Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_18363 LG4 53161484 53164386 PREDICTED: protein SENSITIVE TO PROTON RHIZOTOXICITY 1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 53161541 3_prime_UTR_variant
A/C 53161553 3_prime_UTR_variant
C/T 53161767 synonymous_variant p.Leu484Leu
G/A 53161842 synonymous_variant p.Asp459Asp
G/A 53161955 missense_variant p.His422Tyr
A/G 53162004 synonymous_variant p.Thr405Thr
G/T 53162704 missense_variant p.Ala172Asp
T/A 53162995 missense_variant p.Glu75Val
A/T 53163021 synonymous_variant p.Leu66Leu
C/A 53163071 stop_gained p.Glu50*
C/G 53163074 missense_variant p.Ala49Pro
C/T,* 53163216 start_lost p.Met1?
T/C 53163451 intron_variant
C/G 53163465 intron_variant
A/G 53163559 intron_variant
G/T 53163562 intron_variant
T/C 53163681 intron_variant
T/C 53163781 intron_variant
T/A 53163798 intron_variant
A/T 53163805 intron_variant
A/T 53163827 intron_variant
T/A 53163865 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_18363.1
MDTNGSLRANNWARSSSLTSDSMSFPNFGLQNNQPKWDDPSNSDYGIRAEVPFKDFNQPSQTQSPLPCNSNNEIEIPNQENCHLNESSQNSALQDWDPNVMLNNLSFLEEKIHQLQDLVHLIVRQKGIGQPNELVTQEQQLITTDLTSIIIQLISTAGSLLPSVRHNLANTASLFGQIDQLCETTIPSGTGGSSSCIQPENNGGKKMSDQSMQTDLPNNCEMEPNYNVVEQELKDEEDVDDGENLAPGSYEILQLEKEEILAPHTHFCTICGKGFKRDANLRMHMRGHGDEYKTPAALAKPHKESGSPKLIKRYSCPYPGCKRNKDHKKFQPLKTILCVKNHYKRTHCDKSYTCSRCNTKKFSVMADLKTHEKHCGKDKWLCSCGTTFSRKDKLFGHIALFQGHTPAIPLDDAKGVAEPPNHDSKENSKVGNVQFSFGSSPSSNGNEVENVMDVKGNCDDPISFFSSLNFDNSFGGFNEFTRPLFDDSEGSFSFVIPGSFKSDGVSSPDNLL*


CDS Sequence:
>Vu_18363.1
ATGGATACAAATGGGAGTCTACGTGCCAACAACTGGGCAAGGTCTTCATCGTTAACCTCGGATTCCATGTCATTCCCAAATTTTGGTCTGCAGAATAATCAACCGAAATGGGATGATCCCTCAAATTCTGATTATGGGATCAGAGCAGAAGTACCTTTCAAAGACTTCAACCAGCCTTCTCAAACTCAGTCTCCACTTCCTTGCAACTCAAACAACGAGATTGAGATCCCAAATCAAGAAAACTGTCATCTGAATGAATCATCGCAAAACAGTGCACTCCAAGATTGGGACCCCAATGTGATGTTGAATAACCTGTCTTTCCTGGAAGAAAAGATTCATCAGCTCCAGGATCTAGTGCACTTGATTGTTCGTCAAAAAGGCATTGGACAACCTAATGAACTTGTAACTCAGGAACAGCAGCTTATCACAACTGATCTCACATCAATCATTATTCAGTTGATCTCTACTGCAGGTAGTCTGCTCCCATCTGTTAGGCACAACCTTGCAAACACAGCTTCATTGTTTGGACAGATTGATCAGCTTTGTGAGACGACCATTCCTTCCGGGACTGGTGGAAGTAGCAGCTGTATTCAGCCAGAAAATAATGGTGGAAAGAAAATGTCTGATCAGTCCATGCAAACTGATCTACCTAATAACTGTGAAATGGAGCCAAACTACAATGTGGTAGAACAAGAACTCAAAGATGAAGAAGATGTAGATGATGGAGAAAACCTTGCCCCTGGTTCATATGAGATTCTACAATTAGAGAAAGAAGAAATCCTTGCTCCTCACACCCATTTCTGTACAATTTGTGGGAAGGGGTTCAAGAGAGATGCAAATCTGCGAATGCATATGCGTGGCCATGGCGACGAGTACAAAACCCCAGCAGCTCTTGCAAAACCTCACAAAGAATCTGGATCACCAAAGCTTATCAAGAGGTATTCCTGTCCCTATCCTGGCTGCAAGCGCAACAAGGATCACAAGAAGTTTCAACCTCTGAAGACTATCCTGTGTGTGAAAAACCATTACAAAAGGACACACTGTGACAAGAGCTACACATGCAGCAGATGCAACACCAAGAAATTCTCAGTCATGGCTGATCTGAAAACTCATGAAAAGCACTGTGGTAAGGATAAATGGTTGTGTTCATGTGGCACAACATTTTCTAGGAAAGACAAGCTTTTTGGGCACATTGCTCTTTTCCAGGGCCATACTCCAGCCATTCCCTTGGATGACGCCAAAGGGGTAGCTGAGCCACCCAATCATGACAGCAAAGAAAACAGTAAGGTGGGGAATGTGCAGTTCAGTTTTGGATCAAGTCCTTCTTCAAATGGAAATGAAGTTGAAAATGTGATGGATGTAAAAGGCAATTGTGACGATCCTATAAGTTTTTTCTCATCATTGAACTTTGACAACAGCTTTGGTGGGTTTAATGAATTCACTAGACCTCTGTTTGATGACTCAGAAGGTTCATTCTCTTTTGTGATTCCTGGATCTTTCAAATCCGACGGAGTATCCAGCCCTGACAATCTTTTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_18363::LG4:53164386-53166386(-)
TCGAGAACGAGCGTCCTCATGGGAAACACTAGGTTGGAGCGTTCGGCCCAGCATAGTTGTATCCGCATATCCGAAATAAAGTAATACATATATATACCCTCGTACTTTAAGATTAGTAGTGCTCGGTCTTACACCAAGCGCTCGTACTAATGTATAATCAGTATTGATAAAATAGCGTTCGTCCAACTTCAGTAATGTTTCTTTTTCCATGTTCGGTCATTTATTGGCATTGGATTTCCGTATGTGAACTATTCTAAATATAGTCCTTAACATCTTGATTATTCTTCTTGCATTGGATCCGGCCTAAGGCCTCCATACTTGATTTATTCCTTAAGTATTGGTTTGAACTCAAGAGAGTCAGTTCATTTAACTTACTCACGTGGTAAATACCGTTCGTCACATATTGCACTATTTTACTCGGCTCATTTCTTAAATCCAAAAGTAACTCTCTTAGTCTTATTCTGTTCTGAACGGGAGAATCATCGGTCTTGTTCTTATCGTTCGTCCTCGTTCTGAAGAGGGCTGAACGTTCGTTATTTAATGTCCTTGTAACTGATGATGAAAGTGATAATAAAGTGAAAGATTATAAAGGATGAATAATATATGAGATGATTAAACGGTTGTGGATTTTGAACGAGCGTTCCGGGGAGGAACGACTCATGTATTGAATATTGGAATTGGTAAAGTATGACTGTGGTTATGCTAATGCTGGCAGTTCATCCTGATGTTCCATGAGTACTCGTCCTCACGTAGAGGAGGGTAGGTCATGTGTGGGAACGGCAGGAGGTCCTAGTTCTTAGGGGTACTTTGGATAGGGCTAACCTCGGGTGGCAGCTGTTGAGTGTATCCCAGTTACTACATCACCCGGGTGCAAGAACCCTGTAGCTACACAGATTCATATAGTCCGGACGGTCAGTCTAGTGATAGGCTTGGTATGATACGTACGTTGAAATGTTTCTTGAGTATTGGAATGTTTACTTTATATGTTGATGTATGAATTAAATTACATAAGCTTACCCTGTGTTTTCCTTGTGTTGTCTCGTCTTGTACGTCCGTCTTGTCTATTGCAATGATCATCCGTGTGGATGTAAGCAGAAGGAGACGCATTGATTGTTCGGAAATTGTTTTGTAAAACCGTTCGATCCTGACTTTTTCTTATTTCTGTGGAATTGTAATTAACTCTGTACTTAACTCCGTTCGGTTTTAGACGTTGTATTAGTGTAAGACTGAACTGTTTATTATGAAATGTAATCAACTCTATTATATGGTTTTATTACTGTATTTTTGGGATGTTACATTATCAAAATTAATAAATTAAGGTGAGAACTTTTTAAGGAATTATAATATATAATATTTAATTAAACTGATATAAATTTTCAGTCTTATTATCTATCCAAAAACATTCATTTCTTTAAAATGTTATAAATGTTAAATGAAATTTGATAAGATATTAAATGTGATGTTTAGTTAAACATTTATCTAACTATACAATTATATTTTAATTAAATTAAATATGTTTTTATTCCTTAAATTATTAAATTTATTTTTAGTCTCTTTTTTAAAATAAGGTACATTTTAGTCTTCTTTTTAAAATAAATCTTAATTTTTGTCCTTCCAAAAGAATAAAAAATTAACGTTTTTTTAAATAGAAGGACTAAAATGTACCTTATTCTTGAATATTGTTATTTTCACTTTTGCCAATTTTTAGAATCTGAATAATATATTAGTAATAAAATAAAATTATTTAGTTTAAAAAGACTAGATGTCCAACAATTAAGTTCATACAGATACTACAATTATAAGTGAATAAACTACAAAAAGAAAATGAATTCTATTATTATAAAAAAAAAAACTTAAATTTAAGGAAGAATCATTAGACTGAAACAAAAGAAACAACGGTTGTGATTGATAGATGAAAAAGTTGATTAGAAACTTTGTCATCAGATTGGTGGGGTCCACAATTTGAGTGAACAAAATTGACCTATACAATTGCAGGTCAT


Gene Sequence:
>Vu_18363(-)
AATTGTGGGGTTGACCAAAGCTATCATGGTGCTGCTACTGTGTTCAGCACAACGTATGCTTACAAAGTGAATGCCTATATAAACATTTGCTTGAAACCCTTGTTTTCCTTCTCATGCCACCTTTTTTTTTCAATTGAAATGGAGCAATTTGCTTGGGGCCTCTTTTGATCTTTGAATCTGTGAGTGCTTCCATCCCCTTGTGTGGATTTTATTCTATGAATTTGTGTTGAATGCTCTTTTTTATTTTTAATTTTGTTAAGGGTTATCTCTGAATAGGGTTTTTTCTGTTTTGGGTAAAAAAATGATCTCTCTATTTTCTATGAAATCTGTTTTTCAATTTTGGGTTTCTTAGAACAAAGACTGAGGGGATGAATTAGATACAAAGAGTTTGAAGTTTTTCTTTATAATTGGGGCTTTGTACATGTTGACTTGCCGCTTCACCTGGGGAGTAACGTGAAGGGTAAAGGGGTTTTTCTTTGTTCTGATTGTATGTGGTATGATATAAATATTAAAAGGGAAAAATTTTGGAATTTGGATCCTGAATATACTGTGAAGAAATTTGAACTTGGTATTGTGATTGCTGTGTTTATTTAATTATTGTGTTTATATTGACTTAACTTAAGCCTTTGCTAGGTAATTACCCACGTCAAAAGTTAATTGAACTAAAGTGCAGAGAAAGATTTTGTTTCATGGTTTGATTCCTGTATTCAGTCGTAATTTCATGTGGCATGGGATATTTATTTGTACTCTTGTGGATATCTATGTTGAATGGCATATTTCTTCTAATTGGTGGTCATGCTTAATTTTCCTTTTATCGCTGTCCCCTTTTGTCTCTCTTTCCTTTCAAATTTTCCCTGATCACCCTTTATTATTTCTGCCTTGTTGGAACTTTGAAACATAATCTAATCCAACATGGTCCTTGGTTTTGGTAAATTATTTATAAACTATTGATGTTCTTTATGAATGATGAATGATCCATGTTTGGTATTTTTGTAAAAGAGTCTTGGTTTTTTATGGAGCTGACTTGGCTGTGTAATCCATGTAGCTGATCTTACCCAGTGGTGGGATAAGGCTTTGTTGTTATTGTTGTGCTTTGTACACTGTATCAGTTTCTTGATCATATTTCATTTGATTTTCAGTGATCAAGAATCTAGATAAAGAACTTGAAATGGATACAAATGGGAGTCTACGTGCCAACAACTGGGCAAGGTCTTCATCGTTAACCTCGGATTCCATGTCATTCCCAAATTTTGGTCTGCAGAATAATCAACCGAAATGGGATGATCCCTCAAATTCTGATTATGGGATCAGAGCAGAAGTACCTTTCAAAGACTTCAACCAGCCTTCTCAAACTCAGTCTCCACTTCCTTGCAACTCAAACAACGAGATTGAGATCCCAAATCAAGAAAACTGTCATCTGAATGAATCATCGCAAAACAGTGCACTCCAAGATTGGGACCCCAATGTGATGTTGAATAACCTGTCTTTCCTGGAAGAAAAGATTCATCAGCTCCAGGATCTAGTGCACTTGATTGTTCGTCAAAAAGGCATTGGACAACCTAATGAACTTGTAACTCAGGAACAGCAGCTTATCACAACTGATCTCACATCAATCATTATTCAGTTGATCTCTACTGCAGGTAGTCTGCTCCCATCTGTTAGGCACAACCTTGCAAACACAGCTTCATTGTTTGGACAGATTGATCAGCTTTGTGAGACGACCATTCCTTCCGGGACTGGTGGAAGTAGCAGCTGTATTCAGCCAGAAAATAATGGTGGAAAGAAAATGTCTGATCAGTCCATGCAAACTGATCTACCTAATAACTGTGAAATGGAGCCAAACTACAATGTGGTAGAACAAGAACTCAAAGATGAAGAAGATGTAGATGATGGAGAAAACCTTGCCCCTGGTTCATATGAGATTCTACAATTAGAGAAAGAAGAAATCCTTGCTCCTCACACCCATTTCTGTACAATTTGTGGGAAGGGGTTCAAGAGAGATGCAAATCTGCGAATGCATATGCGTGGCCATGGCGACGAGTACAAAACCCCAGCAGCTCTTGCAAAACCTCACAAAGAATCTGGATCACCAAAGCTTATCAAGAGGTATTCCTGTCCCTATCCTGGCTGCAAGCGCAACAAGGATCACAAGAAGTTTCAACCTCTGAAGACTATCCTGTGTGTGAAAAACCATTACAAAAGGACACACTGTGACAAGAGCTACACATGCAGCAGATGCAACACCAAGAAATTCTCAGTCATGGCTGATCTGAAAACTCATGAAAAGCACTGTGGTAAGGATAAATGGTTGTGTTCATGTGGCACAACATTTTCTAGGAAAGACAAGCTTTTTGGGCACATTGCTCTTTTCCAGGGCCATACTCCAGCCATTCCCTTGGATGACGCCAAAGGGGTAGCTGAGCCACCCAATCATGACAGCAAAGAAAACAGTAAGGTGGGGAATGTGCAGTTCAGTTTTGGATCAAGTCCTTCTTCAAATGGAAATGAAGTTGAAAATGTGATGGATGTAAAAGGCAATTGTGACGATCCTATAAGTTTTTTCTCATCATTGAACTTTGACAACAGCTTTGGTGGGTTTAATGAATTCACTAGACCTCTGTTTGATGACTCAGAAGGTTCATTCTCTTTTGTGATTCCTGGATCTTTCAAATCCGACGGAGTATCCAGCCCTGACAATCTTTTGTAACAGTGTTAGCATCTGTGTTTGTCTCTTAATGTGAGCAACTACAACTCTGGTTTGTATTAAATTTGTAAAGCCAGTTTAGTTTCCTATCCCTTCAAATTCTTAAGAAAGATGATAGATTTTCTTCAATATTTTTATCTTCTTTCAAAACCTCTGAATAGAGAAATATAAATTTGCACTTTTAGCATCTGGGTTCTTC