Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17630 LG4 38292929 38296333 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 38293059 missense_variant p.Leu44His
G/A 38293062 missense_variant p.Arg45His
C/T 38293232 missense_variant p.His102Tyr
A/G 38293241 missense_variant p.Lys105Glu
T/A 38293250 missense_variant p.Ser108Thr
G/A 38293269 missense_variant p.Gly114Glu
T/C 38293678 synonymous_variant p.Val250Val
T/A 38293796 missense_variant p.Leu290Met
C/G 38293823 missense_variant p.Arg299Gly
A/G 38293832 missense_variant p.Ser302Gly
G/A 38293841 missense_variant p.Gly305Arg
G/T 38293873 synonymous_variant p.Val315Val
G/A 38293904 missense_variant p.Gly326Arg
T/A 38293948 synonymous_variant p.Ser340Ser
A/C 38294086 synonymous_variant p.Pro386Pro
T/C 38294257 synonymous_variant p.Ser443Ser
G/A 38294356 synonymous_variant p.Glu476Glu
G/A 38294461 synonymous_variant p.Gly511Gly
T/G 38294491 missense_variant p.Phe521Leu
G/T 38294541 missense_variant p.Arg538Met
G/C 38294592 missense_variant p.Ser555Thr
G/A 38294995 missense_variant p.Met689Ile
T/C 38295052 synonymous_variant p.Gly708Gly
C/G 38295321 missense_variant p.Ser798Cys
G/T 38295329 missense_variant p.Ala801Ser
T/C 38295335 missense_variant p.Phe803Leu
T/G 38295340 synonymous_variant p.Ser804Ser
T/A 38295343 synonymous_variant p.Val805Val
C/T 38295445 synonymous_variant p.Ile839Ile
C/G 38295448 synonymous_variant p.Gly840Gly
G/A 38295454 synonymous_variant p.Pro842Pro
G/A 38295780 downstream_gene_variant
A/G 38295889 downstream_gene_variant
T/C,G 38296174 stop_lost p.Ter964Argext*?

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17630.1
MFSSSSHCSSVIKWSSLVKFLFFVVLFLSPSDAVLGDSDESALLRLKASFSDPAGVLSTWTSAAGADSGYCSWSGVLCNANSRVVAVNVTGNGGNRRNGTSHPCKGFSQFPLYGFGVRRTCEGSKGSLFGNVSSFNFISVLTELRVLSLPYNALEGEIPEAIWGLEKLEVLDLEGNLISGYLPFRIKGLRKLRVLNLGFNRIVGEIPGSISSLESLEVLNLAGNGLNGSVPGFVGRLRGVYLSFNQFSGVVPREIGENCWKLEHLDLSGNSLVQGIPVSLGNCERLRTLLLYSNLLEERIPSELGKLKSLEVLDVSRNTLSGSVPGELGNCSELSVLVLSNLFDPRGDVAGDFGKLGSVNDELNYFEGSMPVEVLSLPKLKILWAPMVNLEGSFQVSWGRCQSLEMVNLAQNFFSGEFPNQLGVCERLHFLDLSGNNLTGVLSKELRVPCMSTFDVSGNMLSGSIPDFSDIVCPPEPSWNGNLFEDGNISPPYAFFFLSKVWENSLFTAMGGVGISVAHNFGRNNFNGILSLPVARDRLGKQSSYTFLVGENNLSEPFPTYLFEKCHGLDALLLNVSYNRISGHIPSSLSGMCRSLKFLDASGNQLAGRIPVDLGNMVSLASLNLSKNQLEGEIPTNLGQIKNLKFLSLAGNKLNGSIPTSLGQLYSLEILDLSSNYLTGEIPKAIENMRNLTDVLLNNNNLSGHIPGGLAYVTTLSAFNVSFNNLSGSLPSNSGLIKCSSAVGNPFLSPCRGVSLSVPSGSQLAPIDGSPYNPATEQATGKDSGNGLSSIEIASITSASAIFSVLIALIVLFFYTRKWKPGSRVVGSTRKEVTVFTDIGVPLTFESVVQATGNFNAGNCIGSGGFGATYKAEVAPGVLVAVKRLAVGRFQGVQQFHAETKTLGRLHHPNLVTLIGYHACETEMFLIYNYLPDKKALDPSFSSFGNGFNIVAWACMLLKQGRANEFFTAGLWEAGPGEDLVEVLHLAIVCTVDSLSTRPTMKQVVRRLKQLQPPSF*


CDS Sequence:
>Vu_17630.1
ATGTTTTCTTCTTCTTCTCATTGCAGTTCAGTGATCAAATGGAGTTCCCTAGTGAAGTTTCTCTTCTTTGTGGTTCTGTTCTTGTCGCCAAGCGACGCAGTATTGGGGGATTCGGACGAATCTGCTCTCCTTCGTCTGAAGGCATCGTTTTCCGACCCCGCCGGCGTTCTCTCCACATGGACCTCCGCAGCCGGCGCTGACTCTGGCTACTGCTCTTGGTCTGGTGTCCTCTGCAACGCGAACTCCCGGGTGGTCGCCGTCAACGTCACCGGAAACGGCGGCAACCGCCGCAACGGAACCTCTCACCCGTGCAAAGGTTTCTCTCAATTCCCTCTTTACGGATTCGGAGTTCGGCGAACGTGCGAAGGTAGTAAAGGTTCTCTCTTTGGAAACGTTTCTTCTTTTAATTTCATCAGTGTGCTCACGGAGCTTAGGGTTTTGTCTCTCCCCTACAACGCGTTGGAGGGGGAAATTCCCGAAGCAATTTGGGGCTTGGAAAAGCTAGAGGTTCTCGATTTAGAAGGGAATCTAATAAGTGGATATCTTCCGTTTAGAATTAAAGGCTTGAGGAAGTTGAGGGTTTTGAATCTTGGGTTTAATAGGATTGTGGGGGAGATTCCTGGTTCAATTTCGTCTCTTGAGAGTTTGGAGGTTTTGAATTTGGCTGGTAATGGATTGAATGGTTCTGTGCCTGGTTTTGTTGGGAGGCTTAGAGGGGTGTATCTTTCGTTTAATCAGTTCAGTGGGGTTGTTCCGCGAGAGATTGGGGAGAATTGTTGGAAGCTTGAGCATTTGGATTTGTCTGGGAATTCGTTGGTTCAAGGTATTCCGGTGAGTTTAGGGAATTGTGAGAGGTTGAGGACGCTTTTGTTGTATTCCAATTTGTTGGAAGAGCGTATTCCTAGTGAGCTTGGGAAGCTCAAGAGCCTTGAGGTGTTGGATGTGTCCAGGAACACTCTTAGTGGTTCTGTGCCTGGAGAGCTTGGGAATTGCTCGGAGTTGTCAGTCCTTGTGCTGTCTAATCTCTTTGATCCACGCGGGGACGTCGCTGGTGATTTTGGGAAATTGGGTTCGGTGAATGATGAGCTGAACTATTTTGAAGGGTCGATGCCTGTGGAGGTTTTGTCGCTTCCGAAGCTGAAGATATTGTGGGCTCCAATGGTGAATTTGGAAGGCAGTTTTCAGGTAAGTTGGGGTCGTTGTCAGAGCTTAGAGATGGTAAATTTGGCTCAGAATTTTTTCAGTGGGGAATTTCCGAACCAGCTTGGTGTCTGCGAGAGATTGCATTTTCTTGATTTAAGTGGAAACAACCTTACCGGGGTTCTTTCTAAAGAACTTCGCGTTCCCTGTATGAGCACGTTTGATGTTAGCGGGAACATGTTATCTGGTTCAATTCCTGATTTCTCTGATATTGTTTGTCCCCCTGAGCCTTCTTGGAATGGCAACCTATTTGAAGATGGTAATATTTCTCCACCATATGCATTCTTTTTTTTGTCAAAGGTTTGGGAGAATTCACTTTTCACAGCAATGGGGGGAGTTGGTATTTCGGTTGCTCACAACTTTGGTCGAAACAACTTCAATGGCATTCTGTCATTACCTGTGGCACGGGACAGGCTGGGGAAACAGAGCAGTTACACATTTCTGGTTGGTGAAAATAATCTTAGTGAACCATTTCCTACGTATTTATTTGAGAAATGCCATGGGTTAGATGCACTGCTTCTAAATGTCAGTTATAATAGGATATCTGGTCATATTCCTTCCAGTCTCAGTGGGATGTGCAGATCATTGAAATTTTTGGATGCATCTGGAAATCAGCTTGCAGGACGAATTCCCGTTGATTTAGGGAATATGGTCTCCCTTGCATCGCTGAACCTCAGTAAGAATCAGTTAGAAGGTGAGATTCCCACCAACCTTGGCCAGATAAAGAATCTGAAGTTTCTTTCTTTGGCTGGTAATAAGTTAAATGGCTCAATTCCGACCAGCCTGGGGCAGTTGTACTCTTTGGAAATCTTGGACCTTTCTTCAAACTATCTTACTGGTGAGATTCCAAAGGCTATTGAGAACATGAGAAATCTGACTGATGTTTTGCTCAATAACAACAATCTTTCTGGTCACATTCCTGGTGGTTTGGCATATGTCACCACACTCTCAGCATTCAATGTGTCTTTCAACAACTTATCTGGATCATTGCCTTCTAATAGTGGCTTGATTAAATGTAGTAGTGCTGTTGGGAATCCGTTTCTAAGTCCCTGCCGTGGAGTTTCTCTATCTGTGCCGTCAGGAAGTCAACTAGCGCCTATTGATGGCAGCCCTTATAATCCAGCAACTGAACAAGCCACTGGCAAGGACAGTGGTAATGGCTTGAGTTCTATTGAAATAGCATCTATAACTTCTGCTTCAGCCATTTTTTCTGTTCTTATAGCCTTGATTGTTCTATTTTTTTACACTCGGAAGTGGAAGCCTGGGTCCAGGGTTGTTGGTTCTACTAGAAAAGAAGTTACAGTGTTTACTGATATCGGCGTCCCGTTGACATTTGAAAGTGTTGTCCAAGCCACAGGAAATTTCAATGCTGGCAACTGCATTGGGAGTGGAGGTTTTGGGGCAACATACAAGGCAGAGGTAGCACCAGGAGTCTTGGTGGCAGTCAAACGACTTGCAGTTGGACGTTTCCAAGGTGTTCAACAATTCCATGCGGAAACCAAGACCCTTGGGAGGCTTCATCATCCTAATCTTGTCACTCTGATTGGTTATCATGCTTGTGAGACAGAGATGTTTCTCATATACAATTATTTGCCTGACAAGAAGGCTTTGGACCCTTCATTTTCTTCTTTTGGAAATGGGTTCAACATAGTGGCATGGGCATGCATGCTATTGAAGCAAGGAAGGGCAAATGAGTTCTTCACTGCTGGGTTATGGGAAGCAGGACCTGGAGAGGATTTGGTAGAGGTTCTTCACTTGGCTATTGTCTGTACTGTTGACTCTCTCTCCACCAGACCTACAATGAAACAAGTTGTGAGAAGGCTCAAGCAGCTTCAACCCCCATCATTCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_17630::LG4:38290929-38292929(+)
TGAAACTTAACTAGGCAGCGTATCAAGGGATATCAAGAGTACCTAAAGATACCAAGAGTGATGAGAATACTTTAATCCCTTATTCCTTATTCGACAATTTCACCTAGTATAAGGATCATCATGTGTAAGTATAATATTAATCCTTATATCATCATAGATATAAATTCAAAACATGATATATTAAGCAATAATTATTCTCCAAATTTCTCATCTTCTCCTAAGAAAACATTTAAATTTGCTATAATTGTTCAAACTCACACTTCCAAATTGACACATTACGATATTATTCCATAAGAAGCTTTGTTTAACTTGTGAAATTGAAGCATATATCACAACAAAAAATGTCTTGAAAACCATTTAAAGAAAAAATAAATAAATTTACCCTTCCATTGAAATATATAATCTTTGCACATGCACTACAAATTATAAAAAAATATGTTCTCTATTGTTAATAATAAAAGTAGGAAGACTAAAGAAGACATAAAATGAATAAACAATTCATTATTGTCATTAGTAAACATCATAACATTTATCTCATTAATATCTAAAATCTTATGATTTTGACAAACAATCATAAATAATACCTCATTACCTTATTAATTCAAATAACTACAATATTAAATATTTTTTAAGTTTAAGCATTTTTATTGCTCTTCAAGAAAGTTACCAACTTTGATGGTTCTCCTTCTAGCTAACCTACACGGTTGGTATTATTCGGCTAATTTTTAAAATACTTAATTGGACATCAATTATTAGTAGGATGTTTAAGAATTATGGTCAAACATTATTAAACTTCCTTTTCATCAATTCTCCACCATCAACTTCATTTTCAATTATTTAGATTGTTTATGATTCCTTAGTTGGAGATATTACACCAAGTTTACTTATACACATATTTACCACAATTTAAATAAGTGAAATTAAACCTTTCATATTCTAATTTAAGTAAAAAAAAACATTAGTTTCTTTTTGGATTTTTTCAACACAAATCCTAACCAATTTGCCTCTTTAATAAATAAAAAATAATTTAGAGTATGGTTTCAAACTTGTTTCTAACATGTCCAACTAACTAAAATGGCAACCTAGTAAACCAATCTAGATAACAACCTTTCTCACTATATTGTTGTGAAAGTGAAATAATGATTTCTATCTTTAGACCATGTTATATTAATTTATGATCATCTATGACTCTCAAAGAGTGCATTCCTATAATTATTTACTTTTATATAATGTACTCAGAAATAATCCTATGAAAAAAAATCTATAATACAAATAGAAATTAAGTTATTTCCTTTCATATTAGAGTTTATTTTGTACCTTGATGAAGCTCACATAGTTAGGTAACACATTAATGACGAGAATATATTATCTAAATAGCACATTATTTTTAAAATTGCTTAATAGTATCGGAGATAATTAAGACAAAGACAAAACTCTTAACTAAAATTATCTCCATATAAATCTAATCTTTATCTATTTTTTTCTACCAAAAGGTTAATAGTAGAGAGCAGTTTCTTTACATCTCTTTTCTTATTTAACTTAAAGACTCAATAATTTACGTAATGCATTGTTAAAAAATGGTTTTATTAATCAATAATACTATTATTGAGTTTTCACAACCAAAATAAAAAGACCCACTCTAGATAATTAGCTACAGAATTGTAAAAGCAATAACCAAGTTAAAATTTGATTTTCAATTTTAGCCTTAATTGAAAAAGTTATAAAATGTTGAGGGTCCACTTTATCAAGCCATTAAAAAACAATTTTATACTAAAAAACAAAATAAAAAAAGAGAAAAGGAAGAAAAACGCGTTTTGCAAAGAGAACACTGTTGAGTCCGAGTCTTGTTTCTCCTTCTTCCCCATCATTTTCCATCGTCTTTTTTCTTCCATATCACAGGATTAGGGTTTTCAAAAACCCTTTCTTCTTCTCTTCGACGTCACTTCTACAACGGGGAAGAAGGGGTTTTCCGTGCGATTCGGTTTTCTTTCACTGTGAGA


Gene Sequence:
>Vu_17630(+)
ATGTTTTCTTCTTCTTCTCATTGCAGTTCAGTGATCAAATGGAGTTCCCTAGTGAAGTTTCTCTTCTTTGTGGTTCTGTTCTTGTCGCCAAGCGACGCAGTATTGGGGGATTCGGACGAATCTGCTCTCCTTCGTCTGAAGGCATCGTTTTCCGACCCCGCCGGCGTTCTCTCCACATGGACCTCCGCAGCCGGCGCTGACTCTGGCTACTGCTCTTGGTCTGGTGTCCTCTGCAACGCGAACTCCCGGGTGGTCGCCGTCAACGTCACCGGAAACGGCGGCAACCGCCGCAACGGAACCTCTCACCCGTGCAAAGGTTTCTCTCAATTCCCTCTTTACGGATTCGGAGTTCGGCGAACGTGCGAAGGTAGTAAAGGTTCTCTCTTTGGAAACGTTTCTTCTTTTAATTTCATCAGTGTGCTCACGGAGCTTAGGGTTTTGTCTCTCCCCTACAACGCGTTGGAGGGGGAAATTCCCGAAGCAATTTGGGGCTTGGAAAAGCTAGAGGTTCTCGATTTAGAAGGGAATCTAATAAGTGGATATCTTCCGTTTAGAATTAAAGGCTTGAGGAAGTTGAGGGTTTTGAATCTTGGGTTTAATAGGATTGTGGGGGAGATTCCTGGTTCAATTTCGTCTCTTGAGAGTTTGGAGGTTTTGAATTTGGCTGGTAATGGATTGAATGGTTCTGTGCCTGGTTTTGTTGGGAGGCTTAGAGGGGTGTATCTTTCGTTTAATCAGTTCAGTGGGGTTGTTCCGCGAGAGATTGGGGAGAATTGTTGGAAGCTTGAGCATTTGGATTTGTCTGGGAATTCGTTGGTTCAAGGTATTCCGGTGAGTTTAGGGAATTGTGAGAGGTTGAGGACGCTTTTGTTGTATTCCAATTTGTTGGAAGAGCGTATTCCTAGTGAGCTTGGGAAGCTCAAGAGCCTTGAGGTGTTGGATGTGTCCAGGAACACTCTTAGTGGTTCTGTGCCTGGAGAGCTTGGGAATTGCTCGGAGTTGTCAGTCCTTGTGCTGTCTAATCTCTTTGATCCACGCGGGGACGTCGCTGGTGATTTTGGGAAATTGGGTTCGGTGAATGATGAGCTGAACTATTTTGAAGGGTCGATGCCTGTGGAGGTTTTGTCGCTTCCGAAGCTGAAGATATTGTGGGCTCCAATGGTGAATTTGGAAGGCAGTTTTCAGGTAAGTTGGGGTCGTTGTCAGAGCTTAGAGATGGTAAATTTGGCTCAGAATTTTTTCAGTGGGGAATTTCCGAACCAGCTTGGTGTCTGCGAGAGATTGCATTTTCTTGATTTAAGTGGAAACAACCTTACCGGGGTTCTTTCTAAAGAACTTCGCGTTCCCTGTATGAGCACGTTTGATGTTAGCGGGAACATGTTATCTGGTTCAATTCCTGATTTCTCTGATATTGTTTGTCCCCCTGAGCCTTCTTGGAATGGCAACCTATTTGAAGATGGTAATATTTCTCCACCATATGCATTCTTTTTTTTGTCAAAGGTTTGGGAGAATTCACTTTTCACAGCAATGGGGGGAGTTGGTATTTCGGTTGCTCACAACTTTGGTCGAAACAACTTCAATGGCATTCTGTCATTACCTGTGGCACGGGACAGGCTGGGGAAACAGAGCAGTTACACATTTCTGGTTGGTGAAAATAATCTTAGTGAACCATTTCCTACGTATTTATTTGAGAAATGCCATGGGTTAGATGCACTGCTTCTAAATGTCAGTTATAATAGGATATCTGGTCATATTCCTTCCAGTCTCAGTGGGATGTGCAGATCATTGAAATTTTTGGATGCATCTGGAAATCAGCTTGCAGGACGAATTCCCGTTGATTTAGGGAATATGGTCTCCCTTGCATCGCTGAACCTCAGTAAGAATCAGTTAGAAGGTGAGATTCCCACCAACCTTGGCCAGATAAAGAATCTGAAGTTTCTTTCTTTGGCTGGTAATAAGTTAAATGGCTCAATTCCGACCAGCCTGGGGCAGTTGTACTCTTTGGAAATCTTGGACCTTTCTTCAAACTATCTTACTGGTGAGATTCCAAAGGCTATTGAGAACATGAGAAATCTGACTGATGTTTTGCTCAATAACAACAATCTTTCTGGTCACATTCCTGGTGGTTTGGCATATGTCACCACACTCTCAGCATTCAATGTGTCTTTCAACAACTTATCTGGATCATTGCCTTCTAATAGTGGCTTGATTAAATGTAGTAGTGCTGTTGGGAATCCGTTTCTAAGTCCCTGCCGTGGAGTTTCTCTATCTGTGCCGTCAGGAAGTCAACTAGCGCCTATTGATGGCAGCCCTTATAATCCAGCAACTGAACAAGCCACTGGCAAGGACAGTGGTAATGGCTTGAGTTCTATTGAAATAGCATCTATAACTTCTGCTTCAGCCATTTTTTCTGTTCTTATAGCCTTGATTGTTCTATTTTTTTACACTCGGAAGTGGAAGCCTGGGTCCAGGGTTGTTGGTTCTACTAGAAAAGAAGTTACAGTGTTTACTGATATCGGCGTCCCGTTGACATTTGAAAGTGTTGTCCAAGCCACAGGAAATTTCAATGCTGGCAACTGCATTGGGAGTGGAGGTTTTGGGGCAACATACAAGGCAGAGGTAGCACCAGGAGTCTTGGTGGCAGTCAAACGACTTGCAGTTGGACGTTTCCAAGGTGTTCAACAATTCCATGCGGAAACCAAGACCCTTGGGAGGCTTCATCATCCTAATCTTGTCACTCTGATTGGTTATCATGCTTGTGAGACAGAGATGTTTCTCATATACAATTATTTGCCTGGTGGGAATCTTGAAAAGTTCATCCAAGAGAGGTCCACAAGGGTTGTGGATTGGAGGATTCTTCACAAGATTGCATTGGACATAGCCCGTGCACTGGCCTATCTGCATGATCAGTGTGTTCCCCGTGTTCTTCACCGTGATGTGAAGCCCAGCAATATCTTGTTAGATGACGATTTCAATGCTTATCTATCGGACTTTGGATTGGCTAGACTTCTGGGAACATCAGAGACACATGCTACCACTGGTGTAGCCGGAACATTTGGGTATGTTGCCCCTGAATATGCCATGACTTGCCGTGTTTCGGATAAGGCTGATGTGTATAGCTATGGTGTGGTGCTTCTGGAGTTGCTCTCAGACAAGAAGGCTTTGGACCCTTCATTTTCTTCTTTTGGAAATGGGTTCAACATAGTGGCATGGGCATGCATGCTATTGAAGCAAGGAAGGGCAAATGAGTTCTTCACTGCTGGGTTATGGGAAGCAGGACCTGGAGAGGATTTGGTAGAGGTTCTTCACTTGGCTATTGTCTGTACTGTTGACTCTCTCTCCACCAGACCTACAATGAAACAAGTTGTGAGAAGGCTCAAGCAGCTTCAACCCCCATCATTCTAG