Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17342 LG4 34497732 34499379 PREDICTED: myb-like protein Q
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 34497741 missense_variant p.Leu278Phe
C/G 34497789 missense_variant p.Lys262Asn
C/G 34497812 missense_variant p.Val255Leu
C/G 34497818 missense_variant p.Glu253Gln
G/C 34497870 missense_variant p.His235Gln
T/G 34497923 synonymous_variant p.Arg218Arg
G/A,* 34498046 splice_region_variant&intron_variant
T/G,* 34498056 downstream_gene_variant
C/*,A 34498059 downstream_gene_variant
T/C,* 34498208 downstream_gene_variant
T/A 34498233 downstream_gene_variant
G/C 34498252 downstream_gene_variant
A/T 34498277 downstream_gene_variant
G/C 34498289 downstream_gene_variant
A/G 34498328 downstream_gene_variant
T/C 34498353 downstream_gene_variant
A/G 34498620 downstream_gene_variant
A/G 34498634 downstream_gene_variant
T/C 34498635 downstream_gene_variant
A/T 34498642 downstream_gene_variant
T/C 34498743 missense_variant p.Lys152Arg
A/G 34498805 downstream_gene_variant
G/A 34498823 downstream_gene_variant
T/*,C 34498910 downstream_gene_variant
A/T 34498925 downstream_gene_variant
A/T 34498938 downstream_gene_variant
T/C 34498955 downstream_gene_variant
A/C 34498963 downstream_gene_variant
G/A 34499259 missense_variant p.His41Tyr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17342.1
MNKNTNMNMNMSVCNPTSMMEARSNPVTTPFYGGFANDHCHHSVTLEPNKTVMDALHGNQKNTVICKFSQKTMSAHPSQASCSKSSPLSFSLFNNCELEMMSEFHWDNNQNAKLKNDTNIANHNIIKGQWTPEEDRALMELVSQFGPKKWTQIARSLHGRIGKQCRERWKNHLQPNIRKGSWSLEEDMILIKGHQEFGRKWSKIAKRLSGRTENDIKNRWNATIRRQNCNKNSKAHYKGSILHAYVKWVTATEEKVLRKPSDKKNKNVFGCTCDELALLLS*


CDS Sequence:
>Vu_17342.1
ATGAACAAGAACACGAACATGAACATGAACATGTCTGTTTGCAACCCTACCTCTATGATGGAGGCTCGTTCCAACCCTGTTACCACCCCTTTCTATGGAGGCTTTGCTAATGATCACTGTCACCATTCTGTGACGTTGGAACCAAACAAAACTGTCATGGATGCTTTGCATGGCAACCAAAAAAACACAGTCATATGTAAATTTTCACAGAAAACCATGTCGGCTCATCCATCTCAAGCTTCATGTTCCAAATCATCACCATTATCTTTTTCTCTCTTTAATAACTGTGAATTAGAGATGATGAGTGAATTTCACTGGGACAATAATCAAAATGCAAAGCTCAAAAATGATACCAACATTGCTAATCATAACATAATCAAAGGGCAATGGACTCCTGAAGAAGATAGAGCTCTTATGGAATTGGTGAGTCAATTCGGACCCAAGAAATGGACACAAATTGCGAGATCACTACATGGCAGAATTGGGAAGCAATGTCGAGAAAGATGGAAAAACCATCTTCAGCCAAACATTAGGAAAGGATCATGGAGCTTGGAGGAAGACATGATTTTGATCAAAGGGCACCAAGAATTTGGAAGAAAATGGTCAAAGATTGCAAAGAGATTGAGTGGTAGGACTGAGAATGACATCAAGAACAGGTGGAATGCAACCATCCGACGCCAAAACTGCAACAAGAACAGTAAAGCTCACTACAAAGGCTCAATCCTCCATGCCTATGTTAAATGGGTCACTGCAACTGAAGAAAAAGTTCTCAGAAAACCCTCAGACAAGAAGAATAAAAATGTCTTTGGATGCACTTGTGATGAGCTAGCTCTTTTGTTGAGCTAG


Promoter Sequence:
>Vu_17342::LG4:34499379-34501379(-)
AAAACCACACATTACATTTTCCAACATATATACAAAAAGATGCTTCCATTATTATGTATGTCCTTAAATAATGTGTTTTTTTTAGAGATACGAACTTTATTCAAGTTGCTTTTAAGACTTATTAATTATACCTTACATAATACATATTTTTTGTGTGTTTATTGTGGTTTGATATAATGGTTTTTCCAAAATCCATTCTAGATTTAATTTAGATATAATAAATTGGATTGAATTTATAATTTCATTTGAACTAGATTAAATAGATTTAAAAAACTTTAAGTTTAATTTAAATTAGATTACTTTAATTTTGTAAATTAAATTAAATTCTATGAGATAAATTTTATATATATAATTATTAGGTTTATTAGATATGGACAAAGTCGATCTTCGGTCAGAGTTGACTCGTACCAACTTTTGACTAGAGCCAACTTGTGCTAATCTTTGGTTAAGGTTGACTTGGATCATCCTTTAATTGGGGCCAACTTGACTTATCTATGATTGGGATCAATTTGAACCAATCTTCGACTAAGATCAACCTAGTTGACTTTCAACTAGCGTCAACTTGATTGACTTCAATCAAGGAAACTCAGTCTACCTTCGATTTAGGCCAACACAATCGACCTTCAGTCAAAGTCAACTATGTCAACCTTTGGTCTAATTTGGGTTGACTTGGATCAATCTTTGACTTAAATCGACACCATCAACATTTGATTGACCTTTCACTTAGGCCAACACGACTCGCACTCTAGCCCTAACCGACTAAGCTTGAATTTTGGCTTGGGGTGACTTAACCTAAACTAACTTGTCTTGAGCTCCAGCTCGAACAAACTCATCTTAATTTTCGACCTAGGTTAACTCAAATTGACCTTCATTCTGAACCAACTTAGTTTAAACTTCAACTTAGGAAAACTCAAAACTTGATCTGTATCTTAAGTCGATTTTAGACTTGGACCGACTTAGTTTGACTTCTTCCTCAACCTCCTTGACTTGACTTATGATGTATCTTAATTTTTTATTTTCAAAAATTGATTTAATCTAATTCCAATTTAATTTCAAATAGATGGATTGGATTTAATGTTAAAAGATATGGGTTTTAATTTGAGAAAAAATTGAATTATTATAAATTGTATATTGCCATGGTCAACATCTACAATTTTCTAAAAGACTTTAATCATTCAAAGGTTAATTTAATCCCAACATGAAATAAAATGATAAAATTGAAATATTTGAGGGCGGACAAATTCTCAGATATTAAAGATCATACCTAATTATAGCCTATAGTAATGTAAAAATAATAATAAATTAATATTTTGCTTTTTTACTAAAATAAAACAATAATTTCTTACCCGCTGAAATCAACTTCTCAAATAAAATATTAAAGATAATTTTTAATGATTATATGTTTTATTGTTAAATTAAATATGTAAGTATTTTGTTCATATATATTTTACGCAATCATATAAAACATTATTTACACCAAACGGTATATATGTGGAGTATTTATCATACTACCAAAGAACTTCCACAGTATGATATAATTTCCATATACAATTTAATGAAATAGATATTTTACATTGTATCCATTTTATGAAAGAACAAAATAAAGATATATTTAGTTTAAAAATAAAATAAAATTCTTGAAAACTGTTTGGAGAAAAAAAATATATATTTAGCCCTAGTTTTAATTTGCATACAGAAGAGACAAAAACATGCAGTTAAAAGAGTTTATTTGAGTTTGATTAATTTGTCCTCTTTCAAAACATAAAACCAGGAATTGATTATGATTCATTCCTTTTTGTTGGCATCTGCATCCTAGTTACAATATTGTTAAGAAAACCATCATCATCAAACCTAGTTCTGTTTGTTTTTCTCTATATATATTCACTTACGTAGAGTTTCACTTGCAGCAACAAATTCAAACCTTGTTTCATTCAAAGATTCTGAACATCATCATCATGTTTCACCACACCAACACCTTCAACCTTTTTCAATGCCACAAC


Gene Sequence:
>Vu_17342(-)
ATGAACAAGAACACGAACATGAACATGAACATGTCTGTTTGCAACCCTACCTCTATGATGGAGGCTCGTTCCAACCCTGTTACCACCCCTTTCTATGGAGGCTTTGCTAATGATCACTGTCACCATTCTGTGACGTTGGAACCAAACAAAACTGTCATGGATGCTTTGCATGGCAACCAAAAAAACACAGTCATATGTAAATTTTCACAGAAAACCATGTCGGCTCATCCATCTCAAGCTTCATGTTCCAAATCATCACCATTATCTTTTTCTCTCTTTAATAACTGTGAATTAGAGATGATGAGTGAATTTCACTGGGACAATAATCAAAATGCAAAGCTCAAAAATGATACCAACATTGCTAATCATAACATAATCAAAGGGCAATGGACTCCTGAAGAAGATAGGTATCTCTTTCTTTGTCATTTTCTTTGGTTTTGGTTTTTCTTTTTCTTATTACAAAAAAAAAATGGTTTTTTCTCAAATAAAAAAAAATATTTAGTATAACAGATTTGTATGTATCGATTTTAGTTTATGAAAAAAATTCATTGAAAAACATTTAATTGAACTGAATTTGTGGTTTTGTAGAGCTCTTATGGAATTGGTGAGTCAATTCGGACCCAAGAAATGGACACAAATTGCGAGATCACTACATGGCAGAATTGGGAAGCAATGTCGAGAAAGATGGAAAAACCATCTTCAGCCAAACATTAGGGTTTTTCTCTTTCAATTCTTATTTCTTACATTTACTTAATTTTCTGTGTATCAATATTAATGGGATGAAAGAGTAAAGTTAAACGTAATTTTATAAAAGTATTCTAATATCACTTTTTCATACTTTTTGAGACTTTTTTTATAAATTTTTATAAAAAAAAATTCTAAGAAATAAGTATATTTTTTTTAATCGTATTAGATCTATTTTCTTTTTCCCCTTTCTCTTCCATTATCCAATTATCCTCCTTCCATTTTTCTTCAACCACTTATGGCTTTTTATGATGGTCATTGCCATGTAATAAATAAAACACAAACTTGCTGTCAAAAATATGAAAAATGAAAATTTCAAGCAATTAAAATTGCGTTTATGCGAATTCAAGTTGAAAATTATTTTTTAAGAAAATTCATGTAAACATTTTTTGCATTCTATTTACGCATGTGATAACATAATTGTGTAACTCTTTCATACATACCAATTAATCTTTTGCTGATTTTTCGAACTTGGTATCTTAGTCTACTTTTGACAAGTTTTTTAATTCAATATTATTTGTCTCTTTCTCTCAATATATATATATATATATAAAAGATGTGATTTGAATTTATCTGGAAAATAATTGTGCAGAAAGGATCATGGAGCTTGGAGGAAGACATGATTTTGATCAAAGGGCACCAAGAATTTGGAAGAAAATGGTCAAAGATTGCAAAGAGATTGAGTGGTAGGACTGAGAATGACATCAAGAACAGGTGGAATGCAACCATCCGACGCCAAAACTGCAACAAGAACAGTAAAGCTCACTACAAAGGCTCAATCCTCCATGCCTATGTTAAATGGGTCACTGCAACTGAAGAAAAAGTTCTCAGAAAACCCTCAGACAAGAAGAATAAAAATGTCTTTGGATGCACTTGTGATGAGCTAGCTCTTTTGTTGAGCTAG