTTTATTAAAAAATGTAATCAATTTAATGTTCTTTGTCTAATCGAATGTGTGGATTGGACGGGACGGGAATGCTACCGAATTGGCACTAAGCTGTTAATGTTTGGATTTGATAATAAAAAGAAAATCTGTACGGTAGTGGAAATACTAATGGACAGTAGCTTTTTGTGCCCTTTCCCTGGTTGTTCCTGTGCTCGTCCTTTCTCGTTGAAACAGCAAAAGCGCGGTCATAGATGTGTGCGCCCTCTCATGGTTATTTTAAAGATCTTTTTATTGCTAAATATATCCCAAAAATTAATTGCAAGTAATCAAATGTTTTATCTATATTATAATAATTCAATTTTTAATCTGACCAAACCCTTAGACCTTAGAAACTCATATATGTTTCCTGAGTGGACATTATATGTACACGTGTGCTAATAAAAATAAGTATTTGTACATGTTGACGAAAAGCCCAATGATTTCGCAGGATAAAATACCTGTTTCGCATGTTAAAAATTTAACCTTGAATGGATATTAGATGTAGGTTCGTGCAATTATGACAATTTAGTGAACATATTTTGGTGTGGTCTCTTGTGGCAGCTGGAGTCGGACAGATACAAAGACATAGTGAAACAGCCACTGGACATGGAAACCATACAATCAAGAATCCAGAAAGGTCAGTATTTCTCATGCACTAGTGCATTCTTCCGCGACCTCCTCCTCCTGTTCACCAACGCTACCGTCATCTTCCCCGTTGACTCTCCAGAGTCACAGGCGGCAAGGCAGCTGCACCGCCTTGTCACCACCGAGATGAAGAACCACGGCCAAGCACAATCCGACCCTATCCCCCGGAAGAGCGATTCACTCCCTCCAAACATACCAGTAGCCAAAGCAGATTCTCTCTTGTCCAAGAACAAAGCCTCTGGTCCCATATTGGTTTGCCGCAAACGCAGTTCAATGTCAGCGAAACCTTCCTCGACCAATTTTGGCCAAAAGAATGACCAACCCATCTTCAACGACAAGAAGGAAAGGGCACCTTCTGATTCAAAACCTCCTACGAAACCTTCTTCTTCTGATACAGACGAAGACGAGCCCCCCAAGGCCAAGGAGAAGCCTGTCACTGGAGCGAGAAGTCTGAGAAGGAGCAACAAGAACCTCAACAATAAGAAACTTCCCTCTAACTCCACTCCTAAGGCGGGGTCCTCGGGTAACAAGCCATCAGAGAGTCTTAAACCAGAGAAGAGCAAAGCAGAGGGAGGGGCAGACAAGAAGAGGAGTGCTGCTGCAGATTTCTTGAAACGGATAAAGCGAAATACTTCAGTGGACGCAGTGAAAGGTGGTGGTGCCGGAGGAGGAGGAAGTAGTAGCAGCAGCAAGGGAGGTGGAGGTGGTGTTGGTGCCAAAGAGCAGAAGAAAATGGTGAATAATGTAAAAGGGGATAAAGGGAAAGAAAGGGCATCAAGGCATGGCGTTGGAGGGGGATCAGGGTCTGCGGATAAAAGGAATAAGAACATCGAGAACAGCTCTCAGTCGAAGAGGAGTGTTGGTAGACCTCCAAAGAAGGCAGCAGAGACAAATGCAGGAAGTTCAAAGCGTGGGAGGGAAAATAGTGCTAGTGCTGGCAAAGATAAGCGACCCAAGAAACGTTCCAAGAAATGATTCAAGTTTCATAGTTAGTCTCTCTTTTCCTTCCTCTGTATATTATTTATTATTATTATTATTTTATCTCCAAAGCATGGGTTTCTTTTTTTGTTTTATACTGCTAATTTATTGATCAGCTGTAGCTTGTAGTCAGTTGGCCGGTACATGTAACAGTATTTTGATTTGGTAAACCTTGTAACAACATTGTCCTTCCGCGGACTGCTTTTCTTGATTTTTTGGTTTAACAGGAAAGCATAGTCAGTGCCAGGTGCCTGTGCTCGTTTTGATCACC