Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17863 LG4 41481269 41484128 PREDICTED: cyclic dof factor 1-like isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 41481279 3_prime_UTR_variant
A/G 41481400 3_prime_UTR_variant
C/T 41481432 3_prime_UTR_variant
T/C 41481502 missense_variant p.Met480Val
C/A 41481505 missense_variant p.Gly479Cys
A/G 41481572 synonymous_variant p.Val456Val
T/A 41481647 synonymous_variant p.Ser431Ser
G/A 41481700 missense_variant p.Pro414Ser
A/G 41481706 synonymous_variant p.Leu412Leu
C/T 41481713 missense_variant p.Met409Ile
C/T 41481778 missense_variant p.Gly388Ser
G/T 41481782 synonymous_variant p.Gly386Gly
A/G 41481929 synonymous_variant p.Ile337Ile
G/T 41482020 missense_variant p.Pro307His
G/T 41482104 missense_variant p.Pro279His
T/C 41482259 synonymous_variant p.Ser227Ser
T/C 41482271 synonymous_variant p.Glu223Glu
T/C 41482588 missense_variant p.Asn118Asp
C/G 41482647 missense_variant p.Ser98Thr
G/T 41482944 intron_variant
C/T 41482970 intron_variant
A/C 41482979 intron_variant
G/A 41482985 intron_variant
G/C 41483274 intron_variant
A/G 41483282 intron_variant
A/T 41483652 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17863.1
MSNKDPGIRLFGRKIPLPESQIPASSQMGYQIQANSATMNAYNGLKKKEVEMPCTENSEQLENYSDSTDSKQETLYNRQENESKVNSKTVENNTESSSTDQDKIFKKPDKILHCPRCNSLDTKFCYFNNYNVNQPRYFCKNCQRYWTAGGTMRNVPVGAGRRKNKHLASQYRHIIVSCDGIPTTSDSSCHQLATTLQSAAVFRSSTDNGTVLKFCPDAPPLCESMESMLNLKEQNRSADENTVNYAEKGEEEVSLCGSSSMTNAYTPRNKSTEPTASKPMQCYPVPPWIFPWNPDWNNVASTASLHPSSLQMCNPYNSADPASMQWCPTPIMAVPTICPPSFPLQFVPGSYWSGPPVYGGGTGAASMGFNACLSPTSSTSNSCCSGNGSPTLGKHTRDNLSTDEEKSDMCILVPTTLRIDDPNGASKLASSGTNPECVPEGTISKRAKPREGKDRVLGVSQILEANPAAISRAHAFQEGM*


CDS Sequence:
>Vu_17863.1
ATGTCTAATAAGGATCCGGGTATTAGGCTCTTTGGCAGGAAGATTCCGTTGCCGGAATCTCAGATTCCGGCCAGTTCTCAGATGGGATATCAGATTCAGGCCAACTCTGCAACCATGAATGCTTACAATGGCTTAAAGAAAAAAGAAGTTGAAATGCCCTGTACTGAAAACTCTGAGCAACTAGAGAATTATTCTGATTCAACGGATAGCAAACAAGAGACCCTATATAATCGGCAGGAAAATGAGTCAAAAGTAAATTCCAAAACAGTGGAAAATAATACAGAGAGTAGCAGTACAGATCAAGATAAAATCTTCAAGAAACCAGACAAAATTCTGCATTGTCCTCGATGCAACAGTTTAGACACCAAATTCTGTTATTTCAATAACTACAATGTGAACCAACCTCGGTATTTCTGCAAGAACTGCCAAAGGTACTGGACTGCAGGTGGAACCATGAGAAATGTTCCAGTGGGTGCGGGGAGACGAAAGAACAAGCACCTAGCTTCTCAATACCGGCACATTATTGTATCTTGTGACGGAATTCCAACTACAAGTGACTCTTCTTGTCACCAACTTGCCACAACACTTCAATCTGCTGCTGTTTTCAGGTCTTCAACAGATAATGGTACTGTGTTGAAATTTTGTCCGGATGCCCCTCCTCTTTGTGAATCCATGGAGTCAATGCTTAATCTTAAAGAACAAAATCGAAGTGCTGATGAAAATACTGTCAATTATGCAGAAAAAGGGGAGGAGGAAGTATCCTTATGTGGATCATCATCTATGACCAATGCTTACACTCCAAGAAACAAATCAACTGAACCAACTGCATCAAAACCTATGCAGTGTTATCCTGTTCCTCCGTGGATATTCCCTTGGAATCCAGATTGGAACAATGTTGCTTCCACTGCATCACTTCACCCCTCTTCACTACAAATGTGTAACCCTTATAACAGTGCCGACCCTGCTTCAATGCAGTGGTGTCCTACACCGATCATGGCAGTTCCAACAATTTGCCCACCAAGCTTTCCCTTGCAATTTGTTCCTGGATCATACTGGAGTGGACCACCTGTGTATGGTGGTGGAACAGGAGCTGCTTCAATGGGTTTCAATGCCTGCCTTTCACCTACTTCCTCTACCAGTAATAGCTGCTGCTCAGGCAACGGCTCCCCAACACTTGGCAAACACACAAGAGACAATCTTTCAACAGATGAAGAAAAATCAGACATGTGTATCTTGGTTCCAACGACCCTTAGAATTGATGATCCAAATGGGGCCTCAAAATTGGCCTCATCAGGAACCAACCCTGAATGTGTACCAGAAGGTACTATTTCAAAAAGGGCAAAGCCTAGAGAAGGCAAAGACCGTGTTTTGGGTGTGTCTCAAATCTTGGAAGCTAACCCTGCAGCTATTTCTCGTGCTCATGCATTTCAAGAGGGCATGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_17863::LG4:41484128-41486128(-)
AAATATAAAAAAAAATGGAAAGGACGGCACTGTTTCCTACAAATAAAAGCCACTCATTTGTTTTTTCTGAAGAGTATGAAATTGCAAAGATACATAAGAACAAATCTATCAAAGGATTTGATAATATCACTTTCCTTAATATACTTGTTTTTTTTTCTTATATTTAATCTTTTCACATAGTTTAAAAATTAAAATCAAGAATAATTTAAATATATATTTTTAATTGTTTAAAATGATTTTTTAAGAATGAAATTGTAACTGAATTCCAATCTTAAGAATGAAAACGAATTAATGAAAATTAACACAGATTTTAAAATTAAGGTAAAAGGTATTACTTGTAAATAATTATTATAGAAATAAACGAACATATATGTATAAACGAGAGAATAAATTAAATGATTACTCACTTTTTTTTCTTTTGTATGTAGTTATATCTAAAGGGATGTTTTCAGTTTTATTTAATTAAATAATTTCTGGTCATAAATTATTTCTATTCTTTTTTATTATTTTTATTTAATATTTAGTTTTGTTATATGAGAATTTTTAACTCTTAATTGTAATTGTTCAATGAAATAAATCCTGAATTCATCAAGTGACATAAAAGAACTTATCATTTCTTTTTATTGTCTTTAATTTTTAGTTTCTTTATTAATTTGAAGCACATTTGTTTTGTTTAAATAATTCTCGTTATTTTTCAATTAAGTTTGATAATGGGTAAGTTTTCTCATATATCTAAAATATTTTTCTACGTATCATATTTTTAATTGTATATTTTTTATTATTATTCATTATCAAATCATACCATTTAATAATTTTTACTTCTTTTTAATATTTTAATCAGTTGATTATTTTTATCCTATAAAATATTATTTAGATGATTTTTATATAATTCTATATATTATAATTTGTTCTGATGAGAAAAACTTTACTACCACAATTATATAAAAATGTTTCATTTACTATAATAATTGCCATAAATATTTTTTATCAATCTAACATATTATGTCATATGTAGTCGAAAAGATTAAAGATCAATGTTTAAATTAGAATTATTATTAGTTTAATTTTGTTATTTGTATATTATATTATAAAAATTTCATAGTATAGAAAGATATTTTATTAAAATTTAAAGAAAAAAAGTTAAATTTATACAACTATAACATTTTTCTTAATATTTTACATCATGAAAAAATAAATTATGTTTTAATATTGAATATTTTAATAATATTATGATTTTTTTTATAAAAATGATTTAATTTATATTTAGAAGGATAAAAAGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATGAGTATATCCGTTAGAAATATAAAAACATGAATATATATCCGTTATTTAGCGGAGACAACGAGATAAAAATTGTATACATGCTCAATTTTAGAATTAGAATGAATTTTTAGTGCTAGAATGGGATGGAATAATAGAACTATACCCTCTTGCCCATCCTTATTCTTAACCTAAATTCATCGAGTAAATATTTAATACTCTCTAATTATCACGTGCTTATTAAAAAATTAATATTAATATGTTGTTTTTCGTTTGATTAATAAGATAGTTTAAAAAAAATAAAATTAATGATTAAGGTTGCAATTATTTTATCATATATTAAAATTGAAATTAATTATTTATCTATAGAAAGAATGAGAAAAAAAGAAAGAAAAAGTATATTTAAGAGAAAGTGATTTTTATAAGGAAGAAATATAAAGAGCAAAAGGGAAAAAGAAGAAAGTTTAAAGGGACGGTATTGTGTCTCTGATGCCTCATGTTGTTGGTGCTTTTTGCAGGGTTACTTTTTCCCTCGGAGGGTTTTGTAGCTTTTTTTAGTGCAAAGTTTCACCCTTGAAAAGTTCCGTGGAAACAAAAGCTGCTTTTTTTACCATCTTATTTTCTCTCTCTTTCTCTATCTCTCACTCTTTCTTTCTCTGTTCTATCTATATCTATGTATCTTGGAGCTGCTCAGAAG


Gene Sequence:
>Vu_17863(-)
CTTCATACTGTTCTTGTGGAAAAAAAACCATTCAACAACAGTACCATTAATTAATACAGAAGGGGACATGTCTAATAAGGATCCGGGTATTAGGCTCTTTGGCAGGAAGATTCCGTTGCCGGAATCTCAGATTCCGGCCAGTTCTCAGATGGGATATCAGATTCAGGCCAACTCTGCAACCATGGTACTTACTCATGAAGGATGCCCAAAAGCCATTTTTCTTGGACTCATATACTATTTTATTTTGTGGGGTTTTCATTAAAAAAATACCATTCCTTTTTCTATGCCATAACTGCTTACTAGACTTATTTTCTAGCTTTAGAATAGTGTGAAATATAAAGAGTATTTATTCCCAAGAAATTTCCCTTTTAACATTTTGAGAATGTGTATCTGATGCACGTTCAGATTCATGGGAGCAAAGGCTGGTCTCAATCGTTCATTTTGAGTAAACTTTTGGTTGACAATTTGTCCTTATGTTTTCTCGTTTCTACAGGAGTTTGGTGAATTTTGACCAAGGTTGGTGAAGTTGTCTTGTGTGAGTAATTGAGTTTTTAAAGAAAAATATGCCTAACATTTGGTTTTTGTTGTCATGAGAGTGTAGTTTTGTTTCAGATTTCAAATAGGTTCTGCTACATCTCTATGGTGGTTTTCTGTTCTTTAAAAGCAGGTCATACTGCTGAAAGAAATATAACGTTAACTTGTTTCAGCTTTATTGGAGCAATGCCGTTGATTATCCATGAATAAATTCCTTTCCATCTTTAGACAAAAATGTTGATATATGGGATTAATATTTTCTTTGGATTAATGTGGCTTCATTGTACTAGAATCTTTCATTTAGTTACTTATTCATTTTTCCTTATCAGCACTTCTGCAGTTTGCATGAAAAAAAAACCTGGTTCCCTTTTGAAGAACAAAAGTTCGCAACAATCTAGTCCAAAAGTTTCTAGGTGCTCTTTGTGGTCATTTTTCAGTAAATTTATGCAATTGTAGCTGTTTATAAGTTACCAGTTCTAGTATGATTCATTTTCATGAATATGACAGTTTGATGGGAGAGATAAACTGAAGTTGAAGTTGAGACAAATTAGAAACAGGAGATGAACATGGTTTCATGTATGAACCAATATGCTATTCCTTGATAAACTGCTATTTTCTATTACTGAGAAATTGCTGAATTCCAGTTGTTCCTCTTGTGTGGTATTTTATATTTTTCATAGGAAATAAGTATTGATTTTGCTTCTCGTCTATTCTTAATTTTCCCACAACATTGTTCTGCTTAACTTGTCATTGATTAAAGCTTAAATTTCAGAATGCTTACAATGGCTTAAAGAAAAAAGAAGTTGAAATGCCCTGTACTGAAAACTCTGAGCAACTAGAGAATTATTCTGATTCAACGGATAGCAAACAAGAGACCCTATATAATCGGCAGGAAAATGAGTCAAAAGTAAATTCCAAAACAGTGGAAAATAATACAGAGAGTAGCAGTACAGATCAAGATAAAATCTTCAAGAAACCAGACAAAATTCTGCATTGTCCTCGATGCAACAGTTTAGACACCAAATTCTGTTATTTCAATAACTACAATGTGAACCAACCTCGGTATTTCTGCAAGAACTGCCAAAGGTACTGGACTGCAGGTGGAACCATGAGAAATGTTCCAGTGGGTGCGGGGAGACGAAAGAACAAGCACCTAGCTTCTCAATACCGGCACATTATTGTATCTTGTGACGGAATTCCAACTACAAGTGACTCTTCTTGTCACCAACTTGCCACAACACTTCAATCTGCTGCTGTTTTCAGGTCTTCAACAGATAATGGTACTGTGTTGAAATTTTGTCCGGATGCCCCTCCTCTTTGTGAATCCATGGAGTCAATGCTTAATCTTAAAGAACAAAATCGAAGTGCTGATGAAAATACTGTCAATTATGCAGAAAAAGGGGAGGAGGAAGTATCCTTATGTGGATCATCATCTATGACCAATGCTTACACTCCAAGAAACAAATCAACTGAACCAACTGCATCAAAACCTATGCAGTGTTATCCTGTTCCTCCGTGGATATTCCCTTGGAATCCAGATTGGAACAATGTTGCTTCCACTGCATCACTTCACCCCTCTTCACTACAAATGTGTAACCCTTATAACAGTGCCGACCCTGCTTCAATGCAGTGGTGTCCTACACCGATCATGGCAGTTCCAACAATTTGCCCACCAAGCTTTCCCTTGCAATTTGTTCCTGGATCATACTGGAGTGGACCACCTGTGTATGGTGGTGGAACAGGAGCTGCTTCAATGGGTTTCAATGCCTGCCTTTCACCTACTTCCTCTACCAGTAATAGCTGCTGCTCAGGCAACGGCTCCCCAACACTTGGCAAACACACAAGAGACAATCTTTCAACAGATGAAGAAAAATCAGACATGTGTATCTTGGTTCCAACGACCCTTAGAATTGATGATCCAAATGGGGCCTCAAAATTGGCCTCATCAGGAACCAACCCTGAATGTGTACCAGAAGGTACTATTTCAAAAAGGGCAAAGCCTAGAGAAGGCAAAGACCGTGTTTTGGGTGTGTCTCAAATCTTGGAAGCTAACCCTGCAGCTATTTCTCGTGCTCATGCATTTCAAGAGGGCATGTGATGAGTTTCTAACCTCCACTTAATCTTGTGCATATTGCTTGGTTCACAAGCATAAAATTTGTTTTGCAGGTAGCATTTTTGGTTTGTGCAATCCACTTTGTAACTACATATTCTGTTGTTTTAAATTTATTTTTGAATTATGATCTCTGAAATTGTTCATTCTTGGAGATGCTAGCTAGTGCAGCAATAATACAGTGATCCGTGCATCACTCACCATTAAAGGTAGTGT