Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_18812 LG4 65787924 65791812 PREDICTED: disease resistance protein At4g27190-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 65788621 intron_variant
T/C 65788964 intron_variant
T/A 65789017 intron_variant
G/C 65789099 intron_variant
T/C 65789141 intron_variant
T/A 65790208 missense_variant p.Gln535His
G/T 65790261 missense_variant p.Leu518Met
C/T 65790383 missense_variant p.Cys477Tyr
G/T 65790402 missense_variant p.Leu471Ile
T/G 65791213 missense_variant p.Lys200Asn
T/G 65791235 missense_variant p.Glu193Ala
G/T 65791451 missense_variant p.Ala121Glu
G/C 65791475 missense_variant p.Thr113Arg
T/C 65791497 missense_variant p.Lys106Glu
C/T 65791503 missense_variant p.Glu104Lys
A/G 65791504 synonymous_variant p.Asn103Asn
C/A 65791507 missense_variant p.Met102Ile
T/G 65791509 missense_variant p.Met102Leu
G/A 65791579 synonymous_variant p.Cys78Cys
C/G 65791583 missense_variant p.Ser77Thr
T/C 65791606 synonymous_variant p.Leu69Leu
A/T 65791612 missense_variant p.Asn67Lys
A/C,* 65791633 missense_variant p.Asp60Glu
C/G 65791638 missense_variant p.Asp59His
G/T 65791668 missense_variant p.Gln49Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_18812.1
MKAAVVAHHLGNLISNRSILENLKTDLKTLQDQRQKVQENLIWEDKEFQTQSDWLKRVDDILGQGDNLLNSYEGRSSCTNILLRYKVGKQSRKMQPEISVLMNEGKSHVSAKTRKHYERPASRDETIVTSMDFLINPDIQAVGVWALGGLGTTSLAENIREKTKEQNVFDAMVFITVTDKPNQEQVQNAIANELGVQFTKGESLVKRRNKLRQRIKKEQSTLIIVDDTWGELNPEEFDLEEFGVPPGNEHERCKVFLTSGNVKFLKYFDDAPELNIVFQLEELQKEEARKLFEKKVGSFDEDQSYIVEEIVRSCEGSISLIYALAKALENKGEDALMQFKENSSPAKLLSYCLEENEEHKALLYLLVIRGRRFINRYSMYIDMWTGVFKNLETADAARKKRESLISDLKAYGLVFENGKDCVKVDDYIYHTAYRMALHDRRASVISTEWPPEELLTDLHFCNLHPVGDLKLPATLQCPNLKHLLISRENSTIDVPDSFFKETKLLKVLDFVSFHCPKLPPSFVVLKDLEALSMYQCGLEDIKEVCELTNLRMLGLLESSIRQLPAQIVKLQKLLFLDLRDTNLQVIPPNVLSKLTSLEELYLRNSFCNWEIETSTSENKNASLKELTDLEHLAYIEDMYVPDPQAWPVDLFFGNLRSYTIFIGKGWDRAYDGDHELKTLKLKLNRRFQSENGIKKMLKEVQVLYLDTLNGVQNVVNDMECDGFPQLQSLFIQHNAEVKFIATGSGNDPLDTFPNLESLSLTILSILEYIYHGDSLTEKSFFKLRVIKIEKCNAMRCLFSVSMINGIPHLATLEVSQCTSIKAIVLFEGAENRPIEFPELCSLTLQGLPALISFCSTEGSSSATLFHDKVSCPKLETMVISEVSELTTIWNEEYDAENSFGKLKNVIIKDCEKLRTVFPVNLSKNLDNLKTLEVRNCSLMTSIFTVMRQDSTKAGLQLSIPMIEITLTGLPKLEYVCVTTGFEALKKKFEEEWYAGLPGLSGNARIEHGRKMKKYLEEYLNM*


CDS Sequence:
>Vu_18812.1
ATGAAAGCAGCAGTGGTTGCACATCATCTTGGTAACCTAATTTCCAACAGAAGTATTTTGGAGAATCTCAAAACTGACCTCAAGACTCTGCAAGATCAAAGGCAAAAAGTGCAAGAAAATCTTATTTGGGAAGATAAAGAATTCCAGACTCAAAGTGACTGGCTCAAAAGAGTGGATGATATTCTTGGACAAGGGGATAATTTATTAAACTCCTATGAAGGCAGAAGTAGTTGCACAAATATTTTGTTGCGGTACAAGGTTGGTAAACAATCAAGAAAGATGCAACCAGAGATTTCAGTATTAATGAATGAAGGAAAATCTCATGTATCAGCGAAAACACGAAAACATTACGAAAGACCAGCATCAAGAGATGAAACGATAGTAACTAGTATGGATTTCCTAATTAACCCTGATATCCAAGCAGTTGGAGTATGGGCGCTGGGTGGTTTAGGCACAACCTCATTAGCCGAAAACATTAGAGAGAAAACAAAAGAACAGAATGTGTTTGATGCAATGGTTTTCATAACTGTAACTGATAAGCCAAATCAGGAGCAAGTTCAAAATGCTATTGCAAATGAATTGGGAGTGCAGTTTACCAAAGGAGAAAGTCTTGTGAAAAGAAGAAATAAATTGCGTCAGAGAATAAAAAAAGAGCAAAGTACTCTCATCATAGTTGATGATACGTGGGGGGAATTGAACCCAGAAGAATTTGACTTGGAGGAATTTGGAGTTCCTCCGGGTAATGAACATGAACGGTGCAAAGTATTCTTGACATCAGGAAATGTGAAATTTTTAAAATATTTCGACGATGCCCCTGAGCTTAATATAGTGTTTCAATTAGAAGAATTACAAAAAGAAGAGGCTCGGAAGCTGTTTGAGAAGAAGGTTGGAAGTTTTGATGAAGATCAAAGTTACATTGTAGAAGAAATAGTGAGAAGTTGTGAAGGTTCCATTTCTTTAATTTATGCCCTAGCAAAGGCATTAGAAAATAAGGGCGAAGATGCCTTGATGCAGTTCAAGGAAAATAGTTCACCAGCAAAACTATTGTCCTATTGTTTGGAAGAAAATGAGGAACACAAAGCATTGTTGTATCTTCTTGTTATTAGGGGAAGAAGATTTATTAACCGTTATAGCATGTACATAGACATGTGGACAGGTGTATTCAAAAATCTGGAAACAGCAGATGCTGCAAGAAAAAAGCGTGAGTCACTGATTAGTGATCTGAAGGCCTATGGTCTTGTGTTTGAAAATGGAAAGGACTGCGTCAAAGTAGATGACTACATATATCATACTGCTTATCGAATGGCCCTACATGATAGAAGAGCTTCAGTGATTTCCACAGAATGGCCACCTGAAGAATTGCTAACAGATCTTCACTTCTGCAACTTACATCCTGTTGGTGATTTGAAACTTCCCGCAACGTTGCAATGTCCAAACTTGAAACATCTTCTGATAAGTAGGGAAAATTCCACAATAGATGTTCCAGATTCATTTTTTAAGGAGACTAAACTTCTAAAAGTGCTAGATTTTGTTTCCTTTCATTGCCCAAAGCTGCCTCCTAGTTTTGTTGTTTTAAAGGACCTTGAAGCATTATCCATGTATCAATGTGGATTGGAAGACATTAAAGAAGTTTGTGAGCTCACAAATCTACGAATGCTAGGCCTCCTTGAAAGTAGTATCCGACAATTGCCTGCGCAAATTGTAAAGCTTCAGAAGTTGCTATTCTTGGATTTAAGAGACACAAATCTCCAAGTGATTCCACCCAATGTCCTGTCCAAATTGACAAGCTTGGAAGAATTATATTTGAGAAACTCCTTCTGTAATTGGGAGATTGAAACGTCTACCAGTGAAAACAAGAATGCAAGCTTGAAAGAGCTTACAGACTTGGAACACTTGGCATACATAGAAGACATGTATGTTCCTGATCCGCAGGCATGGCCTGTGGACTTGTTCTTTGGAAACCTAAGATCATATACAATTTTCATTGGTAAAGGGTGGGACCGAGCATATGATGGTGATCATGAATTGAAGACATTGAAACTGAAGCTGAACAGGAGGTTTCAGTCAGAGAATGGAATAAAAAAGATGCTGAAAGAAGTTCAGGTTTTGTACTTGGATACACTGAATGGTGTCCAGAATGTTGTTAATGATATGGAGTGCGATGGGTTTCCACAACTGCAGTCTCTTTTCATTCAACACAATGCTGAAGTCAAATTCATAGCCACAGGGTCAGGGAACGATCCTCTTGATACTTTCCCGAACTTGGAGTCACTGTCTCTCACCATTCTGAGCATTTTGGAGTACATATACCATGGTGATTCCTTAACTGAGAAATCTTTCTTCAAACTGAGAGTCATCAAAATAGAGAAATGCAATGCAATGCGATGTCTCTTCTCAGTATCCATGATCAATGGTATTCCTCATCTTGCTACTTTGGAAGTTTCACAGTGCACATCCATAAAGGCAATTGTGCTATTTGAAGGTGCAGAGAATCGTCCCATAGAATTTCCTGAATTATGCTCTCTAACCTTACAAGGACTCCCAGCATTAATCAGTTTCTGCTCAACTGAAGGATCCTCTTCTGCTACACTTTTCCATGACAAGGTTTCTTGCCCTAAGCTGGAGACAATGGTGATTTCCGAGGTTAGTGAATTGACAACAATATGGAATGAAGAGTATGATGCTGAAAATTCATTTGGGAAACTGAAAAACGTAATTATCAAAGATTGTGAGAAATTGAGAACTGTTTTTCCAGTTAATCTTTCCAAAAATCTTGATAATTTGAAGACGTTAGAGGTTAGAAATTGCAGTTTAATGACGAGCATTTTCACTGTGATGAGGCAAGATAGCACAAAAGCAGGGCTTCAACTGAGCATTCCAATGATTGAAATAACTTTAACTGGTCTTCCCAAATTGGAGTATGTGTGTGTTACTACAGGATTTGAAGCCTTGAAGAAAAAATTCGAGGAAGAATGGTATGCTGGCCTTCCCGGATTATCAGGTAACGCACGTATTGAACACGGAAGAAAAATGAAAAAATATTTGGAAGAATATTTGAATATGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_18812::LG4:65791812-65793812(-)
CCTGACCCGACCCGACTCACCACGGGTTGGCCACATAGTGAGCCAACACAACCCGACTCATTTATTAGCGAGCCGAAAAAATTCGAACACGACCCGACCCACCACGGGTTGGTGGGTTAAACGGGTTGACTCATTGACTCACTTAATTAACTTTTTTTTCACCCTCTTCTTCTGAGATTCTTATAACATGTTACTTTGATCGATCAAATGGAAACAGTAATAATTGGACCAATTGATGATATAAAAGAAAATGAAACAAAAGAAATATATTGTTATATATATTCTAAGCTATCAAGCATCAAATTTTGCCAATTTAGTTTAATGAGACATACACAACCGTTTTGACCAAGAAACTACATATAGCCGTTAACAAAAATATATAGCACAAGATAAAATTGTCATGCTTGTAGATATGTCTAAAAACAAGATAAAATAAATGATATATTCCTGAATTATCCAATCTATAATATTATCCATCTATTAAATTGGAGTCCTAAATGGATAAATCCACAGTATTATGCTCTCTTGAAGCATTTTCTTCTTTATCTCCATCTATAATATTATCCAATCTATAATCTTAGGGTTTTATTTGCAGAGGGAACTTTTGGAAAGACAGCAGCGCGAAAGGCTCTATTGCTATGTAAAGGTTGTGTATTTTGAATAACTAATTTAATTAATTTGATTTCAATAAAAAAATAGGATTTGAATAATTAATTTAATTAATTTGATTTAATTAAAAAAAATAGGTGGGTTGGTGAGTCAACCCGACCCACCATGGGTTCAACCCATGTGAGCCGGGTTCTTAGTGAGCTGGGTCAAAATTGACTCGCATAAAATTTTTTGCATTTTTTCCAACCCAACCCGACTCAAACCCGTGGTGAACCGGATTGGCTCACAGGTCTCAACCCATTTTGACGGCACTAGAGAAAACGGCTAAGTCCAAGTTTTGTTTCATATTCCTCTTCTTAGCTTAACCAATTATAGGTTTCGAAGTGAACTTTTAATTAGAGTTGACTCAATTACGACCTAAGAGCCTATAGACATGTTTTACCATGTTAAACATGTTGGATTTGTGATGATGATTTTAATATGTACTACCGATCGATCTTCTGTAGAAATGGTAACCGATTGGTCGATGCTGCTATGGGGTTTTAGGGAATCTTCATTATTTTGGGAGAGTTGATCATTCGGTGACTAAGGGAATGCATTGACAGGGCGATTAATTATAAACGTACTATGATTAAAATTGTTCTTTTGAAAATTTACTACGATTGGTGTGCTTTGAAGCACTACAAGAAAATCTTTAAATAACAATCAATTTTTGAAATAAAAATACTTGGTCAGGAACTAATTTAGGTACTAATTTATAAACTAAAAATTATTATTATCTAAAATAGTATTTATTATTAATAAAAAAATTATAATTACTTTATGAATTAGACTTGGTCATTAACATTAATTATAATTACTAATATCTCAAAAAAATTTAATTTATAAATTGACATCTTGTCAATAACCAATTACTTTTTATCTTTAAAATTTGTTACATTTAAAGATTATTGCGAAATGTGAATCTAAATTATATGTAAGATGTGATAATACATACCCATGCCAAACTTTTACATATAAAAAAAACTAATATAATATTGTCCTTTTATTTATAAAATTATAATCATGTCCTTTCGATACCGGTTAAATGTGAAATGTTGAAGTTTGTGTGCGATATTATTTTTTTGCCAGTAATAAATTAAATAGTTTGTTCAATTTGTTTTGTTCATGAAAGGAAGTACAGTTGAAGACAAATTGCTCTTAAAGTCACATCCTTTCTGTTTTCGTCATTATCTAAAAGAGGGTGAGCCATTTGCTTCAAATTTTGCGTCGCTTCATTAAAGTTGTTACCTCTATCTATTATCCTATCCTAGATTAAACTAGTATCTCCTTTGCAGCAACCAACACAAGAACAAAGGAAAGGAAGATCATTTGGCACATTGTTTCAAAAG


Gene Sequence:
>Vu_18812(-)
ATGAAAGCAGCAGTGGTTGCACATCATCTTGGTAACCTAATTTCCAACAGAAGTATTTTGGAGAATCTCAAAACTGACCTCAAGACTCTGCAAGATCAAAGGCAAAAAGTGCAAGAAAATCTTATTTGGGAAGATAAAGAATTCCAGACTCAAAGTGACTGGCTCAAAAGAGTGGATGATATTCTTGGACAAGGGGATAATTTATTAAACTCCTATGAAGGCAGAAGTAGTTGCACAAATATTTTGTTGCGGTACAAGGTTGGTAAACAATCAAGAAAGATGCAACCAGAGATTTCAGTATTAATGAATGAAGGAAAATCTCATGTATCAGCGAAAACACGAAAACATTACGAAAGACCAGCATCAAGAGATGAAACGATAGTAACTAGTATGGATTTCCTAATTAACCCTGATATCCAAGCAGTTGGAGTATGGGCGCTGGGTGGTTTAGGCACAACCTCATTAGCCGAAAACATTAGAGAGAAAACAAAAGAACAGAATGTGTTTGATGCAATGGTTTTCATAACTGTAACTGATAAGCCAAATCAGGAGCAAGTTCAAAATGCTATTGCAAATGAATTGGGAGTGCAGTTTACCAAAGGAGAAAGTCTTGTGAAAAGAAGAAATAAATTGCGTCAGAGAATAAAAAAAGAGCAAAGTACTCTCATCATAGTTGATGATACGTGGGGGGAATTGAACCCAGAAGAATTTGACTTGGAGGAATTTGGAGTTCCTCCGGGTAATGAACATGAACGGTGCAAAGTATTCTTGACATCAGGAAATGTGAAATTTTTAAAATATTTCGACGATGCCCCTGAGCTTAATATAGTGTTTCAATTAGAAGAATTACAAAAAGAAGAGGCTCGGAAGCTGTTTGAGAAGAAGGTTGGAAGTTTTGATGAAGATCAAAGTTACATTGTAGAAGAAATAGTGAGAAGTTGTGAAGGTTCCATTTCTTTAATTTATGCCCTAGCAAAGGCATTAGAAAATAAGGGCGAAGATGCCTTGATGCAGTTCAAGGAAAATAGTTCACCAGCAAAACTATTGTCCTATTGTTTGGAAGAAAATGAGGAACACAAAGCATTGTTGTATCTTCTTGTTATTAGGGGAAGAAGATTTATTAACCGTTATAGCATGTACATAGACATGTGGACAGGTGTATTCAAAAATCTGGAAACAGCAGATGCTGCAAGAAAAAAGCGTGAGTCACTGATTAGTGATCTGAAGGCCTATGGTCTTGTGTTTGAAAATGGAAAGGACTGCGTCAAAGTAGATGACTACATATATCATACTGCTTATCGAATGGCCCTACATGATAGAAGAGCTTCAGTGATTTCCACAGAATGGCCACCTGAAGAATTGCTAACAGATCTTCACTTCTGCAACTTACATCCTGTTGGTGATTTGAAACTTCCCGCAACGTTGCAATGTCCAAACTTGAAACATCTTCTGATAAGTAGGGAAAATTCCACAATAGATGTTCCAGATTCATTTTTTAAGGAGACTAAACTTCTAAAAGTGCTAGATTTTGTTTCCTTTCATTGCCCAAAGCTGCCTCCTAGTTTTGTTGTTTTAAAGGACCTTGAAGCATTATCCATGTATCAATGTGGATTGGAAGACATTAAAGAAGTTTGTGAGCTCACAAATCTACGAATGCTAGGCCTCCTTGAAAGTAGTATCCGACAATTGCCTGCGCAAATTGTAAAGCTTCAGAAGTTGCTATTCTTGGATTTAAGAGACACAAATCTCCAAGTGATTCCACCCAATGTCCTGTCCAAATTGACAAGCTTGGAAGAATTATATTTGAGAAACTCCTTCTGTAATTGGGAGATTGAAACGTCTACCAGTGAAAACAAGAATGCAAGCTTGAAAGAGCTTACAGACTTGGAACACTTGGCATACATAGAAGACATGTATGTTCCTGATCCGCAGGCATGGCCTGTGGACTTGTTCTTTGGAAACCTAAGATCATATACAATTTTCATTGGTAAAGGGTGGGACCGAGCATATGATGGTGATCATGAATTGAAGACATTGAAACTGAAGCTGAACAGGAGGTTTCAGTCAGAGAATGGAATAAAAAAGATGCTGAAAGAAGTTCAGGTTTTGTACTTGGATACACTGAATGGTGTCCAGAATGTTGTTAATGATATGGAGTGCGATGGGTTTCCACAACTGCAGTCTCTTTTCATTCAACACAATGCTGAAGTCAAATTCATAGCCACAGGGTCAGGGAACGATCCTCTTGATACTTTCCCGAACTTGGAGTCACTGTCTCTCACCATTCTGAGCATTTTGGAGTACATATACCATGGTGATTCCTTAACTGAGAAATCTTTCTTCAAACTGAGAGTCATCAAAATAGAGAAATGCAATGCAATGCGATGTCTCTTCTCAGTATCCATGATCAATGGTATTCCTCATCTTGCTACTTTGGAAGTTTCACAGTGCACATCCATAAAGGCAATTGTGCTATTTGAAGGTGCAGAGAATCGTCCCATAGAATTTCCTGAATTATGCTCTCTAACCTTACAAGGACTCCCAGCATTAATCAGTTTCTGCTCAACTGAAGGATCCTCTTCTGCTACACTTTTCCATGACAAGGTATTAAAATATTTCCAGCACTGATAAGGCATTAAAGCATTAAACATGTCTAACTTGTAGAACAATTACTGCATGCATACTCTCAACAACCCTACATCCCATTCACAGGCATACAAGTTTGATGAACATAACTCACTGAAAATGTTGTTATCATCATATAAAGATAGATGAACCTTTATAGTCTTTTTCTTAACAAAGCAAAAGCAGATAATTTTATCAAATGACAAATAATTATTCACAAAAAACTATAGATTAGTCGCACAGCTCATCACTTTTTATATATTACAATAATATGGTACTCTCTTTAAAATGAACAAAGCACACAAAATTTACCACAAACAAATTTTAACTATTCATCTGGTTTGGGATACTGTTTAATTTGTTTTTTTCTTTTGGTAACTATATTTATAAATTACATATCTTAGTCTTTATACAGTCACTTTTAATTATATCTTAGTCTCTATCATTAAGTCTCTTAAACTACCAGAAATTCTCTCCTAAAGTAATATAACAGAAGATTGGTGGTGGTGTAAATTTTGTGACTGTATTAGCGCTAAGGATTTGAAGAGATAGCAGACTGTAGAAACCAAAGCGTAACTAAAAGTTATTACACAGAAACTAAAACATGTATTTTATAAATACGAGAGCCAAAACATAGCAAGATTAAGTATAGTACTTAAACCTTTTATATGTATACCAAAGCATAGCAATAATGTAAGTACAAAAAACCAAACAAATACTGAAACCCTTAGATAATTAGAGTAGTCACAATTGTGTGGTAAAAAACTGCTAATAGTATTGATTAATGTCATTAAATATGCAGGTTTCTTGCCCTAAGCTGGAGACAATGGTGATTTCCGAGGTTAGTGAATTGACAACAATATGGAATGAAGAGTATGATGCTGAAAATTCATTTGGGAAACTGAAAAACGTAATTATCAAAGATTGTGAGAAATTGAGAACTGTTTTTCCAGTTAATCTTTCCAAAAATCTTGATAATTTGAAGACGTTAGAGGTTAGAAATTGCAGTTTAATGACGAGCATTTTCACTGTGATGAGGCAAGATAGCACAAAAGCAGGGCTTCAACTGAGCATTCCAATGATTGAAATAACTTTAACTGGTCTTCCCAAATTGGAGTATGTGTGTGTTACTACAGGATTTGAAGCCTTGAAGAAAAAATTCGAGGAAGAATGGTATGCTGGCCTTCCCGGATTATCAGGTAACGCACGTATTGAACACGGAAGAAAAATGAAAAAATATTTGGAAGAATATTTGAATATGTAG