Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17517 LG4 36818007 36821209 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase NAK
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 36818032 missense_variant p.Gln445His
T/C 36818046 missense_variant p.Thr441Ala
G/A 36818070 missense_variant p.Pro433Ser
A/T 36818100 missense_variant p.Trp423Arg
A/G 36818195 missense_variant p.Phe391Ser
A/T 36818517 missense_variant p.Leu284Ile
T/C 36818560 upstream_gene_variant
A/T 36818569 upstream_gene_variant
T/A 36818938 intron_variant
T/A 36819336 missense_variant p.Asn201Tyr
A/C 36819357 missense_variant p.Ser194Ala
G/A 36819385 intron_variant
C/T 36819404 intron_variant
A/T 36819426 intron_variant
T/C 36819435 intron_variant
T/C 36819440 intron_variant
T/A 36819452 intron_variant
T/A 36819658 intron_variant
G/A 36819820 intron_variant
T/C 36819865 missense_variant p.Thr141Ala
T/A 36819907 missense_variant p.Ser127Cys
G/T 36819920 missense_variant p.Asn122Lys
T/C 36819922 missense_variant p.Asn122Asp
T/C 36819957 missense_variant p.Asp110Gly
T/G 36820021 missense_variant p.Thr89Pro
A/G 36820194 intron_variant
T/G 36820346 intron_variant
A/T 36820383 intron_variant
G/A 36820562 intron_variant
T/C 36820571 intron_variant
G/A 36820654 intron_variant
G/T 36820657 intron_variant
T/C 36820660 intron_variant
A/G 36820669 intron_variant
T/G 36821025 intron_variant
T/C 36821187 missense_variant p.Gln8Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17517.1
MKNKDVAQGAIEERSRFWKKLKTFLGCMLLSSKEEATSNKSKDGEGKNVRRDIVRHKRAKPSSTNEGQEFIATCSNLRRFTFHDIQIATQNFGCRNFLGRGGFGTVFKGWIDERGNSAATPGTRVPVAVKTLNPNGFQGHKQWLAEIKYLGELYHPNLVRLVGYCMEEDKRVLVYEYMCRGSLEKYLFQRGTVRLPWRIRIKIAMDAANGLTFLHEEAARAVIFRDFKTSNILLDKDFNAKLSDFGFAKDGPVGDKNHVSTEIMGTEGYIAPEYVLTGHLTSKSDVYSFGMVLLEMLTGRRAVDQMRPAKEKHLVDWLRPRIRRKENFHYVMDPRFEGQYPIKDAYRAMRLAVQCLRHDPSGRPLMSEVVGELKHLLARDDDDGMHSAPSISPSPSPSPSPSIPSSSLGRIHVGPSNHAAGANKYGLRTASEPNVPRRFQASPLGQDSPLFPPPS*


CDS Sequence:
>Vu_17517.1
ATGAAAAACAAAGATGTTGCTCAAGGTGCCATTGAAGAAAGATCAAGGTTTTGGAAGAAATTGAAGACTTTTCTAGGTTGCATGCTTCTCAGCTCAAAAGAGGAAGCAACCTCCAACAAAAGCAAAGATGGTGAAGGAAAAAATGTCAGAAGAGATATTGTTCGGCACAAAAGGGCAAAACCCTCATCCACCAACGAAGGGCAGGAGTTTATTGCAACTTGTTCCAATCTTCGGAGGTTCACTTTTCACGATATTCAGATTGCAACACAGAATTTTGGTTGCAGGAATTTTCTTGGTAGGGGAGGTTTTGGAACTGTGTTCAAAGGTTGGATTGATGAAAGAGGGAATTCTGCAGCAACACCTGGAACTAGGGTTCCAGTAGCAGTGAAGACTCTAAATCCAAATGGATTTCAAGGTCATAAACAATGGCTTGCTGAAATTAAATATCTGGGTGAACTCTATCATCCTAATCTAGTGAGATTGGTGGGTTATTGCATGGAGGAAGATAAAAGGGTACTCGTATACGAATACATGTGTCGAGGAAGCTTAGAGAAGTATCTGTTCCAGAGAGGAACTGTGCGACTTCCATGGCGTATCAGGATTAAAATTGCAATGGATGCTGCCAATGGTTTGACATTTTTGCACGAGGAAGCTGCACGGGCAGTGATTTTTCGAGATTTCAAGACATCCAATATCCTTTTGGATAAGGACTTCAATGCAAAACTTTCAGACTTTGGGTTTGCAAAAGATGGTCCAGTGGGAGATAAAAATCACGTGTCTACGGAGATTATGGGAACAGAAGGTTACATAGCCCCTGAGTATGTGTTGACAGGGCATCTTACATCGAAGAGTGACGTTTATAGCTTTGGGATGGTTCTCCTGGAAATGCTGACAGGAAGAAGAGCTGTGGATCAAATGAGGCCTGCAAAAGAGAAACACTTGGTGGATTGGTTGCGTCCTCGTATAAGGAGAAAAGAGAATTTTCATTACGTGATGGATCCTAGATTTGAAGGGCAGTATCCAATCAAAGATGCATATAGGGCAATGAGGTTGGCCGTTCAGTGTCTTCGGCATGATCCAAGTGGAAGACCACTGATGAGTGAAGTGGTTGGTGAGTTGAAGCATTTGCTGGCTCGTGATGATGATGATGGCATGCATTCTGCTCCCTCAATTTCACCTTCACCTTCTCCTTCACCTTCACCTTCAATCCCCTCATCCTCACTTGGCAGAATCCATGTCGGTCCCTCCAACCATGCCGCCGGTGCTAACAAGTATGGCCTTAGAACTGCTTCAGAACCCAACGTCCCACGGCGTTTTCAGGCCTCACCACTCGGCCAAGACAGCCCTCTCTTTCCACCTCCATCGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_17517::LG4:36821209-36823209(-)
CTTTTTAATATATTTATTATTGTTGATAAAAAAATTTATTTAAAATAATTTTATATTTTAAAACTTTAAAAAATAAAATTATCCTTTCCACCGCCTTAATGTTTACAAATAATTTAATATTTTATATTCAAGAAATTTTGGCGATTATTATCATTAAAAAATTTCCCATTCTCTACTCTTCTTCCAACAATGTTCCTCTTCACTCAACGTCATCTTATGAAACTGAATTTATGACAATTTTTTTTTGCATTTGAGAAGCATTAATTGCGTTTTTATGATTCTTTAAGTGTTTCATTCATTATTTCCATTTTCTCAAGTCATCTTTCTACTTTTTCATGCATAACGCCCAAAATCTCTTTTGGAAATCAGCGTTTCACTTGAATCAGTCAAAACAAATGCTCTACATATGCTCTCTCTAATATTGTTTAATAATTTTTCATCTAAACTGAGAAAAATGTTTAATTTTTCTTCGTTTAATATAATCCAAATTACATATTTTTTGGTTTTTATTTAAATTTAAATTTATGTGTTATTATAGTTAAAAATTACTTTAATATTGACTAGGAAATTGTTCAAATTTCTGTCTTCCAAATGATCTTGGATAATTTATTAAATTTTCTGCTTAACCGTGTAAACATTTATTAAATTTTCTGGTTTATTTTTCTTGAGCTTTAATATTTTTGACGAGTGTGTATCAGTTGTTTTTAGACTTTTTATTGTACTTTTCTATTATTTAACACTTTATTTGAGCACAGTTATATATTACTTCCGTTACACTTAAAATTTACGCTAATTAATAAAGTGTAATTTTTATTAATAATAAATGTTGTCTTAAAAATAATATATGTTGGAGAGTTACTTTTATCTTTAAAATGTGTCCTTTTTACCCTCTGAACATCTTAAAATTCCAATGAGGATAATTTATTATTCTCCATATCTCAGAAATAATGGCTGGTATTTAAGTTTTTTCAGATTAAAATTAACAATATTTATTAAAATAATTTTAGTACTAAAGTGAGTCCACCATTTTTCTCAACAAATTCAAGGACTACAAATTATAAAAAAAATTAATATATTTTATTTGGAGACAAATTAGAAAAAATAAATTTCATTTAAATTTGAAAACATCAATCAATTTGAAGACTATATATAAAACAGGGTTATTTTAAAACCGAAAGAGTGTTAATCAATGCAACAAGTTCATCAGACTTATTTTGATCTTAGAAGAATTATTCCTTTATTATATTTTACTTACTAAATATATATATATATATATATATATATATATATTGATCCTAATCGGAGATAAAAGATTGAGAAATATGTAGATATTAATGTCTATAGTAAAAAAGAAAACAGGTAATATTTTCTACTAAAAAATCTTGAAAAAAATTTCTTTCTCTATTCCTTATAATTTTAACAAAAACTTGTTCCTTTTTATTTATCATTTTTAAAATTTCAAGAAAACGTGATTTTCTTTTCAATTATACCCTTATTTTCGTGTTTATTGTTCCTTGAAAACTGTTTGTGTAGAAACAAATTAAAAGAAAAGTAAACTAAGTAACGTATTTAAAAATGGATTAAAAATAGAACAGTTAGATATTTTCTTTAATTTTGTGGGAAAAAAAAGAGAGTACCGAGTGGCCCTGAAATAATATGTCAGCATTAAATTCATCGTATATAATTTATTTATTTATTTAATATTATTAATTGGTAATAATAATAATAATAAATGTTTACACATTGACCTATATTAAAAGACGAAACATCCATTGCTAAGTACAGGTTCTATATAAACAAGCATTCCTTGCTCCTCTTTTTTTCACATCTCATATTAAGTTTTGAAGCATCACAAGATAGTTTTACACAAGCATTTCTATATCCAAGGTTTTCCTTTCATTCATCACAAAACCCTAGAATTTTCTCTTCTTCCTTGTCATCTTTAATAATTTTGTGCTAAAATTTGTGTGTGAAATTTTTTAAGGGTCTAAACTGAAAGT


Gene Sequence:
>Vu_17517(-)
ATGAAAAACAAAGATGTTGCTCAAGGTGCCATTGAAGAAAGATCAAGGTTTTGGAAGAAATTGAAGACTTTTCTAGGTTGCATGCTTCTCAGCTCAAAAGAGGAAGCAACCTCCAACAAAAGCAAAGATGGTGAAGGTATGTAACTTGTTGAACCATTCTTCTTAAAGTTCTCCCTTTTCCAATATTTGTCTTCTTATTACATTGTTTTATTTTTGACATTTATTAATTTTATTTCTTTTAGTTTTTTCTCTCTCGTACACTCTCAAAATCCTCAATATGCAATTGCATCTTTCACCCTTTTTCCTTTTTTTTTATCTATCTTTCCGATTCTCATTTTCTTATGTCCATTTACCTTAAATCAAAATCTATTTTAATTAATCAATCATATTAATTTGGATCTAAAACTCACTAGTTCTTATAAAATCGATTCCCTATAAGGTATGGTTTGTGTCTTCACATAAACTATAATTTGATCTTAAATTTTCATCGAATATAAAAATTGATGGGATCCGATAATGAATAGTATATTAATCCAAATATCATTTAAGATACACCCTTATGACTATATTAAGGTAAAAAAGTTTGAGTTTAATTTAATTTTATAAAATCAGTTCATTAAAATAATATCTTTATGATTAGGATTTTACATCAAGGTCATTGATTTATTGTCATATTTTTAATCCTTTTACATCCTTGAGACGTAGAATATTTGGAGAGAAGAAAAATAAAGTTAAAAATAGAAAATGAATGTAATAGATATGCATCTAGAAAAGGAAAAAAGAAATTTAAAATTACGAAAAAGATCCGGATTATAAATTTTGAAAATTGTTTTATTTTTCATTACATCTTTGGAGAAACCAAAACAAAAGATCGATTGCTTATGTTTATGGAATTAGTTGTTGATAAAATCGAAAAAGGGCTTTTTGTGGTTGAAAAAGAATACATTGTGTATGTTGCAAAATTGAATTAGACTTGTTAACGCGACTGGTTCGTGTACAATTTTAGGCTGTTGATTGAATTTTCTATGATGTTTTTTTGTTTTCTATGTAATCAACAGGAAAAAATGTCAGAAGAGATATTGTTCGGCACAAAAGGGCAAAACCCTCATCCACCAACGAAGGGCAGGAGTTTATTGCAACTTGTTCCAATCTTCGGAGGTTCACTTTTCACGATATTCAGATTGCAACACAGAATTTTGGTTGCAGGAATTTTCTTGGTAGGGGAGGTTTTGGAACTGTGTTCAAAGGTTGGATTGATGAAAGAGGGAATTCTGCAGCAACACCTGGAACTAGGGTTCCAGTAGCAGTGAAGACTCTAAATCCAAATGGATTTCAAGGTCATAAACAATGGCTTGTATGTGATCATCCTAAACCCTAATTTATGACTCACCATTTTAAGAAAACTACACTTACAATTTGTATCTTTTAAGGACTTGCTGTAAATGTTAACAAGACAAGAGTAATGAACACAACCACATGATACCAGAGAAGGTGTACAATTTGATAATTTCTGACTGTGTTTTTTAGTGTAAAAATTGAATCTTTTCACTGATCTGTGTTTGCAGGCTGAAATTAAATATCTGGGTGAACTCTATCATCCTAATCTAGTGAGATTGGTGGGTTATTGCATGGAGGAAGATAAAAGGGTACTCGTATACGAATACATGTGTCGAGGAAGCTTAGAGAAGTATCTGTTCCAGAGTATGTTGTAATTTTATTGAAATTTTGGTTCTAATATATCAATCAATGCAATTTTTAAGTCATTTTTTAAAATATAGTACCATTGTATGCTAGGGATTTAAAATGGAAATAACAAGAAATATTCTTATGTATCAGGAGGAACTGTGCGACTTCCATGGCGTATCAGGATTAAAATTGCAATGGATGCTGCCAATGGTTTGACATTTTTGCACGAGGAAGCTGCACGGGCAGTGATTTTTCGAGATTTCAAGACATCCAATATCCTTTTGGATAAGGTAAATAATTTTAACTTTGCATTCATAAATATTCAAATTTTAAATTTAAATATAAGTGTGTTTATTCAATTATATATATTATTAGAGAATTTAAGGGACTAATGTTTAATTATGGACTCTACATTGGGTTACGATTCTAAATATCTCTCGTAATATCATTGAGATGAATTAACTTATATCCGAAATATTGTTGATTTTGAAGTTTTATTTATCACAATTTTATCTTTAAAAGGAATGTAGGAATGTAGGAAGTAGAAAAAGAAAAAAATATTTCATCCGTCTTATAGGATATAATAGAAACCATAAATATATGTATAAATATATGAGATAATAACAACATCCATTATATAATTATAACCTAATATAGCAGAGTTATTCATATTCTATATGTAGTTTAGATTCCACTATCTTAATATAAACATCTGATCGGATTTCATTCACCATTTCAGGACTTCAATGCAAAACTTTCAGACTTTGGGTTTGCAAAAGATGGTCCAGTGGGAGATAAAAATCACGTGTCTACGGAGATTATGGGAACAGAAGGTTACATAGCCCCTGAGTATGTGTTGACAGGTTAGTATATTTTCAAACATCTCATCAATTTGTTATGAAAATGTTAAGGTACAAACTATATTAATATGAAGTTTGTGGTATCTTTTGATGGTTGAGATTAAGAATGTTTTTGACACAGGGCATCTTACATCGAAGAGTGACGTTTATAGCTTTGGGATGGTTCTCCTGGAAATGCTGACAGGAAGAAGAGCTGTGGATCAAATGAGGCCTGCAAAAGAGAAACACTTGGTGGATTGGTTGCGTCCTCGTATAAGGAGAAAAGAGAATTTTCATTACGTGATGGATCCTAGATTTGAAGGGCAGTATCCAATCAAAGATGCATATAGGGCAATGAGGTTGGCCGTTCAGTGTCTTCGGCATGATCCAAGTGGAAGACCACTGATGAGTGAAGTGGTTGGTGAGTTGAAGCATTTGCTGGCTCGTGATGATGATGATGGCATGCATTCTGCTCCCTCAATTTCACCTTCACCTTCTCCTTCACCTTCACCTTCAATCCCCTCATCCTCACTTGGCAGAATCCATGTCGGTCCCTCCAACCATGCCGCCGGTGCTAACAAGTATGGCCTTAGAACTGCTTCAGAACCCAACGTCCCACGGCGTTTTCAGGCCTCACCACTCGGCCAAGACAGCCCTCTCTTTCCACCTCCATCGTAA