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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17578 LG4 37765268 37770959 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 37765358 intron_variant
C/T 37765360 intron_variant
C/*,T 37765538 intron_variant
C/A 37765557 intron_variant
A/G 37765604 intron_variant
A/G 37765718 missense_variant p.Tyr592His
T/A 37766042 intron_variant
A/G 37766059 intron_variant
A/T 37766804 intron_variant
A/T 37767128 intron_variant
C/A 37767239 intron_variant
A/T 37767771 missense_variant p.Cys328Ser
G/A 37768332 synonymous_variant p.Thr208Thr
A/T,* 37768814 intron_variant
G/C,* 37768825 intron_variant
C/A 37768911 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17578.1
MGCISSKNVVAKTYSPSPTMVEISEPIRASSRGHSGLTILDSKGNVDNERNNNSKIKKISSKKSNGSFSLRHGLVHRNVEAEQNAVGWPPWLTAVAAEAIQGWIPLKADSFQKLEKIGQGTYSSVFRAREVETGKLFALKKVRFDNFQPESIRFMAREITILRRLDHPNIMKLEGIITSRLSNSIYLVFEYMEHDLAGLVSRPEIVFTESQIKCYMRQLLSGLEHCHMRGVMHRDIKVSNILLNNEGVLKIGDFGLANTISTSNKNPLTSRVVTLWYRPPELLMGSTSYGVSVDLWSVGCVFAELFLGKPILKGRTEVEQLHKIFKLCGSPPEEFWKKTKLPHATMFKPQTNYESSLRERCADFPESAIDLLETLLSIDASNRGTSSSALMSEYFNTKPYACNPSNLPRYPPSKEMDVKVQEDSSRKKIEGKVREVATSRRQPRRATKLLHDPNNFGKSSSKENMQNTSQNGHKDDGKTHLTKGRGGGMYKDHAKPAMDTMSETSQMMNVVNGNGYSVPIQVSGSTNDYTWVKRRKQDASSTLSDGSKSKISALDTNFAKGTYDLSNQRVSMDFDPAELVNAQFYRVVEKMMYNVQFVNQGLEEINEMKQGL*


CDS Sequence:
>Vu_17578.1
ATGGGTTGCATTAGCTCCAAGAATGTGGTCGCCAAAACTTATTCTCCATCCCCTACAATGGTGGAAATTTCAGAGCCGATTCGCGCTTCCAGCAGGGGCCATTCTGGATTGACGATTTTGGATTCTAAAGGAAATGTAGACAATGAGAGAAACAACAACAGCAAGATTAAGAAGATTAGTTCAAAGAAGAGTAATGGGTCTTTTAGCTTACGGCATGGGTTGGTTCACAGAAACGTGGAGGCTGAACAAAATGCTGTTGGTTGGCCGCCATGGCTCACTGCTGTTGCAGCAGAAGCCATTCAAGGATGGATCCCTCTCAAAGCAGATTCTTTTCAAAAGTTAGAAAAGATTGGACAAGGTACATATAGTAGTGTGTTTCGAGCTCGTGAAGTTGAAACTGGGAAGCTATTTGCTTTGAAAAAAGTGCGTTTTGACAATTTTCAACCTGAGAGTATTAGGTTTATGGCAAGAGAAATAACCATCCTTCGAAGGCTTGACCACCCAAACATCATGAAATTGGAGGGCATAATCACTTCTCGCCTATCAAACAGCATATACCTCGTATTTGAATACATGGAACATGATCTTGCCGGCCTAGTATCACGTCCTGAGATAGTATTCACCGAATCACAGATAAAATGTTACATGAGGCAACTTTTAAGTGGACTCGAGCATTGTCATATGCGTGGTGTTATGCACAGAGACATCAAAGTATCAAATATCTTATTAAACAATGAAGGTGTTCTCAAGATAGGAGATTTTGGATTAGCAAATACAATTAGTACAAGTAACAAAAATCCTTTGACAAGTCGTGTCGTGACTTTGTGGTATCGTCCTCCTGAGCTATTGATGGGATCGACTAGCTATGGAGTGTCAGTAGATCTATGGAGTGTTGGTTGTGTATTTGCAGAACTTTTTCTTGGGAAGCCTATCCTTAAAGGAAGAACTGAGGTTGAACAATTGCACAAAATTTTTAAGTTGTGTGGTTCTCCACCTGAGGAGTTCTGGAAAAAGACCAAACTTCCTCATGCAACCATGTTTAAGCCTCAAACAAATTATGAAAGCTCTCTTCGAGAAAGATGTGCAGATTTTCCTGAAAGTGCTATAGACCTACTTGAGACTTTATTATCCATCGATGCAAGCAACCGAGGAACTTCCTCGTCTGCCTTAATGTCTGAGTACTTTAACACTAAGCCATACGCTTGTAACCCATCAAATCTCCCAAGATACCCACCAAGCAAAGAAATGGATGTAAAAGTTCAAGAAGATTCATCCAGGAAAAAAATCGAAGGTAAAGTGAGAGAGGTTGCAACATCAAGAAGACAACCAAGACGAGCCACTAAACTTTTGCATGATCCAAACAATTTTGGTAAATCAAGTTCAAAAGAGAACATGCAAAACACTTCTCAAAATGGGCATAAAGATGATGGTAAAACACATCTTACAAAAGGAAGAGGAGGAGGGATGTACAAAGATCATGCAAAGCCTGCCATGGATACCATGTCTGAGACCTCCCAAATGATGAATGTTGTTAATGGTAATGGATACAGTGTGCCAATACAAGTCTCAGGATCTACGAATGATTATACATGGGTCAAAAGAAGAAAACAAGATGCATCATCAACTCTATCGGATGGATCAAAAAGCAAAATTAGTGCACTAGATACCAACTTTGCCAAAGGAACATATGATTTATCTAACCAAAGGGTTTCCATGGATTTTGATCCTGCTGAATTGGTGAATGCTCAGTTCTACAGGGTCGTAGAGAAAATGATGTACAACGTGCAATTCGTAAATCAAGGTTTGGAAGAGATAAATGAGATGAAGCAAGGATTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_17578::LG4:37770959-37772959(-)
TTGTCCTTTTAGATAAAGAAAATTGTAATAAATATTCTTCATGAATCATTTCATGCAAATTTCTTCATAAAAATATCTCAAATATTTACCATGACTTATCAAACCTAAGTCCGATAACTTTTATCTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTAAAGTTCATATTCATACAAGATTGATGGTATATTCATACAGTTATTTCATAGGAGTTATTGGTTTATGAAAACTTTAATACATTTTTTTCGAGATATATTTGATGTTGACATATCTTATGAGAAAATAGTCATTAAAAAAACTTAATCAAAATCACTTATGATAATTTTAAGTTTGTTAAAAAAATGTCTAACAATTTCGTTCTAAGTTTTTTTTGCAACAAATGCAAAAGCATTGCAAACATATATGACATAAGTATATATCTTAATTACGTTTGAATTTGTCATTGTTTGCATTCTAATTGATTTTAAGATAAATTAATATTTTTCAAATGTTGCTAGAATTGTTTGTGTTCTTTATATAGAGGGATGCGTGTTGGGTGTTGGTTGTTATGTTCATATATTTATTTATTTTGGGTAAATGTATTTTACTAAATATGTATTGGTAAAAACAAACCAAGTGTGACTTAGATTACAAACTACTTAATATTGGTTGTTTTAACTAATGAAAAATAATTTAATGTATCTCATAGAAGGTTCTAATTGATGTACTAATAACTCTCTTAAATAGAACATAGTTTAGAAGGTTCATAATTACAAATGGTATGATTAATTTAATTAATTAATTATATTTGTAAGCGGCCAAACTTTTCATTAAGAAAGATCTGATGCTTATATTAAACCATTCATATGTCAACATATATTATTATTAATATTATTTCTTAAAACATATAATCTCTAAATAATGGAAAAATATATCTTTTTATAAATTTATCGTGTAAAATAAAATAAAACATTATTTCAAAACTTTAGTTAACTCACTTTTTTTATTGTTTGATGAATAAATGGAAAGTAATGGTTTTCGTTATATTAATATTATTAGTATTCAAATATTGTACTACTTTGGTTTCATTTAAAATGTTTATTGAATATAAATTTAATTTGACTTACCACTATTCTTTATTTTCAATAGGGAATTTATTTATAATATATTGATAATAAAAAAAACTAGTTTATTTATAAATAAAGTTATTTTATGATTATAGTTATATTTTATTTATTAACTCTATAATAATATTTTTATTTTTTAAATAAATTAAATATTGATTCAACATACTTTATAGTTTTCATTTTACAGTATAATTTAGGAATAATGTGTTATTTGCAACAACAAAAAATAAGAATAAAAGCTAGTTTTCATTTTATCATATCCATGTTTGTAATGAAGTGATTCTTAACCACTTTACCATGACACGTTATATATTATACCTTAGTATCATATTTTCTCTCTTCTTATTTAATAAAATGATATCCATTTTTGTTTTCTATAGTTTTCAACAACCAAAATGCAGACTCAATTCTGACCCATGAGTTTCTAATTCTCTCCTTAAAATTCCTCCAACCCCTTATTCCTTCCGAAATCAATGGAAGACAGAGAGAGAACAGGGGAGGAGAGAGAAAATTTGGTGAAGGAGGGGGTCGTTCGTTTCCTTGTTCTATTCCACAACAAAGCTACCATTTTTCCATGTGCGTCTCGCACACCCTCTTGGGAAAACCCAAAGGGTTGCATTGAATTATATAGAACAAAGACGAAGAGACTCAAAATCAGGGAAGAGGAGAAAAGAAAACCGACAAGAACAACAACAAAGGAGGAGGAACAAAGAACAAAGTTGTTGTTTTTGTCGAATTCGAAATGCCCCTGTTTTCTGGTTTTTCTCATCTCCCTGTATTCTGAGCTCCTCTGTTCTGGGTGTAGCAACCACATTGGAGGTGTTGATGTAGGGGAAATTCTCCCCTACAATCGCCATCGTCCATTTTCTTCTTTCTCTTCGTCGTGATCATCTTCTTCTTGATCAA


Gene Sequence:
>Vu_17578(-)
ATGGGTTGCATTAGCTCCAAGAATGTGGTCGCCAAAACTTATTCTCCATCCCCTACAATGGTGGAAATTTCAGAGCCGATTCGCGCTTCCAGCAGGGGCCATTCTGGATTGACGATTTTGGATTCTAAAGGAAATGTAGACAATGAGAGAAACAACAACAGCAAGATTAAGAAGATTAGTTCAAAGAAGAGTAATGGGTCTTTTAGCTTACGGCATGGGTTGGTTCACAGAAACGTGGAGGCTGAACAAAATGCTGTTGGTTGGCCGCCATGGCTCACTGCTGTTGCAGCAGAAGCCATTCAAGGATGGATCCCTCTCAAAGCAGATTCTTTTCAAAAGTTAGAAAAGGTAACAATAATCATAATCATAATCATAATAACATGTGTAGTGTTTATGTTTCTTATGTTATTTTGTTCTTTTTCATGTTCAATCCCTAAAGTTTATGTGGATAATCAATCTAGTTAATATAGGTTATGATAAAAGTAATCATAAATTACTCTCATATGGAACTTCAATTCTAATAGGAATCCAACACCAAAAGTTATATTTAAATTTTATCTATGAAAAACACAATTTGGAAAATTTTGTGATTTGTTGTCATCTAATTTTTACTATAAAATCAGCTTTTAGAGTTTGGTTGTTTGGTAAGATAGAAGAAAAATAACCAATAAGATAATTTTTTTATTTAAATTAAATAGAGGGTGGAAAGAAGAAAAATAATTAAGAGTAGGTTTTATTTTTCATAGGTTTTGAAATAAACAAATAAATAGACTTGTTTGATAAGTGGAAATATTTTTATCATAATTTTGTTCTTATGTTTAGTTTTGAAAAGTTGTAAAGTTTAGACATTATGACATAACTCATCGAGAAGTGATATGTTTTCAAAGGTCTAAGTAAAAAGACTTTATTGTTTATCTTTTTACTATGTCATCGTTTTAATTAATTATTTAGAGGGACCTTTAAAACCTCTTCAACAGTTTCCATTGATAAATGAAAAGAACAACATCTTTAAGTTTTTTTTTTATCCTTTTATTTCTTTTAAAATATTTGAAAACAATTATTGTATTTTCAATAAAATTCATATTGTAAATTAATTTATAATTAAATAATAATTGTTTAAGAAAATAATTTTAAAAAAATCAATCAAATAAAATTTTCTTTCATTTTCTTGTCGTCTCCCACCAAAGAAAAATAAATAAATAATTAATGTATTTTGGTTGCTATTTTCTTCATCTTCATTTTCTTTCATTAATTAAACATAATTATATTGTGAAAGTTATCAAGGTCAAACTTTTAATATTGAATATTGATATTTCTTAATATTATAACATTTTACATTAACATTTGTAACATTAGTCATTGAATTAATATTATATTGTATTACATTTAATAGAAAAAAGGTAATATTAAAACTAAATAAAGTAGAGTACTTTTAATCATGAAAATTGTTATGATGACATTTATCATAGCAAGAAAATTTATCAGTAATAAAGGAGTAATGTAAAAATTAGATAAATTGCTAAATTAATATTTGAATATGCATGTTGTGGACAATTTAGTCCTTGAATGAAAAAAAAATTAAATAACCCTCACATGTTGATGACCACATAGGAGAACATCATGAAGGACTAATTTTTTTTATGTGGGATGCTATTTTTTTTCCGAGGCATTATTTATTTATTGTTGTGTATGTTTGGAACTCAAATTTAGGAAAATCTAAAAGTAAAAGAAAAATGTGAAGGCTTGTTTTAGTGACTTTGAATGACACTCGTCATTGATAATTAAAGTGTTCAAACCTTAATAATCTTTGGATTGTTATGACAAAGTTGTTAGAAAGTTTCCTATTTTGTAGACTAATTATGAATTTTCCTTATTAAAGGATGAAAGTATTTGCAAGACACACATTTGAAGGCAAAATTGATTATTTACCCTATCAAAAATCAACTAACATACTAGTATTTGATATTTATTATATAGTTTATCTACATGAAAATTTAAAATTTCAACTAAAGGATTATAGGTTAGTGTTGACATTTATTACTTATTTTGACATCACATAAACCATGCATTGAGATAAAGTTTCAATTTTATCATAAAAGTAATTGAAAATCAATTGAAGTGTTATTCTTTAGTTCATGTAATAGTTGTTGCTTGTTGTATTGTTACATTTAAAGTTTTCCCCCACAATATTCTTTTTTATTCCTAATATGTTATTTTAAAATTAATACGAATTATGATATTATTTAACATTTAACTTTAGAAAATAAATATTTTATGAGTATATATAGTTGTTATAATCTATTAAGATATTTTGAACTAATAATTATATACATATATATTATTTTTTAATAGATTGGACAAGGTACATATAGTAGTGTGTTTCGAGCTCGTGAAGTTGAAACTGGGAAGCTATTTGCTTTGAAAAAAGTGCGTTTTGACAATTTTCAACCTGAGAGTATTAGGTTTATGGCAAGAGAAATAACCATCCTTCGAAGGCTTGACCACCCAAACATCATGAAATTGGAGGGCATAATCACTTCTCGCCTATCAAACAGCATATACCTCGTATTTGAATACATGGAACATGATCTTGCCGGCCTAGTATCACGTCCTGAGATAGTATTCACCGAATCACAGGTTCGTTTACATCTTTCAACTATTTTTAAAACTCGTGTGTCGTTCCTAATATAAATTTGAATTAGGTTTACATTTGTGTGTAATGTTTCATTTCCATAGATAAAATGTTACATGAGGCAACTTTTAAGTGGACTCGAGCATTGTCATATGCGTGGTGTTATGCACAGAGACATCAAAGTATCAAATATCTTATTAAACAATGAAGGTGTTCTCAAGATAGGAGATTTTGGATTAGCAAATACAATTAGTACAAGTAACAAAAATCCTTTGACAAGTCGTGTCGTGACTTTGTGGTATCGTCCTCCTGAGCTATTGATGGGATCGACTAGCTATGGAGTGTCAGTAGATCTATGGAGTGTTGGTTGTGTATTTGCAGAACTTTTTCTTGGGAAGCCTATCCTTAAAGGAAGAACTGAGGTAATTTTAATAATTCATGTATGTTATGTATAATTTATCTTTAGTTTGAATATGTTTTTTTGTTTATAAACTATTCTCATAAATTGTATTTCTTGAGTGTATAGGTTGAACAATTGCACAAAATTTTTAAGTTGTGTGGTTCTCCACCTGAGGAGTTCTGGAAAAAGACCAAACTTCCTCATGCAACCATGTTTAAGCCTCAAACAAATTATGAAAGCTCTCTTCGAGAAAGATGTGCAGATTTTCCTGAAAGTGCTATAGACCTACTTGAGACTTTATTATCCATCGATGCAAGCAACCGAGGAACTTCCTCGTCTGCCTTAATGTCTGAGGTAAACATTTCATTGATTTGGACTTTTCTATAATGTATTCTTCATTTTTTAGAAAAATTCTTGTTTTAATCCTATATTGTAAGAAATAGTTGATGTTTTATGCATATGACTTCGTAATTATTTTGCTAGAAATGTTAATTTATTAGGATGTTTGTTTAATGTGGACCAATCATATATGACTAACTTGAATTTCTAATTTTCTTTTCTTTGTATATTCTTTATAGTACTTTAACACTAAGCCATACGCTTGTAACCCATCAAATCTCCCAAGATACCCACCAAGCAAAGAAATGGATGTAAAAGTTCAAGAAGATTCATCCAGGTACACTATTGTGGTATTTCTTGTTTATGAAAGGATAATTAGTCAGTTTGGTAGAATAAATATTGACATATTTCATTTTCAGTATAATAAAACAATATTGTCTTAGTATAAAAAAACTTTAATTCTATTAACTTTGTTTGAACTCCACTAGTGTTATTTAAACACATGTTTGATCTATAATAATTGTTACATATGTTTATTAAAAGAAAATACGACACTGATAAGCAATTAATCTTGAAGGAACTTTTAAATTTTGCTTTTGTAAATTTGAAATCCTTAGAGATTTTTTTCTAATACATGTTTAGTGTTAATTTTCGTTATAATATACACATGATAATTACTAAAGACAGAATACATGTTTAATTCAAACAAAATTCACAAAATTAAAAAAATTTATACTAAGATTTTAATTTTTTTATTGTATTAAAAATGAAATATGTAAATATTTGTTGTATTGAATTGATTATTTAATCTTCATAAAACATCTCATTTTTAGGACTAACTCTTGATCCTTACTCTTAGGAAAAAAATCGAAGGTAAAGTGAGAGAGGTTGCAACATCAAGAAGACAACCAAGACGAGCCACTAAACTTTTGCATGATCCAAACAATTTTGGTAAATCAAGTTCAAAAGAGGTACTATTTTTTCAATGGAATATTACTACACGGCTTAAATATCATCATTTTTACAATACTTATCTTGTGTTCTTTGTGTAGAACATGCAAAACACTTCTCAAAATGGGCATAAAGATGATGGTAAAACACATCTTACAAAAGGAAGAGGAGGAGGGATGTACAAAGATCATGCAAAGCCTGCCATGGATACCATGTCTGAGACCTCCCAAATGATGAATGTTGTTAATGGTAATGGATACAGTGTGCCAATACAAGTCTCAGGATCTACGAATGATTATACATGGGTCAAAAGAAGAAAACAAGATGCATCATCAACTCTATCGGATGGATCAAAAAGCAAAATTAGTGCACTAGATACCAACTTTGCCAAAGGAACATATGATTTATCTAACCAAAGGGTTTCCATGGATTTTGATCCTGCTGAATTGGTGAATGCTCAGGTAAACATTATCCCAACTAAATATTTTAAATTATTAAGTCACAAAACCTTCAAATTTACCATTGTTACTTAAATTAATCTTAAGGTGTCAATATAAGAAGCTTGAGTTTACGTTTAATATCGAGTAATAAAAATAAATTCATTATTTTAATTTTTTTGTTAAAGGTAATGTTAATCACTAATTTCTCATTATTATTAAATTTCTCCTATCAATTTCCTTCAAAAATACTCATTAATTACTACATGTATAATGTTATAATTGTCTTAGATGACAATCTCTAGATGACACACGAGTTTTATAATTTTGTTTTCTTGTTAGTTAAAAAAGTAAGTTAGATGTTAATTTCTATAGTGACAATGAACTTGAGTGTGCTAGCTAAATATTTGTGTATTCTATTTATATCAAATTAATTTATATGTTATATTTAACAGTTCTACAGGGTCGTAGAGAAAATGATGTACAACGTGCAATTCGTAAATCAAGGTTTGGAAGAGGTAAATAAACATTTATATTTTAAAATTTTCATACATACGAGAAAGAAAAGAAAAATGCTGTGTATGTGAAATAATTTGTATAATAAATTACAACAAATAACTAAATTAAAATGTAATAAATTATGGAGGGAATAGAGAAAAACAGAAAAAAAAACTATTTTGTACAAAATTTTACCTAAATTGTCTTATCTGTATAGTATATTTAAATAATGCACAAGAACGAAATTAAAAATAATAATAATAATGTTATAAAAATTGTTATATAAGTTGCATATATATAACACAATTAAAAGTAAAATAAAAGAAGTAACTTTTATATTTGGGATGAATAAAATTATTGTAAAAAATGACATTATAAGTGAACTAATGATGCAATTGTTGTTTACAGATAAATGAGATGAAGCAAGGATTGTGA

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