Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17802 LG4 40501886 40502903 probable serine/threonine-protein kinase PBL8
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 40502033 upstream_gene_variant
T/C 40502160 upstream_gene_variant
G/A 40502162 upstream_gene_variant
A/G 40502201 upstream_gene_variant
G/A 40502219 upstream_gene_variant
A/G 40502228 upstream_gene_variant
A/G,* 40502236 upstream_gene_variant
G/T 40502255 upstream_gene_variant
T/A 40502273 upstream_gene_variant
G/A 40502315 missense_variant&splice_region_variant p.Ala11Thr
G/A 40502347 synonymous_variant p.Gln21Gln
A/G 40502360 missense_variant p.Lys26Glu
T/A 40502542 missense_variant p.Leu64Ile
A/T 40502698 upstream_gene_variant
T/A 40502699 upstream_gene_variant
C/T 40502748 stop_gained p.Gln92*
G/A 40502781 missense_variant p.Glu103Lys
A/G 40502782 missense_variant p.Glu103Gly
C/T 40502786 synonymous_variant p.Tyr104Tyr
G/T 40502799 missense_variant p.Asp109Tyr
G/A 40502820 missense_variant p.Glu116Lys
A/T 40502826 missense_variant p.Met118Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17802.1
MCLHLFGIRLQQLHHAASLGASARSQNAGSEKKHGHGHGHRHNLSECASDLSEACSTPRGFDTVYKGYIDENVRVGLKSLPVAVKTEVNFLGQLRHPNLVKLIEYCCEDDHRLLVYEFMFRGSLENLGYVWMDFLTSISKEIK*


CDS Sequence:
>Vu_17802.1
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Promoter Sequence:
>Vu_17802::LG4:40499886-40501886(+)
ACAAGGAAGCTCTTTCCACACAAAATGAACAATTAAGCCACGGTTTGGATCTCGTCACATGTCTCACAATCCACACTCATGGTGATTCCTTGTAAAACATCAAATAAAAAAATTTTAGAGATAATTCACTTTTAAAAAAAAAGTGTTTTTATAATAAAATATGTTTTTTGATTATAGAACTTTATTTAGAAAAATTGAAATCATAAAAATTTAGAAAAGTAAATTTATTAATTAAAATCATATAATTTCAAATTTCTCATAAAAAAAATAAGAATGTGATATTTTTCATACGATTGCATATTCTCTTTGGTTTAACCTACTTGATATATCATCATTTTGACTTTGGTTGAGATGTAATTGATTTGATAATGATTAATGAATGTTTCTTTTGGATTTAAATTTTCATGAGTATTTATCAATCGTTAACTACAAAATTAGTGTTATTTTTCAACCCACAATAGTTAGGATTTGTTTTACAACATCAATAATGTTTTTCATATGTTAAACAATTGTTTCAATTTAAATCAATGCATATTATTTTCAGTTAATTTCAATGGAGGTTGTTTCTTTTTTATTACTAACGTGAATCAAAATATAGGTTATGATGATTTTTTGACTAATATGGACAAGACTATTTTTCATTTAATATCATTTCAGATTATTTATCAATGTCAATAAAACTATTTTTCATATTTTTAAGTCAACGTTTTTTCATTTGACATAAACTATTTTCTATTTGACATTATTACAATTATTTATCCTTCAATATTAAGTCAAATCTATTTCTCATTTGATTTGATGTAGGCCAAAGTGTTTTCAACTAATGTTAGGGTATACTATTTTTTGATTGATGTCAATCAACATTTTTCAATTAAAATCTATTATGATTAATTTTTATTGTTGATATCTAAAGGGTGAAGTAATAATTGAAATATTTTATTTAAATAAAAAAGTTAAAATTAAAATTAAAAATATTGAGGTACTTTATTCAAACAATTTTAAAAAAAAATTAAAATGAAAATAATTCAAATTCAATATATTTAATTTTTTTTTTTAAATTACAAAAAGATTTCTACTTAAACATTATGTTGAATTTTATGTGATTGTGCAATTTTGGAAAGTTCTAATTATAATATTAGAATTATGTTGATAGGATGAGTTTGTACATTGATAAGGGTATATGATTTATATGATCCTTGGATGTGATGGGTATTTTTGTCTAAATGTAAATTGTGTAATATATTATGATAATATGTTTGAGTATTCAATGATTGGCCAAAGATTAAATTTTTTTAATTAAATTGATATGAAATCTTTCAATTATGTTTAAAAAAAGTATTTCTAGTTAAAAAGAAATTTATGTTAATTTAATTAGAAATCACATTGAATTATGTTTGCTAAAGTGATGAAAAGATTACTTGAGCAAGTTTGAAGTGATGATATTTAATTTTATAACAAGATATTATTGTTTAAGTTTCTATTTAGTTACTTAAGGAATAGAGTTTCACACACTGAAGCCATAATTTATAGTTTAGATCTAAACCAAGAAGAAGTAGAATCAATTCTTCCTTCTTAAAGAATAATGCTCAAGTAAATATATATCACTGAAGTGTTGTTTCACAACTTGAGTGAGAGACTTAGTATGAATATCTAATGCAATGATGGGTCATCCAACAGGAAAATAAAACATCTAATAACAGTAGAAAGTCTAACGTGAAGTCCAAAATCGTATATTGCATAATAATCATCATAAATTAAGTATAAAATAGGGTTAGTTAACAATCCATAAAGGTTTAGTCTTCCATGAAAAACAAGAAAAAGAACTATAAAAAGAGAAAATAGAAAAGTGTAATTTGTGTGTATGGTTGAGTTGTCAATGGTGGTATCAATGTTGTGTAGGGAGGTGTATCCTTTCTCTTAAACTCTTTTTATGTAGCCTTTAGAGAATTATCTTTGCAGCTCTAAATCACTTGATTATGCAAAATCTTCATTATCATGCA


Gene Sequence:
>Vu_17802(+)
ATGTGTCTTCATCTTTTTGGCATAAGACGTTTTATAAGGAAGATTTTGACATAATATTCAAAACACATTTTCTTATTTGGTTTAATACCCAATTTTGTCCCCAGTTTGGTTCGGAAATCTCAATTTAGTCCTTTTATATAAAAGTAATTGTAATGGATCCTTACTTGTAATTATGTGAGTCAAATTAGTCCCTTCTGTTAAATATAGGCAAACGGAGTTAATGGACTGATGATGTGGCAGTAGTCACTGATTAGGTGTCAACACGTAATTGAGATTGTGCTTACGTGGTGTTAGGGCACCTGATTTTAAAATTGGATTTTAATTAGAAATTGGGGATAAAATAATTTGGGAGTGATTTGTTGCAGATCAGGGCATTTTATTTGAGATTGTGCTCACACACATTGTTTGTATTTTGGTTGCTTCAGTTCAGCAGCTTCACCATGCGGCGTCCTTGGGCGCCAGTGCGAGGAGTCAAAATGCCGGTAGCGAGAAGAAGCACGGTCACGGTCACGGTCACAGACACAATCTGAGTGAGTGCGCTTCGGATCTGAGCGAAGCTTGTTCGACACCGCGAGGTAACAATAGCAACAACACGCACGTGATATCGTTCACGTGATATTGTTCTACATCCTCGGCGAGGGAGGGTTCGACACCGTTTACAAAGGCTACATTGATGAGAACGTCAGAGTGGGACTCAAATCGCTTCCTGTGGCGGTTAAGGTTCTGAACAAGGAAGGATTACAAGGACATCGAGAGTGGCTTATGCGTTTTGCTTTTGCATCTTCTTTTTTACTTACTTGATTAATTTGTTTATTTAATTTTGTGATTTGTGTGTGTGCAGACGGAGGTGAATTTTCTAGGGCAGCTAAGGCATCCTAATCTGGTGAAGTTGATTGAGTACTGTTGTGAAGATGATCATAGGCTGCTTGTGTACGAGTTCATGTTCCGAGGGAGTTTGGAAAATTTGGGTTATGTTTGGATGGATTTCTTAACTAGCATTTCAAAAGAAATAAAATAG