Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17343 LG4 34502682 34505433 PREDICTED: transcription factor MYB98-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 34503104 upstream_gene_variant
G/T 34503225 upstream_gene_variant
C/T 34503263 upstream_gene_variant
A/T 34503408 splice_region_variant&intron_variant
A/G 34503770 upstream_gene_variant
C/A 34503807 upstream_gene_variant
G/T 34503845 upstream_gene_variant
G/T 34503867 upstream_gene_variant
T/C 34504094 upstream_gene_variant
A/C 34504104 upstream_gene_variant
A/T 34504151 upstream_gene_variant
A/G 34504154 upstream_gene_variant
C/A 34504155 upstream_gene_variant
T/A 34504872 missense_variant p.Thr188Ser
T/C 34504888 missense_variant p.Ile182Met
G/A 34504948 synonymous_variant p.Thr162Thr
T/A 34504972 synonymous_variant p.Ser154Ser
A/C 34505162 missense_variant p.Met91Arg
A/T 34505167 stop_gained p.Cys89*
G/T 34505313 missense_variant p.Leu41Met
T/C 34505316 missense_variant p.Ile40Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17343.1
MEFDPSFQGQLQHPFLSTHFPTNPNMMPQIQTMFPSQSPILIPSSPPPPIMFHPNNTFHHIQDHTFGIPTQNPNFLFEGPLKPTTTPFCGMLTPSLGSSIGGFANVSHHHPMMLPPPNNNNALHGQHEGKVIWDFSQKTMIHPSYASSSSNSPSPLSFPNITQYKWKSNQKIKMKKDTNDLIIKGWWTPEEDRNGPKLQNFYPEGLGSNVEKDVSTASQSERVYKSSRFLSKESWTLEEDMILMKVHQEIGNKWSEIAKRLPGRTENNIKNHWNGIKRRQDYKRNNNKNNDNPNNYDESMLHAYIKRVTVTEEAARVQKKSVSKNNKKDQCSYNMLDGNTNLARNVGI*


CDS Sequence:
>Vu_17343.1
ATGGAGTTTGATCCAAGCTTCCAAGGGCAACTACAACACCCATTCCTTTCAACTCATTTCCCCACAAACCCTAACATGATGCCACAAATCCAAACCATGTTTCCCTCACAAAGCCCTATTCTGATTCCATCATCACCACCACCACCCATCATGTTTCATCCCAACAACACTTTCCACCATATTCAAGATCACACCTTTGGGATACCTACCCAAAACCCTAACTTTTTGTTTGAGGGTCCTTTAAAACCCACCACAACTCCTTTTTGTGGGATGTTAACACCTTCTTTAGGGTCTTCCATAGGAGGTTTTGCCAATGTTTCCCATCACCACCCTATGATGTTGCCACCACCAAACAACAACAATGCTTTGCATGGCCAACATGAAGGCAAAGTCATATGGGATTTCTCTCAAAAAACCATGATTCATCCATCTTATGCTTCTTCTTCTTCCAACTCACCTTCACCTCTTTCTTTTCCTAATATTACCCAATACAAATGGAAAAGTAATCAAAAGATAAAGATGAAAAAAGATACTAATGATCTCATAATCAAAGGGTGGTGGACTCCTGAAGAAGACAGAAATGGACCCAAATTGCAAAATTTCTACCCGGAAGGATTGGGAAGCAATGTCGAGAAAGATGTTTCAACAGCGAGTCAAAGTGAACGAGTTTACAAGTCCAGTCGATTCTTGTCGAAGGAATCATGGACCCTGGAAGAAGACATGATTCTGATGAAAGTTCACCAAGAAATTGGAAACAAATGGTCTGAAATTGCAAAAAGATTACCTGGGAGAACTGAGAACAACATAAAAAACCATTGGAATGGTATCAAGCGTCGGCAAGACTATAAAAGGAACAACAACAAGAACAATGACAACCCTAATAATTACGATGAATCAATGCTCCATGCATACATCAAAAGGGTCACTGTTACTGAAGAAGCTGCAAGAGTTCAGAAGAAATCTGTCAGCAAGAATAATAAGAAGGATCAATGTTCATATAACATGCTTGATGGAAATACCAATTTAGCTAGGAATGTGGGTATATGA


Promoter Sequence:
>Vu_17343::LG4:34505433-34507433(-)
ATTTTAATATGCAATGACTTCATAATGAATAATGTATTAAATGTAAAAGGGAACATTAAATAAGTCAAGAAAAAGTGTTATCATTTTAAGGAGTCAGTTACTTGAAGTATATATTATGTCTCTTAATCTTCTATTTTATTTTAATAACTATATATATTAACGGATCATAAATGCATATTAATTATTTTTCACATAAAAATAATATTTTTTCTCTTAAATGTGTCTTATCAAGATGTTAAATTATCTCATTTTATTTATTAATATATATTATAATATATTGAAAGCAATTATCTTTTCTTATTGTTATTAATATATAATAATTGTTAAAATAATAATAATAATATAATAAACATATTATATTAATTGATATGCACATTTTGTAGGATAATTATCTTGGAATTATTTCATATTAAAAAAATTTCACGAGAGAAGTGTGAGTGTTTTCTTATGAGAGATAATTAATATACATCAATGATATATTAATATATGAGTTGTTAGTCTAAAATAAAATATTAAAATTGAAAGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATACATACACTTGATTTTACATTTTTACCAAAACCATAATAAAAATATTTGTGGTTTGGAACTTTATTAAAAAGTCTCTTAACTTTTCTTAAGCGATACTTTTCTGAATTTAAAGGGTCTTACCTTTGATTTTTTCCAAAAGAATTTTGCTAAAAAATGGTGAAAATGAAAAAAAAAATCTTATGCAACATACAATGTTAATTAGCTTCTTAGAAATACAATTTTTTTAATGATAGAGTTAGAAAATTTTTAAATGAAAAAAAAACGTAAATATAATATATGATATCATAGAAAGAGAAATTATCCCCACAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGCAAACAATAAAAAGTATTAATGGAGTGTTTATGAATTATTTATTACTCTAATATAAAACAAATGGGAAAATATAACCTTCTTTTCTTTTTAGAAGTAGGAAAATGTAGAATGTCAACCGTCATAGTAACTATGAAACATAGCCGTAGAAAATTTTCACATTTTCGTTTACTATTTATTTTTCCATTTCTTCTTATCCCTACTTTATAATTTCTGTCATGTTTTAAAATATTTTGATTTAACTTTTATTTTCAAAATTAGATGATTGGAGATAATTTCCAACAAAATAATGTTAAATTACATCAAATATAAGTAAATATAAATTTTATCTTACAAAGATGGTTTTATGAAACTAAATTTAGTTTAAATTCACATAACTCATTTTCACAAATTTTTTTGAATTTATTGGATCACCCACAAAGTCCTATGCTTGAGATATTAGTCCTTGATGTGAGAAAATAATGTTAAAAATCAGGCATGGGTCAAATAAAAGATCGCGTTATAGTAGTAGAAACTTTATTTTATAATTTTGTTTTGTTTGATTAAGTTAATGAATTTTAAACCTAACTTTACATGTCAAAATTAGCTCGTGTGAAACTAAATATTAATAGACGTAATAATAAATACAATAAACACCAAATTTGATTAAGATATATATAACTCATGACTTTAAAACAATATTAAAAAATAACATTAAGTTTAACTCAATTTTATAAACTAATTTGTAAGATGAGAATTATACTAACTATCATATTCTAATCTTATTTCTAATCGATGTAAGACTTTCAACAACATTTACTCTCTTAATTTGTATTTTTTTTTAATTTATTGTTTTACAATTTCAAAAATACATTTATTAATTTTTCCAATTATTCTTTTATGTATATTTTCATTTAACAAGGATGGATATCCTTTATAATTTCTCAACTTTCTGAAAAGCAAAATCTATAATTATAAGATACGTATTCCCCCACATCACATTCAACATATTCTACCTTCTCTCTACCTCTCTTCTCCATAAGTGACTAAATTGTTGAGCTTTTCTGC


Gene Sequence:
>Vu_17343(-)
ATGGAGTTTGATCCAAGCTTCCAAGGGCAACTACAACACCCATTCCTTTCAACTCATTTCCCCACAAACCCTAACATGATGCCACAAATCCAAACCATGTTTCCCTCACAAAGCCCTATTCTGATTCCATCATCACCACCACCACCCATCATGTTTCATCCCAACAACACTTTCCACCATATTCAAGATCACACCTTTGGGATACCTACCCAAAACCCTAACTTTTTGTTTGAGGGTCCTTTAAAACCCACCACAACTCCTTTTTGTGGGATGTTAACACCTTCTTTAGGGTCTTCCATAGGAGGTTTTGCCAATGTTTCCCATCACCACCCTATGATGTTGCCACCACCAAACAACAACAATGCTTTGCATGGCCAACATGAAGGCAAAGTCATATGGGATTTCTCTCAAAAAACCATGATTCATCCATCTTATGCTTCTTCTTCTTCCAACTCACCTTCACCTCTTTCTTTTCCTAATATTACCCAATACAAATGGAAAAGTAATCAAAAGATAAAGATGAAAAAAGATACTAATGATCTCATAATCAAAGGGTGGTGGACTCCTGAAGAAGACAGGTATAAATAAATACAAACATATATTTTGTAATCTTGTGTGTGTATTTACATTTATTTATGTTTGAAATTTTGTAATATTTTTGTTTTTTTTTTTATGTTTTACAATGCAAAAACAAGTCAATAATTAGTGGCTAAATTTAGTGAAAAGTTATTAATTATGGGACCACAATTTTTATTGTGTTTGTTTACTAAAAAGACAAAGAAATTGTATTGAGAGGATGAACTTTGAGTTCATTTAAGACTTTTTTTAATGATAGAAGATCATGAATTTTAATTAATTAAAGTCTGTTGTTTTTTACAGTAGTCTTGTGGAATTGGTGAATGAATTTGGGTTGAAGAAATGGACCCAAATTGCAAAATTTCTACCCGGAAGGATTGGGAAGCAATGTCGAGAAAGATGGTACAACCATCTTCAGCCAAACATTAAGGTCTCTTCTTTTTCCATTTTTATTTCTCATATATACATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACTTCCCATCTTTTTTGTGAATCATAACATCAAAGTTTGAACTTAATTATATAAAAATAGGACATGTATTATGTAATAAATTACACTAATTAAACATTCAATTAATTCATATTAATTTGTGTCAAAGATTGAAAAATTATGCAACTAAATTAGTTCATTAGATGGTTCTCTCTCTCTTCATAGTGTATATTGGAGATGAATGTCATAGAGTTAATTGAATTATGAATTTATTTATATTCAAATCATATTATGTTACTAATACGAATATATTTATTCACAATACTGAAAAAAGTTTTGTAATTAATTTTTTATATATAAAAATGACATTTTATTGAGTTACTTTTATTAAATTTATTTGTAATTTATAGTAGTCTATAACCCTACAACCTAAACTGTTCAGGTGAGGTAATATATGACTTGAAATTTTTATCACATTTATTTAAACACATAAGCTAATTAGATATTAAATTTAACCCTAGAACCTTAATTGTTTTGTCATTTATATTTTCATTGTTTACAATAATTAAATTAGATTTATATTTTAAAATTTAATTTAGTTGTAATATGAAGTTTATAGATATCTACTCGTACATCATGTATTTCAATAAAAAAGAATTAAGGATAAAATATGTAAAGTTCAAAATAAATTCCCTAGAATATTTTTTCTTATTTTTCTCTAATTTTCGAATGCACCAAAACTAAATTTAAGATATTTTAAAAGGACTAAAATCACATTTTTTCAAATAAATAATATTTTATAAATAAAGGTTATTTAATAATTTCTTTATGAAATTTTATATAAATATTTCATTTCTTTGTTGGTTTTGTTAATATACATGGTATTTTTCTCTTTTAGTTTCAACAGCGAGTCAAAGTGAACGAGTTTACAAGTCCAGTCGATTCTTGTCGGTTTTGAAAATCATTTAATATAACATTTTTTTTTTCAGTTCTTGATCGTTATTAGTATTTTTATTTAAGAATATATTTCTTATGTGACTTTTATTCATATTTGATATACTTTGATATGTAGACCCCAATTAAAAAAAAGCCAAATTCGTGATAATATTTTTATATAAAATGTTATTTAAATATTTCATTCGTTTCTTACAATTTTAAAAATTTATTTATCATTCTTAAATAAATTCTTATCAAAGATTATGCAACACAACTTCATTAATCCATGTGAATTATCAAATAAAACATGATTATTCTATTCATTCTGTACATAATTAATTTGAAGAACATGTATCACATAACTCTTTCTGAATTAACTAAATTGTTCAGAAGGAATCATGGACCCTGGAAGAAGACATGATTCTGATGAAAGTTCACCAAGAAATTGGAAACAAATGGTCTGAAATTGCAAAAAGATTACCTGGGAGAACTGAGAACAACATAAAAAACCATTGGAATGGTATCAAGCGTCGGCAAGACTATAAAAGGAACAACAACAAGAACAATGACAACCCTAATAATTACGATGAATCAATGCTCCATGCATACATCAAAAGGGTCACTGTTACTGAAGAAGCTGCAAGAGTTCAGAAGAAATCTGTCAGCAAGAATAATAAGAAGGATCAATGTTCATATAACATGCTTGATGGAAATACCAATTTAGCTAGGAATGTGGGTATATGA