Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17469 LG4 36197476 36199299 PREDICTED: inactive LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase BIR2
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category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, negative regulation of defense response to bacterium, protein phosphorylation, regulation of defense response to fungus, protein phosphorylation, protein phosphorylation, negative regulation of defense response to bacterium, regulation of defense response to fungus, negative regulation of defense response to bacterium, protein phosphorylation, protein phosphorylation, regulation of defense response to fungus
Cellular Component   located in   plasma membrane, plasma membrane, plasma membrane, plasma membrane, chloroplast, chloroplast, cytosol, plasma membrane
Molecular Function   enables   kinase activity, protein binding, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 36197514 synonymous_variant p.Leu13Leu
G/T 36197560 stop_gained p.Glu29*
T/C 36197570 missense_variant p.Val32Ala
C/T 36197627 missense_variant p.Pro51Leu
T/C 36198027 synonymous_variant p.Asn184Asn
G/T 36198029 missense_variant p.Arg185Ile
T/A 36198056 missense_variant p.Phe194Tyr
A/G 36198106 missense_variant p.Ser211Gly
G/A 36198714 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17469.1
MDHSNTFSSSFLLLTLLGFHVFLASSQVEDDVKCLSGIKEAVSDPQGHLSPWRFENTTVGFICDFVGVTCWNQRENRVLSLDFQDFKLSGRIPEALQYCGKSLQRLNLASNSFSSEIPHEICKWMPFLVALDLSGNQLSGPIPPTLVNCSYLNELMLSDNQLSGSIPFELGSLSRLKKFSVANNRLSGTIPEFFHGFEREGFEGNSGLCGSPLGSKCGGMSKKNLAIIIAAGVFGAAASLLLAFGLWWWYHLGGKKKKKGYGVGSSVGAAGDWALRLRGYKLVQVSLFQKPIVKVKLGDLMAATNNFSGQNVLFATRTGTTYKADLPDGSTLAVKRLSACRIGEKQFGMEMNRLGQVRHPNLAPLLGFVNGDLGEIGYIAPEYPSTLVASLKGDVYGFGVLLLELVTGQKPLDVSNGDEEFKGSLVDWVNMHSSLGRIKDCIDKAICGRGHDEEILQFLKIALNCVVSRPKDRWSMYQVYHSLKGLSKDQSFFEHDDDFPLIFGKPENEARSS*


CDS Sequence:
>Vu_17469.1
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Promoter Sequence:
>Vu_17469::LG4:36195476-36197476(+)
GTTTCAGAAAGTTGAAGAAGATGGTTGCATGCAGAGAGTGGCGTGAATTTTAAAAACTAAGTTTTTCTTCTACACTCAAAACCGAATGGTCACTCAGCTACTCACATCTGTCTTCCACTTTCGGATTTCCAGATCCCCTTTACTTGACACTTGGCTTCTACTACTTGAGATTTTTTAGTGGGTTTTAATGAGTTCTGACAATATAATTACATGACATTATTCTAATCCCACTTGATTATAATTTCTTTAATATAGAAAAAATTTCTCAAATATTTATAGTGTTATAAATATATATGGTTACTATAATTATATTACAATAGTTATAAAAAATTAAATCCATGACTTTCTTAGAAGAAAATGACCTAAATAAAACAAAGTTTAAAAATATGTGAAAAAAAAAACACATAATGGTATAGAGAAAAAAACATAATTAAACTACTATTTTTAATAATTTATTTATGTAAATATAAATAATAAATCACATACTTTTTTTCCCCTCACATTCGTATTAATGCATGTTAGCTAGGTCTGGACCTATGGCTGTTAAATTGAGTCCGTCCAATTTATTGATTCATTGTAGGCCAACAACACACTTTTGAGTTCGCCTAGGTTAGGTCTATTTAATGTTAGACTATAATTTATTCATGGGTAATTTTTTAAAAAATATACCTGAATAACAAAATAAGTTAAAAAAACACGTTATTTAACAACTTAATAAAATAAATTTAGTGAATGCAATATAAATTAAAAATTTAGATAGATTATCACTTGTACCATAAAATGGGGAAAAAATATATAAAATACAGTAATGCAAATAAGATAGATCTTAAATTGTAATGATAAATAAATGTACGTTAGACATTTAAAGCCAACTAGTCCACTCTATTATTGATAAGTCTAACTTAAATAATATTACAAGTTTAATGATTATGAGCAGTATACAAACTGTTATTTTATCATTTCATCAAAATTATGGTTAATATAATTTTTAAGATAATTAGTAAAATTTTTACAAACTTATCAAATGTCATGATTTATATTTAAATAATTGTATAAAACCATTTAATTACAAATAAATTACACACCAATATATACATTTTCTAAAAACATTGTTAAATAACATCAGGGTAAATTTAACACGAGACAATGTAAAAAAAATCGAGCTAAAAAGCAAACAAATATTAAGATCTTACAAAATTTTGATTCGATGAAAACTCAAGAAGAGATAATACGTCATTTACCATCTTAATCCGTGTTCAACATAAATCTAACACAAGACAAAATTCATATGTAACATGCCTTAAAAAGAACCATTGCATTATAAAATGAAGTTATACAACAAGATATATAGATTTGATGAAAAACTAAATAAGAAAATAATATTAAATCACATTAAACACAAATCTAGCACAAGACACAACATGAAGTAACGTTTAACGTTAAATCCTCGTTACCTTATTAATATATGTTCACATTTAATACCTAGTTGTGCATCAAACCAAATTACCTTAGAAAATGTATGTAGTGAGATTTGGCAACTGATTTTATATGCTTTTGGAAAAAAGACAAATAAATGAGAATGAGTTAAATCTAAAGAGAAGATGGTGCAGTTAAATCTGTTGTTTATAATAAATTGTAATGGTTTAGAGAGGATTTAAGTAACATTTATGTTAATAAATTTATCTATAAACAAAACTAAACCATTGGTATTCATTGATAATGGAAGAAAACCACAGTCAAACAACCTCTCCCAATCAGCATCTTCAGTCAAAGAAGCTCTTTTCAATCACCAAATCTCACTGTGTATGCATACACAGCTCCAAAACAACACCTACAATTTCTTTTTTAACAATCTTCCACCCATTTATCTCTCTCTGCACTTTTTATCTCTGCATTTTCTCACACCCCACAAGTCAATGGCACCATTCCAACTGTGTTAGACCAAACCCCACCATAAAAATCAAACCTTTCACCCACCCCACAACCCCCTTTCCCCTCCA


Gene Sequence:
>Vu_17469(+)
ATGGATCACAGCAACACGTTTTCCTCTTCGTTCCTTCTGCTAACCCTGTTGGGGTTTCACGTGTTCCTCGCTTCGTCGCAGGTCGAGGACGATGTCAAATGTCTCAGTGGCATCAAGGAAGCTGTTTCGGATCCGCAGGGCCACCTTTCCCCGTGGCGGTTCGAGAACACCACCGTGGGTTTCATCTGCGACTTCGTGGGTGTGACTTGCTGGAACCAAAGGGAGAACCGGGTCTTGAGTTTGGACTTCCAAGATTTCAAACTTTCGGGTCGGATCCCCGAGGCTTTGCAGTACTGTGGGAAGAGCCTCCAAAGGTTGAATCTTGCTTCAAATTCTTTCTCCTCCGAGATCCCGCACGAGATCTGCAAGTGGATGCCGTTTTTGGTTGCTCTAGATTTGTCTGGTAACCAACTCTCTGGGCCTATTCCTCCCACACTTGTGAATTGTTCATATTTGAATGAGTTGATGTTGTCGGATAACCAGCTCTCTGGGTCAATCCCCTTTGAGCTGGGGAGTTTGAGTAGGCTCAAGAAGTTTTCTGTGGCCAATAATAGACTTAGTGGGACAATTCCTGAGTTTTTCCATGGGTTTGAAAGGGAGGGTTTTGAGGGGAACAGTGGGTTATGTGGGAGTCCTCTCGGATCCAAGTGTGGTGGGATGAGTAAGAAGAACCTTGCTATTATCATTGCTGCTGGGGTGTTTGGCGCTGCTGCTTCATTGTTGCTGGCTTTTGGCCTGTGGTGGTGGTACCATTTGGGTGGGAAGAAGAAGAAGAAGGGATATGGGGTTGGTTCTAGCGTGGGTGCTGCTGGTGATTGGGCTTTGAGGCTAAGAGGGTATAAGCTTGTGCAAGTTAGTCTCTTTCAGAAGCCTATTGTGAAGGTGAAGTTGGGGGATTTGATGGCTGCTACCAATAATTTCAGTGGGCAGAATGTTCTTTTTGCGACAAGAACAGGGACAACGTACAAGGCTGATCTCCCAGATGGTTCCACGCTAGCAGTGAAGCGGTTGAGTGCGTGTAGGATTGGGGAGAAGCAGTTTGGGATGGAGATGAACCGGTTGGGGCAGGTTAGGCACCCAAATTTGGCTCCTCTGTTGGGGTACTGTGTGGTGGAGGAGGAGAAGTTGTTGGTTTACAAGCACATGTCTAATGGAACTTTGTATTCCTTGTTGCACAAGAATGGTGGGGTGCTGGATTGGTTGATGAGGTTCAGGATTGGGTTAGGAGCTGCAAGGGGGCTTGCATGGCTGCACCATGGCTGCCACCCTCCCATTATACAGCAGAACATTTGCTCCAATGTGATTCTTGTTGATGAGGAGTTTGATGCTCGGTTGATGGACTTTGGGCTAGCCAGGCTCATGGCTTCAGACTCAAATGGTAGTTTTGTGAATGGAGATTTGGGGGAGATTGGTTACATAGCCCCAGAGTATCCAAGTACTTTGGTTGCTTCATTGAAAGGGGATGTGTATGGTTTTGGTGTTTTGCTTTTGGAGTTGGTGACAGGGCAAAAGCCACTTGATGTTAGCAATGGGGATGAAGAGTTCAAGGGTAGCTTGGTGGATTGGGTGAACATGCATTCTAGTTTGGGAAGGATCAAGGATTGCATTGATAAAGCCATATGTGGAAGGGGGCATGATGAGGAGATTCTTCAGTTTCTGAAAATTGCTTTGAATTGTGTGGTTTCACGCCCCAAAGATAGGTGGTCTATGTATCAGGTTTATCATTCCTTAAAGGGCTTATCCAAAGATCAGAGTTTCTTTGAACATGATGATGATTTTCCCTTGATCTTTGGTAAGCCAGAAAACGAGGCGCGTAGTAGTTGA