Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_17004 LG4 31202713 31203940 PREDICTED: transcription factor MYB21-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 31202847 missense_variant p.Trp270Cys
T/A 31202924 missense_variant p.Thr245Ser
T/C 31202935 missense_variant p.Lys241Arg
C/T 31203071 missense_variant p.Glu196Lys
T/C 31203574 missense_variant p.Arg82Gly
A/C 31203583 missense_variant p.Phe79Val
G/T 31203671 upstream_gene_variant
T/C 31203730 upstream_gene_variant
G/A 31203735 upstream_gene_variant
A/G 31203825 missense_variant p.Ile39Thr
A/G 31203923 synonymous_variant p.Ser6Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_17004.1
MRLAMSASSKSIICYSEEDTELRRGPWSIEEDDLLGNYIANHGEGRWNLLAIRAGLRRTGKSCRLRWLNYLKPDVKRGNLTSEEQLLIFELHSRWGNRWSKIAQQLPGRTDNEIKNYWRTRIQKQARYMKSETQRTTGFVEFFKALQMTRCLHKAQESSPSAMSLQDQEIPMPSNGGFHYSSFGIEATPETQITSQRGVNHLNQHEQNSDSEHNNGSSISNSESVNIQYMTQPLGCTTNQFQALDNYDFGICSYDGYNIDNSAYDMDSFNLAATMDAQNLELPVIGCQISETNSLNMESECSTRSNDELWQFMNI*


CDS Sequence:
>Vu_17004.1
ATGAGACTTGCCATGTCTGCTTCTTCAAAGAGCATCATCTGTTACAGTGAAGAAGATACTGAACTTAGAAGAGGGCCATGGAGTATTGAAGAGGATGATCTTCTTGGGAATTACATTGCCAATCATGGAGAAGGGAGATGGAATTTGCTTGCTATACGTGCAGGATTAAGGAGAACAGGAAAGAGTTGCAGATTAAGGTGGCTAAATTATCTAAAGCCAGATGTTAAACGAGGCAATTTAACCTCAGAGGAGCAGCTTTTGATTTTTGAACTCCACTCAAGGTGGGGTAACAGGTGGTCAAAAATTGCACAACAGCTGCCAGGCAGAACAGACAATGAAATAAAGAACTATTGGAGAACAAGGATTCAGAAACAAGCAAGATATATGAAATCTGAGACACAGAGAACAACAGGATTTGTAGAATTTTTCAAGGCTCTACAGATGACAAGATGTCTTCATAAAGCACAAGAATCATCTCCTTCAGCCATGTCACTCCAAGACCAAGAAATTCCTATGCCTTCTAATGGTGGTTTTCATTATTCATCATTTGGGATTGAGGCAACACCAGAAACACAAATCACTAGCCAGCGAGGTGTCAACCATTTGAATCAGCATGAGCAGAACTCAGACTCTGAGCACAACAATGGTTCAAGCATTTCCAATTCAGAATCAGTAAATATCCAATATATGACTCAGCCTTTGGGGTGCACTACAAATCAATTCCAAGCCTTAGACAACTATGACTTTGGCATCTGTTCATATGATGGCTACAACATAGACAACAGTGCCTATGACATGGATTCATTCAACCTGGCAGCCACAATGGATGCTCAGAATCTGGAACTACCAGTGATTGGTTGCCAAATATCAGAAACCAACTCGCTAAATATGGAATCTGAATGTAGCACAAGGAGCAATGATGAATTATGGCAATTTATGAACATATAA


Promoter Sequence:
>Vu_17004::LG4:31203940-31205940(-)
ATGGAAACTATATTACATAAATTCATCGATTCAATCGATAAAATAATAAAATGTGTGCAGTAAAGAAAATTATGCTCAAAATTCATAAGACCAGATTTATTAGTAGAAATTTGAGTAATCCCTAGAAAATATTAGATTTTAACTTCATTGTTGCTTTTCTATAACAAACAGAAAATGAACGAGCTTAATTACATCTTTGGTTTCCCATATATTATAAATAAATGTGAAATTTTTTTTGCAACTTCTAATTGATGAATTAAATGGTATTGTTACTATTCTAATTTCTTTATTTAAAAAGAAAAAAACTCAAGATATTCCATTAAAAATAGAACTAAAATCAGACTATTACGGTGCCAACAAAACTAAAATTACAACCTGGCCTTAGAATATGGTATAAAGTAAGAATATCTCACACATTAATAACTGTAGATTTTTATAATACAACCTTTTCATTATAAATTAATAATGGTCAAAATCACATTATTGTGGTTAGTGATACAAATACCCTAATTTATTTGGTTTCACACACCTGTATTAACTTGATCCTATACCAGAATTACCTACAAATGCATAAAATCACTTAAAAATAAATTCTTAACGATTAATTTATTACTTACAAAAAAAAACATAAAACCAGTGCAGCAACACAAAATGTACAGGGGAAAAAGAACATTGCAATTCAAAGAACTAAAAAGATATTTTATTCATATAACTTTTATTTTCTACCTTGAAGAGAAAAAGGGAAATCTTTCTTGATGCTAGTATAAAATATATTTTTTGGTCTAAGATCCCTTTAGCATCTGTGTCTGGAACTCACTTTTTAACAGCAACTGTGTTTATAAAGACAAATTTCTCTTTTAAGACCCATTATTTTTAGGGTAATGATATGTTAACACAACATTTTGATACAACTAAGTATGTTTGTTATTTTTTATTAAGTTTAGAATACATTAATACAAACAAATAAAAAATATCACATGTGTTATGTCAAAAAAATAACACATGTGCTGTGTCAAAAAATTTATGTTAAAATATCTTTTTCTTATTTTTACTATCAAAACTCGAATAACTACATTCAATTTGGAACTCACTTTTTAATTGCAGTTATGTTCTCTTTAACACCTATTATTTTTAGGATAATGACATGTTAACACAACATTTTGACACAGTATACCTGTCATTTATTGTTTAGTTTAGAATACATTAATACAATAACAAATAAATAATGAACCAATAAAAAATAACACTTTTTCTTATTTTTAGTACCAAAATTCGAATAAGTACATTTAATACACTCTTTCGCGCTAACGTATAACGTGAGATTAGACATTAATGGCCGATAGTTACTTGATAGTGGGTGAAACAATATTTTCACACAAATTTAACTAGGATATGTTCTAACCTGACTCTTATAGCATGTTAAGAAGTGAATTTTAAGCCTAACTCAATCCATAAAATCAGCTTGTAAAGTGAAGTTTGCATCAACTTAGATACTATAAATTAATCTTATCTCTAATCGATATAAAACTTCCAAGACGCAAAATGTTTATTTATAGAGTGCGATTCAAGTGAATTTGTTCTTTGACTGCAATAACATAGCCAAGTTCCAGTTATCAACTTATAAACTTTGTCTCTTATGATAGAAGAATAGTTAATATGAGTATGTGATAGAAATAAGCTGTAATTTTTTATATTCTTCTAGAAACGAGGTAAGATGCTGAACAATGAACCTGTCCAACTTTTAAAGTTTCATGGGGCAGAGACCATGAAAAGTATAAGGAAGCCACAATATGGAATTTGCAACAGCAGTAGTAGTTTTTTTCCTGTCTTTAGAAAAAAGCAACAAAGTTCATATTGTTCACGTTGACAAAATCCACAAAAATATGTTACACTGTTAATAGATTCAAACCAGTGTACTTATATATCTGGCGTAGGCTAATTTACATACTTATAATGACTCTCCTCTGCATATATATGCATGGTGTTTCTAGTTTTGATCA


Gene Sequence:
>Vu_17004(-)
ATGAGACTTGCCATGTCTGCTTCTTCAAAGAGCATCATCTGTTACAGTGAAGAAGATACTGAACTTAGAAGAGGGCCATGGAGTATTGAAGAGGATGATCTTCTTGGGAATTACATTGCCAATCATGGAGAAGGGAGATGGAATTTGCTTGCTATACGTGCAGGTAATCCAAGATAAGAATGAAAAGAAACCTTGTTGGTGGTAACTTTTATATTCTTGTGAACAATTTGCATGCTAATTCTGATTACTTTCTTTATCTTTTGTGATGACTAAATTTTCTCAAGGATTAAGGAGAACAGGAAAGAGTTGCAGATTAAGGTGGCTAAATTATCTAAAGCCAGATGTTAAACGAGGCAATTTAACCTCAGAGGAGCAGCTTTTGATTTTTGAACTCCACTCAAGGTGGGGTAACAGGTGCATATCTCATATTTACTTGTCTTAGTGAAACTGTGCTTATTCAAACGCTTTTTATTGTTTAGAAAGAAGCAAAACGGGCCACTAGCCATGTGCTAGTCAAATTCAGAATAATATCCTTTCTTTGGATTCTTATTCCCACTTATGTGATTGTTGTAGGTGGTCAAAAATTGCACAACAGCTGCCAGGCAGAACAGACAATGAAATAAAGAACTATTGGAGAACAAGGATTCAGAAACAAGCAAGATATATGAAATCTGAGACACAGAGAACAACAGGATTTGTAGAATTTTTCAAGGCTCTACAGATGACAAGATGTCTTCATAAAGCACAAGAATCATCTCCTTCAGCCATGTCACTCCAAGACCAAGAAATTCCTATGCCTTCTAATGGTGGTTTTCATTATTCATCATTTGGGATTGAGGCAACACCAGAAACACAAATCACTAGCCAGCGAGGTGTCAACCATTTGAATCAGCATGAGCAGAACTCAGACTCTGAGCACAACAATGGTTCAAGCATTTCCAATTCAGAATCAGTAAATATCCAATATATGACTCAGCCTTTGGGGTGCACTACAAATCAATTCCAAGCCTTAGACAACTATGACTTTGGCATCTGTTCATATGATGGCTACAACATAGACAACAGTGCCTATGACATGGATTCATTCAACCTGGCAGCCACAATGGATGCTCAGAATCTGGAACTACCAGTGATTGGTTGCCAAATATCAGAAACCAACTCGCTAAATATGGAATCTGAATGTAGCACAAGGAGCAATGATGAATTATGGCAATTTATGAACATATAA