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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_18527 LG4 59064600 59065955 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   pollen tube growth, pollen tube growth, pollen tube growth, pollen tube growth, pollen tube growth, pollen tube growth, signal transduction, pollen tube growth
Cellular Component   located in   apical plasma membrane, apical plasma membrane, anchored component of membrane, anchored component of membrane, chloroplast
Molecular Function   enables   protein binding
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_18527.1
MAVLSILLSLLLTTTLFSLSHQQLPLDSSEQESLYQILHSLNPTISWRTLFPDDLCLSAPHGVVCDYPTQLNQTPHIVQLSFGYVSDETPNPPCSSNATLHFHLFNSFPYLRKLFFYNCFNHAPLSLSPSFSFPSSLQELVFINNPSLISPLASLLQNLTSLRRVILIGNAFHGQLPSQIAAFLNLEELTLSRNNLSGEIPSSLGLLNQLKVLDLSGNKFEACLPDSLGNLSRLLKLDLSFNAFGCRIPESLRGLQSMEFLDLSFNRFDSFGVPLFLGEVPKLKEVYLNGNPLSGAIPEIWENMGGVERLGLSEMGLVGSIPVSMGVYLKNLSYLGLDNNKLDGPVPFGLLEYGGEINLENNNLSGRVRLSTRVGQKLKLKVGGNRGLCLENIMECESGGDGLGQLKPCKKTDVPDAVVFSGASFLMCFDSLSLLVGLATLAAGVLVFTGF*


CDS Sequence:
>Vu_18527.1
ATGGCTGTCTTGTCCATACTCCTTTCTCTTCTCTTAACAACCACCCTCTTCTCTCTCTCTCACCAGCAACTTCCTTTGGACTCCTCCGAACAAGAATCACTCTACCAGATTCTTCACTCCCTCAACCCCACCATTTCCTGGCGCACCCTCTTCCCCGACGACCTCTGCCTCTCCGCCCCGCACGGCGTCGTTTGCGACTACCCTACGCAACTCAACCAAACGCCCCACATCGTCCAACTCAGCTTCGGCTACGTTTCCGACGAAACCCCCAACCCTCCTTGCTCCTCCAATGCCACCCTCCACTTTCATCTCTTCAACTCCTTCCCCTACCTCCGCAAACTCTTCTTCTACAACTGCTTCAACCACGCCCCTCTTTCTCTCTCTCCTTCCTTCTCTTTCCCTTCCTCCCTCCAGGAACTTGTTTTCATCAACAACCCTTCTCTCATTTCACCTCTGGCTTCTCTGCTTCAAAACCTCACCTCTCTCCGCAGAGTTATTCTCATCGGAAACGCTTTTCACGGCCAGCTCCCGTCTCAGATTGCTGCCTTCCTCAACTTGGAAGAGCTTACTCTATCCAGAAACAACCTTAGCGGTGAAATTCCTTCCAGTTTGGGGCTCCTCAACCAGCTCAAAGTTCTCGATCTCAGTGGAAACAAGTTTGAAGCTTGTTTACCCGACTCGCTTGGGAATCTCTCTCGGCTTTTGAAGCTTGATTTGAGCTTCAACGCTTTTGGTTGCAGAATCCCGGAGAGTTTAAGAGGGTTGCAGAGTATGGAGTTTTTGGATTTAAGCTTCAACCGTTTCGACAGTTTCGGCGTGCCTTTGTTCCTGGGGGAGGTCCCAAAGTTGAAGGAAGTGTATCTGAATGGGAATCCTCTCTCCGGGGCGATTCCGGAAATATGGGAAAATATGGGGGGTGTTGAAAGATTGGGGCTTTCGGAGATGGGTCTGGTGGGTAGCATCCCTGTTTCAATGGGTGTATATTTGAAAAATTTGTCTTATCTCGGGCTTGATAACAATAAGCTTGACGGGCCTGTGCCTTTTGGGCTTTTGGAGTATGGTGGTGAGATAAACTTGGAGAACAACAATTTGAGTGGGAGAGTGAGATTGTCAACAAGAGTAGGACAAAAGCTGAAGCTGAAGGTTGGAGGGAACAGAGGGCTATGTTTGGAGAATATAATGGAGTGTGAAAGTGGTGGTGATGGATTGGGTCAACTCAAACCCTGCAAGAAAACTGATGTCCCTGATGCTGTCGTTTTCAGTGGGGCTTCTTTTCTGATGTGCTTTGATTCCCTTTCCTTGTTGGTTGGTCTTGCTACTTTAGCTGCTGGGGTGCTTGTCTTCACGGGATTTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_18527::LG4:59062600-59064600(+)
ATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTGTACATTCATCTGCTAAACTATTTAACTTTCGCATTATTTTGATTCTTTTTTTGCTATATGAATCACCTAGCTTGAGAAATTTATTTTTTTTATGAAAAAGAATAATTAATTATTAAGTATTTCGTTTTGAAGTATAATATTTCCTTTATTAATTATGTATATAAAAGAAAATAATTATAATAAAAAATAAAATTAATTACATAAAAGCAATTAAAAGTGATAATAATGTATATACATTAAATAATAATAAAAGTAATTATAATAAAAAATAAAAATAGCATTATTATTAAAATTAATAATTAAATTATTATTTAATAACTGATTAAAATTAATCTATAATAAAAACAAATTTGATCATTTTATAATTTCTTTGAAAATAATTATGTATATCAAATTATTCTTATTTTTTTTCTTTCACTTTATCTCGAATAACTCCGCAATTTATTCTCTTTCATCGTATTTTATTTTTTTTAAATCGTATTCTTAAAATAACCAAACCACAAAAGATTGAAAAGGCCACGACATTAAAGTAAAGAGACCCAAAGAATGACAAAGGGAAGGAATAACCATATAATGAAAATGTTTCGAAAAATACAAAATATTAGATTTTTGAAATTTTTTCTACCAAAACATTTCGCTATTTATATTTAAAATTTCTATATATTTAAATTATATAAATAAAAGTATAATTATAATTTTGACGAATTATAAATAAAAAATAAATTTATATTTTAAATTGAAAAATATTGAGTTTAAAATTAAGTTTAAAATGTGTGTATAATTAAGTTTAAAATTAAGTATAAAACATTATAAAGTTAAAATATGTATACATGAGACATTTACATTACAGAGTAGTTAAACATAAAACATATTAAAAAATAACAATGAAGACATATACGATTGTTAAATTTTTAAATATAATATTCAAGTAATATTTTTTAAAATGATGTTTAAAATGAAAATTGAAATTGAAAACAGAGTTGTATCTGTATTAGAAAAGAATACAGATTGAATAAATTAATGATTGATGCACGTCAAAGGAGCAAAAGAAGAAAAGGAGAAAAAAATATGCAAACTTCTCAATTTAATTTCGTTTTCTGTAAACTTAAGAAAAAAAAATTGATTGATGAATTATACAAAGACGAAATTGAGACTTAAGACTAAATAAACAATTAAACTTAAATATTTTCTTTATTAATTATATATATAAAAAATAATTATAATAAAAAATAAAAATAATTAAACAAAAGCAGTTAAAAGTAATAATAATGTATATACATTAAATACTAATAAAAATAACTATAATAAAAAATAAAAATAACATTATTATTAACATTAATAATTAAATTATAATTTAATAACTGATTAAAATTAATTTATAAAAAAATATCATTTTATAAGTATGTCATTTTATAATTTTCTTTTTTTTTTTCATTTTTTTCACTTTATCTCGAATAAATCCACAATTTTATTCTCTTTCATCGTATTTTTTTTTTCTTTAAATCGAGTTCTTAAAATAACCAAATCAAGCGATGGCATTAAAGTAAAAAGACCCACAGAATGACAAAGGGAAGGAATAACCATACAATGAAAAGGTTTCGAAAAATGTGTATATCACTTTTGTCTTTTTGTGTTTAATTAAAAAAAAAAGTTTATAATTTTAGTAAGTTGATACCAATATTAGAATAAAGTGAGCATAAAGAGTCTAATATTATTATATGTTATAGAAGGATAGAAATGGAAAAGGAATGTAGGTAGACGGCGTTACGAGTCGCTTTCTACAACACGACACACTAAGTCGGCGAGTGCGGCGCACCACTGTCGCTTCTTTCCTCAGCAGGTTTCTGTCTCTCTTTCTCTCGTCTTTTTCCTCTGCCTGCGCATTCTACATTCCACATTCCTCATACTAATACCAAACCAACAACCTCAGAACAAAACATTCCTCTCACCAAA


Gene Sequence:
>Vu_18527(+)
ATGGCTGTCTTGTCCATACTCCTTTCTCTTCTCTTAACAACCACCCTCTTCTCTCTCTCTCACCAGCAACTTCCTTTGGACTCCTCCGAACAAGAATCACTCTACCAGATTCTTCACTCCCTCAACCCCACCATTTCCTGGCGCACCCTCTTCCCCGACGACCTCTGCCTCTCCGCCCCGCACGGCGTCGTTTGCGACTACCCTACGCAACTCAACCAAACGCCCCACATCGTCCAACTCAGCTTCGGCTACGTTTCCGACGAAACCCCCAACCCTCCTTGCTCCTCCAATGCCACCCTCCACTTTCATCTCTTCAACTCCTTCCCCTACCTCCGCAAACTCTTCTTCTACAACTGCTTCAACCACGCCCCTCTTTCTCTCTCTCCTTCCTTCTCTTTCCCTTCCTCCCTCCAGGAACTTGTTTTCATCAACAACCCTTCTCTCATTTCACCTCTGGCTTCTCTGCTTCAAAACCTCACCTCTCTCCGCAGAGTTATTCTCATCGGAAACGCTTTTCACGGCCAGCTCCCGTCTCAGATTGCTGCCTTCCTCAACTTGGAAGAGCTTACTCTATCCAGAAACAACCTTAGCGGTGAAATTCCTTCCAGTTTGGGGCTCCTCAACCAGCTCAAAGTTCTCGATCTCAGTGGAAACAAGTTTGAAGCTTGTTTACCCGACTCGCTTGGGAATCTCTCTCGGCTTTTGAAGCTTGATTTGAGCTTCAACGCTTTTGGTTGCAGAATCCCGGAGAGTTTAAGAGGGTTGCAGAGTATGGAGTTTTTGGATTTAAGCTTCAACCGTTTCGACAGTTTCGGCGTGCCTTTGTTCCTGGGGGAGGTCCCAAAGTTGAAGGAAGTGTATCTGAATGGGAATCCTCTCTCCGGGGCGATTCCGGAAATATGGGAAAATATGGGGGGTGTTGAAAGATTGGGGCTTTCGGAGATGGGTCTGGTGGGTAGCATCCCTGTTTCAATGGGTGTATATTTGAAAAATTTGTCTTATCTCGGGCTTGATAACAATAAGCTTGACGGGCCTGTGCCTTTTGGGCTTTTGGAGTATGGTGGTGAGATAAACTTGGAGAACAACAATTTGAGTGGGAGAGTGAGATTGTCAACAAGAGTAGGACAAAAGCTGAAGCTGAAGGTTGGAGGGAACAGAGGGCTATGTTTGGAGAATATAATGGAGTGTGAAAGTGGTGGTGATGGATTGGGTCAACTCAAACCCTGCAAGAAAACTGATGTCCCTGATGCTGTCGTTTTCAGTGGGGCTTCTTTTCTGATGTGCTTTGATTCCCTTTCCTTGTTGGTTGGTCTTGCTACTTTAGCTGCTGGGGTGCTTGTCTTCACGGGATTTTGA

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