Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17860 LG4 41425747 41427153 transcription factor MYB52-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 41425842 synonymous_variant p.Gln32Gln
G/A 41426162 missense_variant p.Gly139Glu
T/A 41426241 intron_variant
G/A 41426311 missense_variant p.Arg162Gln
T/A 41426461 missense_variant p.Met212Lys
T/G 41426517 missense_variant p.Phe231Val
T/A 41426634 missense_variant p.Ser270Thr
G/A 41426684 synonymous_variant p.Val286Val
C/T 41426730 intron_variant
G/T 41426749 intron_variant
A/G 41426801 intron_variant
A/C 41427050 missense_variant p.Gln316His
A/T 41427055 missense_variant p.His318Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17860.1
MSNSLHLRNGGSGFSAEMNVFPLASVPVLALQCSNTLGFMGHVGGTETECSDMPFKNLNSSLIQHQEKEEECFGIQNKDLSLRPGEELEAKGSSFTEKIRQTKLCARGHWRPVEDAKLKELVAQLGPQNWNSIAEHLPGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRKAFGEEEEERLLNAHKVYGNKWAMISRLFPGRTDNAVKNHWHVIMARRQREKSCVFRRRKPTFQILPPKDLDLILPVNGGSESTISSTIIDESASTGTNLSFTPSLAKPTPLPFLNHCHVQNLQTFWWFSNGFIWRRQKSTERKSNSSEVSISESVATNDTTNLSISGENENMGNNKANKMIFIDFLGVGAA*


CDS Sequence:
>Vu_17860.1
ATGAGTAACTCACTACACTTGAGGAATGGTGGTAGTGGATTCAGTGCTGAAATGAATGTTTTCCCTTTAGCTTCTGTTCCTGTTCTTGCTCTCCAGTGTTCAAACACTTTGGGGTTCATGGGTCATGTTGGAGGAACAGAAACTGAATGTTCTGACATGCCCTTTAAGAATTTGAACTCCTCACTGATCCAACACCAGGAGAAAGAAGAAGAATGTTTTGGGATTCAGAATAAGGACTTGTCTTTGAGACCTGGTGAAGAACTTGAAGCTAAGGGTTCTTCATTCACAGAGAAAATTAGACAGACCAAGCTTTGTGCAAGAGGACATTGGAGGCCAGTTGAAGATGCCAAACTTAAAGAGCTTGTTGCACAATTGGGACCTCAAAATTGGAACTCCATAGCAGAACATCTTCCTGGAAGATCAGGAAAAAGTTGCAGATTGAGGTGGTTTAATCAGCTAGATCCTAGAATTAACAGAAAGGCTTTCGGTGAGGAAGAAGAGGAGAGACTCTTGAATGCTCACAAAGTGTATGGTAACAAATGGGCCATGATTTCTAGACTCTTCCCTGGTAGGACTGATAATGCAGTGAAGAACCATTGGCATGTGATCATGGCTAGGAGGCAAAGGGAAAAGTCATGTGTCTTCAGAAGGAGAAAACCCACATTTCAGATCCTTCCACCAAAGGATTTGGATTTGATCTTGCCAGTGAATGGAGGCAGTGAATCAACCATTTCCAGCACCATCATTGATGAATCTGCCTCAACAGGAACTAACCTCTCCTTCACACCCTCTCTAGCCAAACCAACTCCTCTGCCTTTCCTAAACCATTGTCATGTTCAGAATCTGCAAACTTTTTGGTGGTTCTCTAATGGGTTTATCTGGAGAAGGCAGAAAAGCACTGAGAGAAAGTCAAACTCATCAGAAGTTTCGATATCTGAGTCAGTTGCCACCAACGACACTACCAATCTCTCAATTTCTGGGGAAAATGAAAACATGGGTAATAACAAGGCCAACAAAATGATATTCATTGACTTTCTTGGAGTAGGAGCTGCGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_17860::LG4:41423747-41425747(+)
TGCTTAGTAGTTTAGTTGTGAGGTGATCGTTCGGTCATCGTTCGGTCAACTCCTTTCTTTTGGATCTATGTGACCGTTCGGTAATTGTAGTTTTGTAAATCGTTCGGTCATGTTTCTTTTATTCGGAACAATTTAAGTTTGTAACTTGTGTAAGGCCGTTCGGCCTAAGCGTTCGTTGTTTTGTGTAAGACTGAACTGATTTATTATTAAATGTAATCAATTCTATTATATGGTTTTATTACTGTATTTTTGGGATGTTATAGATACCACTTATAGGTCTTTTAAGGAAATATTCATCGAAAAAAGTCAATACTGATAAAACACGAATCAAAACCAACGTAAGGTTTGACATTAGTTTTAACCTAAAGTCTTATTAAAATAAGTTTATTATAGTCTTCTTTATTTATTACTCAATTTTCTCGTTTTTATTTATTGTAGAACTTTAATTCATAATTTCAAACTATTTTTCCTTATTTGTATAACTAGGTAGTACTCACACTAACCAAACATGATTTAGTATAAAGAATATTTATAATATTTATTTCAAAGATAAAATGAATAATTAAGAACAATTTTGTGTACTTATTTAAGTAAATAACGACTATCAAAATATTTGTGTAATTTTTAATTATAATAGAAGCTTTTAAATTTTTCTTAAAAAAGAACTAGATATATTTCAAATTGAAATCTATTTATATATATATATATATATATATATATATAATAGTTTAATAAAATTATCTTTTTATAACAGGTAACATATTTATATGAAATTCGTAAAATCCTACAAGATGAAGCCATGATATTATTTTTAGGAATTTAATGATGGAATAAGTTATATTAAATAATTTTTAAATAGTGAATAGTTTATGAATATCATTAGAAAACCTTATTAACTTATTCCAGAGAGCTGATTAATACAAAACTTCACGATTTAAAATAGGTAAAAAATACAAATTAATGTTATATCCAATTAGGTATTTTTTTTCTAGTTTTATTTTAATGACTTACAAATGACACTATGAAATTAAAGGTGTTAAATGCATTAAAATTAAATAAATCCACTATGTATTAAATAATTAATAAATTATTCTTCTCATTCTTAGAAAACATTAAAACATCAAGCGACAAAAATAATAGGTTCTTAGTTAATAACAACGAGATATATTAGTTAATAAATACGAGAAAGTACACACACGAGAAGGTGTTTTTGTTATTATTATTTTACATATATCAAAACAAATTTAATCTCCGTAAAATTTAAAATTTTGTATTTAAAAAAAATCATCTATTTTAATTTGAAAATGAAAATTTTAATTCTGAATCACGTCAGTTAGATTTATAAAAAAATTGAAAATAAAATTTAAATTAACCATAGAGCTAAATAATAAGTAAACAGACAAAAGTATTTTGATTAATTAAAAACTAAAAAAGTATAGAATATTTAACTGGGATTGTAAAAGTAAAAAGTGTTTGGCAAATAATCTCGCGTATCTTTAGTTTTTTCCCAGAGCCCGAGAAGAAAAGCTGGAGAAGGAAAAACACGTGCAAAGCTCAGTGAATCTGACAACCCACACGAGCGGTTCTTGTATTGCATGCACACACACTCACTCATGTTTTGTTTAATGTTTTTTTTTTCCTTAAAAAGCGAGAGAGAAACTGAAACAGTGGACCCACTAATCTCATTTTTCCACAGAAGAAAGAAGAAAAAGGCTGAACTTTCATCAATGGAAAAAAAAAAGAAGTAAGAAAAAATATAATTTATAATTTGCTTGAACTCTTCTTTAAAACCTTGTCCTTTTATTCTGGTTCCTGTGTCTTCATTCTGAACACCATTTGTCTCTTCTTTCACTCTCTCTTCTGTGACTCATCAATGGCTGGCCCAGGAGAGGGAATTCACAGTGGCCATGAATGAATATCTTTTTTTTTTTTTTTTTATCTCAGTGAGTTTCTTTTCTCACCCATCTAGCGTTTTTTCTTTTCTGCATATTCAGTTTCAA


Gene Sequence:
>Vu_17860(+)
ATGAGTAACTCACTACACTTGAGGAATGGTGGTAGTGGATTCAGTGCTGAAATGAATGTTTTCCCTTTAGCTTCTGTTCCTGTTCTTGCTCTCCAGTGTTCAAACACTTTGGGGTTCATGGGTCATGTTGGAGGAACAGAAACTGAATGTTCTGACATGCCCTTTAAGAATTTGAACTCCTCACTGATCCAACACCAGGAGAAAGAAGAAGAATGTTTTGGGATTCAGAATAAGGACTTGTCTTTGAGACCTGGTGAAGAACTTGAAGCTAAGGGTTCTTCATTCACAGAGAAAATTAGACAGACCAAGCTTTGTGCAAGAGGACATTGGAGGCCAGTTGAAGATGCCAAACTTAAAGAGCTTGTTGCACAATTGGGACCTCAAAATTGGAACTCCATAGCAGAACATCTTCCTGGAAGATCAGGTAAATGACAGTTTTCCTTTTTAGTGGACTGCTATGTTTTGTGATAACAGATTTTTTGTGCTGAATGGGTTATTGCAGGAAAAAGTTGCAGATTGAGGTGGTTTAATCAGCTAGATCCTAGAATTAACAGAAAGGCTTTCGGTGAGGAAGAAGAGGAGAGACTCTTGAATGCTCACAAAGTGTATGGTAACAAATGGGCCATGATTTCTAGACTCTTCCCTGGTAGGACTGATAATGCAGTGAAGAACCATTGGCATGTGATCATGGCTAGGAGGCAAAGGGAAAAGTCATGTGTCTTCAGAAGGAGAAAACCCACATTTCAGATCCTTCCACCAAAGGATTTGGATTTGATCTTGCCAGTGAATGGAGGCAGTGAATCAACCATTTCCAGCACCATCATTGATGAATCTGCCTCAACAGGAACTAACCTCTCCTTCACACCCTCTCTAGCCAAACCAACTCCTCTGCCTTTCCTAAACCATTGTCATGTTCAGAATCTGCAAACTTTTTGGTGGTTCTCTAATGGGTATGATTTGCTCTTCCATGTAAACATTACAAACCATGGAAGACTTTAAATTGTATTATTAGGTGATATAAATTGTATGACTCTAATTGACAAATATTGAGAGCACTGTATAAGTTTGTCCATGAATTCAATGATTTTCTTGTTCTTGTTTAGTATAACATGTTTAATTTATGTTGCAGGTTTATCTGGAGAAGGCAGAAAAGCACTGAGAGAAGTGAGTTTTGGCATGTATTTTGGTGGTTGGAGGGATTCATTTCAGGTTGGACACATGGAAAGGCTAATGCGTGTGGATCAATCTAATTATTCAGAGTCAAACTCATCAGAAGTTTCGATATCTGAGTCAGTTGCCACCAACGACACTACCAATCTCTCAATTTCTGGGGAAAATGAAAACATGGGTAATAACAAGGCCAACAAAATGATATTCATTGACTTTCTTGGAGTAGGAGCTGCGTAA