Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17475 LG4 36237769 36239573 PREDICTED: transcription factor MYB35
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 36238006 missense_variant p.Cys259Tyr
G/T 36238205 missense_variant p.Leu193Ile
A/G 36238324 missense_variant p.Leu153Ser
C/A 36238332 missense_variant p.Trp150Cys
C/A 36238556 upstream_gene_variant
T/A 36239029 upstream_gene_variant
T/C 36239079 upstream_gene_variant
T/A 36239172 upstream_gene_variant
A/G 36239184 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17475.1
MGRPPCCDKSNVKRGLWTPEEDAKILAYVANHGTGNWTLVPKKAGLNRCGKSCRLRWTNYLRPDLKHDSFTPQEEELIINLHGAIGSRWSLIARRLPGRTDNDVKNYWNTKLRKKLMKMGIDPVTHKPVSQVLSDLGSISGFPNTTTTNQMAYVNKDLMKNNMAPTKTEPSGSNKSVVENTQEGQVHSWQHHIPYQVLTTENVQSQVFSETASSTSSSSSSNLTQLGSPQSYSCQTPQAQTAPHCSSFDWSEFLHSDSFVWSLNPSSLVQSEADLSINAKTNGHDKQGVAAVEGCCGGSMEYQIKKQCEGHSFVDGILDRDSELRAAFPELLDASFDY*


CDS Sequence:
>Vu_17475.1
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Promoter Sequence:
>Vu_17475::LG4:36239573-36241573(-)
TTACCATGAATAGAACAATATAAAGAATGGACTTTAATGAAGTGATAGTCTATGAGAACTGAAATGATATTATAAGTGTTTTGCTTAAGAGAAATAGGACAAAATAAGGATATAGTAATGAATAAAAATAAGCTAAAAATAGAGTGTAAAAGAAATAGACAAATATAATTCCTCGTAAGAAATTGAAATTGTTTTACGTGTAATTAAGTTTTAAGTTTATACATCAATTTTATCTAACTTTTAATTTATTGAATTCTCAAATATTTTATATTTTTTATTAAGTTTTTATTGTTTAATTTTTTTATTCAATAATTTATGTGATTTTTTTAGAAAAATAAAAACAGTTAAATTTTAAAATTTAATTAAAAAAATGAAAAAAAATTAAGTATTTAACAAATTAAAAAGAAAAGATTCAATTAAAAATATACAAATTTATCAAAGATTTAAAATTTGATTAATTCTATTTCTTATCACAACTCTTCAACTTTTTGGATTCTAAGAAAAAATAAATTATTTAAATAATTAATCTAATGTATAATTAATTGTTGTTATTATTACACTCTATCATAATTATGTTTTGTATATAAGAAAATGGCAACATATTATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTTATATATTGCATTTTTTTAATATTTATGAAAACAGTTTAATTTTGAGTTTAAGTGATGCCAAAACATTTAATTTATTTTAGAAAAACTTTTTTTTTTCATATAAAAATCAGGAAGTGACAAAATAAAATCAGTCATAATATGGATGGGATAGCTTTGATGAATAAAATTTAGGTTTAATCCTTTTCGACATCCCTATTTGTGTACGAATGTCTGAGATAGGTCCTAGTTTTCTAAAGTGTATCAAAATAGTCCTTAATTTTGAAAATTGATATCAATTGAGTCCTTCCCGTTAAGTTGGCTGGACGGCGTTAAAAAAATTGATGAGTGGGATGCTGAGATGACGAACGAACGCTCGTCCACCAGCGAACGAACGCTCGTCCACCAGTGAACGAACGCTCGTCGACCACCGAACGAACGGTCGTCCAGTGTGGAACGAACGGTCGTCCAGCGATAAGAGGTCGACGAGCGTTTGTTCGGTGGTGGACGAGCGTTCGTTCGTCATCTCAGCATCCCACTCATCAATTTTTTTAACGCCGTCCAGCCAACTTAACGGAAAGGACTCAATTGATATCAATTTTCAAAATTAAGGACCATTTTGATACATTTTAGAAAACGAGGACCTATCTCAGACATTCGTACACAAATAGGAATGTCGAAAAGATTAAACCTAAAATTTACTAGAAAGGATAAAAAAACCTTTTGTTAAGACTTTCCTCTTCTCTTTGGAACACAAAGATATACCAAATACATTTATGTGTATGTGATACAAATGGAAGTATGATTACATGATAGCATTGTATTCATGGTAGCTCACAGGTTCACTTAAACAGCATTTATGTAGAGTAGAATTTATTTTTCATAATTTAGTGGTAATGATGCTTACACAGGCTCTCTGAGAATGAATCTATCTAGTGACAGGGTCTATGTGTACTTTTTCATTATTGTTTTGTCTTAAGCAAAGATTTTGTACTATTAAGAGGCCAATCAACTATAAGATGAAAGAATTTGGATTGCATTACCAAATTAAATCAGTTAATGTTGTCAGTTCTAACCAAAGAGGTCATTCAAATTGCACCCGAAATAGATATTGCTTTTGGGAGAGGAAGGAATTGGGAAGGCACTTGCATTATGTTTCTGATGTCATACAAATGGTTTTTGTTTTAAATTTTTGTTTACAGAAAGATGAACATAATCATGCAATTGTTGTTATTAGGAGCCAATATTTGCATGCTTTTCTTGCCTCTTCATATCTTAAACATTAGCCCCTTTCACCACTTTAAAGTTACCCTTCAATGCATATTGCATCACCATTACATAATTCACTCTGCATTTCTGCTTTTTCTTCTGTCTCTCTTTTCACAAAAA


Gene Sequence:
>Vu_17475(-)
ATGGGAAGGCCTCCTTGTTGTGACAAATCCAATGTGAAAAGGGGTCTTTGGACTCCTGAGGAAGATGCTAAAATACTTGCCTATGTAGCCAATCATGGAACTGGAAACTGGACATTGGTTCCAAAGAAAGCAGGTTTCTTCTACCCTTTTCTTTCCAAACAATGTAGGAATAGGAATTTAGAGACATAACTATGTTATGATGCAACTTTACTCTCTTTTCTTTAATTGTTTGCAGGTCTGAATAGGTGTGGTAAAAGTTGCAGACTAAGATGGACCAACTATCTAAGACCTGACCTCAAGCATGATAGTTTTACTCCCCAAGAAGAAGAGCTCATTATTAACCTTCATGGCGCCATAGGAAGCAGGTATCTTCCACTCTATATATTTGCTAAAATGCTTCAATGGCCTCAGTGCATTCTAAAATTTCAGTTTAGTTTCTGTATAAAGAGCTTATCTGTCATCATTTTTTGTATTTTAAGTTTTTAACTACATGTATAATTAGAAGTCTGAGATAAGATTAATTTATAATATAGAATAAATACAAATTTTATTTTATAAGTTAATTTCATAAGATTAAATTAGACTTAAAACATACTTTTTAGCATGTATCAGAGTGTATCCTAACATAAGTTATTTCATCACGAGTTAAGTAAATTTCTTAACATGTCATTCACCTAATGATTTATTAAAGGGGATTTAATTTCTAAAATGATAATAGTTAATTCCAAGCTGTCTAATCACACTATAGGGTGCGATGCAATTTAGTAAATTCTGTTTTTATGATATAGCTATTAGCCTCACAAAGTAAGCAAAATTAGCATGACAAAACTTAATGCACTTGCTGGTATATGTTGCATGAGGAAAATATAAACTGTGTTGTCTTGGTTTATTGAGAGAATGAACTAACCATAAACTTTGACATGCATCACAAATGTGCTAACCATATAACCCCATTTTTTTCACTTTGCCTTTCTTTTAACCTTTTTTTTATTTAAAGGGAAAAAAAATCCGATCTCCGTATTTGTGACATCTAATCACATTTTCTTTTCAGATGGTCTTTAATTGCAAGAAGATTACCTGGGAGAACTGACAATGATGTGAAGAACTACTGGAACACAAAGCTAAGGAAGAAGCTTATGAAGATGGGAATTGATCCAGTGACTCATAAACCAGTATCACAAGTCCTCTCTGATTTGGGAAGCATCAGTGGCTTCCCAAACACCACCACCACTAACCAAATGGCTTATGTTAACAAGGATTTGATGAAGAACAACATGGCACCAACCAAAACTGAACCATCAGGTTCCAATAAGTCAGTGGTGGAGAACACACAAGAGGGTCAAGTTCACTCATGGCAACACCACATTCCTTACCAAGTCCTCACCACAGAAAATGTGCAATCTCAAGTCTTCAGTGAAACTGCATCCTCCACCTCATCCTCATCTTCTTCCAACCTCACCCAGTTAGGCTCACCACAGTCCTACTCTTGCCAAACCCCTCAGGCTCAAACTGCCCCTCATTGTTCCTCCTTTGATTGGAGTGAGTTTCTTCACAGTGACTCATTTGTGTGGTCACTGAACCCCTCAAGTCTGGTGCAAAGTGAAGCTGATCTTTCCATCAATGCCAAAACCAATGGCCATGACAAACAAGGAGTTGCAGCAGTTGAGGGTTGTTGTGGTGGAAGCATGGAATATCAAATTAAAAAGCAATGTGAAGGTCATTCATTTGTAGATGGTATTCTGGACAGGGATAGTGAGTTAAGAGCAGCATTTCCAGAACTTTTGGATGCTTCTTTTGACTACTAA