Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16928 LG4 30348624 30356422 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108345707 isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 30348681 missense_variant p.Arg977Leu
G/T 30348799 missense_variant p.Leu938Met
A/C 30348802 missense_variant p.Tyr937Asp
G/T 30350290 missense_variant p.Pro637Thr
C/A 30350345 missense_variant p.Lys618Asn
T/A 30350347 stop_gained p.Lys618*
C/T 30350781 upstream_gene_variant
T/A 30350815 upstream_gene_variant
A/C 30351165 upstream_gene_variant
T/A 30352090 intron_variant
G/C 30352369 missense_variant p.Asn406Lys
T/A 30353053 upstream_gene_variant
A/T 30353561 upstream_gene_variant
C/T 30353584 upstream_gene_variant
C/A 30355784 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16928.1
MHQTFTLTLSLLRSPNTLNAMTPRVDDFENDNLSSTDDDDDDGFKEDMAALSRACMIVVPGADDNFAAEDDVPSLEPLTDAGTAIVPVATDSDSDDQDDLECLKRVQSLYQPLSVLPPLEPAVVVSDDDDGVDDLETVRAIMKRFGDYSEGLHEGGIKKLVAEDQISSMGCEGDIANGSTHYEPDGGELCPFSQNSMEAATEELIENIEMQLSDFVESSEPDAWESSRLQQKRLSCPPVVQCFIDAIKKNRDLQRFLRGKLIELEAKIEENKKIRNKIKILKDFQASCTRRTGNVLSLKKDPRVQLISAKRSPKKSKKRRKVTSICYGPEENSRVANYRMVLERFPLSLERKKWSKADRGNLFKGIKQQFQEMVLELSLSLDRTSSEGLVGSADDMDNIIASVEDLELTPERIRNFLPKVNWDLIASMYVGCHTGSECESRWLNYEDPLVNQGAWTKEEDKSLLLIVQDMGIRNWFSIASALGTSRTPFQCLSRFQRSLNPSMLNSEWTEEEDGQLCSAVTYFGDSNWQCVASVLERRTGTQCSNRWKKSLCPEKKGSFTREEDIRLTVAVMLFGRKWNQIANYVPGRIQSQCRDRYLNSLDPSLKWGGWTEEEDLKLEDAIAKHGYCWSKIAEEVPPRTDSQCRKRWKVLCPEQVPLLQEARKKQRSIIGSNFVDRESERPTITLNDFLPLLALAPKSDVGSSNIRKKHKSSNVPKKKSSKKGAKRTKRTKEVRDTEVYHDDEFYSISARSNHPQKKMKSKRRTKSSRNSPQELVDVSCSDKVTCIEGSENQSTCVTNFENQDSDSITLSCFLRNKSNETLSRFTKNLSQTSFARITDVPEQAESQNPSDDQGGLSHSRETVGTKNLFVQPNIASDRRVRNQEDTNTWTSDDDDDDDDQLTLACILKKIPRKGHPAKLKTGSVLLNEEHSASKPTIISDDSGPSMSKHVEDMETVVHGSVAKPTHIIVEEKDDELFPPLTQYRPRRERKRPCRYL*


CDS Sequence:
>Vu_16928.1
ATGCACCAAACCTTTACACTCACTCTTTCACTCCTAAGAAGCCCTAACACTCTCAATGCGATGACTCCTCGCGTCGACGATTTCGAAAACGACAATCTCTCCTCCACCGACGACGATGATGACGACGGCTTCAAGGAGGATATGGCCGCGCTCTCCCGAGCCTGCATGATCGTCGTCCCTGGCGCCGATGATAATTTCGCAGCTGAAGACGATGTTCCATCTTTGGAACCTCTCACTGACGCCGGCACTGCCATTGTTCCCGTCGCCACCGACTCGGACTCCGACGACCAGGACGACCTCGAATGTCTTAAGAGAGTGCAGAGTCTATACCAGCCTCTGTCCGTTCTTCCGCCACTTGAGCCGGCGGTGGTCGTGTCTGACGACGACGATGGCGTGGATGACCTCGAGACCGTGCGCGCCATCATGAAAAGGTTTGGCGACTACAGCGAAGGTTTGCATGAAGGTGGGATAAAAAAGTTGGTTGCAGAGGATCAGATCTCCAGCATGGGCTGTGAGGGTGACATCGCTAATGGCTCAACCCATTACGAACCAGATGGTGGTGAATTATGTCCTTTTTCTCAAAATTCTATGGAGGCTGCCACAGAGGAGTTGATTGAAAACATTGAAATGCAGCTTAGCGATTTTGTTGAGAGTTCTGAACCTGATGCCTGGGAGTCATCTAGATTACAACAGAAAAGATTGAGCTGTCCTCCTGTTGTTCAGTGTTTTATTGACGCCATTAAGAAAAATAGGGATTTACAGAGATTTCTTAGAGGTAAGTTGATTGAGCTTGAGGCTAAAATTGAGGAAAACAAAAAGATAAGGAATAAAATTAAAATTCTTAAGGACTTCCAGGCTTCATGCACTAGAAGAACAGGGAACGTGTTATCACTGAAAAAAGATCCACGTGTTCAATTAATATCAGCAAAACGGTCTCCAAAGAAGTCTAAGAAACGTAGAAAGGTAACTTCAATATGTTATGGCCCAGAAGAAAATTCTCGTGTTGCTAATTATAGGATGGTATTGGAAAGATTTCCACTTTCCTTGGAAAGGAAAAAATGGTCTAAGGCAGACAGGGGAAATCTTTTTAAGGGAATTAAGCAACAATTCCAAGAAATGGTGCTTGAACTCTCACTTTCACTTGATAGAACAAGTTCAGAGGGCTTGGTTGGAAGTGCTGATGACATGGATAATATAATTGCATCTGTTGAGGATCTCGAACTCACACCAGAGAGGATTAGAAATTTTTTGCCTAAAGTTAATTGGGATCTCATAGCTTCTATGTATGTTGGTTGCCATACTGGTTCTGAATGTGAATCAAGGTGGTTGAATTATGAAGATCCTTTGGTCAACCAAGGTGCATGGACTAAGGAAGAGGACAAGTCCCTTTTACTTATTGTCCAAGATATGGGCATCAGGAACTGGTTCAGTATTGCTTCAGCATTGGGCACAAGCAGGACTCCATTTCAATGCTTGTCACGATTCCAAAGGAGCTTAAATCCTTCCATGCTAAATAGTGAATGGACTGAGGAAGAAGATGGTCAACTATGTTCTGCGGTGACATATTTTGGTGATAGCAATTGGCAGTGTGTGGCTTCTGTTCTAGAACGGCGGACAGGAACCCAGTGCTCAAATAGATGGAAAAAATCCCTCTGTCCGGAGAAGAAAGGGAGCTTTACACGAGAGGAAGATATACGCTTAACAGTAGCAGTCATGCTTTTTGGGCGGAAATGGAATCAAATAGCTAATTATGTTCCTGGCCGGATCCAATCTCAGTGTAGGGACAGATACCTCAATAGTCTGGATCCTTCTTTGAAATGGGGTGGATGGACTGAGGAAGAGGATTTAAAATTGGAAGATGCAATTGCCAAGCATGGATATTGCTGGTCTAAGATTGCTGAAGAAGTGCCTCCCCGTACTGATTCTCAATGCCGAAAGAGATGGAAGGTGTTATGTCCTGAACAAGTTCCTTTGCTTCAAGAAGCAAGAAAGAAGCAAAGGTCTATTATTGGTAGTAACTTCGTTGATCGAGAATCTGAACGCCCAACCATTACACTTAATGACTTTCTACCTTTACTTGCTTTAGCTCCAAAATCTGATGTTGGTTCTTCAAACATCAGGAAGAAGCACAAGTCAAGTAATGTTCCCAAGAAAAAGAGCTCTAAGAAAGGTGCAAAAAGAACTAAACGCACTAAAGAAGTACGAGATACAGAGGTATATCACGATGATGAGTTCTACTCTATATCTGCACGCAGCAATCATCCCCAGAAAAAGATGAAGTCCAAAAGACGCACAAAAAGTAGTCGAAATTCTCCCCAGGAATTAGTGGATGTCTCTTGTAGTGACAAGGTGACTTGCATTGAGGGTTCAGAAAACCAGTCTACCTGTGTTACCAATTTTGAAAATCAAGATTCAGACAGCATAACCCTTTCATGTTTTTTACGCAACAAATCAAATGAGACATTATCTAGATTTACCAAAAATTTAAGTCAGACTTCCTTCGCTAGGATTACTGATGTTCCTGAGCAGGCGGAAAGTCAAAACCCGTCTGATGATCAAGGCGGTTTGTCTCATTCACGCGAGACAGTTGGAACTAAAAATTTGTTCGTGCAGCCGAATATTGCTTCTGATAGACGAGTGAGAAACCAGGAGGATACAAATACTTGGACAAGTGATGATGATGATGACGACGACGACCAGTTGACCCTTGCATGCATTCTGAAAAAAATCCCAAGAAAGGGTCACCCTGCCAAATTAAAAACAGGATCTGTATTATTAAATGAAGAACATAGTGCAAGCAAGCCAACCATCATATCTGATGACAGTGGACCGTCAATGTCAAAGCATGTTGAAGATATGGAGACTGTTGTACATGGTTCTGTTGCTAAACCAACCCATATCATTGTGGAAGAAAAGGATGACGAGCTTTTTCCGCCCCTAACGCAATACAGGCCACGGAGGGAGCGAAAACGTCCCTGTAGATATTTGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_16928::LG4:30356422-30358422(-)
CCTGATATAAAACGTTAACTTTGATTAGACAACAGCTCCAAAAACACATGAGAATTACAACTAAGTTTTGTCCTTAGATTAATTGCTACATTGTACATTGCTCAATTTTCATTTTTTCCCACTTTAAACTACCCATGACTACTTTAATAGAACTCTACATTCATCATATTAAGACAGCATGCTATTACATGCTAAAGACAAATATGTGTAGTATCAGCAATTTCCTCAAAAAAAAAACAACAACCAATGTTTTATACTTGTTTTTTCATATCCTTCTACCTGGAAGAGCTCTGAAGCTGCAGCAACATTCCCTTCTTTGAGCTTCGTCATTGCCAATTCTCGATTAGCCCTTCTTTTTCTACAAGTAATCAAACGCCAAGATTCACCTCAGTGAAAGGATAAAATTGATAGGAGAAAGAAAACCAAAAGAGTAATATATTCATCCAAAACCTAAGACTTCAGAAAAGGAAAAAAAAAAACATGCCTGTTCCTTTCTTCCTCAGTTGCTGCCTTGCAAGGAGCATTGCCACCATCAAAAACAACAACCGGAGTTATTTTATAGAAGCGAAGCAGGTTCACTCTATGCATAAAGTATTCAATGTATCGCAACTTCCTTACACTGTCGGAATCAAGACAAAGATCCATACTACACGAATAAGCTGAAAAATGAAAACGTCAACTTCAACTTCTCACCACTAATTACCCCAAAATTGAAAACCATTCACACAGTTCAATTCCCAACACTCACCCCCTTTATGAAGCCACGAATACGCATCAATACCCACCTACAGATTTTGCAAAGTGAGTGAACATGTACACGCCCCAGATAAAATCATGCGGAAAAATTGAAACTTAGAACAATGAAGTTGATTCTTACGCGTTTTCCAGCATACTTATGGATGTGGAAAGTTTCGATGTAAGGTTTCATGAACCTCAGGAGATCCTTGATGCCCATTTGCAATGTCCTAGGTCTTCTGTTGCTTTCTGGGTTTTGTTTTGGGCTTATTCGAATTTTCTTCGTTTACGTTTTATTGGTCCGAAAATTTTAATTCTCTTGCATATAAATAGGAACACAGAAAATGGCGGGAAGAACGCGAGTGGCGAAAGAGAAACGAGGGACGGCAAAAATTGTGTTATTCTTATATGTAGGTGACAGAAATTTGTGTACAGTCCAATGAAAAGTGTTCACTTAGTAAGGTAAAAACGTGTTCGATTCTGATTGGTTGTTGAGAGAGGACTCGTATTTCAGTTAAAACATTTACCGCCAGTTTGAAACGCGAAAGACTTGCTTCCCGCTCTTTTTGTTTTTTGCTATTTGAAAAATTAGTTCAAAATGTAGTATTTTTGTAATTGAAACTAAAATATATTAATATAGTTTAGTAATTCTATTTTTTTTATTTTCGATAACTATATATTATATTTGTAGCTTATATATATATATATATATATATATACTAAAATGATTGTTTTAATATTTGATAGTAGTTAAATATTAGGTTTGAAATATATGGAGCGCATTCAACCTAATCCATAATAAAGTTTCTATCTTAAATTTTAAAAGCTATTTTTTGTCTGGAATTATAATATAATATTTGAATTTACATAATTTGATTGTTATGATAAGTGCTCTATGGGTATAATTTTTTATTTATTGAAAATTTTAATACGGATTGATTTTAAAATCATTAAATTTATAGGTAAAATTCATAAAATTAATTATTCTTTGTAGAGCGTGAAATCTTACTTTTAACTTTTTACAAAAGACCTGCTTTTCGTGTTTTAATACATGTAAGAAATATATGTTGTGAAAAAGAAGTCATACTTTTAGCACCCTTATATTAAAATAAAATATATATTTTCAAATTCTGAATAATAAGTAATTTTAATTTTAGATACTTTGATATAATATATATATATATATATATATATATATATAAAATAATATTATAATTGAAGCATTCGTGTTCCAACATAAACAAGCCGCCGCTTAAACCCTTTCA


Gene Sequence:
>Vu_16928(-)
ATGCACCAAACCTTTACACTCACTCTTTCACTCCTAAGAAGCCCTAACACTCTCAATGCGATGACTCCTCGCGTCGACGATTTCGAAAACGACAATCTCTCCTCCACCGACGACGATGATGACGACGGCTTCAAGGAGGATATGGCCGCGCTCTCCCGAGCCTGCATGATCGTCGTCCCTGGCGCCGATGATAATTTCGCAGCTGAAGACGATGTTCCATCTTTGGAACCTCTCACTGACGCCGGCACTGCCATTGTTCCCGTCGCCACCGACTCGGACTCCGACGACCAGGACGACCTCGAATGTCTTAAGAGAGTGCAGAGTCTATACCAGCCTCTGTCCGTTCTTCCGCCACTTGAGCCGGCGGTGGTCGTGTCTGACGACGACGATGGCGTGGATGACCTCGAGACCGTGCGCGCCATCATGAAAAGGTTTGGCGACTACAGCGAAGGTATTTGGTTTCCTATGTGCGTTCTCGCTGTTGAATTTTCACTTCTAATTTTTGAATTTGGGATGTGAATCCAAGGGAAATAATAATGCTAGGTGAGCTATAAGTAGAGAATAAAATATAGATATTGGTTGGCGGTAACTAAAAGAGAAGGAAAGACTGCATGTTCATGTATCTAAAATTAACATTGGATATATGCATGTCTTAACCGAACTGTATTTGACTTTTGAAACGATGCCTTGAAATGAGTTTTAGATGTCTCTTGTGTAGCTGAATTTGGATGTATGTTTGTTTGATTATGGGCACCTAACTGAATTCATCGTACAAAACTATTGTATTAAGCTTTATAAGCTCTTATCAGGTGCTTTTTGTAGTTTCTAGTCAATGCAGGATCTCAGTCTTCCCTAATTATCTCTTGTCAAAGTCAAAGTGGTGGGACTTGGTTTTTACCTATGTTTATATATTCCCCAAGTTGTCTTGTTGGCAGTTCTGTTTTAGGACTTTGTTATTTATTTATTTATTTTGTAACAAAAACTTGGAATGATGACAATATTAGGTTTGCATGAAGGTGGGATAAAAAAGTTGGTTGCAGAGGATCAGATCTCCAGCATGGGCTGTGAGGGTGACATCGCTAATGGCTCAACCCATTACGAACCAGATGGTGGTGAATTATGTCCTTTTTCTCAAAATTCTATGGAGGCTGCCACAGAGGAGTTGATTGAAAACATTGAAATGCAGCTTAGCGATTTTGTTGAGAGTTCTGAACCTGATGCCTGGGAGTCATCTAGATTACAACAGAAAAGATTGAGCTGTCCTCCTGTTGTTCAGTGTTTTATTGACGCCATTAAGAAAAATAGGGATTTACAGAGATTTCTTAGAGGTAAGTTGATTGAGCTTGAGGCTAAAATTGAGGAAAACAAAAAGATAAGGAATAAAATTAAAATTCTTAAGGACTTCCAGGCTTCATGCACTAGAAGAACAGGGAACGTGTTATCACTGAAAAAAGATCCACGTGTTCAATTAATATCAGCAAAACGGTCTCCAAAGAAGTCTAAGGTTAGTTGTGTGATGCTTTTATTGTTTACTGAAGTCTGAGTTATCGTTTGTACTATTTCATCATGAATGATGGTACTGGTCATATATAGATATATATTTATCTCTGGGTAGATTAGTGGATAATATTTAAGATTCTCATTCAGTTGAAACTTAATCTTTTAATTATGAAAACTATAGATGCTATCCGTTTAATACAGCTTAGTGGGTTTGAGTGGTAATATGAAAGTTATGGAGAGAAAGGGTTCTCTCCTATGAAAGCCTGGATACAGGAAACATGCTTAATATAAAACTGGAATGGCGAGGAAAGGTTCTTAAAAGTTCAAGATATGTTACGGCCTATTAATACTAGCATGAATTAAAAAAAAAAGAAGAAAAAACTTTACATCATAGTTACCGATCTCAAATAGTGGCATGTGACAGTCCTCTTTGAAGATGCTATAGTGGGAAACAGGGTGACTGTTATTGTAAATGTTATAACACAGACTAACTATCTATAGTACACTTAAGTACTATGAAAAATACAAAAAGAAAAGAAATTCATGATAAACAATAAGCCAAATTGCAGTCACGAAATACATGGGGTCCTTCAAAAAGTGAAAGCTGGTAGTGAAATTTATAGAAAAGAGCACTAAAAATTTAATAAAAGTTAACGAAATGTGAACTGGGAAGTCCAACGGAAGAATGGAGTGCAGGAAAAATATAGTCCTGTAGGCTGTAGCATATGAAGGAAATGTAGGTTAAACAGAGGTAGTTTTTTTTTCAATGGAATGGTTTAAAATTCTAGCGTTTCTGAAGAAAAAGGCTTTAGAAAATTAGGGAGAAATCACAATTTTACCCCCAAAACCCTAAACAAAAGTTTCAGTGTAAAACTTGGTTTCCCTGATAATAATATTACAGCAACCAAAAAAAGCTATTGGCAACCGCTCCACTTTTTGATTATAGAGGCCCAGTGATATTCTGTTCTACTTCTCTGCTGGCGTGCACTTTTGTCGACCATGCTTTTCATAAATGTACTGTTTGTAAAGTAACATTATTATTTTACTGTAACAGTGGATGATGATTGTTATACAAAAAAAAAGTTACTTGTGATCATAGCTAAAACATGGCTACATATCCTCCCATTGACTGCATCAAAATATATAAATCCTCGTAAACATGTTATAAATTTACATATTTGCCCCCACTTAGGTTAGTATGTCATGAAAAGCATCATTGGTCCTACTCATACGTAATTTTGACATTATTTACAATAGCTCTTCAAGTTAAAGCTAATTGGCATTAACTGAAGTCTCCCTGCAAGTATATGGATCATCTAGCAATTACATGCACAATGCGGAGCTTTTTCAATGCATCTCCATTAATGGCTCTTGAGCTATGATGTTATGATGTTAGAGATCTTACGTCAACCGTAGATATTACTAAATTACAATATATATATATAAATAGATGCAAATCTCATTTTACAAGTTAATTTCTTGTAAAGTCGAGTTAGGTTTAAAGTCCATTTTCTTAGATGATATTAGAGTGTATTCCAATAAGGTTTGTTGAGCCTTTCGGACCATCTATAAGATCTATTCCCACGCCTAAGATATTTAGTTTTTGTGTGAAGGATGTGTTAGAAATCTTGCATTGACTAATTTATTGTATATAAGTAGTTGGAAATTTGATCTTACAAGTCAATTTTATGAGTTTGAGTTAAACTTAAAGTTCATTTTCCTAGACATGTGATTCATGGAGTTGATGTGGAACTTTTCAAGTTATCGGAGCCATATCTCAAATATGTCAGTTAATAAATTTTAAAAAATATAAAAGATTTGAAGGATACTTCTTATATACATGTATTGGAGATGAGTACGGCATTGATTAGAAGGTTAAATTTGAGATTTGTAACTTTTCTCTTTACAGCCTTTGATTAGAAGGTTAAATTTACAGCCTTTGTTATTGGATTTGGGTATTATGCCTGATTTGGGGGTATGATTAAGGGGTTTGAATCTATTGCTTAGCAGTCTTGCACAGTTACTGAGTGCAAATATTTAGGTAATTTTGTCGTTATCTAGTTACTGGCTGGCAACATGGCATTTGTAACCTTCTTAGTTTTGTCGAAGTGTCAATTGTCACTGATTATATTGGAAATCCTTGATCCAACTTTTTCCTGGCAGAAACGTAGAAAGGTAACTTCAATATGTTATGGCCCAGAAGAAAATTCTCGTGTTGCTAATTATAGGATGGTATTGGAAAGATTTCCACTTTCCTTGGAAAGGAAAAAATGGTCTAAGGCAGACAGGGGAAATCTTTTTAAGGGAATTAAGCAACAATTCCAAGAAATGGTGCTTGAACTCTCACTTTCACTTGATAGAACAAGGTAATATCTATTCTGTTTTGTCCTATGTTACTAAATTACTAACTGCTGCTTGACCAATGTCATCATTCCCCTGTTGTGTTTTTAAATTTTACCCTTGACGTACCGTACCTCCTTTTACAGTTCAGAGGGCTTGGTTGGAAGTGCTGATGACATGGATAATATAATTGCATCTGTTGAGGATCTCGAACTCACACCAGAGAGGATTAGAAATTTTTTGCCTAAAGTTAATTGGGATCTCATAGCTTCTATGTATGTTGGTTGCCATACTGGTTCTGAATGTGAATCAAGGTATATGTTTTTTAATCTGTGATCTTTTCTTTTTGTGCGTGAAAAAATTGATCTTTGCTATGATAAGTATTTTATGTTTCTGATATTGGAACACGTGCTGAATTTAATGAGGGTATGTATATACTAATTGGTGAAGTTTTCTTTTGCGTGTTTGTATGCATGAATATGGTTCTTGGTTATGATAAAATGTTCATGTTGCTATTATTGGTTCTTAGTCCTGTCCATACAGTTCTTTGACTATTGTTTCGTGTTTATTGCCTTTCTATGAAGAATATTTTTCCCCTACATTGCAGACATCTATGACGATCACCATCACATACAGTTTACCAAATTTGGGTTTCAGTAAGAGTTCAAGATCAACACATCATGCAGGTGGGGTTGTACATGACATGATTTTTAATATAGTCGTGCTTAATAAGTCTGTGGTGGTTGTCATCATCATAGATGTCTGTTATGTAGACCATAGAATAGTGTCTATGTAAGAATGGTTGGATTCCATACCTTTGACGCACTGTATTTTAAATGTTTGCTACCGCAGGTGGTTGAATTATGAAGATCCTTTGGTCAACCAAGGTGCATGGACTAAGGAAGAGGACAAGTCCCTTTTACTTATTGTCCAAGATATGGGCATCAGGAACTGGTTCAGTATTGCTTCAGCATTGGGCACAAGCAGGACTCCATTTCAATGCTTGTCACGATTCCAAAGGAGCTTAAATCCTTCCATGCTAAATAGTGAATGGACTGAGGAAGAAGATGGTCAACTATGTTCTGCGGTGACATATTTTGGTGATAGCAATTGGCAGTGTGTGGCTTCTGTTCTAGAACGGCGGACAGGAACCCAGTGCT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