Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17201 LG4 32875260 32877762 hypothetical protein LR48
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 32875421 synonymous_variant p.Cys54Cys
A/G 32875561 missense_variant&splice_region_variant p.Asn56Ser
G/A 32875567 missense_variant p.Gly58Asp
C/G 32875570 missense_variant p.Thr59Ser
T/C 32875662 missense_variant p.Cys90Arg
G/T 32875954 upstream_gene_variant
A/G 32876182 missense_variant p.Met193Val
A/G 32876196 synonymous_variant p.Leu197Leu
A/T 32876230 missense_variant p.Asn209Tyr
G/T 32876319 missense_variant p.Glu238Asp
C/T 32876476 stop_gained p.Arg291*
G/T 32876991 upstream_gene_variant
A/C 32877447 missense_variant p.Lys451Gln
T/A 32877615 upstream_gene_variant
A/C 32877639 upstream_gene_variant
G/T 32877648 upstream_gene_variant
T/C 32877678 synonymous_variant p.Tyr483Tyr
G/A 32877679 missense_variant p.Val484Ile
T/C 32877681 synonymous_variant p.Val484Val
G/A 32877707 missense_variant p.Arg493His
C/T 32877711 synonymous_variant p.Thr494Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17201.1
MKQKDCYRKVTGKVVVVAVEATKEVSRSGLMWALTNVVQPGDCIKLLAVIPPFCSNIRALGLSGLAFATDCITAQWRSRLGTVSDQKEVFVNSCSQMVLQLHQFYDPEKIKIRIKILSGSFCGAVAAEAKRAKSSWVILDRKLKNEKKYCMEELNCSVVIMERSGPNVLRLNLILSTNMEHNAFPRNFKGKSEHANTIKCPIVTPGSSLKQGSKTASIIGTPSTPWTWTSPFYQYGNDGGRRKDLPFSQNEVKNVEEGVSNSESEIIMSLSSCGSYFQPWISNAICGDEEFSKNININEALVHKLDHDPVLGVLNCKIDVNISRSVREAISLGRNGTTASLPLCSICQHKAPLFGNPPRWFTFAELKLATAGFSQENLLAENEVGSVHRGVLSDGQVVAIKQCKLAATQDDEEFSAQVQVLSCTQHRNVVMLIGFCLEYLAPEYTESGDITEKADVYSFGVLLLELLTGRKALDRSHQCLHEWSYVVASLSALLRTESHSPCFFPHPSSFLP*


CDS Sequence:
>Vu_17201.1
ATGAAGCAAAAGGATTGTTACAGAAAAGTGACAGGGAAAGTGGTGGTGGTTGCAGTTGAAGCAACGAAAGAAGTTTCAAGGAGTGGTTTGATGTGGGCTTTGACTAATGTTGTTCAACCAGGAGATTGTATTAAGCTGCTGGCTGTCATTCCGCCTTTCTGTTCAAACATCAGGGCACTGGGTCTCTCTGGGCTTGCTTTTGCTACTGATTGTATCACTGCTCAGTGGAGATCCCGTTTAGGAACTGTCTCAGATCAAAAAGAAGTTTTTGTGAATTCATGCTCCCAAATGGTGCTTCAACTTCATCAGTTTTATGATCCAGAGAAGATAAAGATCAGAATCAAAATTCTTTCTGGTTCTTTTTGTGGAGCAGTGGCTGCTGAAGCCAAGAGAGCCAAATCAAGCTGGGTGATATTGGACAGAAAATTGAAAAATGAAAAGAAATACTGCATGGAGGAGCTGAATTGCAGTGTTGTAATCATGGAGCGATCTGGGCCAAACGTTCTGCGATTGAATTTGATCCTTTCAACAAATATGGAGCACAATGCATTTCCAAGAAACTTCAAAGGCAAATCTGAACATGCAAATACAATTAAGTGTCCAATTGTTACTCCTGGAAGTAGTCTTAAACAAGGATCAAAGACTGCTAGTATCATTGGAACACCATCAACACCTTGGACTTGGACTTCACCATTTTATCAATATGGTAATGATGGAGGACGAAGAAAAGATTTACCCTTTTCTCAGAACGAGGTGAAAAATGTGGAGGAAGGTGTATCCAATTCAGAGAGTGAAATTATTATGAGTTTGTCATCCTGCGGGTCATATTTCCAGCCATGGATTTCAAATGCAATTTGTGGTGATGAAGAGTTTTCGAAAAACATTAACATTAACGAGGCTCTGGTTCATAAATTGGATCACGATCCTGTGTTAGGAGTGCTTAATTGTAAAATTGATGTGAACATAAGCAGAAGTGTCAGAGAAGCAATTTCACTAGGCAGAAATGGCACTACTGCGTCACTCCCATTGTGCTCTATTTGTCAGCATAAGGCACCTTTGTTTGGGAATCCTCCAAGATGGTTTACATTTGCTGAACTGAAACTTGCCACTGCTGGATTTTCACAGGAAAATCTTTTGGCAGAAAATGAGGTTGGATCTGTACACCGTGGAGTCCTATCTGATGGGCAGGTTGTTGCTATCAAGCAGTGTAAATTAGCTGCTACTCAAGATGATGAAGAATTTTCTGCACAGGTTCAGGTCTTAAGCTGCACACAACATCGTAATGTTGTGATGCTAATTGGGTTTTGCTTGGAGTATTTGGCTCCAGAATATACTGAAAGTGGTGACATCACTGAAAAAGCCGATGTGTACTCGTTCGGGGTGCTATTACTGGAGCTTCTTACTGGACGCAAAGCTTTGGATAGAAGCCACCAATGCCTCCATGAATGGAGTTATGTTGTTGCATCTTTGTCAGCCCTGCTCCGCACCGAAAGTCATTCTCCTTGCTTCTTCCCTCACCCTTCTAGCTTTCTTCCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_17201::LG4:32873260-32875260(+)
ACAAATTAAAACCTTCCAATGGGAGAAGCTGGAATCGTGTTTTGTGCGGTTGCATTGTTCCCTCTTCAATCTTGAGTTGACCAACGCCATCATCACCAAATAGCGCCGTCAAACGCCGTGGATGGATGAGTTATGGCCGTTGATGAAGCTGCTTTTTTGCTTCTTCCATTTAAAGCTTCCAAATACTATGTTTCTTTTTACTATTTTATTGACCAAAAGTGCCCTCTTATATCGTATTGCTTGCCCGTTCCATCTTTCAAACAGCAATGATGTGATCATTATTTATTATTTTTAATATACCTTAATAAAATATTATTTTTGAGTTTAACATGAACCAATAAGAAATGAAAGTTAATATAACATTTAATTAATATAATTATTATAAAATTTATTCTATATGCAAGTTTGTCATTAAATCATTACCAAAGTAATTCACTCTATTAATGTATACATTATATGCTTTCATTACCGTGTGCCAGTTTGATGGTTTTCATGATAATAATATTAAATAATTTAAAATAAATTTTGACCAATAATTTTTTTTTACCGTTGGGCTATGTAAAGTATTATAAATAATTAGTAGGATTTATTAAATACACTTTTTTACTTGTACAAATTTAAATTTGTGCCATTATGAGAAATTTAATTTATTATTTTCAAAATTTTGTATTTGCATACATATAAGTTCATTTATATATGTAATGAAAATATTAACTTTTATTTAAAAGAATAAAGCCATACATGTTTGTTAGTAATGGTGGGCATAACGGACTTTTTGACTTGAACTTGTTTTTGGGTTTAATGAATAGAGAAATTTACAATTTTGAGGAACATGAAAAGGTTTTAATTACTAAGAAAGATGATATAAATTTTAGTTTATGAGAATCATTGGATTTTATTTAACGCAAATAAATGCTCTCAATCTAATGGTAAATAACTATTCTTTTATTACTAAGTGACTATTTGCTCTTTTTTGACTAATTAATAACAATAAATCATGTTTTTAAAGTAAATATTGGGAATAAATGAGATAAAATCATTGATATTATACTAGCAATTTTAACCTTTCACTTTATTCAAAAATTTTAGTTCTCAAAACAAAACTCATAATCTAACCGACCTTTTCGTATAAAAGAAGGAAGGAGAATAATGTTTGAAGAGAATAATATTTAATGAACACTCTTTTCATACATAAAGTTGATGAGCAACATTCTTAACTTTTAATGAAACATTTTTTTTTTTAGTTTCGTCTCACATAAATAAACAATTACTATGATAGTTTTTCACTAATTAATTCACTAACAAATATGAGGTTTGTTCAATTGTCATTGTTACGAAATTTATGATAGTAATTAAAAATCAATTTGAGGTGATTATCAACAAATATAGGCTTGATAACTTAAAAAAATTTATATATTTCAACAAAATGGAATTGTTGAAAAAAAAAACATTTTAATAAGTTATTTTACAATTAAGTTATTTTATTAATCTTGTAAGCAATATGGTTTAGCATAATTGAGGTTGGTTTAGAAAAATGCATGATTCAATTGGAAGAAAAGATTAGGTATGTAGCAATAATAGGTCAAATAAATTCAATTGGACCGAAAATAGTTCCTTCTCTGTTCCAATTCGGCCACACAAATAGTTAAATATAGGAACATATACATTATGATATCAGTCCTTCAATTATATAATCAATAAGTCTTGTAGACACTAAGGAAATATCTTCTGTTGGCTGATTGCATCTGCCAAATCAAACAAAATGGCAACACCATAATCTATTGTGCATGCCTTTGGCCATTCTATATTTCTTAAATTCACTTCTAATCAATCTCTTCAGTCCATTCAGTTCTAGAGACATTGTCAGAACTTGTTTTTAGCTTATATTTTGTTCTCTCTCCGATTTTTGAAGCTTCTCTTCTCTAAAACACTCCTTCAATTATATGATTTTTTTGTTTATCAAGAATTTGACTCTGATTAGTGATTGGTAATAGTTGAAA


Gene Sequence:
>Vu_17201(+)
ATGAAGCAAAAGGATTGTTACAGAAAAGTGACAGGGAAAGTGGTGGTGGTTGCAGTTGAAGCAACGAAAGAAGTTTCAAGGAGTGGTTTGATGTGGGCTTTGACTAATGTTGTTCAACCAGGAGATTGTATTAAGCTGCTGGCTGTCATTCCGCCTTTCTGTTCAAGTATTTCTCGTTCATGTCACTTTTGTTATTATTTGGCTAAGAGATTCTTAAAAATGATTCCATATTCAAACATGCTGACATTATCCTAAGACATGACAGCGATGTTATTAACTGTGTTTTGTCTTCACTTCAGACATCAGGGCACTGGGTCTCTCTGGGCTTGCTTTTGCTACTGATTGTATCACTGCTCAGTGGAGATCCCGTTTAGGAACTGTCTCAGATCAAAAAGAAGTTTTTGTGAATTCATGCTCCCAAATGGTGCTTCAACTTCATCAGTTTTATGATCCAGAGAAGGTTAAATCATAACCTTTCAATTTCAGTGTTTCACTTTTGCTTTATGTGTAACATTCTGCTTCTCTCATGTGTCAAAACTTAAATAGATAAAGATCAGAATCAAAATTCTTTCTGGTTCTTTTTGTGGAGCAGTGGCTGCTGAAGCCAAGAGAGCCAAATCAAGCTGGGTGATATTGGACAGGTAAGAAATAATGCAATGAACATGCTAGAGAATTTGTTCTTTGTGCATGTAACGCCAATTCAGTTCTATTTTACGTGTGTGAATTGATGATTGGTAAACAATTTTACGCACAAATGTTTACAGAAAATTGAAAAATGAAAAGAAATACTGCATGGAGGAGCTGAATTGCAGTGTTGTAATCATGGAGCGATCTGGGCCAAACGTTCTGCGATTGAATTTGATCCTTTCAACAAATATGGAGCACAATGCATTTCCAAGAAACTTCAAAGGCAAATCTGAACATGCAAATACAATTAAGTGTCCAATTGTTACTCCTGGAAGTAGTCTTAAACAAGGATCAAAGACTGCTAGTATCATTGGAACACCATCAACACCTTGGACTTGGACTTCACCATTTTATCAATATGGTAATGATGGAGGACGAAGAAAAGATTTACCCTTTTCTCAGAACGAGGTGAAAAATGTGGAGGAAGGTGTATCCAATTCAGAGAGTGAAATTATTATGAGTTTGTCATCCTGCGGGTCATATTTCCAGCCATGGATTTCAAATGCAATTTGTGGTGATGAAGAGTTTTCGAAAAACATTAACATTAACGAGGCTCTGGTTCATAAATTGGATCACGATCCTGTGTTAGGAGTGCTTAATTGTAAAATTGATGTGAACATAAGCAGAAGTGTCAGAGAAGCAATTTCACTAGGCAGAAATGGCACTACTGCGTCACTCCCATTGTGCTCTATTTGTCAGCATAAGGCACCTTTGTTTGGGAATCCTCCAAGATGGTTTACATTTGCTGAACTGAAACTTGCCACTGCTGGATTTTCACAGGAAAATCTTTTGGCAGAAAATGAGGTTGGATCTGTACACCGTGGAGTCCTATCTGATGGGCAGGTTGTTGCTATCAAGCAGTGTAAATTAGCTGCTACTCAAGATGATGAAGAATTTTCTGCACAGGTTCAGGTCTTAAGCTGCACACAACATCGTAATGTTGTGATGCTAATTGGGTTTTGCTTGGAGTATGGAAGAAAAATTCTGGTTTATGAATATATCTGCAATGGATCTCTATATTCTCATCTTCATGGTAAATATTTTGAATTTCAAACCATTCAATTTGTATATAGAAAATGGCAAGTTTCAGTCTTTATTTACATAAAAGTTAAAAAAGAACTTTTTGCATTACAAAACTTGCACAGATTAAGTTTTTCTGGTTTGCAAAGCTTTTTGGCATATTTTGTATGCCTTAGAAGGTGCAATTATGTTGGTGTAGTTAATAAGAATATGCATATTTAAATCTTAACAATATGTTGATTGCAGAAAAGAATGAAAATGTACTGAATTGGTCTGCACGCAAGAAAATTGCTCTGGGAGTAGCTCGTGGGTTGAGATACCTTCATGAAGAGTGTAGAGTGGGTTGTATTGTGCACGGCGACATTAGACCCTGCAATATCTTCCTTACTCATGACTTTGAGCCATTGGTATGTCTAAACTTTAATATGAAAATGCATAGGTATTTGGCTCCAGAATATACTGAAAGTGGTGACATCACTGAAAAAGCCGATGTGTACTCGTTCGGGGTGCTATTACTGGAGCTTCTTACTGGACGCAAAGCTTTGGATAGAAGCCACCAATGCCTCCATGAATGGGTAAGCTTTTTACAGTTCATCATATTTGATGACTTGGGCCAAGAACAATAGCAAGTCAAGAGCCTATTATTGCTGAATCTGCTATAAATCAACACCTATCTCCCTTGTATCATTACTTTTGGAATTTACAGAGTTATGTTGTTGCATCTTTGTCAGCCCTGCTCCGCACCGAAAGTCATTCTCCTTGCTTCTTCCCTCACCCTTCTAGCTTTCTTCCATAG