Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17671 LG4 38806620 38810432 PREDICTED: PI-PLC X domain-containing protein At5g67130-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 38806662 splice_region_variant&intron_variant
A/C 38806741 splice_donor_variant&intron_variant
A/T 38806744 stop_gained&splice_region_variant p.Cys676*
T/C 38806777 synonymous_variant p.Lys665Lys
C/T 38806864 intron_variant
A/T 38806926 splice_region_variant&intron_variant
G/T 38807362 missense_variant p.Pro536Thr
T/G,C 38807576 intron_variant
T/C 38807618 intron_variant
A/C 38807653 intron_variant
G/A 38807754 missense_variant p.Ala451Val
T/A 38807798 intron_variant
A/C 38808062 intron_variant
T/G 38808139 intron_variant
A/T 38808145 intron_variant
T/C 38808231 intron_variant
G/A 38808260 intron_variant
T/A 38808296 intron_variant
G/T 38808349 intron_variant
T/A,C 38808352 intron_variant
A/T 38808384 intron_variant
G/A 38808455 missense_variant p.Ser381Phe
G/T 38810393 missense_variant p.Gln14Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17671.1
MAPFCSLPFFTTTQSKTTSECNPIEQLCHRFSLAELQAATNGFMPSLIVNGEGQCQVYKAHLKGHGDVAIKHFKTRSPDRDIEFRVEVKILCQLHHPNVVPLVGFCDHKHDKFVVYDYVSNGSLHDCLHGTNNNSVVPLSWIQRLNICIGVARGLHYIYFETKIPIIHRAVKSSNVLLDHNLVPKVADFGLCKKHPQEESRPKPPRVELRENLEVSLEYMEPEYFMTGRLSNKSDVYSFGVVMLEILCRKKACFLTPGGECEYLAKWAFDDERKGVLEKIVDPSLIGKIAPACWKVFIEIVQRCLASVEERPTMGEVTPNFVTEQMGSLPSFLLVIILPLCYCVDAACSNGKCKLNDECSSNGDCGTGLYCFSCPRGFSGSRCVRSSVTDQFKLINNSLPFNKYAFLTTHNSFAIDGEPSNRRVHRVTIINQEDSVTQQLKNGVRGLMLDAYDFDGDVWLCHSFGGHCNDFTAFEPAIDTLKEVAAFLSANPEEIVTLILEDYVKTPKGLTRVFTEAGLMKFWFPVTRMPKKGDWPLVSDMVAKNQRLIVFTSRKSKEQSEGIAYQWNYMVENQYGDGGRKAGSCPNRKESSPLDDMSKSLVLINYFRTIPLKPITCKDNSGGLVDMLKTCHGAAGNRWANYVAVDYYKRSEGGGSFKALDKLNGKLLCGCDDVHACGSTSQACSAQKA*


CDS Sequence:
>Vu_17671.1
ATGGCTCCTTTTTGCTCTCTTCCATTTTTCACCACCACACAATCCAAAACCACGAGCGAATGTAATCCAATAGAACAGCTCTGTCACCGCTTCTCTCTTGCTGAGCTTCAAGCAGCCACAAATGGGTTCATGCCGAGTTTAATTGTCAATGGAGAAGGTCAATGTCAGGTCTACAAAGCCCACCTCAAAGGCCATGGAGACGTAGCCATCAAGCACTTCAAGACTAGAAGCCCAGATCGTGATATAGAATTCAGGGTCGAAGTCAAGATTCTGTGTCAACTACACCACCCAAATGTTGTTCCTTTGGTTGGTTTCTGTGATCACAAACATGACAAGTTTGTTGTGTATGATTATGTCTCCAATGGAAGCCTCCATGATTGTTTGCATGGCACCAACAATAACAGTGTTGTTCCCTTGTCATGGATACAAAGACTTAACATCTGCATCGGGGTGGCTCGTGGACTGCACTACATTTACTTCGAAACCAAGATACCTATCATACACCGTGCTGTGAAATCAAGCAACGTTCTTTTGGACCATAATTTGGTGCCTAAAGTGGCAGATTTTGGACTTTGCAAGAAGCACCCACAAGAGGAGTCAAGGCCAAAGCCACCAAGAGTTGAGTTGAGGGAGAACTTGGAGGTTAGTTTGGAATACATGGAGCCGGAGTATTTTATGACTGGAAGGTTATCAAACAAATCAGATGTGTACTCTTTTGGGGTGGTAATGTTAGAGATTTTGTGTAGGAAGAAAGCTTGTTTTTTAACCCCAGGTGGAGAATGTGAGTACCTTGCTAAGTGGGCCTTTGATGATGAAAGGAAGGGGGTTCTTGAGAAGATTGTTGACCCATCTCTCATTGGAAAAATAGCACCTGCTTGTTGGAAAGTGTTCATTGAGATTGTTCAGAGATGTTTGGCATCAGTTGAAGAGAGGCCAACGATGGGTGAAGTGACACCCAACTTTGTCACAGAACAAATGGGTTCTCTTCCGAGCTTTCTTTTGGTAATTATTCTTCCCTTGTGTTATTGTGTTGATGCTGCTTGCTCCAATGGAAAATGCAAGCTAAATGATGAGTGCTCGTCCAATGGTGATTGTGGAACCGGACTCTATTGTTTCTCATGTCCACGTGGGTTTTCAGGCTCTAGGTGTGTGAGATCTTCTGTCACAGATCAATTCAAGCTCATAAATAATTCTCTTCCATTCAACAAGTATGCCTTTTTGACAACGCACAATTCTTTTGCTATTGATGGAGAACCATCTAACAGAAGAGTACATCGAGTCACCATCATTAATCAAGAAGACAGTGTAACCCAGCAGCTAAAAAATGGAGTTCGGGGACTAATGCTAGATGCGTATGATTTTGATGGAGATGTGTGGTTATGTCATTCATTTGGAGGCCACTGCAATGACTTCACAGCTTTTGAACCAGCTATAGATACACTTAAGGAAGTTGCAGCTTTTCTATCTGCCAACCCAGAGGAAATTGTCACACTCATACTGGAGGATTATGTTAAAACACCCAAAGGATTGACAAGAGTCTTCACCGAAGCTGGTTTGATGAAGTTTTGGTTTCCTGTGACAAGAATGCCAAAAAAAGGAGACTGGCCTCTTGTGAGTGATATGGTTGCTAAAAATCAAAGGCTAATTGTGTTCACTTCAAGAAAATCTAAAGAACAAAGTGAAGGCATTGCATACCAGTGGAATTACATGGTTGAAAATCAGTATGGAGATGGAGGAAGAAAAGCGGGAAGTTGTCCAAATAGAAAAGAATCTTCTCCTCTTGATGACATGAGCAAGTCCTTAGTGTTGATAAACTATTTTCGTACTATTCCACTTAAGCCAATCACATGTAAAGATAACTCTGGAGGTCTCGTTGACATGCTCAAAACCTGTCATGGTGCTGCTGGCAACAGGTGGGCTAATTATGTTGCTGTTGACTATTACAAGAGAAGTGAAGGAGGAGGATCCTTTAAAGCTTTGGATAAACTCAATGGGAAACTCTTGTGTGGTTGTGATGATGTCCATGCCTGTGGATCTACTTCACAAGCTTGCTCAGCCCAGAAAGCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_17671::LG4:38810432-38812432(-)
GTAGTGGCTGTTCTAGGTCACGTTGGATCTGTGCGTGGAGGGTTTCTGCGATTAGGTATTCGCGACTCTGGGTTCTTTCGCGTGGTGTGATTTGCTGTGTTTGGTGGTTCTTTCATAACACGAAGGAGCTCGCAAAAACGGCGCTGCTCAAGGGGTTGATGGTGGTGGCACGATTTCGAATACCCAAACCCTAACTCAGAATTTTTAATCACTGCCACTTTCACGTCAACTGCCACATTATGAAGGTAAACAGTCACGTTGCACAGATTACTCCATGCTGTCAGCTGGATCGTTAAATATTTAACGCCGTGACCAAAAAGAATTTAATTGGACATTTTTTTCACAACTTGGGACCACATTAAACTTTTTAAAAAAGGTAGGACGAACTTGAACATTTCGCTTATAAAGAGGGACAAAAAGAGGTATTAAGCCTAATAATAATAATAATAATAATTTTATCAATAAAATATATATAAATAGTAGGACAATTTGGGTGTCCTAACCCAAATACAACAATTTTACATAATTCTTCTATACATAATATTCTATTAATATTCCAAACAACTTTAGATTACAATAATTATAATATGGTCTTGCCATTTTTATGTTAAAAAAAAATATATTTAGATTAGAAACAACAATACATAATCGACCAAATCATCATAATACATGTTCAAACAATAAAAGTCAAATACATCTAAATACGTTGACCAAAATATCCTCGAACATACACCTTATATTTGAGATAATAATAATATTGAAAGTAGTTATAATGGAACTGCAATCGTAGACAATAATTACATCTTAACGCTAATTCTAATGACAATCTAATTATAATGACAATTGTTAAATTGTTAAGATAAGGTGATATGATTATAATGATGACAGAAGATGATGATGATAATGATAAGATTGATTTGAAAACGTGGAAATATAGTGGGAAATTTTTTGGAAACAAGTGGCTGCGGTTGTTGTAATAACCGTGTGGAGGTGGTGATTGCGGTTCCTACCATAACAATAATAATGGAAGCTTAAAAAATCTGATACAAGTGACGATAAAAACAACAATAATTTTAACAAGAGTAGTGATAACACCAATAAAAATAATGATGATAATGATGGAGGAACTAAGATAAAAAGAGAGTTAATTATCCTACTTTATCCTTAACATAAGAAATTTCTTTTTGAAAAAAAAAATCATGTCAATACACATAGTAATTAATTTTAGCTGACTTTAATAATGCAGTTATTTTCAGTTTCAAAGTCTATGCCTTCTGCTTCAAAGTCCATATCTTTTGTAATTCTTTTATTTTTAAAATATATTTTGGAGGATTGAAAGATATAAATGTATTTAAATTATTATTTAGTGTATTGAAATAAGTCTTCAATCGAAACTTAAGAGAGGGAAAGTTAATTTTAAAACTTTTTTTTCCATGTCATTAGGATAAATTACTTAATTTGAAGTATTATTTACTTTAAAATTTTGAATTCACGGTCTCGAAAGTTTTTTTTTTCAAAAATCAAAATAATGGGATAAAAAAACACATACTTAAGTTATAATTAAAGAATAATAATACTTTTGACACAATTTTTTATTTTCACACTAAAATGATACTTTGTGGATTCTATTAATAGTTTTATTCAACTAGTCATATTAAACCATTTTATAAATAAATGATATGACACATGTCAAATGAATATATTTGATATACAGGCGTGTCAAGATACTCATTCTCGTACTTAAAAGGTTCAATGTTACTTTGGGATCAGTGTACATTTCCACAAGACTTGACTTTGTGCGTGATAATTCTTCCAATGGCAGATGACAAATTGCAGCAATCAATGGCAATCACATTCAAGATCACATGTTTTCAAGTCAAGCCCACAAATTTGACCATAGTTTGAATCAATCCATCCATTCATAGCAGCGAGAACCATGCATCTTGTAAGTAGCATTCAGTTATATATTCTTCAGACGCAGGATTCCATTCCACCCAAAA


Gene Sequence:
>Vu_17671(-)
ATGGCTCCTTTTTGCTCTCTTCCATTTTTCACCACCACACAATCCAAAACCACGAGCGAATGTAATCCAATAGAACAGCTCTGTCACCGCTTCTCTCTTGCTGAGCTTCAAGCAGCCACAAATGGGTTCATGCCGAGTTTAATTGTCAATGGAGAAGGTCAATGTCAGGTCTACAAAGCCCACCTCAAAGGCCATGGAGACGTAGCCATCAAGCACTTCAAGACTAGAAGCCCAGATCGTGATATAGAATTCAGGGTCGAAGTCAAGATTCTGTGTCAACTACACCACCCAAATGTTGTTCCTTTGGTTGGTTTCTGTGATCACAAACATGACAAGTTTGTTGTGTATGATTATGTCTCCAATGGAAGCCTCCATGATTGTTTGCATGGCACCAACAATAACAGTGTTGTTCCCTTGTCATGGATACAAAGACTTAACATCTGCATCGGGGTGGCTCGTGGACTGCACTACATTTACTTCGAAACCAAGATACCTATCATACACCGTGCTGTGAAATCAAGCAACGTTCTTTTGGACCATAATTTGGTGCCTAAAGTGGCAGATTTTGGACTTTGCAAGAAGCACCCACAAGAGGAGTCAAGGCCAAAGCCACCAAGAGTTGAGTTGAGGGAGAACTTGGAGGTTAGTTTGGAATACATGGAGCCGGAGTATTTTATGACTGGAAGGTTATCAAACAAATCAGATGTGTACTCTTTTGGGGTGGTAATGTTAGAGATTTTGTGTAGGAAGAAAGCTTGTTTTTTAACCCCAGGTGGAGAATGTGAGTACCTTGCTAAGTGGGCCTTTGATGATGAAAGGAAGGGGGTTCTTGAGAAGATTGTTGACCCATCTCTCATTGGAAAAATAGCACCTGCTTGTTGGAAAGTGTTCATTGAGATTGTTCAGAGATGTTTGGCATCAGTTGAAGAGAGGCCAACGATGGGTGAAGTGGTAGTGATTCTTGAAAATGCATTTTTGTTGCAAGAGAGAGCAGATGTGTGAAGGAGTGTGATGAGCCTAGAACTGAGACACAAATGACAAAAGCTGAGTGGCAATGGCATTAAGAAGAGAATACGGTTATTGTTGTATTTTTCATGTTTCTTTTCAATTTTTGTAATATTGGTTTGGCAATGGCAATGGCATTTGGAAGATGAAAAACTCTAAAATTAACTCTCTATTTTAATAGTGGTTACCTCCTTTGTCTCTTGTTAATATTAGTCCATACGAGCCTTTAGCGAAAGTTGTCTTGAAAACAACACTATGCATGTACATTTTACTTATGAGCGTATTTGATTTAAAAGGATAATCTTTCCTGCGTTTTTGTTTGTAACTTACATGTACAGGAAAAAGCTATATATTTTGTTCTACCGTAGTAGCATCAACAACAGTTGTTGAACCAGAATCTTGTATTGTCAACACCAAGATCTAGCACTCAAATAAAAATCCAAAACAACCCTTCAACTGTTGGTGTTGCTTTCTAAAAGTAGAAGATAACTATGAAAAGATGGGGACACTTTCAGATTAGTGAAATACTAAGTTGTCTTTATTTCCAATAATTAATGCAGCATAAATACATAACCTCTTACACTTCAGTTGTTCATAAGAATTGAGAAAGCCATGAGTCGCTTCCCTCTTTTCATTTTTAACATATATTAGATCATTTGTGATTATCTTTTCGTTATCACTTCCTTTTAGACACCCAACTTTGTCACAGAACAAATGGGTTCTCTTCCGAGCTTTCTTTTGGTAATTATTCTTCCCTTGTGTTATTGTGTTGATGCTGCTTGCTCCAATGGAAAATGCAAGGTTTGTATAGCCTACCACCTATTGTTTGAATCATGCCTTTAACTTTTCAGTTTCAAAATTAGTATTATATTTGTTTTTCAATCTTTGATCAGCTAAATGATGAGTGCTCGTCCAATGGTGATTGTGGAACCGGACTCTATTGTTTCTCATGTCCACGTGGGTTTTCAGGCTCTAGGTGTGTGAGATCTTCTGTCACAGATCAATTCAAGCTCATAGTAAGATTCTCATTTCTCCTTGGTCTTTGCCTTATTTCTCAAGAAACTGTCACAACACAAGCCTAGAGATTTTTGAAATGCCATCATCGAGCGACATAATATAAAGTACTTGAACACTTGGCAGGGTTTTGGTTCTGGTGATGTATAGAAACTAGTTCCATCATTTTACATGAACTGAATATTAACTGCTATTGTTTGAAAAAATCAGGAAAATTTTTCAAGACTTTGTATTATTATATTTATTTTTGGATACCAAAAGAGAAATATAAGTTATAATATGAGATATGTACAGTGTCTTTAGACAGAAAAGGAAATTTAGGACTGTTTCTTCTTAATCAAATTTTTAACTTCTGTTTTTTTCTTCTTTTGGTATAGAATAATTCTCTTCCATTCAACAAGTATGCCTTTTTGACAACGCACAATTCTTTTGCTATTGATGGAGAACCATCTAACAGAAGAGTACATCGAGTCACCATCATTAATCAAGAAGACAGTGTAACCCAGCAGCTAAAAGTATGTTACTCGTTACTACTAGCCTTATCTTCTATTAACTTTTATGATGTTCTGTTTCACTACTTCCCAGGATGTTTAAGGGTCACTATTTTCTGCCATCAATGTTTCATCTGTAGAATGGAGTTCGGGGACTAATGCTAGATGCGTATGATTTTGATGGAGATGTGTGGTTATGTCATTCATTTGGAGGCCACTGCAATGACTTCACAGCTTTTGTATGTAAAATTCATCTTCCCAGTAGTGTTTTTTTTGGCCTAGGATTTTCCTAACTCTTTTCTCTACAAAAATACAAACATTTATGACTAACACTAATTCAGCTACAAAAAGATCCTAACTTTGTATTCTACAAGTAGGAACCAGCTATAGATACACTTAAGGAAGTTGCAGCTTTTCTATCTGCCAACCCAGAGGAAATTGTCACACTCATACTGGAGGATTATGTTAAAACACCCAAAGGATTGACAAGAGTCTTCACCGAAGCTGGTTTGATGAAGTTTTGGTTTCCTGTGACAAGAATGCCAAAAAAAGGAGACTGGCCTCTTGTGAGTGATATGGTTGCTAAAAATCAAAGGCTAATTGTGTTCACTTCAAGAAAATCTAAAGAACAAAGTGAAGGCATTGCATACCAGTGGAATTACATGGTTGAAAATCAGTGTAAGATATCACCAACCATTAAATCTTTCGTGTTCTTCACGCGGAGTACATTTTTATTCCATTTTGGTGTGATCTTAATTTCCGCAGATGGAGATGGAGGAAGAAAAGCGGGAAGTTGTCCAAATAGAAAAGAATCTTCTCCTCTTGATGACATGAGCAAGTCCTTAGTGTTGATAAACTATTTTCGTACTATTCCACTTAAGCCAATCACATGTAAAGATAACTCTGGAGGTCTCGTTGACATGCTCAAAACCTGTCATGGTGCTGCTGGCAACAGGTGGGCTAATTATGTTGCTGTTGACTATTACAAGGTAGAACTTTGGCACGTTTTCTCTTTTGCTACTAATTTTGTTGCTGAAGCATAAGCCTTTGACTCATTCGTTCTAATATTAGCTATGTTTGAGGATCATTGTGCAGAGAAGTGAAGGAGGAGGATCCTTTAAAGCTTTGGATAAACTCAATGGGAAACTCTTGTGTGGTTGTGATGATGTCCATGCCTGTGGTGAGGAAATTTTCACACTTTCTTTCTTGAACACAAAGTTAGTAAATAACTCATTGGATTTTGATTCTTTTTCATTTTCAGCCAGGATCTACTTCACAAGCTTGCTCAGCCCAGAAAGCATAG