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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_18790 LG4 65238810 65240974 hypothetical protein LR48
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 65239511 intron_variant
G/A 65239523 intron_variant
T/C 65239685 intron_variant
G/A 65239773 intron_variant
G/A 65240013 intron_variant
G/A 65240014 intron_variant
G/A 65240929 missense_variant p.Leu16Phe
A/C 65240930 missense_variant p.Phe15Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_18790.1
MQVRLIGYSIEGSLFLVYEYIENGNLSQHLRGSGSREPLPWATRVQIALDSARGLEYIHEHTVPVADFGLTKLTEVGSSSLPTGRLVGTFGYMPPEYAQYGDVSPKVDVYAFGVVLYELISAKEAIVKTNDSVTDSKGLVALFDGVLGQPDNTEDLCKLVDPRLGDNYPVDSVRKMAQLAKACTQDNPQLRPSMRSIVVALMTLSSTTDEWDVGSFYENQNLVNLMSGR*


CDS Sequence:
>Vu_18790.1
ATGCAGGTGCGGCTGATTGGGTATAGCATCGAGGGATCTCTTTTTCTTGTCTATGAATACATTGAAAATGGAAACCTAAGTCAACATCTGCGTGGTTCAGGTAGTAGAGAACCACTGCCATGGGCTACTCGTGTTCAGATTGCTCTGGATTCTGCCAGAGGTCTTGAATATATTCACGAGCACACAGTGCCTGTTGCTGATTTTGGATTAACCAAACTTACAGAAGTTGGAAGTTCATCACTTCCCACGGGTCGTCTTGTTGGAACATTTGGATACATGCCACCGGAGTATGCTCAATATGGGGATGTTTCTCCCAAAGTAGACGTGTATGCTTTTGGAGTTGTTCTTTATGAACTCATTTCGGCTAAGGAAGCAATTGTCAAGACAAACGACTCCGTTACCGACTCAAAGGGCCTAGTAGCTCTGTTTGATGGAGTTCTTGGTCAGCCGGATAACACTGAAGACCTCTGCAAACTAGTTGATCCAAGGCTTGGGGATAACTACCCAGTTGACTCTGTCCGCAAGATGGCACAACTAGCCAAAGCCTGTACACAAGACAATCCTCAACTCCGTCCAAGTATGAGATCTATTGTGGTTGCGCTGATGACACTTTCTTCAACTACAGACGAGTGGGATGTTGGTTCCTTCTATGAAAATCAAAATCTTGTGAATCTAATGTCAGGAAGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_18790::LG4:65240974-65242974(-)
ATGATAAAAAATACAAGACAAAAGCTAAACACCCCTGTACATAGAAAGTTGGTACCTATTATAAAGAAATTCTGAACTAATGCTAGGAGGCTGTTACGATATAAGGTAGGGGTAATAATAAGGGTTGGAAAGTATATAAGTAGAGATAATATTTAGTATAAGTTAATTAGAGTAAATAAATATAGTATAAGTTAATTAGAGTAAATAAATATATATTTAGGGAAATATTCAATATAAGATATTTATAATTAAGGATATATGCTAGGATAATATACGGAGAGATGTTTATATTAAATATAGGGATATTTATATTAAATATTAAATATAGGGATATTTATATTAAATATTAAATATAGGGATATTTATATTAAATATTAAATATAAGGATATTTATATTAAATGCAGATATATTCTAGAGAAATATTTAATAAGAGATGGGCGGGAAATAATTAGTACAAATAAAGTTAGAGTCTAGGGTTAAAGACAGGCTTTTGATTATTGAGTTTTGTGACAGACATTATTGTCTTGTGAGGGAGGTTATGCTCTCAAAGTAATTGAAGGAGGTTATGCTTCCAATTATTATTTACCCTTGTTTATTCAGATATTACCATCAATAAAAGAGATTCATTCATCCAATATCATTCGTTTATTGTTCTGTTACGTGTGAGAGAGTGGGAAAGATTGTATTTGGAACAGAGGCATAACAGAATACCATTTAAATTGTTCCGTATTTACCAAGCCTAAATTGACCAATTTATCGCCACAGTGGTTCCCTTCCCTAAAATATGTGAAACTTTTAATTCCATGTTACTACAAATCTTCAAACATTTCCTCCATGCTTGTTCAATTTACATTTTTTTTTTTCTTATCCTTAACATTTGTTTCTCTAGTGCATAATATATACGGAAGTTTTATGTGCTTAGTAAAAGTTTTTAAAGTAGTTCTATTTGGAATCCGGATTATCTTGTCTCTACTTTTTGACTTTTTCCTTTTTCCTTTTTCCTTTCCTTTCTTTTCAAACTTTCCTCTGATCTTGCAAGTATTCTATTCGTGACAGTCTCTTTATTATGTTATATGCAATTTTAATTATGAATTCAATTTGGTGCACCGATGTTGCCGATAACATTCCCAACAAGGGCCAATCTTTATTTCAAATAGAATACCGTCTAACAAGTATCTAAATGACTGTAAATGTACAGTATAAATGAATCACCTCTCGTCCTTCCATTAAACAGACCTGGACTTTACTTCCCAAAATCCATTCTCAAACCAAAGATTCTTCAGTCCTTTTCTTACTATTCTTATTCATGACCTGTCATCTCTTACTTTCTGAAATGCTATCGAATTATTAAAACTAACTAACATGTCATTTAAGGATATTGCTATGATTTATCACATAAATAAGCCATCGATCCATCTCCATCTGTCTTCCTCTTTTCCCTTGAAGAACATCACAACAAGAAAACAAAAGGGTGAATCTATGTTTTGTTTATATGGTGTGAGTGAATTGGGCTCAAAATCTAAAATTTCAATTAGAGTTTGTACACATAAGATGATGAAACCAATATACAAGGCTAAACAGTTATCTTTGTTGACAAAGGAGTTTTGGCTTGATAAATCATGTGGTCCTATACCAGTTCCTACTTTTGATTTTGGTCCTTATATCTAATTCTACGTTTTAGTTCCTTTATAAGCAGTTTTTTATGTTTATGTTTCAATTTTCTTGCAGTTTGAAACCTCCACAAAATGAAGGCATAAGGACTAAATCATAAAAAAATTGCTTTTATAGTGTGCTGAGAGATAACTTCTTAGGTATATAGACTAAAATGAAATTGGTGAAGATATAGGGATCAAATGTTATTAAGCTAAACATATATTTCCTGAAAGAATTTCTATTACATTTATGTTTTCTGTTTGTACTATACACAGACACTCGGCATGCTTTATTATACATAAATTCTTACATCTGCTTTAGGGAATGGCTTAAACTCTTAATCACT


Gene Sequence:
>Vu_18790(-)
ATGCAGGTGCGGCTGATTGGGTATAGCATCGAGGGATCTCTTTTTCTTGTCTATGAATACATTGAAAATGGAAACCTAAGTCAACATCTGCGTGGTTCAGGTTGTATAACCCTTAGTTTAGTTTTTGTTTACCCATGATGGGTTGAAATTGTTCCGTGTTGACAGTTAATTGATATTGGTGTTTAATTACTATGATGTGTTTAATTACCTAGGTAGTAGAGAACCACTGCCATGGGCTACTCGTGTTCAGATTGCTCTGGATTCTGCCAGAGGTCTTGAATATATTCACGAGCACACAGTGCCTGTATATATTCATCGTGACATAAAGTCAGCAAATATATTAATAGACAAAAACTTCCGGGGCAAGGTTGAATGTTTTGAGATCTTATCTACTTTTATTATTTGGATCGCAATGGGAGCTCATACAATGCTCATATATGCAGGTTGCTGATTTTGGATTAACCAAACTTACAGAAGTTGGAAGTTCATCACTTCCCACGGGTCGTCTTGTTGGAACATTTGGATACATGCCACCGGAGTATGATAATTAATATTCCTTTTAACATTAGAGTGTTGGTGTTCATATTGAAAATTAACTTTCCAAGTTCATATGCCAGTTTTTTTTCAAACATAGATTGAATACTACCATTGCAATTGGCAACTATTTTATTTGCATTTCCAATATAGGAGAACATGATTTCTTGTGGCTAATTTTGTGACAAATGTTCATGCAGTTGAACTCCTTAGCTATTACATGACTCTTCACCTATGATGCACCGATACTTCGGGTCACGTATTCGTGTCCGATACATTAGGATACTTTATGGATATTTATCAGTGAAGTATCTAATCTATAAAACAGTAGTACTTTTATGATGACAATAATTTATAATCTTTTATTTTCAATATGCATATATCATGTATCTTATTATTTTTAAGGTTTAATAGCCAATTTAGTCCCCACTTTGGTTGAAAAATCTCAATTTAGTCCCTCGTTATAAAAGTGTTTTACATTAGTCCTAACTTTTAAAATAATGGGTCAGATTGGTCCCTTTCGTTAAATATAAGTTAACGAAATTAAGGGATGATGATGTGACACAGCTTAAAGCTGATGTGTTAGATTGGTCCCTCGTTAGCTTTAAGTTGTGTCACATCATCATCCATTAATTTTGTTAACTTATATTTAACAGAAAGGACCAATCTGACCCACTATTTTAAAAGTTAGGACTAATTCAAAACACTTTTATAACGAGGGACTAAATTGAGATTTTTCAACCAAAGTAAGGACTAAATTGGCTATTAAACCTATTTTTAAAATAAACTTATCGGTGTATCAGATACGTGTCGTATCCATTACACTATCGGTGCCTCATAGCTCTTCATATATAACACCCTAAGTGGTCATAATGTCAATGACCCTTCAAACATTTAGCGATTACATAAGAATAATGCCCCTTAATACATGTTAATTTACAAGCCTTCACTATCTCAACCCTTTGTTTTCTCACAACCCTTTGATTGCCATGGCTTTGTCTGAAGGTATGCTCAATATGGGGATGTTTCTCCCAAAGTAGACGTGTATGCTTTTGGAGTTGTTCTTTATGAACTCATTTCGGCTAAGGAAGCAATTGTCAAGACAAACGACTCCGTTACCGACTCAAAGGGCCTAGTAGCTCTGGTCAGTGTTGATTTCTCCAAATATTTTTTATTATTGTAGTCATTGCAAATATTAAGAAAATCATCATCATGCTTCTTCATCAATCTAAATTATGAAAGTGACTTTCTTAATTTTATTATGCAATGCAGTTTGATGGAGTTCTTGGTCAGCCGGATAACACTGAAGACCTCTGCAAACTAGTTGATCCAAGGCTTGGGGATAACTACCCAGTTGACTCTGTCCGCAAGGTAAGAAATTTGTTAAGAGTAAACCCTTTGAACGTTTGTTTTTTTGTGATTTCAACATGGATCAACAAATATATGGTCATTATTTGGGGTTGCAGATGGCACAACTAGCCAAAGCCTGTACACAAGACAATCCTCAACTCCGTCCAAGTATGAGATCTATTGTGGTTGCGCTGATGACACTTTCTTCAACTACAGACGAGTGGGATGTTGGTTCCTTCTATGAAAATCAAAATCTTGTGAATCTAATGTCAGGAAGATAG

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