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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17977 LG4 44440353 44441840 PREDICTED: tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 1-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 44440660 missense_variant p.Ile103Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17977.1
MPSPSSSSSAYSLYNSYMVSNFMVSIIVPLFLFSLFVVHVSSCSQIDKLSLLAFSGNISTSPPFPYLNWSDSLDCCAWEGITCDGDLRVTHLLLPSRGLTGFISPSLTNLSCLPHLNLSHKRLSGGLQHQFFSLLSHLVVLDLSYNHLSGELPPFGIDNSGKNSSGAAIQELDLSSNFFNGTLPNSLLENLAAAAAGGSLVSLNVSNNSFIGHIPTSLFCINDRNSSSLRFLDYSSNDFDGAIQPRLGACSKLERFRAGFNFLSWPIPSDLFDAVSLTEISLPLNRLTGTIEDGIVGLTNLTVLELYSNHFTGFIPREIGKLSKLERLLLHVNNLTGTMPPSLMNCVNLVVLNLRVNLLEGNIPAFNFSGFLSLTTLDLGNNYFIGGLPPTLYACKSLSAVRFASNQLEGEISPSILELESLSFLSISNNKLRNVTGPLTILRGLKNLSTLMLSKNFFNEMIPQDVNIIEPGGFQKLQVLGFGGCNFTGCININK*


CDS Sequence:
>Vu_17977.1
ATGCCATCACCATCTTCATCTTCCTCTGCATATTCCCTTTACAATTCTTACATGGTTTCCAACTTCATGGTCTCTATCATAGTCCCCTTATTCCTCTTCTCCTTGTTTGTTGTTCATGTTTCCTCTTGTAGTCAGATTGATAAACTCTCCCTCTTGGCTTTCTCTGGGAACATATCCACCTCTCCACCTTTTCCTTATCTCAATTGGTCTGATTCTCTTGACTGCTGTGCTTGGGAAGGCATTACTTGTGATGGGGATCTTAGAGTCACACATCTTTTGCTACCTTCTAGAGGCCTCACTGGCTTCATCTCCCCCTCTCTCACAAACCTCTCTTGTCTCCCTCACCTTAATCTCTCCCATAAGAGATTATCTGGTGGTCTCCAGCACCAGTTTTTTTCATTGCTCAGTCACTTGGTGGTTCTTGATTTGAGCTACAATCATCTGTCTGGTGAATTGCCACCTTTTGGGATTGATAACAGTGGCAAAAATAGCAGTGGTGCTGCTATCCAGGAGCTGGATTTGTCCAGCAATTTTTTCAACGGGACACTTCCAAATTCTTTGCTCGAGAACTTGGCAGCTGCTGCAGCTGGAGGAAGTTTGGTGTCTTTGAATGTTAGTAATAACAGCTTCATAGGTCATATTCCCACTTCCCTGTTTTGCATTAATGACCGTAACTCCTCCTCTCTAAGATTCTTGGATTATTCCTCCAATGATTTTGATGGTGCCATTCAGCCTAGACTTGGAGCATGTTCCAAGCTGGAGAGATTTAGAGCAGGCTTCAATTTTCTGTCATGGCCTATTCCAAGTGATCTTTTTGATGCTGTTTCTCTCACAGAAATCTCATTGCCCCTCAATAGACTCACTGGAACAATTGAAGATGGTATAGTTGGCCTTACCAACCTCACAGTTTTGGAGCTCTACTCCAATCATTTCACAGGTTTCATCCCCCGTGAAATTGGTAAACTCTCCAAGTTGGAACGGCTACTCCTTCATGTCAACAATTTGACAGGTACTATGCCCCCGTCTCTGATGAACTGTGTTAATCTTGTGGTGTTGAATTTAAGGGTCAATCTCTTGGAGGGAAATATCCCTGCATTCAATTTCTCAGGATTCCTCAGCCTTACTACACTTGATCTTGGCAACAATTATTTTATCGGTGGTTTACCACCAACCCTTTATGCATGCAAATCACTTTCAGCTGTGAGGTTTGCATCTAATCAGCTTGAGGGAGAGATTTCTCCCAGTATCCTTGAACTAGAGTCTTTGTCTTTCCTATCAATTTCTAATAACAAGTTGAGGAATGTTACTGGGCCTCTGACAATACTCAGGGGGCTCAAAAACCTCAGTACCCTTATGCTCTCCAAGAATTTTTTCAACGAAATGATACCTCAAGATGTGAACATAATAGAGCCAGGTGGATTTCAAAAACTGCAGGTTTTAGGATTTGGTGGTTGTAATTTCACTGGTTGTATAAATATAAATAAATAA


Promoter Sequence:
>Vu_17977::LG4:44438353-44440353(+)
GTGTGAACATTGAAGGGAATGAGAGTCGATTGGTAGAATAATTATGGAGAAAGGAGGTGGTGGGTGTAGGTGTTGTGGAAAAGGAGTATGAGTGGAAGAGAGGGAGAGGTTGGTAGGTTGCAGGTGAAGGACTTAATAGTGAGAGTGCCTCGGGTTGGGTAGCATGAATGAAATAATGTGTGAAGGGCTTAGTTTCTCATCGTGGTTATGTTGGGAAAGAAAGATAATAAGAAAGGGTTCGGCATGTGCAGGGAACATGCAAGGAATATTGTAACTAGGAAATATAGTTGGTTTTAGGGTGGAGATGATTCCAGGGGTCATAGTGAGTTTAAGGGTAAATTATTTGGGAAGAATAATGGTGGTATAGGGGTATAAGGGATTATAGAAGGGTTGAGCAGGGAATGGTATACACATTCATTAGATTGTACTAACTAACCCTAAACATATATATAACTAAGCGTAATTAGGTGTATAACCAGCCATAACAAACCTCTCAAACGCCATTGTGAAGGGTTTCAACTCTTGAAACGATGCATGTATTGTTCATGTGTTTTTTCAAATCATAATTGTAAACAAAAGCATTACAATTACTAGAACTTGCCACTGTTTTCAATGGCAGCAGCTGGAAGAGATAGTCTTAGCTCCAAATCTGGTTCTGTGGTGTTGAAGGATGTTCCACCAAGGTCTACCACTGTTAAATGTTTAGAAGTAATTTAGAAGTGCCACTCTATTTTAGATAAAATTTAGAAAAACTTGGCATCACCACAACTTTGTGACGTTAGTCTTGATGATATTGATGATCAACACTTCCTGTGCTAATTAGTTGTTTTTAGACCATTATTAGTGTAGTGTCTTAAATTGATAGATTTCACTCACTTAGTTTAGTAGTAGTTTAAATTGTTTGGCTTTTCATTCTAAAATTGATTTGAATTTCACCAAAAGAAGTACTTCTTAGTTGTGTTAGATGAACATTAAAAATTGTTTTAGACAACTTAGTGGATTTTTAGATTACCCTTAGATAGATTTTGTTGTAGTTAGTGTGCATGTTAGTTGAACTGACTTTGTGGATGCCCACACTGGCCACCTGTTAGCAGGGTTTAGCTCTGCAACTCCTTTCTCTGCCTCATCAAAAAACATCCTTGTCCTCTTTATCTGTCCCTTCATGAATTTACTAGGTTTATCTATAACTTTACCCAGGAAAATGTCATCATCTAAAAGCCTAGCTTTTGCCAATTCATCTTGTCCCTCCTCCTAGTTTACTTCCCCTTTGTTGAGAATGGCATAGTACCTTATCTGCTACTCTTCTTTCTCTTAATTACGAATAATCTTCTGCAGATCAAGCTTTGTTTGTCAATCTTTCTACTTCTTTTACTGCTTATATTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTAGTTGTTAGGTGATGATATTGTTTTAATTAGCAATGATATGGCAGAAATTAATCATCTTAAGCACATCTTAGATACCAAATTTAAAATCAAAGACCTAGGATCTTTAAGATACTTTCTCGGTCTTGGAATTACAAGGTCCAAATCTGGAATTCACATGAATAAGAGAAAATATATTCTTGAACTTCTCGATGACAGTGGTTTGATTGGTTCTAAACCTACTAACACTCCTTCTGATCCTTCTATTAAACTTATGGCAAATCATGGACAACTTTTATGTAATGCTGCTGGTTACTGGCAGTTAGTTGGCAAACTTTTGCACCTCACCATCATCAAGCAAGATATTGATTATGTGTACAACAACTCAGCCAATTTCTATGCAAACCTCTTGATACTTATTACAATGCTGCTCAAAGAATCTTTCATTACCTCAATGGATCCCCTGCTCATGGCTTGTTCTTCTTTGCTTCATCAGACCTTAGAATCTCGGCCTTTGCCAATTGAGATGAGCTTGCTGTTTGGATACCAGAAGGTCTATCATGGATCCCCTGCTCATGACCAACCATCACTTCAAACACTCCATTCTCTCAGTTTTTCTCA


Gene Sequence:
>Vu_17977(+)
ATGCCATCACCATCTTCATCTTCCTCTGCATATTCCCTTTACAATTCTTACATGGTTTCCAACTTCATGGTCTCTATCATAGTCCCCTTATTCCTCTTCTCCTTGTTTGTTGTTCATGTTTCCTCTTGTAGTCAGATTGATAAACTCTCCCTCTTGGCTTTCTCTGGGAACATATCCACCTCTCCACCTTTTCCTTATCTCAATTGGTCTGATTCTCTTGACTGCTGTGCTTGGGAAGGCATTACTTGTGATGGGGATCTTAGAGTCACACATCTTTTGCTACCTTCTAGAGGCCTCACTGGCTTCATCTCCCCCTCTCTCACAAACCTCTCTTGTCTCCCTCACCTTAATCTCTCCCATAAGAGATTATCTGGTGGTCTCCAGCACCAGTTTTTTTCATTGCTCAGTCACTTGGTGGTTCTTGATTTGAGCTACAATCATCTGTCTGGTGAATTGCCACCTTTTGGGATTGATAACAGTGGCAAAAATAGCAGTGGTGCTGCTATCCAGGAGCTGGATTTGTCCAGCAATTTTTTCAACGGGACACTTCCAAATTCTTTGCTCGAGAACTTGGCAGCTGCTGCAGCTGGAGGAAGTTTGGTGTCTTTGAATGTTAGTAATAACAGCTTCATAGGTCATATTCCCACTTCCCTGTTTTGCATTAATGACCGTAACTCCTCCTCTCTAAGATTCTTGGATTATTCCTCCAATGATTTTGATGGTGCCATTCAGCCTAGACTTGGAGCATGTTCCAAGCTGGAGAGATTTAGAGCAGGCTTCAATTTTCTGTCATGGCCTATTCCAAGTGATCTTTTTGATGCTGTTTCTCTCACAGAAATCTCATTGCCCCTCAATAGACTCACTGGAACAATTGAAGATGGTATAGTTGGCCTTACCAACCTCACAGTTTTGGAGCTCTACTCCAATCATTTCACAGGTTTCATCCCCCGTGAAATTGGTAAACTCTCCAAGTTGGAACGGCTACTCCTTCATGTCAACAATTTGACAGGTACTATGCCCCCGTCTCTGATGAACTGTGTTAATCTTGTGGTGTTGAATTTAAGGGTCAATCTCTTGGAGGGAAATATCCCTGCATTCAATTTCTCAGGATTCCTCAGCCTTACTACACTTGATCTTGGCAACAATTATTTTATCGGTGGTTTACCACCAACCCTTTATGCATGCAAATCACTTTCAGCTGTGAGGTTTGCATCTAATCAGCTTGAGGGAGAGATTTCTCCCAGTATCCTTGAACTAGAGTCTTTGTCTTTCCTATCAATTTCTAATAACAAGTTGAGGAATGTTACTGGGCCTCTGACAATACTCAGGGGGCTCAAAAACCTCAGTACCCTTATGCTCTCCAAGAATTTTTTCAACGAAATGATACCTCAAGATGTGAACATAATAGAGCCAGGTGGATTTCAAAAACTGCAGGTTTTAGGATTTGGTGGTTGTAATTTCACTGGTTGTATAAATATAAATAAATAA

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