Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17557 LG4 37422014 37424135 transcription factor MYB16
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 37422031 synonymous_variant p.Leu402Leu
A/T 37422188 missense_variant p.Phe350Tyr
T/A 37422264 missense_variant p.Arg325Trp
T/C 37422275 missense_variant p.Gln321Arg
C/T 37422335 missense_variant p.Arg301Lys
T/A 37422542 missense_variant p.Lys232Met
C/T 37422602 missense_variant p.Arg212His
G/T 37422606 missense_variant p.Arg211Ser
C/T 37423100 intron_variant
G/A 37423189 intron_variant
G/A 37423271 intron_variant
G/T 37423374 intron_variant
C/T 37423598 intron_variant
C/T 37423850 missense_variant p.Val48Met
G/C 37423894 intron_variant
A/G 37423907 intron_variant
T/A 37423913 intron_variant
T/C 37423977 intron_variant
A/T 37423978 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17557.1
MGRSPCCDKVGLKKGPWTPEEDQKLLAYIEEHGHGSWRALPAKAGLQRCGKSCRLRWTNYLRPDIKRGKFSLQEEQTIIQLHALLGNRWSAIATHLPKRTDNEIKNYWNTHLKKRLTKMGIDPVTHKPKNDALLSSDGQSKTAANLSHMAQWESARLEAEARLVRESKLRSHSLQQQIGSSSTFASSSSASTSASVLNNNKPEAPPPPPPPPSRSSLDVLKAWNNGGWLKSSEGSGAIASTVGVSGDLESPTSTLSFSENAPPIMNAIGGENNNNNDNAMPMIEFVGSSGNSSSLVKEEGEQEWKGYDSSINTFSSGLHEFTMAMEGTWVHETLRTNGSHDDIVEEGFTNLLLKTNSEDPSLSSEGGGESNNGDGGSAGHSDFYEDNNNYWNSILNLVNSSPSNSPMF*


CDS Sequence:
>Vu_17557.1
ATGGGACGATCACCATGCTGCGACAAGGTAGGTTTAAAGAAAGGACCATGGACTCCGGAAGAAGATCAGAAGCTCTTAGCTTACATTGAAGAACATGGTCATGGAAGCTGGCGTGCCTTGCCAGCAAAAGCTGGGCTTCAGAGGTGTGGCAAGAGCTGTAGACTGAGATGGACCAATTATCTCAGACCTGATATTAAGAGAGGAAAGTTCAGTCTGCAAGAGGAACAAACCATCATTCAACTCCATGCCCTCTTAGGAAACAGGTGGTCGGCAATAGCCACACACTTGCCAAAGAGAACGGACAACGAGATCAAGAACTACTGGAACACACATCTTAAGAAAAGGTTAACAAAAATGGGAATTGACCCTGTCACACACAAACCCAAAAACGATGCACTTCTCTCCAGTGATGGTCAATCCAAAACCGCTGCAAACCTCAGCCACATGGCCCAGTGGGAAAGTGCTCGACTTGAAGCCGAAGCAAGACTAGTGAGAGAGTCAAAGCTACGTTCGCATTCACTTCAGCAACAAATTGGAAGTTCTTCTACATTTGCATCATCATCTTCTGCATCCACTTCAGCTTCAGTGCTCAACAATAATAAACCAGAAGCACCACCTCCGCCACCGCCCCCGCCGTCGCGGTCCTCCCTTGACGTCCTCAAGGCTTGGAACAACGGAGGTTGGTTGAAGTCCAGTGAAGGGAGTGGCGCCATTGCAAGCACGGTTGGGGTAAGTGGGGACCTTGAGTCTCCTACTTCTACGTTATCTTTCTCTGAGAATGCACCACCGATTATGAATGCGATTGGAGGAGAAAATAACAACAACAATGATAACGCAATGCCTATGATCGAGTTTGTGGGAAGTTCGGGTAATTCTTCTTCTCTTGTGAAAGAAGAGGGTGAGCAGGAATGGAAAGGTTACGATAGTTCTATCAACACTTTCAGTTCTGGTTTGCATGAGTTCACAATGGCCATGGAGGGCACGTGGGTCCACGAGACTCTCAGAACCAATGGCTCACATGATGACATTGTTGAAGAAGGCTTCACCAATCTTCTCCTTAAGACAAACTCGGAAGATCCAAGTTTGTCGTCGGAAGGTGGAGGAGAGTCTAACAATGGTGACGGTGGTAGCGCCGGTCACAGTGATTTTTACGAAGATAACAACAACTATTGGAACAGCATCCTTAATTTAGTGAATTCATCTCCTTCTAATTCTCCTATGTTCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_17557::LG4:37424135-37426135(-)
ACTAAGAAAACAACTTACTTTCTTAGGATGGAAATTATTTTCATGAAGTATTTTTTGAGTCTAAAAATAATTAGAAAAAACTAGTTCACTTCTTTCTATAAATTTGATAAGGATTTTTTCATTTTTAAAAAAGACTATTTTCAGTTTAAGTTTTTAAAATGAACAACGTCTCAATAAAGTTTAAATTTTTCAGCCTTTTCAACCTAGATTAAATTAAGTCAAAGGCAAATCAATTTAAAAACATTTTTGAATTACCAATTTGAAGTTTCCACTCTTTATTTTTTTTTCAGGCAAATCCATATGAAACTTTAGTGTGGACTATATATCATAATTAAGACTGATGTAAAGAGAATAATAATAAATAGAGTAATTGTAAAAAAAGTACTTCCCTACTGATATTGGTTGATATAGAAAAAGAAAAAACTGAAAAGGAATGGTATGATGAATAATTAAAAACTGGGCTTAGCCATGCCATAAATACAGCTAGATGACGTATCACTTAGAAATTATGGCTATAATAACTTTGGCATAGCTCATTGCTCTATGGCTTCAAAATTCTACCCAAAGTAAATTCATAAGAAAAGACAGTCCACTCCTTTCGTATCAATCTTTCCACCAATACATTTATATTTCTCAATATTTTTTATTTATATATAAATATGTCATACCAAGAATATTTTAATATAATAGCCATTATACATAAAGTATTTTATTAAATTACACTCCTTTAATTAAAATCATTTGTCTGTATTTGAATTCCTATTGCTAACGTGAAGCAGTTACTTTAAGTGAAATAAAGTAAACAAAATTGTTATATAAGCTCAATTTCTACATACTATCTTTATTTGAATTCTAATTATAATATGCTAGAATAATACTACACTGTATCTAGGTGATTTAGGTGATGAGTGTTGTTTCTTACATGTATTTTTCACTAAGATTTTAATTCTTGTAAATTTATTTGTGTAAATGAGTTATAATATTTCAAGTGTCACTCTTTAAACATGTTATTTTTTATTGAGAGAAAAAGAGTGAAATGAAGTTTAATTTTTTATATATAATTTTATCATTTTAAAATTATGTAAATAAGAAATATATAATTGGACAGAAAGATTTTACTGAAGGGGGTTCATGGTATATGTAAAAGTTCCATATTATATCATATATGATAATCTATAAATACTTTCATTTCATTTCTTACTAGCTGATTAGGAATCTGACTCATTTCTAGTCTTTTAGTTTTGATTGAAGGTTTATTTAAGTTATACTTTCGTATTATTTAAGAGTTGAAATTAAAGTAGTTTATAAAATTCTCATTTCCTAATCACCCACATCTATTTTAAGGACATATGGTGTAAAGAAGTAAAATTTGAGTTTAAGATTATACAATTCATAAATTACCCTAATAGTCAAAACATGTTTTTTTCTTTGTCATCTCAAAACTATTCCTAATTTACTAAATTATAAACTAATCTCACTTAAGTCCAACAAGTTTTCACATGTGATTGAAAAAGAGATTATCCACAGAATTATCAAAAACAATGACTTTAGATATTTAGCAACTATGACAATCTTTCACACACAACAATGATCCAACATAAAACTGTTTGTTAAACAAATCATTCTTAGATGTAAACGTACGGTGTCTAAATCCTAAAAATCACATGATTATTTTAATAGAAATTTTATGAGTAACATAACTACCAAAAAATAAAATAAAATTGATGAGTTGGTAGAGAAGGGTACTCTTGTAACGATATAGTCCACAAACATGTACCTTATAATTTAGTTTAGTTTATTATGCCATTTATGCCGCTGACCTTTCTTCCATGCCTATCTCTTCATTTATAATTAACTCCATCTCACTCTCTCTCTCCCTCTCTCTTCTCTCTTTCTCTCACTGATCTCTCTCACACCATAGTTTTCTTTCTTCCCTTCGTTGTGCTATATAAGTAAGAGCAAAAGCTACTACAGTCTTTAGTGCTTGTTTCCACTTGCAA


Gene Sequence:
>Vu_17557(-)
ATGGGACGATCACCATGCTGCGACAAGGTAGGTTTAAAGAAAGGACCATGGACTCCGGAAGAAGATCAGAAGCTCTTAGCTTACATTGAAGAACATGGTCATGGAAGCTGGCGTGCCTTGCCAGCAAAAGCTGGTACTTCACACTGTTTTTTTGGTGTAATATTGCTTATGTAGTGTGTAGCAACATGTGTAAGTACATGTTTGTGTAGTGTTGCAATGTAGATCATGTTGAAGTGAAACTCCTTGTGCTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTTTATAGGGCTTCAGAGGTGTGGCAAGAGCTGTAGACTGAGATGGACCAATTATCTCAGACCTGATATTAAGAGAGGAAAGTTCAGTCTGCAAGAGGAACAAACCATCATTCAACTCCATGCCCTCTTAGGAAACAGGTTTGTTTGGAATCTTTGTTTGTGCTATGTTGTTTTTGCAGTTTTGAAACCAAGTGTTTTTGCTCAGGCTTGAAATCTTAGGAAACTGTTTTGAATGAGTTTTTTCTTAGAAGCAAGGGTAACATTAAGAATGTTCAAAACTCAAGACCCATTATGGGTTTTTTTGAAGATGTGAAAGTGATGCATTGTTTTTCTAAATGACAGTGTGTTATAATGGATCATGTCACTGTATTTCACACACTGACCTCAACTTCATATTTTATTCTCTCATACTCTCTCCTCAGTAACTACATGAATCATTCATTCATTCATTCATTTTCCGTGTGGAGCTATAATTTCTTTTCTGTTCCTGTGCCCTTCCTGTGCAGCAGAATGTCTTAAATGCAATGACCTCTCAATTTCTTCACCCAACTATTCAACCCTCTCCCCCAACAAAAAAAATAAAAAATTAGACACTGTCCTCTGTGCCATTTCCATAAATTTTTCCCTGACATACAGGTTTATTCGAGGCCAATCTTAATTGCAAAACATATATGTCATACACATCTTCTGCCATAATCAAAATGGCATGTAGCCATCATCTATGTGATTATCTAATGCATACTACATACCCTTCTCGTTCTCTTTCACGTTTTTTATAGTGGTTAGTTAAAAAGAAGAAACAGTAATCTGATTTAGTAGTATTTTTGGAATACTGGTCTAGGGTTTAATTTAACGTTGTCTGCACTATGGTTGTGCTGTCTTTGTACTCAGGTGGTCGGCAATAGCCACACACTTGCCAAAGAGAACGGACAACGAGATCAAGAACTACTGGAACACACATCTTAAGAAAAGGTTAACAAAAATGGGAATTGACCCTGTCACACACAAACCCAAAAACGATGCACTTCTCTCCAGTGATGGTCAATCCAAAACCGCTGCAAACCTCAGCCACATGGCCCAGTGGGAAAGTGCTCGACTTGAAGCCGAAGCAAGACTAGTGAGAGAGTCAAAGCTACGTTCGCATTCACTTCAGCAACAAATTGGAAGTTCTTCTACATTTGCATCATCATCTTCTGCATCCACTTCAGCTTCAGTGCTCAACAATAATAAACCAGAAGCACCACCTCCGCCACCGCCCCCGCCGTCGCGGTCCTCCCTTGACGTCCTCAAGGCTTGGAACAACGGAGGTTGGTTGAAGTCCAGTGAAGGGAGTGGCGCCATTGCAAGCACGGTTGGGGTAAGTGGGGACCTTGAGTCTCCTACTTCTACGTTATCTTTCTCTGAGAATGCACCACCGATTATGAATGCGATTGGAGGAGAAAATAACAACAACAATGATAACGCAATGCCTATGATCGAGTTTGTGGGAAGTTCGGGTAATTCTTCTTCTCTTGTGAAAGAAGAGGGTGAGCAGGAATGGAAAGGTTACGATAGTTCTATCAACACTTTCAGTTCTGGTTTGCATGAGTTCACAATGGCCATGGAGGGCACGTGGGTCCACGAGACTCTCAGAACCAATGGCTCACATGATGACATTGTTGAAGAAGGCTTCACCAATCTTCTCCTTAAGACAAACTCGGAAGATCCAAGTTTGTCGTCGGAAGGTGGAGGAGAGTCTAACAATGGTGACGGTGGTAGCGCCGGTCACAGTGATTTTTACGAAGATAACAACAACTATTGGAACAGCATCCTTAATTTAGTGAATTCATCTCCTTCTAATTCTCCTATGTTCTGA