Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_18664 LG4 62224828 62225400 PREDICTED: agamous-like MADS-box protein AGL29
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SNP Position Effect Amino acid change
C/T 62225107 synonymous_variant p.Gln98Gln
C/T 62225338 synonymous_variant p.Glu21Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_18664.1
MAPYSTTNNGRTSNQRKRKIEIKEVEQKNRRCVTFSKRKLGLFNKLTELSLLCKAQTALIITSENGNVYSCGYPNTDAVLYRYVSGGFTELCKVTQDQQEYNEKQRLEYENVHKNLKEKHKQLEELKEAQKSRSCFDSWWNLSHQNMSLEDLEEFKTSLETFKFNLITLLQEKEISLPLSMASRNSQSVL*


CDS Sequence:
>Vu_18664.1
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Promoter Sequence:
>Vu_18664::LG4:62225400-62227400(-)
ATTTTACTAAAAAATCATTATATATTAATTAAATTTAAAGACAAAAAAGAATTAATTACTATAAAAAAAATACGGACTATTTGCGTCAAAACCTATCAGTTATTTAAAATATATATATATATAAAGGAAATTTAATTTGGTGTAAATTGTGAGAAACTCTTATCATTAATTAATACTTAAAACATTAAATAATAGATGTATAAATCTTTTTTTAGAAAAATGTATAAATTTTCTTGAAAAAAAATTAAAAGAAAGGAATCTTCGTTAATATGATTCAATGAAAATTTCAAGTTAAAATCATATAAAATCTTAAATATATGTAAAATCTTTAAAATAATGTATTAAAGTTGATAAATGTTTTCAAATTAATGAGAGTGAATATTTTATTTTAAAATAATTTAATAGTATAAATAAAATTTTTTAAACTTATTTTATTATTAAAATATATTTTATTTTTTAAAAATTTGTCTCTTAGTTTTCTCTCTCTGAGTTTTTTCATTCATCCATATTTTTTGATGATCATGAAGTTTATAGAAGATCCTAACTGAGTTATCTCCACATCTAGTCGATCAAATTCTGTCATAGAAAATAAGTTTGGACTCATTTTTTCTACTTTATTTTAATATGTTTTTGAAAGAATAAGGTGTAATTGAATGTTTAATCATGGGTTATGGAGTTGAAATTAATTGTTTATTGAAATGTGTATTATGAAGGTTCTTTAATATATGTTCATGATTCCCATATAAGTACAAATCATCTTTAACTAAAGAAATTAGGTTCTTCAACTAATAAATAATAAGAATGTATATAAAAAGCAAACAAGTTTTGACGGTTTTGACTTTCTGGGATAGCATTATAATTCTTTATAAGATGTCCCAACAATGTAGAGTTAGAAGCTAACAGGAACACAAGAATTTCTTGAAAAGTAAAGGCTTGAATTGTGCATAATAAGTATGAAAAATGTCTCAAAAATGTTCTGATATTAATTATGAGAACATGTTCTGAGTTTTTTAGTGCTTTTGATCATTTTTAAATATGAAAAATGTCTCAAAATGATAATTTAAATGGTTGTAAATAAAAATATTATTTTGATATAGATCAGTAATACAAGTTGTTTTGAAAATGAAAATTTATAAAATGTAAAAGTTTTTTATACCTAATAAATAATTTTCTTTAATTTTAAGCTACTCATGACATCTAAAGTCAAAAAAATATTATTATTTATAAACAATACTAAGAAACTAGCAATATTTGTTCTTCTAGTGTATATTTAGATTTTTTTTTCTGAATAACTGATTTATCTTGCTTTGATTTCTGATTAATTAATCTAAAAAATTTAATTTTTTCATACAGACCAATTTTCAACCTGACTTATTTAGAACCCTTGAACCTATGCGGTTCATCAACCCAACTACTTTAATTTACTTATTTATTATTTTGTATTTTAATATTATTAGTTAACATTTTTATTATTATATTTAAATGATAATAAAGAAAAAGGATGTTTCAAGAGACAAAAATATTATAAATTCATCCATTTAAGTCTCTAATCTTATAAATGGATAAATGACACAAAAATTATCAATATTATAAACTTTTTAGGTTTGCTTTTCAACTATATTTGAGTTGTATGTTAATTTTTTATTTTGAATTGTCTTTGGAGTTTAATATTATTTTAGAGTGAAATTATTTAAATTTGAATTACAAAAAAATTGTAATTTTTTTTTGGATTTAAAAAAAATTATAATTAAGTGAGTCAGTGAGTCTACCCGTTTAACCCACCAACCTGTGGTCAGTTGGGCCGAGTTTAAATTTTTTCGATCACTAATAAATGAATCGGGTTGGATTGGCTCACTAAGGGGCCAATCCTGATGGGCCGGGCCGGGTTGAGCCGGTTGGCCCGTTTAGACAACTCTCATTAGGACATTATAAAAGGGCACCAAAACATTTTGTAATTCATTCTTTGGTTTGTGATTTGTTTGTTATCCGTGTTATGTGCA


Gene Sequence:
>Vu_18664(-)
ATGGCTCCTTATTCTACAACAAACAATGGAAGAACATCAAATCAAAGAAAGAGAAAGATTGAGATCAAAGAAGTTGAACAGAAAAACAGACGATGCGTCACCTTCTCAAAACGAAAATTAGGACTTTTTAACAAGCTCACTGAACTTTCTCTTCTATGCAAAGCACAAACTGCTTTGATCATCACCTCTGAAAATGGCAACGTGTATTCCTGTGGTTATCCTAATACCGACGCCGTTCTCTATCGCTACGTCAGCGGAGGGTTTACCGAACTCTGCAAAGTTACACAGGACCAGCAAGAATATAACGAAAAGCAAAGACTTGAATATGAGAATGTGCACAAGAACTTGAAAGAAAAGCACAAGCAATTGGAAGAATTGAAAGAAGCACAAAAGAGTCGTTCTTGTTTTGATTCTTGGTGGAATCTCTCCCATCAAAACATGTCTTTGGAAGATCTTGAAGAGTTCAAGACCTCTTTGGAAACTTTTAAGTTTAATCTCATCACACTGTTGCAAGAGAAAGAAATAAGTCTTCCATTAAGTATGGCATCAAGAAACTCCCAAAGCGTTCTTTAA