Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17102 LG4 32106333 32108586 PREDICTED: cyclin-dependent kinase F-1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 32106352 3_prime_UTR_variant
A/C 32106490 3_prime_UTR_variant
C/G 32106507 3_prime_UTR_variant
A/T 32106536 3_prime_UTR_variant
G/C 32106579 3_prime_UTR_variant
T/A 32106601 missense_variant p.Ile456Phe
C/T 32106693 missense_variant p.Gly425Asp
A/T 32106717 missense_variant p.Val417Asp
T/A 32106765 missense_variant p.Lys401Met
T/A 32106766 stop_gained p.Lys401*
A/T 32106778 missense_variant p.Leu397Met
A/G 32106806 synonymous_variant p.Asp387Asp
G/A 32106848 synonymous_variant p.Thr373Thr
T/A 32106951 missense_variant p.Glu339Val
T/A 32106954 missense_variant p.Asn338Ile
G/C 32107041 missense_variant p.Ala309Gly
A/G 32107451 synonymous_variant p.Asp172Asp
G/T 32107536 downstream_gene_variant
C/A 32107537 downstream_gene_variant
A/T 32107540 downstream_gene_variant
T/A 32107823 downstream_gene_variant
C/A 32107875 downstream_gene_variant
A/T 32107877 downstream_gene_variant
T/C 32108280 synonymous_variant p.Ala47Ala
A/G 32108287 missense_variant p.Val45Ala
C/G 32108337 synonymous_variant p.Ser28Ser
C/T 32108543 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17102.1
MDPPAKSWSIHIRSEITAKYDVIGWVGSGAYADVYEGRRRSDGAVVALKEVHDSQSASREIEALRILKGSQNVVVLHEFFWREDEDAVLVLEFLGTDLAAVIGKGGVGVGEVKRWMVQALSAVDACHRNMIVHRDLKPANFLVSDDGVLKLADFGQARILVECGFDGHQEDDDASNSERSLQQHPEAISQLDNLNQTEHENPDQRTLSHEEYFRVLDEMKTKSYSYDTDKEANIHDGNTSCLATCTTSDIDDELCKGSFTYEAEEVGGNELGCLTSCVGTRWFRAPELLYGSTDYGVEVDLWSLGCVFAELLTSKPLFPGTSDVDQLSRIVSVLGNINEETWPGCPKLPDYGKISFFKVENPSGLEACLPNCTPDEVSLVKRLVCYDPDKRATAMELLQDKYFSEVPLPVPVSELRVPLISIGQGKDRPGGHNEMGSDSDLEEFRTLNITTTDSDISIQIP*


CDS Sequence:
>Vu_17102.1
ATGGATCCTCCGGCCAAGAGTTGGAGCATCCACATACGCTCCGAGATAACTGCCAAGTACGATGTTATTGGTTGGGTCGGGTCGGGTGCCTACGCCGACGTGTACGAAGGACGGCGCCGCTCGGACGGTGCGGTGGTGGCACTGAAGGAGGTGCACGATTCCCAATCGGCGTCTCGCGAAATCGAAGCCCTGCGGATCCTGAAAGGGTCCCAAAACGTGGTCGTTCTGCACGAATTCTTCTGGCGCGAGGACGAGGACGCGGTTCTCGTGCTCGAGTTTCTCGGAACCGACCTCGCCGCCGTGATCGGAAAAGGTGGTGTCGGAGTCGGTGAGGTTAAGAGGTGGATGGTGCAGGCTCTGAGTGCTGTGGATGCGTGCCACCGGAATATGATCGTTCATAGAGACTTAAAACCCGCGAATTTTTTAGTTTCCGATGATGGGGTGCTCAAGTTAGCAGATTTTGGACAGGCAAGGATACTAGTGGAGTGTGGATTCGATGGTCACCAGGAAGATGATGATGCTTCAAATAGTGAAAGATCACTCCAACAACATCCTGAAGCCATTTCCCAGCTAGACAACTTAAATCAAACTGAACATGAAAACCCAGATCAGAGAACCTTGAGTCATGAAGAATATTTCAGAGTTTTAGATGAGATGAAAACCAAGAGCTACTCTTATGACACTGACAAGGAAGCAAATATCCATGATGGAAACACCTCATGTCTTGCAACATGCACAACGAGTGACATAGATGATGAACTTTGCAAAGGTTCTTTTACCTATGAAGCTGAGGAGGTGGGAGGGAATGAACTTGGCTGTCTGACATCATGTGTTGGAACACGCTGGTTTCGGGCTCCTGAGTTACTGTATGGATCCACAGACTATGGTGTAGAGGTTGATCTTTGGTCATTGGGGTGTGTTTTTGCTGAGCTCTTAACATCGAAGCCATTGTTTCCTGGAACAAGTGATGTAGACCAGCTTAGCAGAATTGTGAGTGTTTTGGGGAACATTAATGAGGAAACTTGGCCTGGTTGTCCCAAACTTCCTGATTATGGAAAGATCTCATTTTTCAAGGTGGAAAACCCCAGTGGTCTTGAAGCATGCCTGCCCAATTGCACCCCTGATGAAGTTTCCCTAGTCAAAAGACTGGTTTGCTATGATCCAGATAAGAGAGCCACAGCAATGGAGTTGCTTCAAGACAAGTACTTCAGTGAAGTACCACTTCCTGTTCCAGTTTCTGAGTTGCGGGTTCCTTTGATTAGTATTGGACAAGGCAAGGATCGCCCTGGAGGGCACAATGAAATGGGTTCTGATTCTGATTTGGAGGAGTTTAGAACTTTGAATATCACTACAACTGATTCTGATATTTCTATTCAAATACCTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_17102::LG4:32108586-32110586(-)
TGGTCCAAAAGACAGTTAAAGAAAAGTTAATAGAACAGGCAGGTTTGTTTTAAGGTTTAGCATTTCATTACAATAACTTGAGAATCTGTCAGAACAGCCAGGTTTGTTTCCTGCTCATGCATGCATGTGTTTATTCCTGTTACCTTCTTTTATCTGTTTTCATTCAGAAATTTATAAGTTCTAAAATGTCAATAATAGCATTAGTTTAATCTAATAATAAGGTGTACTAACTATCATCAAACTTTAATACTTCATCAAACTATTAAACTTGTACTGTTTATAATGTTTACAGCTTATGTTTTTCTCCCCAATAATTTTGTAGTTTAGTTTTCAGTTTTTACATATTTTATTAATTAAAAAAATTCGTATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAATTGTACAAATTTAATTGTGGCCATGCAATTGATAAAATAATGTTGTTCCTTGGAAAAAAATTATGACAAAGCAATATTTGTTTTCGGATGCATGTCAACACTTTTATTACATATTAATAAATTATGCTAAAACTTAAAAGCATAATAACGAACGAATCAGTGAAAAATGAAGGATAATAAAACTCGTAATAATAATAATAATAATAATAATAGTTAACCAGAAAATGTACATGGTGATTAAGTTCTTAGATCAATTGATGAAAAACTATTTATGATATTTTATTTTAAAATTTATGAATTCTCTGTATAATAAAAATAACTTTACTTGATTTTGACCAAAATATCACAGATAATAAAAAATTCTTCAAATATATAGTAGCACGGCTATATATTTACTATAATTTTAATTCAATACTATTAATTAATTGAAACAATTTTATTTAATTGAAAAAAGCTCGAAACTCTGTACCTTTGACGTATTGCCCATCCATCACAAATCAACTATTAATAAATAGTTTGCATCAATTATTTAATAGAATAGCATGTTTTAACGCTATTTTTTCCATGTAATTAGTTATATTTCTAATATTATAAAGTTTTTTCTTTGGTTAATCATGATGCATAGTAAAATTATTTATTGTGCTGGTTATTTTAAAAATTATATAGATAGTATAAAAGAAATATACTAGTAAGAATCACAATTGAGTTTTATGACTGAACATGAGATTAATCAATTTATATTTATGACGTAAAAAACATACTATTTCTTTAAATTATTAGTAATAGTGTATCTGCTAGCTTTTCCGTTTTCAGATTATCACAAATAATGATGTATGATAAGATTATTAGTTCATAATATTTTTTAATTAAATAATAGTTCAAAATTCTTCCACTAACAACACATAAACATTAAAGCTTAAAATTAAATAAAAGTTAAATATGTCTGTAATATTAAACTAACAGTGTGAAAGTTTTACTCTAATCATATACATCAATTATCGTATACATAAATATTTGTTTTATGTTTTAAGTGTGGGAGTCAAAATCATTTGTTTACTGTTTTATAAGTAACCATAAATTTGAACGTGTATTAAATATAATTACTTGATTTTTTATCTTAAAATTGTATTTATAAATTTTTTATTAACAACAATCTAATAATAACTTAAATGATAATAATATTAAATGTAATGTGAATTACAGTTTCAAAAGTAATACATGATTGTACTTATAGTATGCCTAATCGTTTGGATTATCCAATGTTAATCAAACTATATCATACATATTACTTGTTGTAAATTTTTTTTCTAATAACTATGATTTTAGTATTGGTCAACTTTTTATATCAAAAAAATGCTTAATGATTTTTAAAAAGAACATTGTCTTTACTATTGAGATTTAATGTAAAACAAAATTTGATATAAACCAAAGCTGTAAGAAAATATTTATAATTAATACATTACACAAACGGAAAATTATTCAATTGAGTCTTCATAACGTAAATAAAAACTGAAAAAATAAAAGTGTTTGATTATTGATTTCATTGTTGTTTTGGTAAACATATATCAAAGTGATAAAACCAGACAATCCC


Gene Sequence:
>Vu_17102(-)
AAACGTAAAAGAAACATTTTCCTAAATACAACAATTTAGAAAAGGACAAAGCAAAGAAATAGTGTGAAACATTCAGACCCAAAGACCATAGCCATAGTCAACACAGTTTCCTTCGTTCTTCTCAATTCACCAACTAAATTTTTGTAAAACTTTGCGTTGATCACTGATGGATCCTCCGGCCAAGAGTTGGAGCATCCACATACGCTCCGAGATAACTGCCAAGTACGATGTTATTGGTTGGGTCGGGTCGGGTGCCTACGCCGACGTGTACGAAGGACGGCGCCGCTCGGACGGTGCGGTGGTGGCACTGAAGGAGGTGCACGATTCCCAATCGGCGTCTCGCGAAATCGAAGCCCTGCGGATCCTGAAAGGGTCCCAAAACGTGGTCGTTCTGCACGAATTCTTCTGGCGCGAGGACGAGGACGCGGTTCTCGTGCTCGAGTTTCTCGGAACCGACCTCGCCGCCGTGATCGGAAAAGGTGGTGTCGGAGTCGGTGAGGTTAAGAGGTGGATGGTGCAGGCTCTGAGTGCTGTGGATGCGTGCCACCGGAATATGATCGTTCATAGAGACTTAAAACCCGCGAATTTTTTAGTTTCCGATGATGGGGTGCTCAAGTTAGCAGATTTTGGACAGGTTTAAAGGATAAAGTTTTCGACTTCGTTTTAATCTACTTTTGGGTTTTCTGTTTTTTTGTTTTATGGGATTGTGTTGGTTACTTGATCATTACGTGACTTGTTTTTTTCTTTTCTCTTTTTTTATTTGATTATGTTATGTGGTTTGTGTTAATCTATGATCATGGTGATCGATCGTATTTCTGTGGCACAGGCTCATAACCTTGGTTGCAATTTTGATAGTTTTTGTTTTGCTGCTGAAACCTGTAGTCGATGATTCTCTTCTCTATCTAAAGAATTATTTGAATTTGGATCGGGGAAAATGGAATAGAGGTTGATTTTCATGATTTATTGAGCAATAAAAAATCATCTTATATACAACTTCTATGAAACTTTCATGACAATCATCTTCTACCTTTTTCTTTTTGTCTTTGTTTGCTGATATATGTGAATGTTTAGTTTGATTACTTTTTCAGGCAAGGATACTAGTGGAGTGTGGATTCGATGGTCACCAGGAAGATGATGATGCTTCAAATAGTGAAAGATCACTCCAACAACATCCTGAAGCCATTTCCCAGCTAGACAACTTAAATCAAACTGAACATGAAAACCCAGATCAGAGAACCTTGAGTCATGAAGAATATTTCAGAGTTTTAGATGAGATGAAAACCAAGAGCTACTCTTATGACACTGACAAGGAAGCAAATATCCATGATGGAAACACCTCATGTCTTGCAACATGCACAACGAGTGACATAGATGATGAACTTTGCAAAGGTTCTTTTACCTATGAAGCTGAGGAGGTGGGAGGGAATGAACTTGGCTGTCTGACATCATGTGTTGGAACACGCTGGTTTCGGGCTCCTGAGTTACTGTATGGATCCACAGACTATGGTGTAGAGGTTGATCTTTGGTCATTGGGGTGTGTTTTTGCTGAGCTCTTAACATCGAAGCCATTGTTTCCTGGAACAAGTGATGTAGACCAGCTTAGCAGAATTGTGAGTGTTTTGGGGAACATTAATGAGGAAACTTGGCCTGGTTGTCCCAAACTTCCTGATTATGGAAAGATCTCATTTTTCAAGGTGGAAAACCCCAGTGGTCTTGAAGCATGCCTGCCCAATTGCACCCCTGATGAAGTTTCCCTAGTCAAAAGACTGGTTTGCTATGATCCAGATAAGAGAGCCACAGCAATGGAGTTGCTTCAAGACAAGTACTTCAGTGAAGTACCACTTCCTGTTCCAGTTTCTGAGTTGCGGGTTCCTTTGATTAGTATTGGACAAGGCAAGGATCGCCCTGGAGGGCACAATGAAATGGGTTCTGATTCTGATTTGGAGGAGTTTAGAACTTTGAATATCACTACAACTGATTCTGATATTTCTATTCAAATACCTTGAACTCGAAGGATGTGATGCACCTTGAATACTGTTTTATATTTATTTATAAAAAAATGGAATTCAAGTAGCATCAGATTCTTGGGACAGAATTTGTCCTGTGTTCTATTGGTATTTTATTTGCTGAATATCACTAGTGCAATCCGTGGTTGGATTCTTTGGAATAAGAATATCTTTTGGCAAGAATTCTGAAGAAAGGATAAAGTATTTAAAAATAAGCTTTATAATAAAATAGAATTGTTGTTTTACCA