Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_18612 LG4 60862607 60869227 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 60863205 missense_variant&splice_region_variant p.Val621Glu
C/A 60863211 splice_region_variant&intron_variant
T/C 60863328 upstream_gene_variant
C/A 60863341 splice_donor_variant&intron_variant
C/A 60863406 missense_variant p.Gly599Val
A/T 60863489 upstream_gene_variant
C/A 60863494 upstream_gene_variant
T/G 60863499 upstream_gene_variant
A/C 60863572 upstream_gene_variant
T/A 60863581 upstream_gene_variant
T/A 60863601 upstream_gene_variant
G/C 60863613 upstream_gene_variant
C/T 60863624 upstream_gene_variant
T/C 60863659 upstream_gene_variant
C/T 60863703 upstream_gene_variant
A/T 60863704 upstream_gene_variant
T/C 60863738 upstream_gene_variant
A/T 60863750 upstream_gene_variant
T/A 60863836 upstream_gene_variant
A/T 60863941 missense_variant p.Asn560Lys
A/G 60863965 synonymous_variant p.Asn552Asn
G/T 60863979 missense_variant p.Gln548Lys
T/A 60863986 missense_variant p.Glu545Asp
G/A 60865127 upstream_gene_variant
G/T 60865128 upstream_gene_variant
T/G 60865179 upstream_gene_variant
G/A 60865180 upstream_gene_variant
A/T 60865248 upstream_gene_variant
T/A 60865254 upstream_gene_variant
A/G 60865519 upstream_gene_variant
A/T 60865691 upstream_gene_variant
C/T 60865736 upstream_gene_variant
T/C 60865741 upstream_gene_variant
A/T 60866002 intron_variant
A/T 60866067 intron_variant
T/C 60866140 intron_variant
A/G 60866260 intron_variant
A/T 60866331 intron_variant
T/A 60866458 intron_variant
A/C 60866469 intron_variant
C/T 60866474 intron_variant
C/T 60866498 intron_variant
A/T 60866702 intron_variant
T/C 60866731 intron_variant
C/T 60866742 intron_variant
T/C 60866857 intron_variant
T/A 60866925 intron_variant
A/G 60867352 downstream_gene_variant
T/A 60867447 splice_region_variant&intron_variant
A/T 60867451 missense_variant&splice_region_variant p.Leu311His
C/T 60867668 downstream_gene_variant
G/C 60867840 stop_gained p.Ser217*
A/G 60867898 synonymous_variant p.Leu198Leu
G/A 60867901 missense_variant p.Arg197Trp
T/A 60867920 missense_variant p.Arg190Ser
C/A 60868115 missense_variant p.Asp154Tyr
G/T 60868123 missense_variant p.Ala151Asp
C/A 60868135 missense_variant p.Gly147Val
A/T 60868644 downstream_gene_variant
T/A 60868655 downstream_gene_variant
A/T 60868690 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_18612.1
MVEAVTIEERPKSRDIRRYFCQYCGICRSKKTLITSHINSQHKEEDEKARKETDPETESSKSNTCEECGVTFKKHAYLLQHMQSHSPERPFVCTVDDCHASYRRKDHLTRHLLLHEGKTFKCPVENCNIEFSLQGNMKRHVEEIHDGGSTAAADKSHKQHVCPEIGCGKVFRFASKLKKHEDSHVKLESIEVVCLEPGCMKHFANDQGLRAHVNTSHQYMTCDICGSKQLKKNIKRHLRSHEADSSSSKTFQCEFKGCSCTFSKKSNLDKHKKAVHLEEKPFRCGFPDCGMRFAYKHVRDNHEKTAKHVFTLGDFEEADAEFRSRPRGGRKRECPTIEMLIRKRVTPPSRLEDWTPFLMDALDFFPHKSKETQDDDDEDDDNDNDNDIHHRQTLDFHVDTSLDLLTKNTGGNRSVEESDALETMDEKRFVALVTELHQVNAENQRLRELIDQMNNNSNAVRMQLIKITQKQHNLRKNGVDGEKEEMVPRSFLDIGVAEKDEASQQPSEEKLRESKSVVDLMHRCKGNEKDVEDKLDCGRESSKARMEGDQELSNKVPKLDQNSETLSMIKKARVSVRARSDSTMIADGCQWRKYGQKMAKGNPCPRAYYRCTMSTGCPVRKQVQRCAEDRSVLITTYEGQHNHPLPPTAQAMASTTSAAASMLLSGSMPSSDGLINPTILENASLPCSQNMATLSASAPFPTITLDLTQNPTNSSHHQRDPHNQLSLLSPLLAQKFMSVPKLFGHSLCDQTKLAGLHESQGMDAAAPSFANSLNAATAAITADPNFTAALVAAITSVMGSSHSNTSGTSNTTGDHHCNNNA*


CDS Sequence:
>Vu_18612.1
ATGGTTGAAGCCGTAACAATTGAAGAAAGGCCAAAGTCCAGAGATATTAGACGTTATTTCTGCCAGTACTGCGGTATCTGCAGATCCAAGAAAACCCTAATTACCTCTCACATCAATTCGCAACACAAGGAAGAGGATGAGAAGGCTAGAAAAGAAACAGATCCTGAAACGGAGTCTTCAAAATCTAACACCTGCGAGGAATGTGGTGTCACTTTCAAGAAACACGCATATTTGTTGCAGCACATGCAAAGTCACTCGCCTGAGAGGCCGTTTGTGTGTACTGTTGATGATTGTCATGCGAGTTACCGAAGGAAGGACCACCTGACTAGGCACCTTCTACTACATGAGGGGAAGACATTCAAGTGCCCTGTTGAGAACTGCAACATTGAGTTCTCTTTGCAAGGCAATATGAAAAGACACGTTGAGGAGATTCACGATGGCGGTTCCACTGCCGCCGCTGACAAAAGTCACAAACAACATGTGTGTCCAGAGATTGGCTGTGGAAAGGTTTTCAGATTTGCTTCAAAGCTAAAAAAGCATGAAGATTCTCATGTTAAGCTGGAATCAATAGAGGTGGTGTGCTTAGAACCCGGTTGCATGAAGCATTTTGCTAATGACCAGGGCCTTAGAGCTCATGTAAATACTTCCCATCAATATATGACCTGTGACATTTGTGGGTCTAAGCAACTGAAGAAGAATATTAAGCGTCACCTTCGTTCACATGAAGCTGACAGCAGTTCCTCGAAGACCTTTCAATGCGAGTTTAAGGGTTGTAGCTGCACATTCTCTAAAAAATCTAATCTTGATAAGCATAAGAAGGCTGTGCACCTTGAAGAAAAACCTTTTCGGTGTGGGTTTCCTGATTGTGGCATGAGATTTGCTTACAAACATGTGCGGGATAATCACGAAAAAACTGCTAAACATGTTTTTACCCTCGGTGATTTTGAAGAAGCTGATGCAGAGTTCAGGTCAAGGCCGAGGGGAGGGAGGAAGAGAGAATGTCCTACTATTGAAATGTTAATCAGGAAGAGGGTTACCCCACCCAGTAGATTGGAGGATTGGACACCATTCCTCATGGATGCCCTCGATTTCTTCCCTCACAAGAGTAAAGAAACCCAAGATGATGATGATGAAGATGATGATAATGATAATGATAATGACATTCATCATCGTCAAACCCTCGACTTTCATGTAGATACCAGTTTGGATCTCCTTACCAAGAACACGGGTGGCAACAGATCAGTTGAAGAAAGTGATGCTTTGGAAACTATGGATGAAAAGAGGTTTGTAGCTTTGGTAACTGAATTGCATCAAGTGAATGCTGAAAATCAAAGATTAAGAGAGTTGATCGATCAGATGAACAATAACAGCAACGCCGTACGCATGCAACTTATCAAGATAACGCAGAAGCAGCATAACCTACGGAAGAATGGAGTGGATGGAGAGAAAGAAGAGATGGTTCCGAGGTCATTTTTAGACATTGGTGTGGCTGAAAAGGATGAGGCTTCGCAGCAACCCTCAGAGGAAAAACTCAGAGAGAGCAAAAGCGTGGTTGATTTGATGCATCGGTGTAAGGGTAATGAGAAAGATGTTGAAGATAAGTTGGATTGTGGAAGGGAAAGCTCAAAAGCTAGAATGGAAGGTGACCAAGAACTTTCTAATAAAGTTCCTAAATTGGATCAAAATTCAGAAACCTTGTCAATGATCAAGAAAGCCCGTGTGTCAGTTCGAGCAAGATCAGACTCCACAATGATTGCAGATGGATGCCAATGGCGAAAGTATGGGCAGAAGATGGCAAAAGGGAATCCATGTCCAAGGGCCTATTATCGTTGCACAATGAGTACAGGCTGCCCAGTGCGTAAACAAGTACAAAGGTGTGCAGAAGATCGAAGTGTGTTGATCACTACATATGAAGGACAGCATAACCATCCACTTCCTCCCACAGCTCAGGCAATGGCCTCAACCACATCTGCAGCTGCTTCAATGCTTCTTTCTGGATCAATGCCAAGCTCAGATGGCCTAATCAATCCAACCATTTTGGAAAATGCTTCACTTCCATGCTCTCAAAACATGGCAACTCTCTCTGCCTCAGCTCCATTTCCCACCATCACTCTCGATCTCACTCAAAATCCTACCAATTCCTCACACCACCAAAGGGATCCACACAACCAACTTAGCCTCCTTTCTCCCCTTTTGGCTCAGAAGTTCATGTCAGTTCCAAAATTATTCGGACACTCACTGTGTGATCAAACTAAGCTTGCTGGCTTACATGAATCTCAGGGAATGGACGCTGCAGCTCCATCGTTTGCTAACTCACTGAATGCAGCAACTGCTGCTATCACTGCAGACCCCAATTTCACTGCTGCACTTGTGGCAGCCATAACATCTGTCATGGGAAGTTCACATTCAAACACCAGTGGTACCAGTAATACCACTGGCGATCACCACTGCAATAATAATGCATGA


Promoter Sequence:
>Vu_18612::LG4:60869227-60871227(-)
TAAAGGATAAAATTGGAAAACAAACACTAAAAAAATTATACTAAGATTTTTTTTAGTAGTGTGATAGTGTGGTGGATTATTGTTGTAAATGAGTACAAAGTTTAAATTTGAATTTTGTATAAATATAGATATTTCATTATTTAATACAAAATGGTTAGTACATGCTACATACATTTAAAAATAGAAATACACACATATATATATATATATATAATATATATATATATAATAATTATATTTTGTATAATTTATTTAATAACTAATACATATTAATACTAAATTGATTAGTAAAATTTATAATTTAGCACTAAATTAATTTCTATAAATTATAAGTTTATGATAAAATAATCCTCCAAATTTAATAATAAAAATGTAGTTATGTAATTTTTATTTATTTCTGCACTAAATTTCCTTTTCAAAAAGATTAAACAATGACTCTTTTACTCGTTTATGCCAAGTGTTTTAATTATTTGATGTTACGAGGGTCAGATCCAGCATAAGTAATATTTATTCACTATCTGTTCCGTATTGCGAAAATATATTTCTTACATGTTTGTTATCGGTAAAAAGAATTAATGGATTTTATATATGTATAAATACTCGTAAAATACTTGCTGATATTTTTTTTTAAAATATAAATTCAAATAAAAAATTAATTTTTAAACTACAATTTAAATTAAATTATTAAAAAAATATTAATATAAATAAAAATTGTATTGCAATAAAATAAATTTAAATCGCTTATATCAAAATATAAATTTTAAAAAATCAATCTTTGTGTAATATAATTTCAATTTACTAAGTCTAAATGAAAAAGTATAAAGATATGAAATTAAATTTTAAATAATTATATTAATAATTTTATTTTGAATATGTGAATGTTAAAAAAATACTTAAATAAAATTAACTAATATTATTGTTGGATAATGAATATCAACCGATCATTATCATAATATTTTATTATCTACATATATTTATTGAAAATATTTATTTAATTTTATCTGTAAATATTTGTTAATAATATCTATTTAATATTGATTACAAATTCATTTAATATCTATCATAATCACCAAATAAATAATACGAAAATTGCTTTTAGTCTTCAAATTAAATTGCTTTTAGTTTCTAAAATTTAGAACAAATATTTGTTATAATACGAAAATTAACCACTTCAAATCTTTAATTATAGTACTTTTAATTCTTTTAATTTGAATGAAATGTTCTTTTTAGTTTAGAAATTTAATATATTTTAATTTTTTCTCTCTCATTTAGCTCCTTTACATAAAAAAAAATGAGGATAGAAAACATAACACTTATGCTAACCTTCGTATTTTTACATGATTAAGTTTAAATAATAAAAAATATATTTCTAATAATTTTAAAGATATAATTTATCACTTTTAAATTTCAAATAACATATTCATGATTTTATATTTGGAGACTAAAACAACATTTTTAAATTTGAAGAATTAAAAAAATTACTTTCAAATTTAAAAGACTTTAAGTATTAATTTTATATTTGAGAAACTAAAAATTAATTTAAAATTAAAAATTAAAAATTAAAAAATCGATCCAAATTTTAAGGGTTAAAATATGATTTAGATAAAATTTTTATAATAAATATTTACATCATTATACTTCTGACACGTGTCATTACTGAACTAGATACCTCTAGTCATACTGGTAACGAGTCGGAAGGCGTAAAGCTAAAAAAAGAAATATTGTTGGAAATTTAGTTATCATGAAAAAAATAACTAAAAGAAAAAATAACCAAAATTGATGAATAAAATATTTAATTTTATTATAATTTTAATTAAACCACCCAAACGGCATCGTGTAGGTCTTCTATATATATATATATTCCTAGTTGCGGTAAAACCTAGAAGCTCACACACTCTTCATTCGCAGCTTCACAAAATCGCCGCACATAACACCATCCTCATATTTACATTGAATTTCTGCACTCTTCGATTTGTTCTCTGTATCTCATCACCAAAACA


Gene Sequence:
>Vu_18612(-)
ATGGTTGAAGCCGTAACAATTGAAGAAAGGCCAAAGTCCAGAGATATTAGACGTTATTTCTGCCAGTACTGCGGTATCTGCAGATCCAAGAAAACCCTAATTACCTCTCACATCAATTCGCAACACAAGGTAGTTTTATTTTCTGTATTTTTGTTTGTTCTTTTGAAAAATTAAACCCTTCACAATCATCCTTATTTAAATTATTACGATTTGGTAGATGTATACGGTCATGTAAGACTTCGTTAATTTTGGTGTCTTTTTAGGAAGAGGATGAGAAGGCTAGAAAAGAAACAGATCCTGAAACGGAGTCTTCAAAATCTAACACCTGCGAGGAATGTGGTGTCACTTTCAAGAAACACGCATATTTGTTGCAGCACATGCAAAGTCACTCGCCTGAGGTATCTTTACATTCTTAAATATAAGACAATTTACAGATGGAAAATTCTGAAAGCACATGACAAACATATACTTTTTTTATCAGCAAAGAATAATAGTGCTCTAACAGAAACATATTCTTGTGTAATGTTTTATTTACTGTTGTGTTATTTGAAACATATTTTGATTGTGGGAGAAGTAGCTCTTGTTGTGACTTAATAGTATTGTTGCATTAGGCTGAAGATACAAATTTTGCAGGAATATAATCTATAAGATTCTAAAATCATTGGAAAATTATGGATTAATAGTGTGAAGCATTGGATCCCAGACAACGAACTCCAAAATGCACGAGGCAACGAGTTTAGACTTGATGGATCAGTATCAGGTAGGGAGACCTCCTGTGAAGCTCCATCAAGGATGCCTCAGTCACGCTCTTTGAATTTGAGGTTGGCAGTCTGTTCATTTGTTTCTTGTTCTTCTCGGGGTATGATGATGTTTATGTTTGGGTTTTTTGTCGTTAACCAATTTTGTGATGTTTCCAGAGGCCGTTTGTGTGTACTGTTGATGATTGTCATGCGAGTTACCGAAGGAAGGACCACCTGACTAGGCACCTTCTACTACATGAGGGGAAGACATTCAAGTGCCCTGTTGAGAACTGCAACATTGAGTTCTCTTTGCAAGGCAATATGAAAAGACACGTTGAGGAGATTCACGATGGCGGTTCCACTGCCGCCGCTGACAAAAGTCACAAACAACATGTGTGTCCAGAGATTGGCTGTGGAAAGGTTTTCAGATTTGCTTCAAAGCTAAAAAAGCATGAAGATTCTCATGGTAGGCTCTCTTTTTTGGTTTTATGTACGAATTAGTGAAATGTCCTGTTGGTTACAATTTTGAAGAAAGCCTTTATCATGCAGTTAAGCTGGAATCAATAGAGGTGGTGTGCTTAGAACCCGGTTGCATGAAGCATTTTGCTAATGACCAGGGCCTTAGAGCTCATGTAAATACTTCCCATCAATATATGACCTGTGACATTTGTGGGTCTAAGCAACTGAAGAAGAATATTAAGCGTCACCTTCGTTCACATGAAGCTGACAGCAGTTCCTCGAAGACCTTTCAATGCGAGTTTAAGGGTTGTAGCTGCACATTCTCTAAAGTAATAGTAATACATGTTAAATCTTGTGGTTGTGCATAATATTATTGAATTCTCAATTTGGTTTCGAGTGAACCTTATATTAATCTGTTCTTCATTGTGTCAACAGAAATCTAATCTTGATAAGCATAAGAAGGCTGTGCACCTTGAAGAAAAACCTTTTCGGTGTGGGTTTCCTGATTGTGGCATGAGATTTGCTTACAAACATGTGCGGGATAATCACGAAAAAACTGCTAAACATGTTTTTACCCTCGTAAGTTCTGCTTTTTTGCTTTGGTATCCGGTTGTGCCAAAAGTTATCTATCTGACAAGAAATGGTGTGTGAAAGTTTTGCTTTTGAATTGTCATACTCAAAGGTTTTTTTGATGCAGGGTGATTTTGAAGAAGCTGATGCAGAGTTCAGGTCAAGGCCGAGGGGAGGGAGGAAGAGAGAATGTCCTACTATTGAAATGTTAATCAGGAAGAGGGTTACCCCACCCAGTAGATTGGAGGATTGGTTATTTATGCAGGACAGAGAGTAGAGTGCATTGAGAATTGTATTCCCAATACAAGTATGCAAATATGTTGGTAGTATTATATATATTTAGGATTAGTATTAGTCTTAGGAGATATAGAACATGTAGGGCATCAAAGATTAAACCGTGTAAGAAATTGAAGGGAGGGAGAACCATCTTTGATTGTTCTATGTAACATATACAGTTCGTCAATTTTAAATTTGATTGAATCAATTAATAAAATAAATATAAAGAGATAACGGGTTTTAGTAATAGTCTTATTATAAAATTATTTTTTTATTTAATAATGTACATATCATATATATATATATATTTAAAATATTTAGAGTTATTTTTATTAGATAATAAAGTTTTCAATATTATTTATTCGGTTTATCCAATTGAAATCAATTACAATTCAATAAGGTGGAATATAAATAAATTAAATAATACATAAAAGTTTTATGTAGTATTTAAATAATTAAAAATAATAGCATGATCTATATTGCTGTAACACTTACGTAAGTTATAAACGAATTAGTTAAATTAGGAAATCTAATTTTAAAATAAACGATAAAGGAATTAAATAAACCAAAAGCTGAATTTGATTTTAAAAACCTATCAAATTAATTTCAAATCAACTCTGGAATAATGTAAATTTATATATATTTAAGGTTTAGTTGCTTACTTTAAAAATCTATCAAATTAACGGAATGGTTAATGTGGATGAAGTTGATAGTTTTTTTTTTAAATAGTAACCAAATTGACACAGCAATAAAACTATGAACAAAACTTATATATAAAGTCGCATAGACTACTTAAACTGACCATTCTGATCGGGTTTAGTGATGTTTTATCAAGAATTTAAAAAGAAATATTTAAATGTTGGCACTCGTATGATTCTGTTAAACGATATTTATATGAATTTTAGTATTAATTCAAGTTTAATTTGTTTTTAACTATTGTGATATTTTCACTAATACACATGTATAATATATATAATTTTGGGAATAGTATAAAATTCAATACAATGTATTACAATTCAGTAAATTTAAATTAAAATAAATAAATTATAAATTATTATTGTCATAAATTACTTCATGAGCCTTTTTCACACGTCTTTCAATATTGTTCGAACAATTTAAACATTTTATTGAATTTTTATCAAATCTTTCACATAGTATATCATATCTTATAAAGAGTTAGTCATAAAATCTTACACATAATTCCTTTTGAGAACCTATATCCAATCATAGTTACAAATTTCAATAGTTTGAATGAGAAATTTTGTTATCCAATTGATATCTTTAGTTATATAATTTAAAAACTCACTTAAAAGTTTTTGCCTAGACACTTAAAAGTTTCAACTAGGCAGGAAATAACCGAATCTTGATATAATTCCTAACATAAGGAAGCTCCTGTTTGGTGATGTTTTATTAAGTATAATTATGTGCTAGTGCGAATTTTAAAATGAAATATTATTTAGTAGTTAGCAGTTGTGGGAATCTGTTAAATGGTATCTATGAGAATTTTCAGAAAAGAATTTTAGTATTAATTCAAGTTTAACTTGTTTTTGAACTATTGTGATATTTTCACTTATACATATTCAGTAAATCTAAATTAAAAAATACGTTTGGGATATATTGAATTTAATCGAAATTCAGATTTGATAATAAAAATCTATCAAATTAACTCATACAGTAGTTTTTTTTATAAACCACTTATTCATATTTCTATTCTTAAACACAGTATAATTCTCAGATAAGTTAATTATGAAAATATATTTACTTGAAAAATAGAATGACATGCAGAAAAGCGTTGAATTTAAATAAGAGATTGCCTTTAGTCAGATGATTTCTCTGAAACCGATTCAAGACACGAAACTGATGAATATAATCTTAAAATAGTAAATTGCGCAGTCAGACATTAGTTAATAGCAAATAGTGTAAGTCAGAGTCGCTCTAATGTTCTGGTTCCTGTCCTTTCTCCAATGGCTCTTCAGAAAAGTGACACGTGTGCATCACTTCCCACACTTCCCAAATCTTTGGTCTTAGTCAAAACAAAACCCCATTTTTTGTTGCCGACTCCATTGCATCTCTCTGCCTCTTTCTCTCTCCATTTTCTCTCCCTTTAGAAAACTTGTGGGCACAACTGCATGACTCTTCTTTGATACTCATTCAACAACTTTCTTTCTAACCAAGCACACACTTATGTAAGACTTCTTCAACAGACACATACATTATATATTTAATCAACATGGAACCCTCTTCCAATCATGACATTGCTCACCCTTCTTCACATCCATTCATGTCCTTCACAGGACACCATTCCTCATGGATGCCCTCGATTTCTTCCCTCACAAGAGTAAAGAAACCCAAGATGATGATGATGAAGATGATGATAATGATAATGATAATGACATTCATCATCGTCAAACCCTCGACTTTCATGTAGATGTATGTGCTTTTTACATCCATCCATGCAAACTCATATATTTCTTCACATTTTTAAACCTAACCCTAGTTCGCTATGTGAAAATCTTATGTTTTTGTAATGTTGTTCATCTATAGACCAGTTTGGATCTCCTTACCAAGAACACGGGTGGCAACAGATCAGTTGAAGAAAGTGATGCTTTGGAAACTATGGATGAAAAGAGGGTAAGTGAATATTTGTGTCAGTGTTGTATATTAATGCAATTTCAGCACACAAAGTAGGCAAATTTTATAATATGTAATTAGTTTATTTATTCTTATGGGTACAGTTTGTAGCTTTGGTAACTGAATTGCATCAAGTGAATGCTGAAAATCAAAGATTAAGAGAGTTGATCGATCAGATGAACAATAACAGCAACGCCGTACGCATGCAACTTATCAAGATAACGCAGAAGCAGCATAACCTACGGGTAATTTATTTGTTTATTTATTTATGTATTTCTACAACTCGTCGATTATCAAAGAATATATACGGTGTAGAACATACGT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