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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16914 LG4 30128527 30133975 PREDICTED: mitogen-activated protein kinase 9-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 30129635 missense_variant p.Gly428Val
G/A 30129907 intron_variant
A/T 30129908 intron_variant
G/A 30129909 intron_variant
C/A 30129923 intron_variant
T/C 30129935 intron_variant
T/C 30129941 intron_variant
G/A 30129996 intron_variant
A/T 30130052 intron_variant
G/A 30130175 stop_gained p.Gln386*
T/C 30131166 synonymous_variant p.Glu348Glu
A/T 30132104 intron_variant
C/T 30133202 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16914.1
MDRNKKGTGEAEFFTEYGEASRYDILEVIGKGSYGVVCSAVDSHNGEKVAIKKINDVFEHVSDATRILREIKLLRLLRHPDIVEIKHIMLPPSRREFRDVYVVFELMESDLHQVIKANDDLSPEHYQFFLYQLLRGLKFIHTANVFHRDLKPKNILANADCKLKICDFGLARVSFNEAPSAIFWTDYVATRWYRAPELCGSFFSKYTPAIDIWSIGCIFAEMLTGKPLFPGKNVVHQLDLITDLLGTPPTETISKIRNEKARRYLGSMRKKQPIPFTKKFPNVDPLGLHLLERLLAFDPKDRPAAEEALSDPYFNGLANVDREPSTQPISKLEFEFERRKLTKDDVRELIYREILEYHPQMLQEYLRGGEQTSFMYPSGVDRFKRQFAHLEEHSGKGERGTPLLRHHASLPRERVPAPKEENNQNDDGENPTAAVDESDSGNPDAQNGPSKPNCSARSLLKSASISGSKCIDVKKSNDQEEEPLTEVSDETLDELTKVASLHT*


CDS Sequence:
>Vu_16914.1
ATGGATCGTAACAAAAAGGGAACAGGGGAGGCAGAGTTTTTTACTGAGTATGGAGAGGCAAGTAGGTATGACATCCTGGAAGTGATTGGAAAAGGGAGTTACGGTGTTGTGTGTTCTGCTGTTGACAGTCATAATGGGGAAAAAGTTGCAATAAAGAAAATCAATGATGTTTTCGAGCATGTGTCAGATGCCACACGGATCCTAAGAGAAATAAAACTCCTTCGTTTGCTTCGACATCCTGATATAGTTGAGATAAAGCACATAATGCTTCCTCCCTCCCGACGAGAGTTCAGGGATGTCTATGTTGTGTTTGAGTTGATGGAGTCTGATCTTCATCAAGTGATTAAGGCAAACGATGATCTTAGCCCTGAGCACTATCAATTTTTCTTGTACCAACTTCTTAGAGGCCTCAAATTTATACACACAGCAAATGTGTTTCATCGTGATTTGAAGCCAAAAAATATTCTAGCTAATGCTGATTGCAAACTAAAAATATGTGATTTCGGACTTGCTCGAGTTTCATTTAATGAGGCTCCGTCAGCTATATTCTGGACCGACTATGTTGCAACCCGGTGGTATCGTGCACCTGAACTATGCGGCTCTTTTTTCTCAAAATATACTCCCGCAATTGATATTTGGAGCATTGGATGCATATTTGCAGAAATGCTCACTGGGAAGCCATTGTTTCCAGGAAAAAATGTAGTGCACCAATTGGATCTCATAACTGACCTGCTTGGTACTCCTCCTACTGAAACCATTTCTAAGATTCGAAATGAGAAGGCTAGAAGGTACCTTGGTAGCATGAGGAAAAAACAACCTATTCCATTCACCAAAAAATTTCCAAATGTAGATCCTTTGGGTCTTCATTTACTGGAGCGATTACTTGCATTTGATCCTAAAGATCGTCCAGCAGCTGAAGAGGCACTAAGTGACCCTTATTTCAATGGTTTGGCCAATGTGGACCGTGAACCATCCACTCAACCCATTTCAAAGCTGGAGTTTGAGTTTGAGAGGAGAAAATTGACCAAAGATGATGTTAGAGAATTGATTTATCGAGAGATTTTAGAGTATCATCCCCAGATGCTCCAAGAATATCTTCGCGGTGGAGAACAAACTAGCTTCATGTATCCAAGTGGGGTTGATCGATTCAAGCGACAGTTTGCTCATCTTGAGGAGCATTCTGGCAAAGGTGAACGAGGCACTCCATTGTTGAGGCACCATGCCTCCTTGCCTAGAGAGCGAGTTCCAGCTCCCAAGGAAGAAAATAATCAAAATGATGATGGTGAAAATCCAACTGCAGCAGTTGATGAGTCAGATTCTGGAAATCCAGATGCACAAAACGGACCCTCCAAGCCAAACTGCAGTGCACGTAGCCTATTGAAGAGTGCCAGCATTAGTGGTTCAAAGTGTATAGATGTGAAAAAAAGCAATGATCAAGAGGAGGAGCCACTTACAGAGGTCAGTGATGAGACTCTGGATGAGTTGACAAAGGTTGCTTCCCTGCATACTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_16914::LG4:30133975-30135975(-)
CTCTCACGAGTTTACATAAATTCTCAAATTTGATAACTTTGTTCATAAAGTGCTATAATTATTTTCAATCATCATCATCTTTTCCAGACATTTTATCATACAACTCATGCACAATTCTAATTTTCTAGTTTTCCAACCAACAAGTCATCTGGAATTGCCAAGGACAACTTTGAAAAAAATATTGACCATTACTTTCTCTAAATTTTCTGTTATTTTGTATTAATGAAAAAAAGATGGACTCTAAAAGGAAAAAAATTCTACATTATCAAAAAATTCTATATGACGATTAAAAAGAGAAACATACTTTTATTATATTGTCAGTATAATTATGGTATATAATTTAGTAAATTTTGGATAAATTCATTATCCCACTCATTAAATAAAATATCGAACTGAAATGAACTTTTATAGTAGTCTGGATTTAATTAAATCATTTAAGTTAAAAAAATTATTTTATGTTATTAAAAATTGTTATTTTTCAAGTATAAAACTAATTAAAATAATGATTTTTTAAAGTAAACCAATAAATGAAGTCATAATAAATTTATTCAAATTAATTAATTCAAAACGTGAAAATAAAATATAACGCAATTTATATAATACAATTATAAAAATGAATATCGGATTTATTAAATAATATGCATATGAGTGGGTTAGATAAAATTGGATCCAATCATAAATAAAATACAATCTAATTAAATCGAGTTGGATTTGATGAAATTAAATTATCAGATAACCTAACCCAATCAATATTATCAATAAAAATCAAATAATCAACAAAAATATTATCAACAGTATAAAACACTGTTATAATAAAGTGACATAAACTTTTTTTAATAGATAAACTGAGATTGAACAGTTAAAATAAAGAAATTAAAATGGTGAGAAACTTAAGAAAGCAAAAGTAAATAATAAGAAGTGTAGATAATGATGGAAGACAGTAAAGACAAAGTATGGATGGAGAAGAGCAATCAAACTTTGGAATCTTCATGCTCAATTTATTTATTTATTTATTTATGTTAAAAATATGTTTCTTGAAATTAATAAACTTCTATTCTAATAATTCAAACTCAATAATGTTAGAAAAATTTATAATCGTATGAGTGAAACCAATAAAATGAAATTAGTATAATTTGATGGGATATAAGGGTAAACTTAAAAGTTCAAATTTTCTGTTGATTTATTATATATATATTTTTATTAGTTAGAAGTTTTTAAAATAATAATTATAATAATTAATAAATTTAACATATAATAATGTAAAAATAACAAATAACTTTAGACTCGTTAATGAAATTAGTTAATTATGTTAAATTTTTCAAATCTTGATATTATTCCTATAATGTCCATACACTTTTAATGAAATATAGTTTTACCATACAAAACAATTATCAAGTATATGATCAAATTTATTATTATTTTATACATACTTTTATTAAAATTAATTTGATTCATTAAAAATATAAGAGAACTAAAAGATTACTTACAAATTTAAGCAGTTTAAGAATGATTATATCAAAAACATAAAAGAAATATATCTATTTTAAAATTCATCCATATAAATTTAGAAAAACAGTGAGTATAGTTTTTCTTTTTATTATTGTCTTGTTCTTGTAAAAGTAGCTCTTACTGTAAAAGGTAATAACATTGAGAAGAATAAGTTGTGTCAATTCATATTTTTACTTCTATTTTCCTAAATGGAAATCTTCATTGTCAAAATCCTTCTAGTTATATAGTTTTTGTTTCTGATTCAGATTTCAGATTGACTTGAAAAAGATAAACATGACTGAGAATACAGCATCGTGAAGGTAGTTTATTTGGATAAGAATTTCAGTTTTTTTTTTCTAATAATTTAATAATAATAATAATAATAATAGTTAGATGTCAATGTCGAAAAGACCACATCAAGATTTTCTTGCCATGTTTTCCGCAGGCGCAGAAAATTCCAAAACAGTAGAAAGACGACAGAGATAAAACCAAAATAGAGAATAAGAAAAAGA


Gene Sequence:
>Vu_16914(-)
AGAGAGGGAAGGAAATTGAGAGAGAGAGAAATGGGGTAGGCGCAGATTGAGGAAGAGTGAGTGTATATGGGTGGTGTGGGAGCAACACTCTTTCGTGGATGGCATTCTTCGTTTCTTCCATCGATGCAATTCTATTAACTCTCACATTCACCTTCACAACAACAAAAACAACCTCAACAAAAATGCCAACAACAACGTTAACAACATTCTCCTCCTGAGAGACATTTACGTTCAAACATCTTCCTTCAACCTTCTCTCAAAGCCCCCAAACGCTCCCACTTCAAATCTTCCTCCATGGATCGTAACAAAAAGGTCCCTTTTATACAAAATTACTTTTTTCTTCTGTTTGTGAAAGATCATGCCTTTTTGTAGCTTTTCTGAGCAACGGGTGTCGTTCAAGTTTCAATCTTATTCCAATCCGTATTTTCAATTTTTGTTTTTGATTTGCTTTTGCGTCCATTTTTATTTTAACAATTAGTATTTGTAAATCATGGCAAAGAGTTATGTTTAGAATCTGGTTCAAGTTTTGTCTGAGAATATGCAAAAGGATATACCAGAGAGGTTTGATTTTATAGGTTGGAATTGATTTCATTTGGTGCTTCTTTCTGGTTATGAATCAAACTATTAGAAACTAAAGAGGTAGCATTTGGCAATTATTAAGTTAGCCTGATAATGGGTAACTTGTTCGGAATCCAAGTTATATTTTTTGATACTGTATCTGTGATTTACATCTATTACCATAGAGCTTGTAGTTGGTTGAAAGACAAGAACACGAATTAATTTATAGTACTCTAATCAAATAATATTTTCATGCTATTTGTCTGTCTCTAAATATTGATTCATCGAACAGGGAACAGGGGAGGCAGAGTTTTTTACTGAGTATGGAGAGGCAAGTAGGTATGACATCCTGGAAGTGATTGGAAAAGGGAGTTACGGTGTTGTGTGTTCTGCTGTTGACAGTCATAATGGGGAAAAAGTTGCAATAAAGAAAATCAATGATGTTTTCGAGCATGTGTCAGATGCCACACGGATCCTAAGAGAAATAAAACTCCTTCGTTTGCTTCGACATCCTGATATAGTTGAGATAAAGCACATAATGCTTCCTCCCTCCCGACGAGAGTTCAGGGATGTCTATGTTGTGTTTGAGTTGATGGAGTCTGATCTTCATCAAGTGATTAAGGCAAACGATGATCTTAGCCCTGAGCACTATCAATTTTTCTTGTACCAACTTCTTAGAGGCCTCAAATTTATACACACAGGTATACTTGTGATTAAGTACTTAACCTTTTCAGATAGTGATATTGAACCCAAACAATTGTTTTCTTACAGCAAATGTGTTTCATCGTGATTTGAAGCCAAAAAATATTCTAGCTAATGCTGATTGCAAACTAAAAATATGTGATTTCGGACTTGCTCGAGTTTCATTTAATGAGGCTCCGTCAGCTATATTCTGGACCGTAAGTATTATTGGAAATTGATTCACTTGTTATTTCTGTTCTGCTTCTGCTTTCTAAGATTTTCAGCTGAAAAGTGCAATCAAATTTATGGTTTCTGTGCCAGAATTATCCTTCTAAACATTTTGCTGACTAATTTTACTTACTCTTATTAAGGACTATGTTGCAACCCGGTGGTATCGTGCACCTGAACTATGCGGCTCTTTTTTCTCAAAAGTAAGTTTCTTGTATTCTTTCTACCTCTTTCTGTAGTTTGTGACATGTATGTTATGGCTCCAAATCTGTTTGTGCTTAATTATATGATATAGTTCAATTCTCTTGTTATACCTTTTATTTTTGAAAATTAGCTTGATGTGCATATATAATAGTACTCCCCCACATGAAAATACTTCTTGAATTTAGAGTTGATTTGTTTATTTGAAATTTCAATTATTATATATGTGACATGTACATGTCATTCTGTTTTAGTTGCTTCTTCATCATCTTTTTGCAAAGATTTGAATTTGTGTACGAAATATGAAGTTGAAGAATACTTAAAAAGTATTGATATACGTGTGTAATTTTATATCCTTGCCTTTTGCAGTATACTCCCGCAATTGATATTTGGAGCATTGGATGCATATTTGCAGAAATGCTCACTGGGAAGCCATTGTTTCCAGGAAAAAATGTAGTGCACCAATTGGATCTCATAACTGACCTGCTTGGTACTCCTCCTACTGAAACCATTTCTAAGGTCAGTTTATTCAAAAATCCATTATCCATTTTTTAACATCAATAGGCAAACTTGTAACATGCTGGACTGCAGAGACTACTCAAGGTCTGAGAGGTCTAAAACAAACTTGTAACATGCTAATGGTATTAATTATAAGCTTCTGATTTTCCTGTTTTAAAACATCCATGTCTGTTCTAATGGTTACTTTATTTCCTATAGCTTGTCCTCATGTTAGTAATTTTTAATCTTAATTTCACAGATTCGAAATGAGAAGGCTAGAAGGTACCTTGGTAGCATGAGGAAAAAACAACCTATTCCATTCACCAAAAAATTTCCAAATGTAGATCCTTTGGGTCTTCATTTACTGGAGCGATTACTTGCATTTGATCCTAAAGATCGTCCAGCAGCTGAAGAGGTTGATCTTTGGTTACCTAGATAGCTACCAAAGAGGAAATTTCGTTTGATTATGCAGATAATTTCCCAAGTTCCTTACTTCTTCTTTGTTATGCCTGTGATTGCAGGCACTAAGTGACCCTTATTTCAATGGTTTGGCCAATGTGGACCGTGAACCATCCACTCAACCCATTTCAAAGCTGGAGTTTGAGTTTGAGAGGAGAAAATTGACCAAAGATGATGTTAGAGAATTGATTTATCGAGAGGTATGGCCACGCATTTCAATGGCTTGATTCACTTTATAATTTATTGTCTTCTCTTTTTTGGCTTGGTAATAATGACTTTTACATTTGTACTCAACAGATTTTAGAGTATCATCCCCAGATGCTCCAAGAATATCTTCGCGGTGGAGAACAAACTAGCTTCATGTATCCAAGGTAGGGGGCATTTTATCTCCCTCTAACTCGATTTGTTTTTGAAATTTCTGATAGTGCTACCTTATTATAGTTTTTTAGGAAACTATCCCCTAAAATATCAAATAGTTCTTGTCGTGATTTGGAACTTTTCTCATATTGTTCATAATTGAAGTAGTTTTTCCTGCTTTATAATATGTTCATGCTTCATCTTCTCAGTTCTATGAAAATCAATTCTTCTCAACTTTAAACCAAACTGGTACTTAGCAGAACTTCTACCTTAATGATTATTAGTCTGGTTCACATTTCATGCATTGTACTTGATGGTCTGAAAAACAGAATTTACTTGTTAAAATGAATCCAATCCTCCATGCTTGAACAGCCTATGCATTTGAAAAGTAATGGCTTCATGTATTTGTGAAAGCTGATGAGACTGGTAGACATGTATGTCCTTTGCTAAAGGATATAAGATATTGAGCCAGCTTTTATGATACTTGATTTGGATCCCTTACATTTATTGTTGCTGCACTGCACCAAAGTTCTGTTAGATTTTTTCTGCACAATTTTTTATAAAGAGCTATAGCCTCCACTAGCAAAACATTTAACATGCATGTCTAGTTTTTGTTTATGATTCTTGCACCTGATTTGGCATGCATGTATAGTTTTTGTTGGTTACTCTTGAGAAGCAACTGATGGTTTCTTGTCCTTTTTTTTTTCTGCATACCTCAGAACTGTGTAATGTTGGACCTTTAAAATCACTGCTTTCTTGGGATTCTAATCTGTAATTGTGTGTTATCTTGTTGCAGTGGGGTTGATCGATTCAAGCGACAGTTTGCTCATCTTGAGGAGCATTCTGGCAAAGGTGAACGAGGCACTCCATTGTTGAGGCACCATGCCTCCTTGCCTAGGTAAGTCTTTGTTAAACTTGGCAAACCTGTTCAAGTACTTGATTTGCACACTAACAATCTTGTTCTTTTGGAGATTTATTTTATCTATATTTTTTATTACCATCATTGGTTCAAAATTATAATCTAGGGTAGTATTTATCATTACAATGTTTGTAGATGAAACTGTAGTTATGCCTACAAAACTGTCTCTGACATTATCTTTACAATGTTGGTGGATGAGACTGGTAGTTATGCCTCTCTGACATTATCTTTACAATGTTTGTGGATGAGACTGGTAGTTATGCCTACAAAACTGTCTCTGACATTATCTTTACAATGTTTGTGGATGAGACTGGTAGTTATTCCTACAAAACTGTTATTGACATTATCTTTACAATGTTTGTAAATTGATTGTTTCAATTTACTTTTTCCAGAGAGCGAGTTCCAGCTCCCAAGGAAGAAAATAATCAAAATGATGATGGTGAAAATCCAACTGCAGCAGTTGATGAGTCAGATTCTGGAAATCCAGATGCACAAAACGGACCCTCCAAGCCAAACTGCAGTGCACGTAGCCTATTGAAGAGTGCCAGCATTAGTGGTTCAAAGTGTATAGATGTGAAAAAAAGCAATGATCAAGAGGTACCTACCTAACTCTCCTCTCAGTTGCTGTTCTTGCATTGTGTGAAGTGAAATCCAATACCAATATTTTTCTACTCTTCACTGATGTGTGTCTTTGAAGTTTCAAACCCTTTAAAAAGAAGTTTTGAAAATCCAATGCAACTATATATAAGACTTAAAAATGTAGAGTATATAAACATAGAAACATTGCCTTTAGTGAATCAAAAACTCAAAGATTCATACAACTCCAAGTTGTATGTACACTGTAGAAAACAATTCATAATTAATGGCTATCATTTATATTTGATCCACCTTTTGTATGTGTGCATCATGGCCAATAATTGTTTATGATTTCTTGTTCTACCAAAGATATAGAATACCCAATTGCCTTCACTTGATCAATGTTGATTTTTGATGTTTTACTCTGAGTACATTTGTCCTTTGGTTATGTTGATCCTATTTCTTCAATATAGGAGGAGCCACTTACAGAGGTCAGTGATGAGACTCTGGATGAGTTGACAAAGGTTGCTTCCCTGCATACTTGATTCATGATTTTGATCTAACTTTCCAATGTTCCTCCCTTTACAAAAGAGAGAATGAATTGTTGCACAGAAACCTTTCACATTTTTTTGGGTGTAGAAGTTAACTGTAGGATTCTGTTGTATTTAAGTATCATTTTTTTACATCTGCAAGAAGTCATGTCAATATATATTTGTGTAATAGTAATTATTATTGCATCACAATGTATTATATATAGTACGTATTGGAGCAAGTAGGGATTGTACCAATCACCTTAATTCTTCTTTTATAGCAGAATTTGGTCTTGGTTTTGCATGTCTATGTAGGTGTCATGTATATTATTTATGTTTTCATCCTCATTGCATATCCTCTGTATCCTTGAAACTATGTCATGCTTTTGAAATTTTAAAAGCCTTTTTAAATTGATATGTAATTAGGAATCACCATGGATAG

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