Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17156 LG4 32550019 32553686 PREDICTED: receptor-like protein kinase HSL1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 32550068 5_prime_UTR_variant
T/A 32550370 stop_gained p.Cys87*
A/G 32550372 missense_variant p.Asp88Gly
T/G 32550373 missense_variant p.Asp88Glu
G/A 32550418 synonymous_variant p.Pro103Pro
C/A 32550740 missense_variant p.Gln211Lys
C/T 32551774 synonymous_variant p.Asn555Asn
T/C 32551813 synonymous_variant p.Leu568Leu
C/T 32551856 missense_variant p.Pro583Ser
G/A 32551939 synonymous_variant p.Leu610Leu
C/G 32551942 missense_variant p.Ser611Arg
T/C 32551944 missense_variant p.Leu612Pro
G/A 32551950 missense_variant p.Ser614Asn
A/T 32552057 missense_variant p.Met650Leu
G/T 32552081 missense_variant p.Gly658Trp
G/A 32552777 intron_variant
C/T 32552802 intron_variant
A/G 32552835 intron_variant
C/A 32552842 upstream_gene_variant
C/T,G 32552844 upstream_gene_variant
C/G 32552880 upstream_gene_variant
T/C 32552883 upstream_gene_variant
T/A 32552884 upstream_gene_variant
T/C 32552903 upstream_gene_variant
T/C 32552936 upstream_gene_variant
T/C 32552973 upstream_gene_variant
C/T 32552974 upstream_gene_variant
G/T 32552975 upstream_gene_variant
A/G 32552979 upstream_gene_variant
A/T 32552986 upstream_gene_variant
T/A 32553000 upstream_gene_variant
G/C 32553007 upstream_gene_variant
T/C 32553014 upstream_gene_variant
G/A 32553035 upstream_gene_variant
A/C 32553074 upstream_gene_variant
A/C 32553079 upstream_gene_variant
C/T 32553091 upstream_gene_variant
C/T 32553101 upstream_gene_variant
G/T 32553116 upstream_gene_variant
G/A 32553125 upstream_gene_variant
G/A 32553129 upstream_gene_variant
A/C 32553144 upstream_gene_variant
A/G 32553145 upstream_gene_variant
A/T 32553148 upstream_gene_variant
C/T 32553149 upstream_gene_variant
C/T 32553185 synonymous_variant p.Val876Val
A/G 32553256 missense_variant p.Tyr900Cys
T/A 32553523 missense_variant p.Leu989His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17156.1
MTIPFYYCLTIFLFLSCVKSQIQLQDQEHAVLLQIKQHLQNPSFLSHWTPSNTRHCSWSEITCTDDSVTGLTLFKSNINQTLPNFMCDLKNLTHVNFSFNSIPGEFPTFLYKCSKLVSLDLEGNEFSGSIPNDIDKLVNLQHLNLGSTSFSGDIPASIGGLKQLRFLQLHYCLFNGTFPSESIANLFNLEFLDISSNLVLPPSKFPSGLTQLKKLKFLHMYSCNFFGEIPDTIGELVALENLDLSRSNFSGHIPKGLFMLRNLTILYLFNNSLSGEIPGEIEALNLIELDLAQNNLAGRIPHDFGKLQKLRWLSLSLNNLSGEIPQSLGRLPSLKHIRIIFNNFSGILPPDLGRYSELKTFLVANNSFSGKLPENLCYHGQLQNLSAYCNYLSGNLPESLGHCSSLTDVKIYSNEFSGNIPSGLWTLNLSDFMVSNNKFTGELPERFSPTISRLEISHNQFSGRIPTGVSSWTNMVVFKASENYLNGSVPKELTNLSMLTTLLLDHNHLTGPLPSDIISWKSLENLNLSHNQLSGKIPDEIGQLPVLNQLDLSENQFTGQVPSLLPRLTNLNLSSNHLTGKVPNELEISVYSTSFLNNPGLCADTSVLNLSLCSVGAGFEKKTKGSSWSIALILCLVAVAFLLALLISIMIIKLFRRGKHVLDNSWKLVSFQRLSFTESDIVSSMTEHNVIGSGGFGTVYRVPVDGLDYIAVKKISSNRKLDRKLESSFRAEVKILSNIRHKNIVKLLCCISNEDSMLLVYEYLENRSLDRWLHNKDKSSTVSVSVDHFVLDWPKRLEISIGVAHGLCYMHHDCFPPIVHRDVKSSNILLDAQFNAKVADFGLARMLMKLGDLATMSSVVGSFGYMAPEYVQTRRVSEKIDVFSFGVVLLELTTGKEANYGDEHSSLAEWAWRHIIVGSKIEELLDNDFMDPSYTNEMCSVFKLGVLCTSTLPANRPSMKEVLHMLVTIGEGLAFGEGNVRHFDGVPLLKNSRWECRFDAIDNDSD*


CDS Sequence:
>Vu_17156.1
ATGACAATACCATTTTACTACTGTCTAACCATCTTCCTATTCCTGAGCTGTGTAAAATCTCAGATTCAGCTGCAAGATCAAGAGCATGCAGTGTTACTGCAGATAAAGCAGCACCTACAAAACCCTTCGTTCCTCAGTCACTGGACCCCTTCAAACACCCGTCACTGCTCCTGGTCTGAGATAACATGCACCGATGACTCTGTCACTGGATTAACTCTGTTCAAGAGCAATATCAATCAAACACTTCCTAATTTTATGTGTGATCTTAAAAATCTCACACATGTTAATTTCAGCTTTAATTCCATTCCGGGGGAGTTTCCAACGTTTCTCTATAAATGTTCCAAGCTGGTGTCATTGGACCTTGAAGGGAATGAATTTTCTGGTAGCATTCCTAATGACATAGACAAGTTGGTTAACTTGCAGCATCTTAATCTCGGTTCCACCAGCTTTAGTGGTGATATTCCTGCAAGCATTGGAGGGTTGAAGCAACTGAGATTTCTTCAACTTCACTATTGTCTGTTTAATGGCACTTTTCCTTCTGAGAGTATTGCCAACTTGTTCAATCTTGAATTCTTGGACATTTCCTCTAACTTAGTGCTCCCTCCTTCAAAGTTCCCATCAGGCCTGACCCAGTTGAAAAAACTGAAGTTCTTGCACATGTACAGTTGCAACTTCTTCGGGGAAATTCCTGATACCATCGGAGAACTGGTGGCTTTAGAGAACTTGGATTTGTCACGAAGCAATTTCAGTGGACACATTCCCAAAGGCTTGTTCATGCTCAGGAATTTGACCATACTCTACCTCTTCAATAACAGTCTCTCTGGGGAGATTCCTGGTGAGATTGAAGCATTGAATTTGATCGAACTCGATCTTGCACAGAACAATCTCGCAGGGAGAATACCTCATGATTTTGGGAAGCTCCAAAAGTTAAGATGGTTAAGTTTGTCTCTCAATAACTTGTCAGGGGAGATTCCACAAAGCTTAGGCCGTCTTCCATCTCTCAAACATATTCGTATCATATTCAACAATTTTTCAGGTATTCTTCCTCCTGATTTAGGTCGCTACTCGGAGCTCAAAACATTTCTGGTTGCAAACAATAGTTTCAGTGGAAAGCTCCCGGAGAACTTATGCTATCATGGCCAGTTACAGAATTTATCTGCTTATTGTAATTATCTGAGTGGGAACTTACCAGAGTCACTTGGCCACTGTAGTAGTTTGACTGATGTAAAAATTTATAGCAATGAGTTTTCTGGCAACATTCCTAGTGGTCTTTGGACTCTCAACTTGTCAGATTTCATGGTGAGCAATAACAAGTTCACTGGTGAGCTTCCTGAGAGATTTTCCCCAACTATTTCACGCTTGGAGATAAGTCACAACCAGTTTTCTGGTAGAATTCCAACTGGGGTATCTTCATGGACTAACATGGTTGTGTTTAAAGCCAGCGAAAACTACCTCAATGGGAGTGTTCCAAAGGAGTTAACAAATCTTTCCATGCTAACAACTCTATTGCTTGATCATAACCATCTCACAGGGCCACTTCCATCAGATATAATATCATGGAAGTCCCTAGAGAATCTAAATTTGAGCCATAACCAACTCTCCGGAAAAATCCCAGATGAAATTGGTCAGTTGCCTGTCCTCAATCAGCTTGACCTGTCAGAAAACCAGTTCACAGGTCAAGTTCCTTCACTACTTCCTAGACTTACTAATCTCAACCTATCCTCTAATCATCTTACAGGGAAGGTTCCAAATGAGTTAGAAATCTCTGTGTATTCCACCAGCTTTTTGAACAATCCTGGCCTCTGTGCTGATACCTCAGTACTGAATCTGAGCCTGTGCAGTGTTGGTGCTGGCTTTGAAAAGAAAACCAAAGGCTCTTCTTGGTCTATTGCTTTGATTCTGTGTCTGGTGGCAGTAGCCTTCTTGTTGGCTTTGCTGATATCAATCATGATTATCAAACTTTTCAGAAGAGGGAAACATGTGTTGGATAACTCATGGAAACTCGTCTCCTTTCAAAGGTTGAGTTTCACCGAATCAGACATAGTGTCATCAATGACAGAACACAATGTTATTGGAAGTGGTGGATTTGGCACAGTGTACCGTGTCCCTGTTGATGGTTTAGACTATATTGCTGTGAAAAAGATCTCAAGCAACAGAAAGTTAGACCGAAAGCTAGAGAGCTCGTTTCGTGCAGAAGTGAAAATACTGAGCAACATTCGTCATAAGAACATTGTGAAGTTGTTGTGTTGCATCTCTAATGAGGATTCTATGCTCCTTGTGTATGAGTATTTGGAAAACCGTAGCTTAGACAGGTGGCTGCACAATAAGGACAAATCATCAACTGTGTCGGTTTCAGTCGATCATTTTGTGCTTGATTGGCCAAAGAGATTGGAAATTTCCATTGGGGTTGCTCATGGTCTGTGCTACATGCACCATGATTGCTTTCCACCGATTGTTCATAGAGATGTAAAATCAAGCAACATCCTTTTGGATGCTCAGTTCAATGCAAAAGTAGCTGATTTTGGTCTGGCTAGGATGTTAATGAAGCTAGGGGATCTTGCTACCATGTCTTCAGTGGTTGGCTCATTTGGCTACATGGCTCCAGAATATGTTCAAACAAGGCGAGTCAGTGAGAAGATTGATGTGTTCAGCTTTGGGGTTGTACTGCTGGAGCTGACAACAGGTAAAGAAGCTAATTATGGTGATGAACATTCTTCCCTTGCAGAGTGGGCATGGCGTCACATTATCGTGGGAAGCAAAATAGAAGAGCTGCTAGACAATGATTTCATGGATCCAAGTTACACAAATGAAATGTGCAGTGTTTTCAAACTTGGGGTCTTGTGCACTTCCACACTTCCTGCTAATAGGCCTTCCATGAAAGAGGTGCTACACATGTTGGTCACCATAGGAGAAGGGCTTGCTTTTGGAGAGGGGAATGTTAGGCACTTTGATGGTGTTCCTCTTCTTAAGAATTCAAGATGGGAGTGTAGGTTTGATGCTATTGATAATGATAGTGATTAG


Promoter Sequence:
>Vu_17156::LG4:32548019-32550019(+)
TCACAGTTAATGTTAGTGTTTTGCCAACTTCATGAAATGATTAGCAACGTATATTATTGTATATAAAGTTATTTTTTTTAAATGTAATCATTATAAGATAAAATTAATTATATTTATGTGTGATTAACCACGAGTTAACGTGGAATGCAAAATATGAGTGGGATACTGAGTGTACTCATGGGTATATCACAGGACAGGTTTTGCTTCGTTGGAAAAAAAAACACGCTTAACTGAATTTTAAACGCTCCTTTGTGAAATAAATAATTAAACTATCTTATATTGAATTACATTTTAACACCACTCTTGAAAATACTAATGCATGAATGGCATATATCCTAGGTTTGGTCGATGAAACAAGGAACCTGAAAATGGCATATATCCTAGGTTTGTGAAATAAATTATTTAAAAAATATATATTTTATACTATATTAATATATAAAAAAATATATTTTGGTACATCAATCAAATTAACTACTCTTTTCATTTCTTTTTTTGGTTTTACTTTCTACTTTTTCTACTTTTTTCCCCCTCCGTTCAAATAACTATACTGTCTACTCTTTATTTTTTCTCTAAGAGCTCCGTGTTTTCACACCAAGATTGTGATTGATAATCTTAAAAACAATTGGAGACAAATTATAATTCAAAGGCTAATTCTTTTATGGTTTTGTATTTATCTAAATTAAAAGTGAATTGTTTACAAGAAGGCCAGAAATTAAAATAGATAAATACAAGGTTTTCTCAAAGACATTAGTATAATTATTCTAATTTTCCACTTTATTATCTCTCTCTCTATATAGTTTTACCACATTAATAAAATAAAATAAGATAATAATTATTTTTTATTTTATTTTTAATTTAAATAATATTACCTTTCATTTCTATTCTGTACTAAAAAGATCCATATGTTGCAACTTTAAAATGCATCTTTATAGTGGTCAAAATGTGTTTCATAAAATAATCTTTATTGGTGTCGGTGGTTATAATGTGCACATTGGACATGGTCAAAAGTTGAAATATTACTCACTTCACTAATCATAAGTTACATATATACTCAGTTAGGTTGAGTGCCACTATCTTATTCTTATTCATAGAATAAAATAACAAGTGGAAGAATGTTTCTGCTAATGCTTACGCACAAATTTCTCTAGACAATAATTACATAACAAATCATAAGCTGGATGCTTAGTGTGTACACAGTTTCGATCTCTTGCTCAATCATTCGAACAATGACTTTTGTTATTTTGAGTTATTATTGTGCAAGCAACAACACAACTTGAATTTAAATTGAGTAGATATCAACTTTTTTTTTCTTAATTCGGTTTTCTATTTCCGCACTCAGATTAAAGTTCTTCTTTTTTACAGGTCAAACTAGTATGCACTTTGTTGATAAAGTCACTAAAAATTTGGTGATATTAGGATTAAATATAATCGATCTATTAAATACTTTGTATTTATAGATTTTAAAATTAATATTAATCTAATTACGATTCAACTGATAATAATCTTACTTAGTTTTAATTCAATATGATAATAGGATTTCTGTGCAACCAATCGGTCTACAACGGTTAACTGCACGAGGAGTTACTCTCTAACCGTGTCACTTGAATAAACCAAACAAAATAAACAACACACGTAAATGAACAATGTTAATGTTTAGCAGAATTTCTACGGCTATGTCTCAATTATAACAGATGTTACAGTGCAATCACAGCATTACCCCTACATCATGATTCACGCACAGCACATTTTCCTGGCAAACCATGTTACATTTCTTGACCAACAAATCATTCGAAACTTGTCATCAAATCCGATTGGTGAATAGCAAAGATGCATTGGCCTTAGATACATGTATGCATTCATGAAGTCAAGGTCTTCCAATAAACGGACATTTTCTCACTGTCCTTTACGGTGGATTGTGACTTCAAGGAACACTTTCCACAGATGCGTGTTGCTCGAGTTGGAAATACAAACAAGACACTCAACACGAATAGACCACATCA


Gene Sequence:
>Vu_17156(+)
ATAGATGTTTCATCACTGTTCAGTCCAAGTTTAAAGTGAAAAAGTCTTCTTTATCTTCCTTTGCTGCATTTCAGAACCACTGCACAAACACATGACAATACCATTTTACTACTGTCTAACCATCTTCCTATTCCTGAGCTGTGTAAAATCTCAGATTCAGCTGCAAGATCAAGAGCATGCAGTGTTACTGCAGATAAAGCAGCACCTACAAAACCCTTCGTTCCTCAGTCACTGGACCCCTTCAAACACCCGTCACTGCTCCTGGTCTGAGATAACATGCACCGATGACTCTGTCACTGGATTAACTCTGTTCAAGAGCAATATCAATCAAACACTTCCTAATTTTATGTGTGATCTTAAAAATCTCACACATGTTAATTTCAGCTTTAATTCCATTCCGGGGGAGTTTCCAACGTTTCTCTATAAATGTTCCAAGCTGGTGTCATTGGACCTTGAAGGGAATGAATTTTCTGGTAGCATTCCTAATGACATAGACAAGTTGGTTAACTTGCAGCATCTTAATCTCGGTTCCACCAGCTTTAGTGGTGATATTCCTGCAAGCATTGGAGGGTTGAAGCAACTGAGATTTCTTCAACTTCACTATTGTCTGTTTAATGGCACTTTTCCTTCTGAGAGTATTGCCAACTTGTTCAATCTTGAATTCTTGGACATTTCCTCTAACTTAGTGCTCCCTCCTTCAAAGTTCCCATCAGGCCTGACCCAGTTGAAAAAACTGAAGTTCTTGCACATGTACAGTTGCAACTTCTTCGGGGAAATTCCTGATACCATCGGAGAACTGGTGGCTTTAGAGAACTTGGATTTGTCACGAAGCAATTTCAGTGGACACATTCCCAAAGGCTTGTTCATGCTCAGGAATTTGACCATACTCTACCTCTTCAATAACAGTCTCTCTGGGGAGATTCCTGGTGAGATTGAAGCATTGAATTTGATCGAACTCGATCTTGCACAGAACAATCTCGCAGGGAGAATACCTCATGATTTTGGGAAGCTCCAAAAGTTAAGATGGTTAAGTTTGTCTCTCAATAACTTGTCAGGGGAGATTCCACAAAGCTTAGGCCGTCTTCCATCTCTCAAACATATTCGTATCATATTCAACAATTTTTCAGGTATTCTTCCTCCTGATTTAGGTCGCTACTCGGAGCTCAAAACATTTCTGGTTGCAAACAATAGTTTCAGTGGAAAGCTCCCGGAGAACTTATGCTATCATGGCCAGTTACAGAATTTATCTGCTTATTGTAATTATCTGAGTGGGAACTTACCAGAGTCACTTGGCCACTGTAGTAGTTTGACTGATGTAAAAATTTATAGCAATGAGTTTTCTGGCAACATTCCTAGTGGTCTTTGGACTCTCAACTTGTCAGATTTCATGGTGAGCAATAACAAGTTCACTGGTGAGCTTCCTGAGAGATTTTCCCCAACTATTTCACGCTTGGAGATAAGTCACAACCAGTTTTCTGGTAGAATTCCAACTGGGGTATCTTCATGGACTAACATGGTTGTGTTTAAAGCCAGCGAAAACTACCTCAATGGGAGTGTTCCAAAGGAGTTAACAAATCTTTCCATGCTAACAACTCTATTGCTTGATCATAACCATCTCACAGGGCCACTTCCATCAGATATAATATCATGGAAGTCCCTAGAGAATCTAAATTTGAGCCATAACCAACTCTCCGGAAAAATCCCAGATGAAATTGGTCAGTTGCCTGTCCTCAATCAGCTTGACCTGTCAGAAAACCAGTTCACAGGTCAAGTTCCTTCACTACTTCCTAGACTTACTAATCTCAACCTATCCTCTAATCATCTTACAGGGAAGGTTCCAAATGAGTTAGAAATCTCTGTGTATTCCACCAGCTTTTTGAACAATCCTGGCCTCTGTGCTGATACCTCAGTACTGAATCTGAGCCTGTGCAGTGTTGGTGCTGGCTTTGAAAAGAAAACCAAAGGCTCTTCTTGGTCTATTGCTTTGATTCTGTGTCTGGTGGCAGTAGCCTTCTTGTTGGCTTTGCTGATATCAATCATGATTATCAAACTTTTCAGAAGAGGGAAACATGTGTTGGATAACTCATGGAAACTCGTCTCCTTTCAAAGGTTGAGTTTCACCGAATCAGACATAGTGTCATCAATGACAGAACACAATGTTATTGGAAGTGGTGGATTTGGCACAGTGTACCGTGTCCCTGTTGATGGTTTAGACTATATTGCTGTGAAAAAGATCTCAAGCAACAGAAAGTTAGACCGAAAGCTAGAGAGCTCGTTTCGTGCAGAAGTGAAAATACTGAGCAACATTCGTCATAAGAACATTGTGAAGTTGTTGTGTTGCATCTCTAATGAGGATTCTATGCTCCTTGTGTATGAGTATTTGGAAAACCGTAGCTTAGACAGGTGGCTGCACAATAAGGACAAATCATCAACTGTGTCGGTTTCAGTCGATCATTTTGTGCTTGATTGGCCAAAGAGATTGGAAATTTCCATTGGGGTTGCTCATGGTCTGTGCTACATGCACCATGATTGCTTTCCACCGATTGTTCATAGAGATGTAAAATCAAGCAACATCCTTTTGGATGCTCAGTTCAATGCAAAAGTAGCTGATTTTGGTCTGGCTAGGATGTTAATGAAGCTAGGGGATCTTGCTACCATGTCTTCAGTGGTTGGCTCATTTGGCTACATGGCTCCAGGTGAATTATCACCTGTTAATCAATTCTTTTCTTACTCCAGATATAATTTTAGAAAAAACTATGTTAACAACTTTTTTATAATTGGTTCGTATATTTGAAACAGATTAATCACACGCTTTCATATAGACTCTTGTAAAAAAATTGTTAAAAAAACATTTTCTTTTTCGTTTGTGTTTCAAATTTTGATATTTTAAAGTCGAATAAATATAGTCTTTTTAATTTAAATATCAGTTTGAAACATCGTTTAAATATGGTCTATCGGTTACATTGTAGAATAAAAAATGATTTTTTTGACATATTTAAATTTTTTACATTCATTTGAAACTATTATTTTCTACTTTTTACTTTTTTTTTTGAAAAAATAAAAAAATTTATACTTTTATGATCATTTTATCTTTTTTGTGTCAAATGAATGTAAAAGTGTGTCATAATAACATTATTGTTGCAGAATATGTTCAAACAAGGCGAGTCAGTGAGAAGATTGATGTGTTCAGCTTTGGGGTTGTACTGCTGGAGCTGACAACAGGTAAAGAAGCTAATTATGGTGATGAACATTCTTCCCTTGCAGAGTGGGCATGGCGTCACATTATCGTGGGAAGCAAAATAGAAGAGCTGCTAGACAATGATTTCATGGATCCAAGTTACACAAATGAAATGTGCAGTGTTTTCAAACTTGGGGTCTTGTGCACTTCCACACTTCCTGCTAATAGGCCTTCCATGAAAGAGGTGCTACACATGTTGGTCACCATAGGAGAAGGGCTTGCTTTTGGAGAGGGGAATGTTAGGCACTTTGATGGTGTTCCTCTTCTTAAGAATTCAAGATGGGAGTGTAGGTTTGATGCTATTGATAATGATAGTGATTAGTGAGTAATTAACAATGTGTTTGTTTAAAGATGGATATGTTAGAGAATGAATATCAGAAAAAAAAAATTAAGTGATTTTAATGTTATAAGAAATATATTTGTTTAACTT