Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17158 LG4 32563998 32567142 PREDICTED: receptor-like protein kinase 5
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 32564221 missense_variant p.Gln75Arg
T/A 32564357 synonymous_variant p.Leu120Leu
G/T 32564404 missense_variant p.Gly136Val
T/C 32564453 synonymous_variant p.Asn152Asn
G/T 32564496 stop_gained p.Glu167*
A/T 32564497 missense_variant p.Glu167Val
C/T 32564538 missense_variant p.Leu181Phe
T/C 32564576 synonymous_variant p.Ile193Ile
C/T 32564615 synonymous_variant p.Pro206Pro
C/T 32564666 synonymous_variant p.Asn223Asn
G/T 32564765 synonymous_variant p.Val256Val
T/A 32564853 missense_variant p.Leu286Ile
C/T 32564930 synonymous_variant p.Thr311Thr
G/T 32564962 missense_variant p.Gly322Val
A/C 32565349 missense_variant p.Asn451Thr
A/T 32565639 missense_variant p.Thr548Ser
G/A 32565849 missense_variant p.Ala618Thr
C/T 32565853 missense_variant p.Ser619Phe
T/A 32566001 synonymous_variant p.Ile668Ile
A/T 32566002 missense_variant p.Ile669Phe
G/C 32566133 upstream_gene_variant
A/T 32566554 upstream_gene_variant
C/T 32566646 upstream_gene_variant
T/A 32566663 upstream_gene_variant
A/G 32566674 upstream_gene_variant
G/C 32566682 upstream_gene_variant
C/T 32566792 missense_variant p.Thr715Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17158.1
MYDEEHAVLLKIKQYLQNPPFLNHWIPSNSSHCTWPEITCINGSVTSLTMFNTNITQTLPHFLCDLKNLTHVDFQFNFLPGEFPKSLYNCSKLEYLDLSQNLFVGKIPDDIDHLAGLRFLSLGGNNFSGDIPASIGRLKELRSLQLYQSLFNGTFPAEIGNLSNLEELYVFSNHMFPPTKLPSSLTQLNKLKIFDMHESNLVGEIPETIGNMVALEELDLSVNGLSGEIPKSLFMLKNLSKLYIYKNSLSGDIPEVVEAFNLTEIDLSYNNLSGKIPDDLGKLSKLIFLSLSTNQLSGKVPESIGSLPALTDFVVFHNNLSGTLPPDFGRISKLETFQVASNSFTGSLPENLCYHGRLVGLTAFDNNLSGELPESLGSCSSLQILRVENNELSGNIPSGLWTSFNLSTIKINENKFTGQLPERLSENLRDIGISYNQFSGRIPHGVSSWKNIVEFNASNNLFNGSIPPELTSLPDLTILLLDHNQFTGPLPSDIISWKSLINLDLSHNELSGEIPLAIAQLPALNILDLSENRISGQIPHQLALMRPTNINLSSNSLVGRIPSELENLVYARSFLNNPGLCADTPVLNLILCNSRPQRARIDRRYASHVIIISLVLAASLLALLSLFLMIRVYRKRKQELKRSWKLTSFQRLSFTKGNIVSSMSEHNIIGSGGYGAVYRVAVGDTDYVAVKKILKYAQTTRVNEKIDVYSFGVVLLELTTGKEANHGDEYSSLAEWAWRHIQIGADVEDILDKEIKEACYMDEICNIFKLGVMCTATLPASRPSMKEVLKILLSCSSPLSIGDKNVGFYDSAPLLKNSKWENNMEYYTDDD*


CDS Sequence:
>Vu_17158.1
ATGTATGATGAAGAGCATGCAGTCCTATTGAAGATAAAACAATACCTGCAAAATCCACCGTTCCTCAATCACTGGATCCCATCAAACTCCTCACATTGCACTTGGCCGGAGATCACATGCATCAATGGCTCAGTCACTTCACTGACTATGTTCAACACCAACATCACTCAAACACTGCCACATTTCCTATGTGACCTCAAAAACCTCACACATGTAGATTTTCAGTTTAATTTCCTTCCTGGGGAGTTCCCGAAATCTCTCTACAACTGCTCCAAGCTTGAGTACCTTGACCTCTCACAGAACCTCTTTGTTGGTAAGATTCCTGATGACATTGACCACTTGGCTGGCTTGCGTTTTCTTAGCCTTGGTGGCAACAACTTCTCTGGTGATATTCCAGCCAGCATAGGGAGGTTGAAGGAGCTACGAAGCCTTCAACTTTATCAGAGTCTTTTCAATGGTACTTTCCCTGCTGAAATTGGGAATTTGTCCAACCTTGAGGAGTTGTATGTGTTCTCAAACCACATGTTCCCTCCTACAAAGCTTCCATCAAGCTTGACCCAGTTGAATAAATTGAAGATTTTTGATATGCATGAATCCAACTTGGTAGGGGAAATCCCCGAAACCATTGGAAACATGGTGGCATTGGAGGAATTGGATTTGTCAGTAAACGGTTTGAGTGGAGAAATTCCCAAAAGTTTGTTCATGCTGAAAAATCTGAGCAAACTATATATTTACAAGAACAGCCTCTCTGGGGACATACCCGAAGTGGTTGAAGCATTCAACTTGACAGAAATTGATCTTTCATACAATAATCTTAGTGGGAAAATACCAGATGATTTGGGAAAGCTCAGCAAGTTAATATTCTTGTCTTTGTCTACGAACCAATTATCAGGGAAGGTACCAGAAAGCATTGGTAGTCTGCCAGCTCTGACCGATTTTGTTGTTTTTCACAACAATTTATCAGGCACTCTTCCACCAGATTTCGGTCGGATCTCAAAGCTTGAAACTTTTCAGGTTGCATCTAATAGTTTCACAGGAAGTTTGCCAGAGAACTTGTGCTACCATGGAAGGTTAGTTGGTTTAACTGCTTTCGACAATAACCTGAGTGGGGAGTTGCCAGAATCTTTAGGAAGTTGCAGTAGCCTGCAAATTCTGAGGGTTGAAAACAATGAACTTTCTGGCAACATTCCTAGTGGTCTATGGACATCTTTTAACTTATCGACCATTAAGATAAACGAAAACAAGTTCACTGGTCAGCTTCCTGAAAGATTGTCTGAGAATCTCAGAGACATAGGCATAAGTTACAATCAGTTTTCTGGTAGAATTCCACATGGAGTGTCTTCCTGGAAGAATATTGTGGAATTTAATGCCAGTAACAACCTCTTCAATGGTAGTATTCCACCGGAGCTAACATCTCTTCCTGACCTAACAATTCTTCTGCTTGATCATAACCAGTTCACAGGACCACTTCCTTCAGATATAATATCATGGAAGTCCCTGATAAATCTAGATTTGAGCCACAATGAACTCTCTGGAGAAATCCCCCTTGCAATTGCTCAGTTGCCTGCCCTTAATATTTTGGATTTATCAGAGAACAGAATATCTGGCCAAATTCCACATCAACTAGCTCTTATGAGACCCACAAATATCAATCTGTCCTCCAATAGTTTGGTAGGAAGGATTCCAAGTGAACTTGAAAATCTTGTTTATGCTAGGAGCTTTTTGAACAATCCTGGTCTCTGTGCTGACACTCCAGTACTAAACCTTATCTTGTGCAATTCCAGGCCTCAAAGGGCAAGAATTGATAGAAGATATGCATCTCATGTTATAATCATAAGCCTGGTGTTAGCAGCCTCCTTGCTGGCTTTGTTGTCATTATTTTTGATGATCAGAGTTTACAGAAAAAGAAAGCAGGAACTGAAAAGGTCATGGAAGCTTACTTCCTTTCAAAGGCTCAGTTTCACAAAAGGAAATATCGTATCCTCAATGTCAGAACACAATATTATTGGCAGTGGTGGGTATGGTGCAGTGTATCGTGTCGCTGTTGGTGATACAGACTATGTCGCAGTGAAGAAGATACTCAAATATGCTCAAACAACAAGGGTCAATGAGAAGATAGATGTCTACAGCTTTGGAGTAGTCCTACTGGAACTGACAACAGGAAAAGAAGCTAATCATGGAGATGAGTACTCATCTCTGGCAGAATGGGCGTGGCGCCACATTCAGATAGGAGCAGATGTAGAAGATATTTTGGACAAAGAAATTAAGGAAGCTTGTTACATGGATGAAATCTGCAACATCTTCAAACTTGGGGTGATGTGCACTGCAACACTTCCAGCTAGTAGACCTTCCATGAAGGAAGTCCTGAAAATTTTGCTCTCCTGCAGCAGTCCACTCAGCATTGGAGACAAGAATGTTGGCTTCTATGATTCTGCTCCACTTCTTAAGAATTCAAAATGGGAAAATAATATGGAATATTATACCGATGATGATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_17158::LG4:32561998-32563998(+)
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Gene Sequence:
>Vu_17158(+)
ATGTATGATGAAGAGCATGCAGTCCTATTGAAGATAAAACAATACCTGCAAAATCCACCGTTCCTCAATCACTGGATCCCATCAAACTCCTCACATTGCACTTGGCCGGAGATCACATGCATCAATGGCTCAGTCACTTCACTGACTATGTTCAACACCAACATCACTCAAACACTGCCACATTTCCTATGTGACCTCAAAAACCTCACACATGTAGATTTTCAGTTTAATTTCCTTCCTGGGGAGTTCCCGAAATCTCTCTACAACTGCTCCAAGCTTGAGTACCTTGACCTCTCACAGAACCTCTTTGTTGGTAAGATTCCTGATGACATTGACCACTTGGCTGGCTTGCGTTTTCTTAGCCTTGGTGGCAACAACTTCTCTGGTGATATTCCAGCCAGCATAGGGAGGTTGAAGGAGCTACGAAGCCTTCAACTTTATCAGAGTCTTTTCAATGGTACTTTCCCTGCTGAAATTGGGAATTTGTCCAACCTTGAGGAGTTGTATGTGTTCTCAAACCACATGTTCCCTCCTACAAAGCTTCCATCAAGCTTGACCCAGTTGAATAAATTGAAGATTTTTGATATGCATGAATCCAACTTGGTAGGGGAAATCCCCGAAACCATTGGAAACATGGTGGCATTGGAGGAATTGGATTTGTCAGTAAACGGTTTGAGTGGAGAAATTCCCAAAAGTTTGTTCATGCTGAAAAATCTGAGCAAACTATATATTTACAAGAACAGCCTCTCTGGGGACATACCCGAAGTGGTTGAAGCATTCAACTTGACAGAAATTGATCTTTCATACAATAATCTTAGTGGGAAAATACCAGATGATTTGGGAAAGCTCAGCAAGTTAATATTCTTGTCTTTGTCTACGAACCAATTATCAGGGAAGGTACCAGAAAGCATTGGTAGTCTGCCAGCTCTGACCGATTTTGTTGTTTTTCACAACAATTTATCAGGCACTCTTCCACCAGATTTCGGTCGGATCTCAAAGCTTGAAACTTTTCAGGTTGCATCTAATAGTTTCACAGGAAGTTTGCCAGAGAACTTGTGCTACCATGGAAGGTTAGTTGGTTTAACTGCTTTCGACAATAACCTGAGTGGGGAGTTGCCAGAATCTTTAGGAAGTTGCAGTAGCCTGCAAATTCTGAGGGTTGAAAACAATGAACTTTCTGGCAACATTCCTAGTGGTCTATGGACATCTTTTAACTTATCGACCATTAAGATAAACGAAAACAAGTTCACTGGTCAGCTTCCTGAAAGATTGTCTGAGAATCTCAGAGACATAGGCATAAGTTACAATCAGTTTTCTGGTAGAATTCCACATGGAGTGTCTTCCTGGAAGAATATTGTGGAATTTAATGCCAGTAACAACCTCTTCAATGGTAGTATTCCACCGGAGCTAACATCTCTTCCTGACCTAACAATTCTTCTGCTTGATCATAACCAGTTCACAGGACCACTTCCTTCAGATATAATATCATGGAAGTCCCTGATAAATCTAGATTTGAGCCACAATGAACTCTCTGGAGAAATCCCCCTTGCAATTGCTCAGTTGCCTGCCCTTAATATTTTGGATTTATCAGAGAACAGAATATCTGGCCAAATTCCACATCAACTAGCTCTTATGAGACCCACAAATATCAATCTGTCCTCCAATAGTTTGGTAGGAAGGATTCCAAGTGAACTTGAAAATCTTGTTTATGCTAGGAGCTTTTTGAACAATCCTGGTCTCTGTGCTGACACTCCAGTACTAAACCTTATCTTGTGCAATTCCAGGCCTCAAAGGGCAAGAATTGATAGAAGATATGCATCTCATGTTATAATCATAAGCCTGGTGTTAGCAGCCTCCTTGCTGGCTTTGTTGTCATTATTTTTGATGATCAGAGTTTACAGAAAAAGAAAGCAGGAACTGAAAAGGTCATGGAAGCTTACTTCCTTTCAAAGGCTCAGTTTCACAAAAGGAAATATCGTATCCTCAATGTCAGAACACAATATTATTGGCAGTGGTGGGTATGGTGCAGTGTATCGTGTCGCTGTTGGTGATACAGACTATGTCGCAGTGAAGAAGATACTCAGTAACAGAAAGTTAGAGGAGAAGCTTGTAAGTTCATTTCTTGCAGAAGTTGAGATACTGAGCAATATTCGTCATAACAACATTGTGAAGTTGCTATGCTGCGTCTCCAAAGAGGATTCTCTTCTCCTTGTCTACGAGTATCTTGAAAACCATAGCCTTGATAGATGGCTGCACAACAAAAGTAAGCAGACAGCTTCAGGTTCAGTCCTTGACTGGCCAAAGAGATTACATATAGCCATTGGAGCTGCTCAAGGTTTGTGCTATATGCATCATGACTGCTTACCACCTGTTGTTCATCGTGATGTGAAAACAAGTAACATCCTGCTGGATTCTAAATTCAATGCCAAAGTTGCTGATTTTGGTCTAGCCATGATGTTGATTAAGCCAGAAGAACTTGCAACCATGTCAGCTGTGGCTGGTACATTTGGCTATATTGCTCCAGGTAAAAACAAGTTACAAATGTATCATTGCTCCAAGTGTAAATCTAAACTCCACCTTACATAAAAATGACAAGGTTAAACATCATACAAGAAGAAAGATCCATAAATCCATTGTTTTGAATCATGCATTGCTGTTGCTTCAGTTAAATTCTCTATCTAATTGTTCTGTCATAAGCCTAGTCTAAATTTTTGTTCATGCATGAATTGCAGAATATGCTCAAACAACAAGGGTCAATGAGAAGATAGATGTCTACAGCTTTGGAGTAGTCCTACTGGAACTGACAACAGGAAAAGAAGCTAATCATGGAGATGAGTACTCATCTCTGGCAGAATGGGCGTGGCGCCACATTCAGATAGGAGCAGATGTAGAAGATATTTTGGACAAAGAAATTAAGGAAGCTTGTTACATGGATGAAATCTGCAACATCTTCAAACTTGGGGTGATGTGCACTGCAACACTTCCAGCTAGTAGACCTTCCATGAAGGAAGTCCTGAAAATTTTGCTCTCCTGCAGCAGTCCACTCAGCATTGGAGACAAGAATGTTGGCTTCTATGATTCTGCTCCACTTCTTAAGAATTCAAAATGGGAAAATAATATGGAATATTATACCGATGATGATTGA