Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17017 LG4 31325481 31328496 PREDICTED: zinc finger protein CONSTANS-LIKE 16
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 31325671 3_prime_UTR_variant
T/A 31325959 stop_gained p.Arg393*
A/T 31326171 downstream_gene_variant
A/G 31326182 downstream_gene_variant
G/C 31326186 downstream_gene_variant
T/A 31326260 downstream_gene_variant
T/A 31326274 downstream_gene_variant
C/T 31326331 downstream_gene_variant
G/T,* 31327163 downstream_gene_variant
T/A,* 31327167 downstream_gene_variant
C/T 31327415 missense_variant p.Gly275Glu
G/C 31327490 missense_variant p.Ser250Cys
G/C 31327639 missense_variant p.Asn200Lys
A/T 31327666 synonymous_variant p.Ala191Ala
G/T 31327676 missense_variant p.Ala188Asp
T/C 31328322 5_prime_UTR_variant
C/A 31328368 5_prime_UTR_variant
T/G 31328412 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17017.1
MKEASALGARTARACESCLKVRARWFCAADDAFLCHGCDNMVHSANQLARRHERVKLQTASSKVNYSVTLNQNNKVAWHSGFTRKARTPRHNSKHVTVQLQEQQKKIVHEEEVFFNNTISLPLVPELGSEEALHNYESEEQLLCRVPVFDAELCSVYNEVKEEVLAGEEVFDLDNFSSELLPSDMDLAEFAADVESLLGNGADEDSSEHVKGSELLLDCKEEDEEMDACVDAVGAKETMVKVKDEEELDSDTPCHLDSIILDMNSEAFNWNDIVGSESLAQEQEEEASTVGTDKKDMFLRLNYEDVISAWASQGCSPWTTGTPPNFNSDDCWPDFLGSNGGDVQCCYGEMKSLRGHADGGREARVSRYREKRRTRLFAKKIRYEVRKLNAEKRPRMKGRFVKRTSIALPA*


CDS Sequence:
>Vu_17017.1
ATGAAAGAAGCAAGTGCATTAGGAGCTAGAACTGCTCGAGCATGCGAGAGCTGTCTAAAAGTAAGAGCACGGTGGTTTTGTGCTGCTGATGATGCTTTCCTTTGCCATGGCTGTGACAACATGGTTCACTCGGCAAACCAATTAGCACGCAGGCACGAAAGGGTTAAGCTTCAAACTGCATCCTCTAAGGTCAACTACTCAGTGACCCTTAATCAGAACAATAAGGTAGCATGGCACAGTGGATTCACACGCAAGGCAAGAACACCGCGCCACAACAGCAAGCACGTAACGGTGCAGCTACAAGAACAACAGAAGAAAATAGTACACGAAGAAGAAGTGTTTTTCAACAACACCATTAGTCTTCCCCTTGTGCCAGAGCTTGGAAGTGAAGAAGCACTGCATAATTATGAGAGTGAGGAGCAGCTATTGTGTCGCGTGCCCGTGTTTGATGCTGAGCTTTGTAGTGTATACAATGAAGTGAAGGAAGAGGTTTTAGCTGGTGAAGAAGTCTTTGACTTAGACAATTTTTCTTCCGAGCTTCTGCCATCAGATATGGATCTTGCTGAGTTTGCTGCTGATGTGGAAAGCTTACTTGGAAACGGAGCTGACGAGGATTCATCTGAGCACGTGAAAGGATCAGAACTGCTGCTTGATTGCAAAGAAGAAGATGAAGAAATGGATGCATGTGTTGATGCAGTTGGAGCCAAAGAAACAATGGTGAAGGTCAAAGATGAAGAAGAACTTGATTCTGATACACCTTGCCATTTGGATTCGATTATTCTTGACATGAACAGCGAGGCCTTTAATTGGAATGATATTGTTGGGTCAGAATCACTTGCTCAGGAACAGGAAGAGGAGGCAAGTACAGTGGGAACCGACAAGAAGGACATGTTTTTGAGGCTAAACTATGAAGATGTTATTAGTGCTTGGGCCAGTCAAGGTTGTTCTCCATGGACAACAGGAACCCCACCAAACTTCAACTCAGATGATTGCTGGCCAGATTTCTTGGGTTCGAATGGAGGGGATGTTCAGTGCTGTTATGGGGAAATGAAAAGTTTAAGAGGGCATGCAGATGGTGGAAGAGAAGCAAGAGTGTCAAGATACCGAGAGAAGAGAAGAACTCGTTTATTTGCAAAGAAGATAAGGTATGAAGTGAGGAAATTGAATGCTGAGAAAAGACCTAGAATGAAAGGTCGATTTGTGAAGAGAACATCCATTGCTTTGCCAGCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_17017::LG4:31328496-31330496(-)
AAATCCTGTTTCTTCTTCTTATTATCTAAATAAAATAAAGCAAAATTTTGTCACCTAGTTAAGTAATATAAAATATATGAATTGAAAGCATGGGAGTTTTCTATTATTTTATCATTTTTATTCCTTATTTTATTTTAAAATCCTTATTTCAAATTAAAATTTATAATTTTAGTTACAATATTGATAATATAAATATTTTTTACGTTAGTATCTAACCACAAATTGATATATGTAACATAAGATTATTGTTTTTTTGAAGAAATATAGAACTATAAAAATCATATCTAAGATGATATTCATAAATTTATTAACAATGGTCAATTTTTGCTCAAAATTAAATTTATTACAATAAATAAATAAACAAACAAACATTTTCATCAATTGCATCACTTTGATAGCTATGAAATATCTCAGACTTTATCAGTTACAGATCGTGGCATGCATATTCTGAGATTCTGCTATACGAAAGAAAAATATCTGAATAATGTTACGTTCATATCTCATTACACACATACATGTGTCATAAGCTAGCTTGCTCCTATGGTTCCATCAAACTTGAAGATTTTATAACATCAATGTCGAATTGATATTAACATTGTACTAAGATTCTCTCTACACTGCCCCGAGTTACTGCATAGAAGATAGATAGCAAAGAATTTGTTCCCTCTGTGCCTGTCCATGTCCCCTTTTTTCCTCTATTTGTTTGCAAATTTACGCCAAAGGATAAGATCGTAGGAGCACCCATGATGGAGAATTTAATGAAAGGAAAGTTGTAGAAGGGTGCCAAGGAAGAGGCTCGTCACTGTTCATAACATTGCAGAACCAAAACAGTCTCAAAAATCAACCTTTTTGGCTGCATCTATGTGTGTCAATATATGGTGCAATTTGTGGTTTTCATTATTAGTAGAAAATATATGGGCCCTGATAAAATGCAGGAAATTTTATGGTAAACTATTCTTTGGACACATTCCTAGAATGTCAACATTTGTGGCAAATTTGTTACAATATCACTGTCTGATTAATTGCTCTTATGTTATCTCTAAGTTTTCACATCATAATTGCCTCCCATGAATGGAAATTTGAGCTAACAAAGCTAAAAATATGAAGATGTATGAACACAACCATTTCACTGTCTTGGTTGGCTTATATGCACCAATCAAATAAACAGGTCATTGTTTATACTAGAAAGTGAGTTTTTAAGCTTAATTCATTCCCATAAAACTGGTCCCTTCACGCCGAGGTATAGACATCTCGTGATAGTAGAAATTGCGTGGTCCAATAGCGACGCCCACAAAACCTGCTTATAAGGTAAGGTTTGCACCTAATTATCTAGTCGATGTGAGACTTCCAACAGTTTACAAAAATCCTCAAATCAGAAAATCATGTGATTGGCCAATAATGGTTCTCTTGGTGGACTTTTTTGCTCAGAAATTTGAGCCACCATCGTAAGATAAAAAAAAGGAAACAAGGTGAAATCCCAAACTTACCAAATTTAACCAAGTTTGGGCACACTCAAGTGGAAGAAAACACAAGGCATATAGATTTATCTGTGGTTCAAAATTCTCTGAAGCTTAACTCCACCAGATTAGTCAAGCTGAACCATATGTTATTCAAACGTAGGGCTGCATCTACTGGTGCAAAATGCATCATTGCAAAGGTGAATGGTTGAGAAGTTGAAGACAAACCATAGGGGAAGTGAAAGCAACGTGAAGTTAGGACCGCAAAAAGGAATTATTGAATTACAGTTGCAACACAACAAAAAAGGTCTTACTCCAGCACACACCAACAACACTGACACTGGTAGTCACTCACAAATAACCTGCATTGGATCCACCAGAAATCCCATAAAAGGAAAGCTAACCAATAAGAATTCAGAGAATAAGATGAACATCAAATCTCCAGCCAATGAGCATTGCGATAAGACCAAATTGTGGGTCCTAACACCTTCACTCAATGTCTTGTAGCAATCTTATACATGACCAAACCATAATACTAATTAC


Gene Sequence:
>Vu_17017(-)
ATAGTATAATACTTTCTACTTAAACTAAAGAAGAAACCAAGTAAGAACAAACTATAAGACCCCACTGTACTTCTTTCTCTTCACATTCTCAAACCCATCATAACCAATAATTGAATTTGAATAATCTGGGGGCTCTCTAGATCTATGCAGTTATACTCCCTCAACATTGTTATGATCCTTTGTTGGTAATAACCAGTTAACTGTTCAGTGCAGTTCTCTTTTGCAGCCAAAAATCAGTTCCTAACTTTGACCAACAAAATGAAAGAAGCAAGTGCATTAGGAGCTAGAACTGCTCGAGCATGCGAGAGCTGTCTAAAAGTAAGAGCACGGTGGTTTTGTGCTGCTGATGATGCTTTCCTTTGCCATGGCTGTGACAACATGGTTCACTCGGCAAACCAATTAGCACGCAGGCACGAAAGGGTTAAGCTTCAAACTGCATCCTCTAAGGTCAACTACTCAGTGACCCTTAATCAGAACAATAAGGTAGCATGGCACAGTGGATTCACACGCAAGGCAAGAACACCGCGCCACAACAGCAAGCACGTAACGGTGCAGCTACAAGAACAACAGAAGAAAATAGTACACGAAGAAGAAGTGTTTTTCAACAACACCATTAGTCTTCCCCTTGTGCCAGAGCTTGGAAGTGAAGAAGCACTGCATAATTATGAGAGTGAGGAGCAGCTATTGTGTCGCGTGCCCGTGTTTGATGCTGAGCTTTGTAGTGTATACAATGAAGTGAAGGAAGAGGTTTTAGCTGGTGAAGAAGTCTTTGACTTAGACAATTTTTCTTCCGAGCTTCTGCCATCAGATATGGATCTTGCTGAGTTTGCTGCTGATGTGGAAAGCTTACTTGGAAACGGAGCTGACGAGGATTCATCTGAGCACGTGAAAGGATCAGAACTGCTGCTTGATTGCAAAGAAGAAGATGAAGAAATGGATGCATGTGTTGATGCAGTTGGAGCCAAAGAAACAATGGTGAAGGTCAAAGATGAAGAAGAACTTGATTCTGATACACCTTGCCATTTGGATTCGATTATTCTTGACATGAACAGCGAGGCCTTTAATTGGAATGATATTGTTGGGTCAGAATCACTTGCTCAGGAACAGGAAGAGGAGGCAAGTACAGTGGGAACCGACAAGAAGGACATGTTTTTGAGGCTAAACTATGAAGATGTTATTAGTGCTTGGGCCAGTCAAGGTTGTTCTCCATGGACAACAGGAACCCCACCAAACTTCAACTCAGATGATTGCTGGCCAGATTTCTTGGTAACTTCTTCTCCCAACCTTCTTCTTTGCTTATGTGACAATGTTAACTGATGCCTTTTTTGTACAACTTATTTCATGATAATAACTTTTCAGCTTCTGAGAGGACTTAACAAAAGTTCTATAATGTCATAGTTGTTCTCATATCTGACTACACGATGAGGAGGATTGTGTTATGCCTTCAATAATCAATACAAAATTCGTCGATATACCTAAATTAGAGGATTTTTTTGTTATGTCGTCGGTAACCAAATGTCAAATTCGTCGATATACCTAACATGCAAATTTGTAGGTAACCAATGATAGCTCGAGAGACTTCAATTGGTAACTTCTTCTCTCAACCATCTTTGCTTGTGCAGTGATGCTAGTTGTATTTAGTTTAACTTATTCTATAGTTCATCTACCTATAATACACTATGGCTAAAGGGAATTGTGTTATACTTTCGGTAATCAATGCAAAGATTTGTCCATACCTACTGTAAATCATCCATAAAGGGTTTGCTCTATATTTTTGGTAAGTTAACCAATGCTGGTCAGACTTATTGGTAATTTCTTCTCATCAACCTGCTTTTCCTATGCAAAAATTTCAACTGTGTTTGGTTTAACAATAAATTTTTCAGTTTTCTGAGAGAACTTTAAAAGAGTTCTGCGTATAAATATCACAGTTGATCTCATATATTTGGCTATAGAAAGAAGATTGTGCTATATCTTCTTCAATAATTAGTCAATGAAAAATTCGTCGATATACCTTACATGAAAACTTATAGCTGGTAAGGTAATGAATAATTTCTTGGTAGACTTCTTGGTAAGTTGTTCTCTGAACCCTCTTTGCTTATGTAACAATATCAGTTGTCTGTTTCGTTTACTTCATTTTATGAGAATAACTTTACAGTCTTCTGAGAGAACTTCAAAAAAGTTCTACCCATAATGTAATTGTCGATCTCACATCAGGTTAAAGAAGAAGAATTGTGTTACATCTTCAGCAATGAATACAAAATTCGTCGATATACCTAATATTGGAACGAACTTTAACATTCTTCTGAAGCTCAAATTTGATAAAGGTGACTGTTTGTATAGTGATATGCAAGTTTTTTGTTGTTGTTAAGGGTTCGAATGGAGGGGATGTTCAGTGCTGTTATGGGGAAATGAAAAGTTTAAGAGGGCATGCAGATGGTGGAAGAGAAGCAAGAGTGTCAAGATACCGAGAGAAGAGAAGAACTCGTTTATTTGCAAAGAAGATAAGGTATGAAGTGAGGAAATTGAATGCTGAGAAAAGACCTAGAATGAAAGGTCGATTTGTGAAGAGAACATCCATTGCTTTGCCAGCATAGTTATCATCATCAATCACCACTGACACCAACAAAGTAATCAAATTAATGGTTAACTTTTCCAAAGTTTGATTTTGTGGAAAGGTTAATTAGGTTAATTGATTATCATTAGATACTTGGTTTTGCCATGCACGTGCAATGCCGTCACTAGGTCAGGTTTCTCTTTCTTGGGATATTTATTGATTTCTCTAGCAGGTCCTAGTAGCTAGCTAGTACTAATGGAAATGGTAGCTCCTCTCAGCATTTTCATGGCTTTGGTATTCAATTTCAGAAGCCCTTTTTCAATATTGGTTATATATAAGAAAATGTAATGTATGCTGATGTTATTTTGTATATGTCTGTTTTCCTTAATTAACTCTTTGAGGTTACTGATTAACAGTGTTTAACAGATATCAGGTACTTAAATATCTACAAGTTTTACATCT