Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17887 LG4 41819066 41823104 PREDICTED: probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g03770
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 41819184 missense_variant p.Thr719Ile
A/T 41819187 missense_variant p.Ile718Lys
C/T 41819270 synonymous_variant p.Gly690Gly
T/A 41819327 intron_variant
C/T 41819332 intron_variant
G/A 41819347 intron_variant
A/T 41819605 intron_variant
A/T 41819949 intron_variant
C/A 41819983 intron_variant
T/A 41820032 intron_variant
A/T 41820064 intron_variant
T/A 41820070 intron_variant
C/A 41820156 intron_variant
G/T 41820292 intron_variant
T/A 41820356 intron_variant
T/A 41820364 splice_region_variant&intron_variant
G/A 41820371 missense_variant p.Pro649Ser
C/A 41820690 missense_variant p.Arg575Met
G/A 41820699 missense_variant&splice_region_variant p.Ala572Val
G/T 41820719 intron_variant
G/A 41821075 stop_gained p.Gln546*
C/T 41821078 missense_variant p.Gly545Arg
A/G 41821110 missense_variant p.Val534Ala
C/T 41821189 missense_variant p.Ala508Thr
G/T 41821212 missense_variant p.Ser500Tyr
G/A 41821574 synonymous_variant p.His474His
T/G 41821746 intron_variant
A/G 41821767 splice_region_variant&synonymous_variant p.Ala446Ala
A/T 41822233 missense_variant p.Leu291His
A/T 41822377 missense_variant p.Leu243Gln
C/T 41822430 synonymous_variant p.Leu225Leu
G/A 41822553 synonymous_variant p.Thr184Thr
A/G 41822618 missense_variant p.Ser163Pro
C/A 41822895 synonymous_variant p.Leu70Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17887.1
MFQGGTMRQFCYLYLVVLSWFFFIPNTYELQAAQTQALLQLRVHLEYPSSLQIWQYYQGDLCTLSPSANLSIKCEDDEVTELKITGEKSSKPPRFNGYPVPNHTLSMNFSIDSFFITLTELTTLRVLSLVSLGIWGPLPDKIHSFTLLQVLDLSSNFLFGAISPKISTMVTLHTLTLDDNYFNTTMPDSFDSLSNLNILSMKSNGLKGSFPSSLGKIKTLEVISLSHNELSGDLPGLSSLTGLHVLDLRENHLESELPLLPKYVVTVLLSNNSFSGEIPKQFQELDQLQHLDLSSNFLSKTPPSALFSLPEISYLNLASNVLSGTLPDKLNCGSKLGFVDISRNKLSGGLPSCLANTSDSRVVRYAGNCLSVDSQNQHRRSYCKESTSGWKSFKTWELAVVMAIVVVLVLVVLVSSVFLWKKYHSRKTTGQDNSSIAVPSEILANARFISQTVKLGTQTIPTCRQFSIEELKEATKNFDLSTYIGQGSMGKMYKGKLENGSYVAIRSLALSKKCSIQTLRAKLDLLSKLHHPNLVSLLGHCIDGGGQDDSNSHKLHLVYEYVPNGNYHAHLSELSVGKALKWSDRLAILIGVAKAVHFLHTGVIPGCFSNLLKTKNVLLDEYCIPKLSDYGMSIITEEIEMFEAKGEKSKPCLRTKADDDVYNFGFILFESLVGPIACDRGETFFLNEKASFGSQDGRRKIVDPIVLTTCSQESLSIAISITTKCISPESSLRPSFEDVLWNLQYAAQVQATADADHKSD*


CDS Sequence:
>Vu_17887.1
ATGTTCCAAGGTGGTACAATGAGACAGTTTTGCTACCTTTATCTTGTTGTTCTTTCATGGTTCTTTTTCATCCCAAACACTTATGAGTTACAAGCTGCTCAGACACAAGCATTGCTGCAGTTAAGAGTTCATCTAGAGTATCCCTCTTCTTTACAGATATGGCAATATTACCAGGGGGACCTTTGTACGCTCTCTCCATCTGCAAACCTGAGCATTAAATGTGAAGATGATGAGGTAACTGAGCTTAAAATTACGGGTGAAAAATCTTCGAAGCCACCACGGTTCAATGGATATCCAGTTCCTAATCACACTCTATCCATGAATTTCTCCATTGATTCCTTTTTCATCACTTTGACAGAGTTGACCACCTTAAGGGTTCTTAGCTTGGTGTCCTTGGGGATTTGGGGGCCACTTCCTGATAAGATTCACAGTTTCACTTTGCTTCAAGTTTTGGACTTGAGTTCCAATTTCTTATTTGGAGCCATTTCACCAAAAATATCCACAATGGTAACGCTTCACACACTGACCCTTGATGACAATTATTTTAACACCACTATGCCCGATTCCTTTGATTCTCTGTCCAATCTGAATATCTTGAGTATGAAGAGCAATGGCTTAAAGGGTTCATTCCCCTCCTCACTGGGAAAAATTAAGACACTTGAAGTTATTTCCTTGTCCCACAATGAGTTGTCTGGTGACCTGCCTGGTCTCAGTTCTCTCACTGGCCTACATGTTCTGGATTTAAGAGAAAACCATTTAGAATCTGAACTACCATTGTTGCCAAAATATGTGGTCACTGTGCTGCTTAGCAATAACTCATTTTCAGGAGAGATACCTAAGCAGTTTCAAGAACTGGATCAGCTTCAACATCTTGATCTTTCTTCAAATTTTCTCAGTAAGACACCCCCATCTGCCTTGTTTTCTCTGCCAGAAATAAGTTATTTGAATCTGGCAAGCAATGTGCTAAGTGGGACCCTCCCAGACAAACTTAACTGTGGTAGCAAACTTGGGTTTGTGGACATTTCTCGTAACAAGCTAAGTGGTGGACTTCCTTCTTGCTTGGCGAATACATCTGACAGTAGAGTTGTTAGATATGCTGGAAACTGTCTATCTGTTGACTCTCAGAACCAGCACAGAAGGTCTTATTGCAAAGAATCCACCTCTGGATGGAAAAGCTTCAAGACATGGGAACTAGCTGTAGTAATGGCCATCGTTGTTGTACTTGTTCTTGTGGTTTTGGTTTCTAGCGTCTTCTTATGGAAAAAGTACCATTCCAGAAAGACAACTGGGCAAGATAACTCCTCGATAGCAGTTCCGTCAGAGATCCTTGCAAATGCTAGATTTATTTCTCAAACAGTGAAGCTAGGAACACAAACTATTCCAACCTGTCGGCAATTTTCAATAGAGGAATTGAAGGAAGCCACAAAAAACTTTGATTTGTCAACTTATATTGGTCAAGGCTCCATGGGGAAGATGTACAAAGGTAAACTGGAGAATGGATCCTATGTGGCAATACGGTCTTTGGCTCTGTCAAAGAAATGCTCAATTCAAACTCTCAGAGCTAAATTGGATTTACTCTCAAAACTTCATCATCCAAATTTGGTTAGCCTTTTGGGTCATTGTATTGATGGTGGAGGACAAGATGATTCCAATTCCCATAAACTTCATCTTGTGTATGAGTATGTGCCAAATGGGAATTATCATGCTCATCTCTCAGAACTTTCTGTAGGGAAGGCACTTAAGTGGTCTGATAGATTGGCAATTTTAATTGGAGTTGCAAAGGCAGTGCATTTCTTACATACTGGTGTTATACCTGGCTGCTTTAGTAACCTACTGAAGACAAAAAATGTCTTGCTTGATGAATACTGCATTCCAAAACTAAGTGACTATGGTATGTCCATCATCACAGAAGAAATTGAAATGTTTGAGGCAAAGGGCGAGAAATCAAAGCCATGCCTAAGGACAAAAGCAGATGATGATGTTTATAATTTTGGATTCATCCTGTTCGAATCACTTGTTGGACCCATAGCATGCGACAGAGGTGAAACATTTTTCCTAAATGAAAAGGCATCGTTTGGGAGTCAAGATGGTAGAAGAAAGATTGTGGATCCGATAGTGTTGACCACTTGCTCTCAAGAGTCTTTATCAATTGCAATATCAATAACAACCAAATGCATTTCTCCAGAATCTTCCCTTCGTCCCTCTTTTGAGGATGTCTTATGGAACTTACAGTATGCAGCTCAAGTCCAAGCCACAGCAGATGCAGACCACAAATCAGATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_17887::LG4:41823104-41825104(-)
CTGCCCAATTTCTACATCTATAAAATAGTCTCCCTTTGTTCTTCAATGTAGTTGCCTTCAACAACAACAATCTTTCCCCACAACCACAGTTTTTTGAAGCTAAGTGAGATGATCCACAACTTTGGGACATTCCAGAACCTATGCTCCTTGGTGTGCAACCTCCTCTATCACCTTTCATTTCCCTTCAAAAGTGATTAACAAAGAAACTCAAGTTCGAAACCAGAACCCTTCAACAAAATCCTACATCCCCAAATCCATCCATCATTTTAAACCAAAACAAAGACAAATGTGAACTTACGTGCCCAACTCCACCAACGCCCAAGAAGGTGATATCCAAGCTTCAACCTTCTTTCCACTTTGTCTTTGCTCAAATCCTTCAGACAACACTATGCAATGAAACTAATAAACCAAACTTTACGAACGTTGGATTAACTTTGCATTTTAGCTGTTTAAACACGTGGAAAGAGACGTTAGAACACGTGGAAAGAGACGTTAGACACATCAGCATATTTTTCACGGTGTTAGTTTTGGAGGACTAAAACCATAGTTTCGAAAAGTATGAGGACTAAAGTGTACCTTACTTTGGAAGAGGGACGAAAACCAGAAATGACCAATAGTTTAGGGACTAAAAACATATTTAACCCATTAAAAAATGATAATATTATAAAAAATTGTATATTTATTATTATTATTATTATTTATATAAATATACCTTACTCGCCCGATATTTTAGACACAAAAATTATATAGAAATTAAATTGCAAGCAGACAATTGGGATTTCACGAGAGAGCTTTAAAGTTAAGAACATTAATTGTTTCTCTTCTAAAGCATCTTCTATAAATTGATATGTTTCTATTAAAAAAATAGTAAATATTTAAAATGAACAAAGTTTATCTCGCTTGATTTAATATGGAAATATTCGTATTTAATGATTTCAAAGTCTTACCTAAGTACTTCAATTTTAAATATAATAAATAAAAATTTTAAAATAAGAATACAAATGAAAATTTTAAAATAAGAATACAAATGAAAATTTTAAAATAAGAATACAAAGTATTAATATGTCATGAATTAACGAAAATATGTTATAAAAGTAATTAAGTAATGTCATAACGTGATTTGAAATTTAGGAGAGAGAAAATATATATATTATTAGTGGATAGAGATTCTGTACTGCATTATCTTTTTGAAGCTATGACCCTGCTCTGCTATCTCCTCTGTCCTTCACCTTCTCTCCAATAGTTACCGACCCCATTAATGGCAGCAACGCCACTTCAAACACCAAAATAAATGCCTTTCTCAGTCACCAGAGTATCACATTTTCAACTACCTCACTTGTTTTGTCCCATTTCAACACACGTTCACCATTCATTGAAGCCGCAATTTGTGCCCTTCCATTGTTATACTTACCAAGGTCCTGTTTCCCCTGTTCTGCTCTGTTACCCTCTGCATTCAACTACTACCAATAAATGGGTTCTTCTTTCTTTCTCCCGACAGGTGCAGGTCCAGGTGCTCCATGGTTTAAAGTTAAAGTTTTTACTAACCCAAGTCCGTGAACAATGTCCAAGTTTCCTCTTTTTCCTTGTTGGTTCTCTTTAATTGTAAAGTTAGAGTTGTTGATGCTGTGATCGAAACCGTTGACAGGGTTTTGATAAAAAGGGTGTGTGAATGTGATTTCGGTCACTCTGTTTGAAAGTTTTTGGAATCTCTGGGGCTATAATTGTGACTGTCTTAGTTGTGTTTGTCTATGATATCTTCAAATTTCTGCGATAAAGTTATGGTTTTTAGGGTCTCTGGCATTGCAACTGTGGTCGCATGGGCTGTGTTTGTCTGTGATTTCTTTTAATTTCAAGAACTGTGTGGCGAAACTGTAACCGCAAGTGCAATTTAGAATCTTCGCTGTTCAACAGAAATTTCTTCAGGGTGGTCTACTTTTGACTTCTTTGAGGTTTGAAGGATCTGTTTTGAGTCTTTGGGCATTCATCAAATCTGATGCGTT


Gene Sequence:
>Vu_17887(-)
ATGTTCCAAGGTGGTACAATGAGACAGTTTTGCTACCTTTATCTTGTTGTTCTTTCATGGTTCTTTTTCATCCCAAACACTTATGAGTTACAAGCTGCTCAGACACAAGCATTGCTGCAGTTAAGAGTTCATCTAGAGTATCCCTCTTCTTTACAGATATGGCAATATTACCAGGGGGACCTTTGTACGCTCTCTCCATCTGCAAACCTGAGCATTAAATGTGAAGATGATGAGGTAACTGAGCTTAAAATTACGGGTGAAAAATCTTCGAAGCCACCACGGTTCAATGGATATCCAGTTCCTAATCACACTCTATCCATGAATTTCTCCATTGATTCCTTTTTCATCACTTTGACAGAGTTGACCACCTTAAGGGTTCTTAGCTTGGTGTCCTTGGGGATTTGGGGGCCACTTCCTGATAAGATTCACAGTTTCACTTTGCTTCAAGTTTTGGACTTGAGTTCCAATTTCTTATTTGGAGCCATTTCACCAAAAATATCCACAATGGTAACGCTTCACACACTGACCCTTGATGACAATTATTTTAACACCACTATGCCCGATTCCTTTGATTCTCTGTCCAATCTGAATATCTTGAGTATGAAGAGCAATGGCTTAAAGGGTTCATTCCCCTCCTCACTGGGAAAAATTAAGACACTTGAAGTTATTTCCTTGTCCCACAATGAGTTGTCTGGTGACCTGCCTGGTCTCAGTTCTCTCACTGGCCTACATGTTCTGGATTTAAGAGAAAACCATTTAGAATCTGAACTACCATTGTTGCCAAAATATGTGGTCACTGTGCTGCTTAGCAATAACTCATTTTCAGGAGAGATACCTAAGCAGTTTCAAGAACTGGATCAGCTTCAACATCTTGATCTTTCTTCAAATTTTCTCAGTAAGACACCCCCATCTGCCTTGTTTTCTCTGCCAGAAATAAGTTATTTGAATCTGGCAAGCAATGTGCTAAGTGGGACCCTCCCAGACAAACTTAACTGTGGTAGCAAACTTGGGTTTGTGGACATTTCTCGTAACAAGCTAAGTGGTGGACTTCCTTCTTGCTTGGCGAATACATCTGACAGTAGAGTTGTTAGATATGCTGGAAACTGTCTATCTGTTGACTCTCAGAACCAGCACAGAAGGTCTTATTGCAAAGAATCCACCTCTGGATGGAAAAGCTTCAAGACATGGGAACTAGCTGTAGTAATGGCCATCGTTGTTGTACTTGTTCTTGTGGTTTTGGTTTCTAGCGTCTTCTTATGGAAAAAGTACCATTCCAGAAAGACAACTGGGCAAGATAACTCCTCGATAGCAGTTCCGTCAGAGATCCTTGCAAATGCTAGTAAGTATATAGGTTTCTTAGGCCATAGTGATGTGTTGTTGACTCTTAATTTTAAATTGGAATGCTGTTTTCCAACATAGGAATGACATGATTTGTGTTGTTTTCAGGATTTATTTCTCAAACAGTGAAGCTAGGAACACAAACTATTCCAACCTGTCGGCAATTTTCAATAGAGGAATTGAAGGAAGCCACAAAAAACTTTGATTTGTCAACTTATATTGGTCAAGGCTCCATGGGGAAGGTACAGTTCAACCACTTAAAATGTTACTGAAATATTGTATACACCTGAGGTGTGTTCTACAGTTCTACCAAGTCATCTTAAGGAGACAAAATTTCTTGAGTTTTCAGGAAGGTTGCAATTTCTGAAATCCTAGTTAAGGTTACACTATTTGCATGTCTTTTGGCCTTTACACCTTGTTAAGAGGTCAAATGATTTAAAATGTATGTGTAAAAATAAAAACACTTTGTGATACTTATTTTGTGTGCTCACTGAAATGCATCTTTAATTCTTCTGCCATATTACAGATGTACAAAGGTAAACTGGAGAATGGATCCTATGTGGCAATACGGTCTTTGGCTCTGTCAAAGAAATGCTCAATTCAAACTCTCAGAGCTAAATTGGATTTACTCTCAAAACTTCATCATCCAAATTTGGTTAGCCTTTTGGGTCATTGTATTGATGGTGGAGGACAAGATGATTCCAATTCCCATAAACTTCATCTTGTGTATGAGTATGTGCCAAATGGGAATTATCATGCTCATCTCTCAGGTTAGCATGGAAAAACGATAGCATGCATATTATTGAGTCAAGTTTCACCAATTATGTCTCTCCTTATCTTTATGGCTTCATGAATATCTGTAGTACTAATTCTGACCAATATTCTATCGAGATTAGGACAATTTAACTATTTCTTAAGTGATGATTGTATCTTCTCAATCCTTCATAACCTTTTCATTTTTCTTACTGTAATCATTATACTATAACTTGTAAAAGTTGTATTTGACATCACATCTTTCTGCTTGAAGGCTTCAATCCACTGATCTTCCTTCATTCAAACATGCAGAACTTTCTGTAGGGAAGGCACTTAAGTGGTCTGATAGATTGGCAATTTTAATTGGAGTTGCAAAGGCAGTGCATTTCTTACATACTGGTGTTATACCTGGCTGCTTTAGTAACCTACTGAAGACAAAAAATGTCTTGCTTGATGAATACTGCATTCCAAAACTAAGTGACTATGGTATGTCCATCATCACAGAAGAAATTGAAATGTTTGAGGTATGTTCCTGGCAACCCAATGTTGCATTTTTACCATTGTTTGACATAATTATGATTGATCCTCAATTCACTGTGTTGCCTCTTTTGTGTTGTACAGGCAAAGGGCGAGAAATCAAAGCCATGGTATGATACCAAAACTCAGTTTAGTTAACATAAACACCAAAACATATTAGTAGTTCAAATAAAGTTATGTTAGACATCACTGTAAATTTTGATATCTGAGCTAACATCCAAAGTTCATCTACCATTTGCCATCACAAGAAAAATTTATTTCCATATTATCATGAAAACCATGATTAGTTTTCACTCAAAACATGATTTCTTTACATATTAGGGTATTCTGTTTGCTTCCTTGAAGCCACTTCACTTCTCAATGCAACTACTTCTCCCAATTTTATGTGTAGTAATCACTTTTGATAATTTCCTGCCCTTGGATTGTGAAGGGTATGAAAGATGGAATACCCAAAGTTTGATGTCCTTTGTTATGCATAAATGTATTTTTGGTAGGAAAGATGGAATTACAAAGAAATTGTTCTTTTTTGTATTGTAGCCTAAGGACAAAAGCAGATGATGATGTTTATAATTTTGGATTCATCCTGTTCGAATCACTTGTTGGACCCATAGCATGCGACAGAGGTGAAACATTTTTCCTAAATGAAAAGGTTAGTGCTTTTTTAAACATTTGCCTTTTGCTTCTTGATGAATATAACTACTACTTCAATGAATTTAATCATATTTAAGTACTGATTATTTTTTCCTCAATTAGCAGAAAGAAAGTTGTAGAAGAATAAACTGTCAAAATATAAATTCCTTTTTTGCACTTAAAGATTTTCTTATATGTTTGTAATTCTTTACATATCACAAAATTGAAAAACAAAAAGTTCTGGTCGTTTAACATTTTAGTCAAATTCAAAATTGGAAGATAATCCCTCTAATGGCATATATCTAGACATGCCACATGCGGTCTTAAAATAATTCATGAAAACACATGACATGTCAAGATGCATGAAGCAAGTGATGATGGAGACATTTGAAAAAAAAAAGGTTAAATTTATGAGAAATCAATAAAAATAAAATATAATAAAATCTGAAACAAAAAAAAATTAACTTGATTGGTGTAAATTGATATGTAAACCTTTTACCTATTATTATAAAAAGATTAATTTTTTTAATGCAAGACCTAATGTGATAATTGGTGTGAATGACAGGCATCGTTTGGGAGTCAAGATGGTAGAAGAAAGATTGTGGATCCGATAGTGTTGACCACTTGCTCTCAAGAGTCTTTATCAATTGCAATATCAATAACAACCAAATGCATTTCTCCAGAATCTTCCCTTCGTCCCTCTTTTGAGGATGTCTTATGGAACTTACAGTATGCAGCTCAAGTCCAAGCCACAGCAGATGCAGACCACAAATCAGATTAA