Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16922 LG4 30269481 30277221 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108345707 isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 30269787 missense_variant p.Met914Thr
T/A 30269828 stop_lost p.Ter900Cysext*?
T/A 30269911 stop_gained p.Lys873*
T/C 30271255 splice_acceptor_variant&intron_variant
C/T 30273154 missense_variant p.Cys437Tyr
A/G 30273159 synonymous_variant p.Ile435Ile
A/T 30273845 upstream_gene_variant
C/T 30273846 upstream_gene_variant
T/A 30274425 upstream_gene_variant
C/T 30274428 upstream_gene_variant
A/G 30274433 upstream_gene_variant
T/A 30274436 upstream_gene_variant
G/A 30274634 upstream_gene_variant
A/T 30274711 upstream_gene_variant
C/T 30274829 upstream_gene_variant
A/T 30274986 upstream_gene_variant
T/A 30275021 upstream_gene_variant
T/C 30275033 upstream_gene_variant
T/A 30275749 missense_variant p.Asn306Ile
A/T 30276507 upstream_gene_variant
G/T 30276757 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16922.1
MHQTFTLTLSLLRSPNTLNAMTPRVDDFENDNLSSTDDDDDDGFKEDMAALSRACMIVVPGADDNFAAEDDVPSLEPLTDAGTAIVPVATDSDSDDQDDLECLKRVQSLYQPLSVLPPLEPAVVVSDDDDGVDDLETVRAIMKRFGDYSEGLHEGGIKKLVAEDQISSMGCEGDIANGSTHYEPDGGELCPFSQNSMEAATEELIENIEMQLSDFVESSEPDAWESSRLQQKRLSCPPVVQCFIDAIKKNRDLQRFLRGKLIELEAKIEENKKIRNKIKILKDFQASCTRRTGNVLSLKKDPRVQLISAKRSPKKSKPLIRRLNLQSLLLDLGIMPDLGLLAGNMAFVTFLVLSKCQLSLIILEILDPTFSWQKRRKADRGNLFKGIKQQFQEMVLELSLSLDRTSSEGLLGSADDMDNIIASVEGLEVTPERIRNFLPKVNWDLIASMYVGCHTGSECESRWLNYEDPLVNQGAWTKEEDKSLLLIVQDMGIRNWFSIASALGTSRTPFQCLSRFQRSLNPSMLNSEWTEEEDGQLCSAVTYFGDSNWQCVASVLERRTGTQCSNRWKKSLCPEKKGSFTREEDIRLTVAVMLFGRKWNQIANYVPGRIQSQCRDRYLNSLDPSLKWGGWTEEEDLKLEDAIAKHGYCWSKIAEEVPPRTDSQCRKRWKVLCPEQVPLLQEARKKQRSIIGSNFVDRESERPTITLNDFLPLLALAPKSDVGSSNIRKKHKSSNVPKKKSSKKGAKRTKRTKEVRDTEVYHDDEFYSISARSNHPQKKMKSKRRTKSSRNSPQELVDVSCSDKVTCIEGSENQSTCVTNFENQDSDSITLSCFLRNKSNETLSRFTKNLSQTSFARITDVPEQAESQNPSDDQDGLSHSRETVGTKNLFVQPNIASDRRVRNQEDTNTWTSDDDDDDDQMTLACILKKIPRKGHPAKLKTGSVLLNEEHSASKATIISDDSGPSMSKHVEDMETFVHGSVAKPTHIIVEEKDDELFPPLTQYRPRRERKRPCRYL*


CDS Sequence:
>Vu_16922.1
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Promoter Sequence:
>Vu_16922::LG4:30277221-30279221(-)
ATTAGATAACAGCTCCAAAAACACATGAGAATTACAACTAAGTTTTGTCCTTAGATTAATTGCTACATTGTACATTGCTCAATTTTCATTTTTTCCCACTTCAAACTACCCATGACTACTTTAATAGAACTCTACATTCATCATATTAAGACAGCATGCTATTACATGCTAAAGACAAATCTATGTAGTATCAGCAATTTCCTCAAAAAAAAAAAAACAACCAATGTTTTTTACTTGTTTTTTCATATCCTTCTACCTGGAAGAGCTCTGAAGCTGCAGCAACATTCCCTTCTTTGAGCTTCGTCATTGCCAATTCTCGATTAGCCCTTCTTTTTCTACAAGTAATCAAACGCCAAGATTCACCTCAGTGAAAGGATAAAATTGATAGGAGAAAGAAAACCAAAAGAGTAAAATGTTCATCCAAAACCTAAGACTTCAGAAAAGGAAAAAAAAAAAACATGCCTGTTCCTTTCTTCCTCAGTTGCTGCCTTGCAAGGAGCATTGCCACCATCAAAAACAACAACCGGAGTTATTTTATAGAAGCGAAGCAAGTTCACTCTATGCATAAAGTATTCAATGTATCGAAACTTCCTTACACTGTCGGAATCAAGACAAAGATCCATACTACACGAATAAGCTGAAAAATGAAAACGTCAACTTCAACTTCTCATCACTAATTACCCCAAAATTGAAAACCATTCACACAGTTCAATTCCCAACACTCACCCCCTTTATGAAGCCACGAATACGCATCAATACCCACCTACAGATTTTGCAAAGTGAGTGAACATGTACACGCCCCAGATAAAATCATGCGGAAAAATTGAAACTTAGAACAATGAAGTTGATTCTTACGCGTTTTCCGGCATACTTATGGATGTGGAAAGTTTCGATGTAAGGTTTCATGAACCTCAGGAGATCCTTGATGCCCATTTGCAATGCCCTAGGTCTTCTGTTGCTTTCTGGGTTTTGTTTTGGGCTTATTCGAATTTTCTTTGTTTACGTTTATTGGTCCGAAAATTTTAATTCTCGTGCATATAAATAGGAACACAGAAAATGGCGGGAAGAACGCGAGTGGCGAAAGAGAAACGAGGGACGGCAAAAATTGTGTTATTCTTATATGTAGGTGACAGAAATTTTTGTACAGTCCAATGAAAAGTGTTCACTTAGTAAGGTAAAAACGATTCTGATTGGTTGTTGAGAGAGAACTCGTATTTCAGTTAAAACATTTACCGCCAGTTTGAAACGAGAAAGACTTGCTTCCCGCTCTTTTTGTTTTTTTCTACTTGAAAAATTATCAAAATGTAGTATTTTTGTAATTGAAACTAAAATATATTAATATAATTTAGTAATTCTATTTTTTTTATTTTCGATAACTATATATTATATTTGTAGCTTATATATATATATATATATATATATACTAAAATGATTATTTTAATATTTGATAGTAGTTAAATATTAGGTTTGAAATATATGGAGCGCATTCAACCTAATCCATAATAAAGTTTCTATCTTAAATTTTAAAAGCTATTTTTTGTCTGGAATTATAATATAATATTTGAATTTACATAAATTTGATTGTTATGATAAGTGCTCTATGGGTATAATTTTTTATTTATTGAAAATTTTAATACGGATTGATTTTAAAATCATTAAATTTATAGGTAAAATTCATAAAATTAATTTATTCTTTGTAGAGCGTGAAATCTTACTTTTAACTTTTTACAAAAGACCTGCTTTTCGTGTTTTAATACATGTAAGAAATATATGTTGTGAAAAAGAAGTCATACTTTTAGCACCCTTATATTAAAATAAAATATATATTTTCAAATTCTGAATAATAAGTAATTTTAATTTTAGATACTTTGATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAATAATATTATAATTGGAGCATTCGTGTTCCAACATAAACAAGCCGCCGCTTAAACCCTTTCA


Gene Sequence:
>Vu_16922(-)
ATGCACCAAACCTTTACACTCACTCTTTCACTCCTAAGAAGCCCTAACACTCTCAATGCGATGACTCCTCGCGTCGACGATTTCGAAAACGACAATCTCTCCTCCACCGACGACGATGATGACGACGGCTTCAAGGAGGATATGGCCGCGCTCTCCCGAGCCTGCATGATCGTCGTCCCTGGCGCCGATGATAATTTCGCAGCTGAAGACGATGTTCCATCTTTGGAACCTCTCACTGACGCCGGCACTGCCATTGTTCCCGTCGCCACCGACTCGGACTCCGACGACCAGGACGACCTCGAATGTCTTAAGAGAGTGCAGAGTCTATACCAGCCTCTGTCCGTTCTTCCGCCACTTGAGCCGGCGGTGGTCGTGTCTGACGACGACGATGGCGTGGATGACCTCGAGACCGTGCGCGCCATCATGAAAAGGTTTGGCGACTACAGCGAAGGTATTTGGGTTTCCTATGTGCGTTCTCGCTGTTGAATTTTCACTTCTAATTTTTGAATTTGGGATGTGAATCCAAGGGAAATAATAATGCTAGGTGAGCTATAAGTAGAGAATAAAATATAGATATTGGTTGGCGGTAACTAAAAGAGAAGGAAAGACTGCATGTTCGTGTATCTAAAATTAACATTGGATATATGCATGTCTTAACTGAACTGTATTTGACTTTTGAAACGATGCCTTGAAATGAGTTTTAGATGTCTCTTGTGTAGCTGAATTTGGTAGTATGTTTGTTTGATTATGGGCACCTAACTGAATTCATCGTACAAAACTATTGTATTAAGCTTTATAAGCTCTTATCAGGTGCTTTTTGTAGTTTCTAGTCAATGCAGGATCTCAGTCTTCCCTAATTATCTCTTGTCAAAGTCAAAGTGGTGGGACTTGGTTTTTACCTATGTTTATATATTCCCCAAGTTGTCTTGTTGGCAGTTCTGTTTTAGGACTTTGTTATTTATTTATTTATTTTGTAACAAAAACTTGGAATGATGACAATATTAGGTTTGCATGAAGGTGGGATAAAAAAGTTGGTTGCGGAGGATCAGATCTCCAGCATGGGCTGTGAGGGTGACATCGCTAATGGCTCAACCCATTACGAACCAGATGGTGGTGAATTATGTCCTTTTTCTCAAAATTCTATGGAGGCTGCCACAGAGGAGTTGATTGAAAACATTGAAATGCAGCTTAGCGATTTTGTTGAGAGTTCTGAACCTGATGCCTGGGAGTCATCTAGATTACAACAGAAAAGATTGAGCTGTCCTCCTGTTGTTCAGTGTTTTATTGACGCCATTAAGAAAAATAGGGATTTACAGAGATTTCTTAGAGGTAAGTTGATTGAGCTTGAGGCTAAAATTGAGGAAAACAAAAAGATAAGGAATAAAATTAAAATTCTTAAGGACTTCCAGGCTTCATGCACTAGAAGAACAGGGAACGTGTTATCACTGAAAAAAGATCCACGTGTTCAATTAATATCAGCAAAACGGTCTCCAAAGAAGTCTAAGGTTAGTTGTGTGATGCTTTTATTGTTTACTGAAGTCTGAGTTATCGTTTGTACTATTTCATCATGAATGATGGTACTGGTCATATATAGATATATTTATCTCTGGGTAGATTAGTGGATAATATTTAAGATTCTCATTCAGTTGAAACTTAATCTTTTAATTATGAAAACTATAGATGCTATCCGTTTAATACAGCTTAGTGGGTTTGATTGGTAATATGAAAGTTATGGAGAGAAAGGGTTCTCTCCTATGAAAGCCTGGATACAGGAAACATGCTTAATATAAAACTGGAATGGCGAGGAAAGGTTCTTAAAAGTTCAAGATATGTTACGGCCTATTAATACTAGCATGAATTAAAAAAAAAAAGAAGAAAAAACTTTACATCATAGTTACCGATCTCAAATAGTGGCATGTGACAGTCCTCTTTGAAGATGCTATAGTGGGAAACAGGGTGACTGTTATTGTAAATGTTATAACACAGACTAAATATCTATAGTACGTTTAAGTACTATGAAAAATACAAAAAGAAAAGAAATTCATGATAAACAATAAGCCAAATTGCAGTCACGAAATACATGGGGTCCTTCAAAAAGTGAAAGCTGGTAGTGAAATTTATAGAAAAGAGCACTAAAAATTTAATAAAAGTTAACGAAATGTGAACTGGGAAGTCCAACGGAAGAATGAAGTGCAGGAAAAATATAGTCCTGTAGGCTGTAGCATATGAAGGAAATGTAGGTTAAACAGAGGTAGTTTTTTTTTTTCAATGGAATGGTTGAGATGAATGGTTTAAAATCCTAGCGTTTCTGAAGAAAAAGGCTTTAGAAAATTAGGGAGAAATCACAATTTTACCCCCAAAACCCTAAACAAAAGTTTCAGTGTAAAACTTGGTTTCCCTGATAATAATATTACAGCAACCAAAAAAAGCTATTGGCAACCGCTCCACTTTTTGATTATAGAGGCCCAGTGATATTCTGTTCTACTTCTCTGCTGGCGTGCACTTTTGTCTACCATGCTTTTCATAAATGTACTGTTTGTAAAGTAATATTATTGTTTTACTGTAACAGTGGATGATGATTGTTATACAAAAAAAAAGTTACTTGTGATCATAGCTAAAACATGGCTACATATCCTCCCATTGACTGCATCAAAATATATAAATCCTCGTAAACATGTTATAAATTTACATATTTGCCCCCACTTAGGTTAGTATGTCATGAAAAGCATCATTGGTCCTACTCATACGTAATTTTGACATTATTTACAATAGCTCTTCAAGTTAAAGCTAATTGGCATTAACTGAAGTCTCCCTGCAAGTATATGGATCATCTAGCAATTACATGCACAATGCAGAGCTTTTTCAATGCATCTCCATTAATGGCTCTTGAACTATGATGTTAGAGATCTTACGTCAGCCGTAGATATTACTAAATTACAATATATATAAATAGATGCAAATCTCATTTTACAAGTTAATTTCTTGTAAAGTCGAGTTAGGTTTAAAGTCCATTTTCTTAGATGATATTAGAGTGTATTCCAATAAGGTTTATAAGATCTATTCCCACGCTTGAGATATTTAGTTTTTGTGTGAAGGATGTGTTAGAAATCTTGCATTGACTAATTTATTGTATATAAGTAGCTGGAAATTTGATCTTACAAGTCAATTTTATAAGTTTGAGTTAAACTTAAAGTTCACTTTCCTAGACATGTGATTCATGGAGTTGATGTGGAACTTTTCAAGTTATCGGAGCCATATCTCAAATATGTCAGTTAATAAATTTTAAAAAATATAAAAGATTTGAAGGATACTTCTTATATACATGTATTGGAGATGAGTACGGCATTGATACTTTACCATTTTTGTTTGAGATTTGTAACTTTTCTCTTTACAGCCTTTGATTAGAAGGTTAAATTTACAGTCTTTGTTATTGGATTTGGGTATTATGCCTGATTTGGGGGTATGATTAAGGGGTTTGAATCTATTGCTTAGCAGTCTTGCACAGTTACTGAGTGCAAATATTTAGGTAATTTTGTCGTTATCTAGTTACTGGCTGGCAACATGGCATTTGTCACCTTCTTAGTTTTGTCGAAGTGTCAATTGTCACTGATTATATTGGAAATCCTTGATCCAACTTTTTCCTGGCAGAAGCGTAGAAAGGTAACTTCAATATGTTATGGCCCAGAAGAAAATTCTCGTGTTGCTAATTATAGGATGGTATTGGAAAGATTTCCACTTTCCTTGGAAAGGAAAAAATGGTCTAAGGCAGACAGGGGAAATCTTTTTAAGGGAATTAAGCAACAATTCCAAGAAATGGTGCTTGAACTCTCACTTTCACTTGATAGAACAAGGTAATATCAATTCTGTTTTGTCCTATGTTACTAAATTACTAACTGCTGCTTGACCAATGTCATCATTCCCCGGTTGTGTTTTTAAATTTTACCCTTGACGTACCGTACCTCCTTTTACAGTTCAGAGGGCTTGCTTGGAAGTGCTGATGACATGGATAATATAATTGCATCTGTTGAGGGTCTCGAAGTCACACCAGAGAGGATTAGAAATTTTTTGCCTAAAGTTAATTGGGATCTCATAGCTTCTATGTATGTTGGTTGCCATACTGGTTCTGAATGTGAATCAAGGTATATGTTTTTTAATCTGTGATCTTTTCTTTTTGTGCGTGAAAAAATTGATCTTTGCTATGATAAGTATTTTATGTTTTTAATGAGGGTATGTATATACTAATTGGTGAAGTTTTCTTTTGCGTGTTTGTATGCATGAATATGGTTCTTGGTTATGATAAAATGTTTATGTTGCTATTATTGGTTCTTAGTCCTGTCCATACAGTTCTTTGACTATTGTTTCGTGTTTATTGCCTTTCTATGAAGAATATTTTTCCCCTACATTGCAGACATCTATGACGATCACCATCACATACAGTTTACCAAATTTGGGTTTCAGTAAGAGTTCAAGATCAACACATCATGCAGGTGGGGTTGTACATGACATGATTTTTAATATAGTCGTGCTTAATAAGTCTGTGGTGGTTGTCATCATCATAGATGTCTGTTATGTAGACCATAGAATAGTGTCTATGTATGAATGGTTGGATTCCATACCTTTGACGCACTATATTTTAAATGTTTGCTACCGCAGGTGGTTGAATTATGAAGATCCTTTGGTCAACCAAGGTGCATGGACTAAGGAAGAGGACAAGTCCCTTTTACTTATTGTCCAAGATATGGGCATCAGGAACTGGTTCAGTATTGCTTCAGCATTGGGCACAAGCAGGACTCCATTTCAATGCTTGTCACGATTCCAAAGGAGCTTAAATCCTTCCATGCTAAATAGTGAATGGACTGAGGAAGAAGATGGTCAACTATGTTCTGCGGTGACATATTTTGGTGATAGCAATTGGCAGTGTGTGGCTTCTGTTCTAGAACGGCGGACAGGAACCCAGTGCTCAAATAGGTTGGTAATTTAATTTTTCATGTTTGTAGCCC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