Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17629 LG4 38282567 38285833 PREDICTED: LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RPK2
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 38282568 start_lost p.Met1?
T/A 38282598 missense_variant p.Val11Asp
C/T 38282634 missense_variant p.Ser23Phe
G/T 38282637 missense_variant p.Gly24Val
A/C,T 38282638 synonymous_variant p.Gly24Gly
A/G 38282714 missense_variant p.Ser50Gly
G/A 38282810 missense_variant p.Gly82Arg
T/C 38282880 missense_variant p.Phe105Ser
T/A 38283296 intron_variant
C/T 38283299 intron_variant
G/A 38283379 synonymous_variant p.Arg212Arg
T/A 38283387 missense_variant p.Leu215His
G/T 38283685 synonymous_variant p.Pro314Pro
T/C 38283834 missense_variant p.Phe364Ser
C/T 38283848 missense_variant p.Pro369Ser
T/A 38283878 missense_variant p.Phe379Ile
G/T 38283888 missense_variant p.Gly382Val
G/T 38284017 missense_variant p.Arg425Leu
T/A 38284159 missense_variant p.Ser472Arg
A/T 38284164 missense_variant p.Asn474Ile
A/T 38284167 missense_variant p.Asn475Ile
T/A 38284172 missense_variant p.Ser477Thr
G/A 38284709 missense_variant p.Gly656Arg
T/C 38284718 missense_variant p.Ser659Pro
C/T 38284724 missense_variant p.Pro661Ser
G/A 38284726 synonymous_variant p.Pro661Pro
G/A 38284734 missense_variant p.Ser664Asn
G/A 38284751 missense_variant p.Glu670Lys
C/T 38284755 missense_variant p.Thr671Ile
A/C 38284767 missense_variant p.Asn675Thr
G/A 38284769 missense_variant p.Gly676Ser
G/A 38284774 synonymous_variant p.Lys677Lys
G/A 38284782 missense_variant p.Gly680Glu
T/C 38284801 synonymous_variant p.Ile686Ile
G/A 38284802 missense_variant p.Glu687Lys
G/A 38284808 missense_variant p.Ala689Thr
C/T 38284812 missense_variant p.Ser690Phe
T/C 38284826 missense_variant p.Ser695Pro
G/A 38284840 synonymous_variant p.Ser699Ser
C/T 38284851 missense_variant p.Ala703Val
G/A 38284931 missense_variant p.Val730Met
T/G 38285320 intron_variant
T/C 38285395 intron_variant
A/T 38285665 stop_gained p.Lys857*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17629.1
MKASLSDPAGVLSTWTTADGSHSGHCYWSGVLCDANSRVVAVNVTGNGASRASHPCSDSSKLPLYGFGIRRTCKGSKGSLFGNVSSVGFDFISELTELRVLSLPFNALEGEIPEAIWGMENLEVLDLEGNLISGYLPLRIHGLRKLRVLNLGFNRFIGEVPSSIASLESLEVLNLAGNELNGSVPGFVGRLRGGIPGELGKLKSLEVLDVSRNTLSGSVPRELGNCSELSVLVLSNLFDVRGDAAGDFGKLGSVNDEVNYFEGSMPLEVFSLPNLRILWAPMVNLEGSFQGNWGGCQSLEMVNLAQNFLSGEFPNQLGVCKRLHFLDLSGNNLTGVLSAELHVPCMSVFDVSGNMLSGSVPDFFNTVCPPVPSWNGNLFEDGNVSSPYASFFLSMVHERSLFTSMGGIGTSVVHNFGQNSFTGIRSLPVPHDRLGKKNGYTFLVGGNILTGTFPTYLFEKCDRLDAFLLNASYNNISGHIPFNISRMCRSLKFLDVSGNQLAGPIPVDLGNVVSLVSLNLSRNQLQGQIPSSLGQMKNLKFLSLAGNKLNGSIPTSLGQLYSLEVFDLSSNSLTGEIPKAIENMRNLTDVLLNNNNLSGHIPDGLAHVTSLSVFNVSFNNLSGYFPSNSGLFKCSSAVGNPYLSPCRGLSLTVPSGNQSGPIDSSSYNSETEQANGKKSGSDFSSIEIASITSASAIVSVLIALIVLFFYTRKWKPRSRVVGSTRKEVTVFTDIGVPLTFESVVQATGNFNAGNCIGSGGFGATYKAEIASGILVAVKRLAVGRFQGVQQFHAEIKTLGRLHHPNLVTLIGYHACETEMFLIYNYLPGDKKALDPSFSSFGNGFNIVAWACMLLKQGRANEFFTAGLWEAGPGEDLVEVLHLAIVCTVDSLSTRPTMKQVVRRLKQLQPPSC*


CDS Sequence:
>Vu_17629.1
ATGAAGGCGTCGTTGTCCGACCCCGCCGGCGTTCTCTCCACGTGGACCACCGCTGACGGTTCTCACTCCGGACACTGCTACTGGTCTGGCGTCCTCTGTGACGCGAACTCCCGCGTCGTCGCCGTCAACGTCACCGGAAACGGCGCCAGCCGAGCCTCGCACCCGTGCTCCGATTCCTCTAAACTCCCCCTCTACGGTTTCGGAATTCGGCGAACATGCAAAGGTAGTAAAGGTTCTCTCTTCGGAAACGTTTCTTCTGTTGGTTTCGATTTCATCAGTGAGCTCACGGAGCTTAGGGTTTTGTCTCTCCCCTTCAACGCGTTGGAGGGGGAAATTCCCGAAGCAATTTGGGGCATGGAAAATCTAGAGGTTCTCGATTTAGAAGGGAACTTGATAAGTGGTTATCTTCCCTTGAGAATTCACGGTTTGAGGAAGTTGAGGGTTCTGAATCTTGGGTTTAATAGGTTTATTGGGGAGGTACCTAGTTCAATTGCGTCTCTTGAGAGTTTGGAGGTTCTGAATTTGGCTGGTAATGAATTGAATGGTTCTGTGCCTGGTTTTGTCGGGAGGCTTAGAGGGGGTATTCCTGGTGAGCTTGGGAAGCTCAAGAGCCTTGAGGTGTTGGATGTTTCCAGGAACACTCTCAGTGGCTCTGTGCCGAGGGAGCTTGGGAATTGCTCAGAGTTGTCGGTTCTTGTGCTGTCAAATCTCTTTGATGTTCGGGGTGATGCTGCCGGTGATTTTGGGAAATTAGGTTCAGTGAATGATGAGGTGAATTATTTTGAAGGGTCAATGCCACTGGAGGTTTTTTCGCTTCCAAACTTGAGGATATTGTGGGCTCCCATGGTGAATCTGGAAGGCAGTTTTCAAGGGAACTGGGGTGGTTGTCAGAGCTTGGAGATGGTAAATTTGGCTCAGAACTTTTTGAGTGGGGAATTTCCGAACCAGCTTGGTGTCTGCAAGAGGCTGCATTTTCTTGATTTAAGTGGAAACAACCTTACTGGGGTGCTTTCTGCAGAACTTCACGTTCCCTGTATGAGTGTTTTTGATGTTAGTGGGAACATGTTATCTGGCTCAGTTCCTGATTTCTTCAATACCGTTTGTCCCCCTGTTCCTTCTTGGAATGGAAACCTGTTTGAAGATGGGAATGTTTCCTCGCCATATGCCTCGTTTTTTTTGTCAATGGTTCATGAAAGATCACTTTTTACATCAATGGGGGGAATTGGTACTTCTGTTGTTCACAACTTTGGGCAAAACAGCTTTACCGGTATTCGGTCGCTACCCGTACCTCATGACAGGCTGGGGAAGAAGAATGGTTACACGTTTCTTGTTGGTGGAAATATTCTTACAGGAACATTTCCTACATATTTATTTGAGAAATGTGATAGACTAGACGCATTCCTTTTAAATGCCAGTTATAATAATATATCTGGTCATATACCTTTCAATATCAGTCGAATGTGCAGATCATTGAAATTTTTGGACGTGTCTGGAAATCAACTTGCGGGACCTATTCCTGTTGATTTAGGGAATGTTGTATCCCTTGTATCGCTAAACCTCAGTAGGAATCAATTACAAGGTCAAATTCCCTCCAGCCTTGGCCAGATGAAGAATCTGAAGTTTCTCTCTTTGGCTGGTAATAAGTTAAATGGCTCAATTCCTACCAGCCTGGGGCAGTTGTACTCTTTGGAAGTCTTTGACCTCTCTTCAAACTCTCTTACTGGTGAAATTCCAAAGGCTATTGAGAACATGAGAAATCTGACTGATGTTTTGCTCAATAACAACAATCTTTCTGGTCATATTCCTGATGGTTTGGCACATGTCACTTCACTCTCAGTATTCAATGTGTCTTTCAACAACTTATCTGGATATTTTCCTTCCAACAGTGGCTTGTTTAAATGCAGCAGTGCTGTTGGGAATCCATACCTAAGTCCCTGCCGTGGACTGTCTCTGACTGTGCCATCAGGGAATCAGTCAGGGCCGATTGATAGCAGCTCTTATAATTCGGAAACAGAGCAAGCTAATGGCAAGAAGAGTGGGAGTGACTTCAGTTCTATTGAAATAGCATCTATAACTTCTGCTTCAGCCATTGTTTCGGTACTTATAGCCCTGATTGTTCTATTCTTTTACACACGGAAGTGGAAGCCAAGGTCCAGGGTTGTTGGCTCTACAAGAAAAGAAGTTACAGTGTTTACTGATATTGGGGTCCCATTGACATTTGAAAGTGTTGTCCAAGCCACAGGAAATTTCAATGCTGGAAACTGTATTGGGAGTGGAGGTTTTGGAGCAACATACAAGGCGGAGATAGCATCAGGAATCCTGGTGGCAGTCAAACGACTCGCAGTTGGACGTTTCCAAGGTGTTCAACAATTCCATGCCGAGATCAAGACCCTTGGGAGGCTTCATCATCCTAACCTTGTCACTCTGATTGGTTATCATGCTTGTGAAACAGAGATGTTTCTCATATACAATTATTTGCCAGGTGACAAGAAGGCTTTGGACCCTTCATTTTCTTCTTTTGGAAATGGGTTCAACATAGTGGCATGGGCATGCATGCTATTGAAGCAAGGAAGGGCAAACGAGTTCTTCACTGCTGGGTTATGGGAAGCAGGACCTGGAGAGGATTTGGTAGAGGTTCTTCACTTGGCTATTGTCTGTACTGTTGACTCTCTCTCCACCAGACCTACAATGAAACAAGTTGTGAGAAGGCTCAAGCAGCTTCAACCCCCATCATGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_17629::LG4:38280567-38282567(+)
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Gene Sequence:
>Vu_17629(+)
ATGAAGGCGTCGTTGTCCGACCCCGCCGGCGTTCTCTCCACGTGGACCACCGCTGACGGTTCTCACTCCGGACACTGCTACTGGTCTGGCGTCCTCTGTGACGCGAACTCCCGCGTCGTCGCCGTCAACGTCACCGGAAACGGCGCCAGCCGAGCCTCGCACCCGTGCTCCGATTCCTCTAAACTCCCCCTCTACGGTTTCGGAATTCGGCGAACATGCAAAGGTAGTAAAGGTTCTCTCTTCGGAAACGTTTCTTCTGTTGGTTTCGATTTCATCAGTGAGCTCACGGAGCTTAGGGTTTTGTCTCTCCCCTTCAACGCGTTGGAGGGGGAAATTCCCGAAGCAATTTGGGGCATGGAAAATCTAGAGGTTCTCGATTTAGAAGGGAACTTGATAAGTGGTTATCTTCCCTTGAGAATTCACGGTTTGAGGAAGTTGAGGGTTCTGAATCTTGGGTTTAATAGGTTTATTGGGGAGGTACCTAGTTCAATTGCGTCTCTTGAGAGTTTGGAGGTTCTGAATTTGGCTGGTAATGAATTGAATGGTTCTGTGCCTGGTTTTGTCGGGAGGCTTAGAGGGGTGTATCTTTCGTTTAATCAGTTCAGTGGGGTTGTTCCGCGAGAGATTGGGGAGAATTGTTGGAAGCTTGAACATTTGGATTTGTCTGGGAATTCGTTGGTTCAAGGGATTCCGGGGAGTTTAGGGAATTGTGAGAGGTTGAGGACGCTTTTGCTGTATTCCAATTTGTTGGAAGAGGGTATTCCTGGTGAGCTTGGGAAGCTCAAGAGCCTTGAGGTGTTGGATGTTTCCAGGAACACTCTCAGTGGCTCTGTGCCGAGGGAGCTTGGGAATTGCTCAGAGTTGTCGGTTCTTGTGCTGTCAAATCTCTTTGATGTTCGGGGTGATGCTGCCGGTGATTTTGGGAAATTAGGTTCAGTGAATGATGAGGTGAATTATTTTGAAGGGTCAATGCCACTGGAGGTTTTTTCGCTTCCAAACTTGAGGATATTGTGGGCTCCCATGGTGAATCTGGAAGGCAGTTTTCAAGGGAACTGGGGTGGTTGTCAGAGCTTGGAGATGGTAAATTTGGCTCAGAACTTTTTGAGTGGGGAATTTCCGAACCAGCTTGGTGTCTGCAAGAGGCTGCATTTTCTTGATTTAAGTGGAAACAACCTTACTGGGGTGCTTTCTGCAGAACTTCACGTTCCCTGTATGAGTGTTTTTGATGTTAGTGGGAACATGTTATCTGGCTCAGTTCCTGATTTCTTCAATACCGTTTGTCCCCCTGTTCCTTCTTGGAATGGAAACCTGTTTGAAGATGGGAATGTTTCCTCGCCATATGCCTCGTTTTTTTTGTCAATGGTTCATGAAAGATCACTTTTTACATCAATGGGGGGAATTGGTACTTCTGTTGTTCACAACTTTGGGCAAAACAGCTTTACCGGTATTCGGTCGCTACCCGTACCTCATGACAGGCTGGGGAAGAAGAATGGTTACACGTTTCTTGTTGGTGGAAATATTCTTACAGGAACATTTCCTACATATTTATTTGAGAAATGTGATAGACTAGACGCATTCCTTTTAAATGCCAGTTATAATAATATATCTGGTCATATACCTTTCAATATCAGTCGAATGTGCAGATCATTGAAATTTTTGGACGTGTCTGGAAATCAACTTGCGGGACCTATTCCTGTTGATTTAGGGAATGTTGTATCCCTTGTATCGCTAAACCTCAGTAGGAATCAATTACAAGGTCAAATTCCCTCCAGCCTTGGCCAGATGAAGAATCTGAAGTTTCTCTCTTTGGCTGGTAATAAGTTAAATGGCTCAATTCCTACCAGCCTGGGGCAGTTGTACTCTTTGGAAGTCTTTGACCTCTCTTCAAACTCTCTTACTGGTGAAATTCCAAAGGCTATTGAGAACATGAGAAATCTGACTGATGTTTTGCTCAATAACAACAATCTTTCTGGTCATATTCCTGATGGTTTGGCACATGTCACTTCACTCTCAGTATTCAATGTGTCTTTCAACAACTTATCTGGATATTTTCCTTCCAACAGTGGCTTGTTTAAATGCAGCAGTGCTGTTGGGAATCCATACCTAAGTCCCTGCCGTGGACTGTCTCTGACTGTGCCATCAGGGAATCAGTCAGGGCCGATTGATAGCAGCTCTTATAATTCGGAAACAGAGCAAGCTAATGGCAAGAAGAGTGGGAGTGACTTCAGTTCTATTGAAATAGCATCTATAACTTCTGCTTCAGCCATTGTTTCGGTACTTATAGCCCTGATTGTTCTATTCTTTTACACACGGAAGTGGAAGCCAAGGTCCAGGGTTGTTGGCTCTACAAGAAAAGAAGTTACAGTGTTTACTGATATTGGGGTCCCATTGACATTTGAAAGTGTTGTCCAAGCCACAGGAAATTTCAATGCTGGAAACTGTATTGGGAGTGGAGGTTTTGGAGCAACATACAAGGCGGAGATAGCATCAGGAATCCTGGTGGCAGTCAAACGACTCGCAGTTGGACGTTTCCAAGGTGTTCAACAATTCCATGCCGAGATCAAGACCCTTGGGAGGCTTCATCATCCTAACCTTGTCACTCTGATTGGTTATCATGCTTGTGAAACAGAGATGTTTCTCATATACAATTATTTGCCAGGTGGTAATCTCGAAAAGTTTATCCACGAGAGGTCCACGAGGGCTGTAGACTGGAGAATTCTTCACAAGATTGCATTGGACATTGCCAGAGCACTTGCCTATCTGCATGATCAGTGTGTTCCCCGTGTTCTTCACCGTGATGTGAAGCCCAGCAACATCTTGTTGGATGATGATTTCAATGCTTATCTATCGGACTTTGGATTGGCTAGACTTCTGGGAACATCAGAGACACATGCTACCACTGGTGTAGCCGGAACATTTGGGTATGTTGCCCCTGAATATGCCATGACTTGCCGTGTTTCGGATAAGGCTGATGTGTATAGCTATGGTGTGGTGCTTCTGGAGTTGCTCTCAGACAAGAAGGCTTTGGACCCTTCATTTTCTTCTTTTGGAAATGGGTTCAACATAGTGGCATGGGCATGCATGCTATTGAAGCAAGGAAGGGCAAACGAGTTCTTCACTGCTGGGTTATGGGAAGCAGGACCTGGAGAGGATTTGGTAGAGGTTCTTCACTTGGCTATTGTCTGTACTGTTGACTCTCTCTCCACCAGACCTACAATGAAACAAGTTGTGAGAAGGCTCAAGCAGCTTCAACCCCCATCATGCTAG