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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16905 LG4 29990176 29995456 PREDICTED: mitogen-activated protein kinase 9-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 29990581 intron_variant
T/C 29990645 intron_variant
C/T 29990786 intron_variant
T/A 29991242 intron_variant
G/A 29991489 intron_variant
G/A 29991930 intron_variant
T/G 29991950 intron_variant
C/T 29992070 intron_variant
C/A 29992185 intron_variant
A/T 29992367 intron_variant
T/A 29992442 intron_variant
T/C 29993661 intron_variant
T/C 29994284 synonymous_variant p.Gln113Gln
T/A 29994567 missense_variant p.Glu19Val
T/C 29994625 intron_variant
A/T 29995112 intron_variant
G/A 29995303 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16905.1
MDRNKKGTGEAEFFTEYGEASRYDILEVIGKGSYGVVCSAVDSHNGEKVAIKKINDVFEHVSDATRILREIKLLRLLRHPDIVEIKHIMLPPSRREFRDVYVVFELMESDLHQVIKANDDLSPEHYQFFLYQLLRGLKFIHTANVFHRDLKPKNILANADCKLKICDFGLARVSFNEAPSAIFWTDYVATRWYRAPELCGSFFSKYTPAIDIWSIGCIFAEMLTGKPLFPGKNVVHQLDLITDLLGTPPTETISKIRNEKARRYLGSMRKKQPIPFTKKFPNVDPLGLHLLERLLAFDPKDRPAAEEALSDPYFNGLANVDREPSTQPISKLEFEFERRKLTKDDVRELIYREILEYHPQMLQEYLRGGEQTSFMYPSGVDRFKRQFAHLEEHSGKGERGTPLLRHHASLPRERVPAPKEENNQNDDGENPTAAVDESDSGNPDAQNGPSKPNCSARSLLKSASISGSKCIDVKKSNDQEEEPLTEVSDETLDELTKVASLHT*


CDS Sequence:
>Vu_16905.1
ATGGATCGTAACAAAAAGGGAACAGGGGAGGCAGAGTTTTTTACTGAGTATGGAGAGGCAAGTAGGTATGACATCCTGGAAGTGATTGGAAAAGGGAGTTACGGTGTTGTGTGTTCTGCTGTTGACAGTCATAATGGGGAAAAAGTTGCAATAAAGAAAATCAATGATGTTTTCGAGCATGTGTCAGATGCCACACGGATCCTAAGAGAAATAAAACTCCTTCGTTTGCTTCGACATCCTGATATAGTTGAGATAAAGCACATAATGCTTCCTCCCTCCCGACGAGAGTTCAGGGATGTCTATGTTGTGTTTGAGTTGATGGAGTCTGATCTTCATCAAGTGATTAAGGCAAACGATGATCTTAGCCCTGAGCACTATCAATTTTTCTTGTACCAACTTCTTAGAGGCCTCAAATTTATACACACAGCAAATGTGTTTCATCGTGATTTGAAGCCAAAAAATATTCTAGCTAATGCTGATTGCAAACTAAAAATATGTGATTTCGGACTTGCTCGAGTTTCATTTAATGAGGCTCCGTCAGCTATATTCTGGACCGACTATGTTGCAACCCGGTGGTATCGTGCACCTGAACTATGCGGCTCCTTTTTCTCAAAATATACTCCCGCAATTGATATTTGGAGCATTGGATGCATATTTGCAGAAATGCTCACTGGGAAGCCATTGTTTCCAGGAAAAAATGTAGTGCACCAATTGGATCTCATAACTGACCTGCTTGGTACTCCTCCTACTGAAACCATTTCTAAGATTCGAAATGAGAAGGCTAGAAGGTACCTTGGTAGCATGAGGAAAAAACAACCTATTCCATTCACCAAAAAATTTCCAAATGTAGATCCTTTGGGTCTTCATTTGCTGGAGCGATTACTTGCATTTGATCCTAAAGATCGTCCAGCAGCTGAAGAGGCACTAAGTGACCCTTATTTCAATGGTTTGGCCAATGTGGACCGTGAACCATCCACTCAACCCATTTCAAAGCTGGAGTTTGAGTTTGAGAGGAGAAAATTGACCAAAGATGATGTTAGAGAGTTGATTTATCGAGAGATTTTAGAGTATCATCCCCAGATGCTCCAAGAATATCTTCGCGGTGGAGAACAAACTAGCTTCATGTATCCAAGTGGGGTTGATCGATTCAAGCGACAGTTTGCTCATCTTGAGGAGCATTCTGGCAAAGGTGAACGAGGCACTCCATTGTTGAGGCACCATGCCTCCTTGCCTAGAGAGCGAGTTCCAGCTCCCAAGGAAGAAAATAATCAAAATGATGATGGTGAAAATCCAACTGCAGCAGTTGATGAGTCAGATTCTGGAAATCCAGATGCACAAAACGGACCCTCCAAGCCAAACTGCAGTGCACGTAGCCTATTGAAGAGTGCCAGCATTAGTGGTTCAAAGTGTATAGATGTGAAAAAAAGCAATGATCAAGAGGAGGAGCCACTTACAGAGGTCAGTGATGAGACTCTGGATGAGTTGACAAAGGTTGCTTCCCTGCATACTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_16905::LG4:29995456-29997456(-)
CTCTCACGAGTTTACATAAATTCTCAAATTTGATAACTTTGTTCATAAAGTGCTATAATTATTTTCAATCATCATCATCTTTTCCAGACATTTTATCATACAACTCATGCACAATTCTAATTTTCTAGTTTTCCAACCAACAAGTCATCTGGAATTGCCAAGGACAACTTTGAAAAAAATATTGACCATTACTTTCTCTAAATTTTCTGTTATTTTGTATTAATGAAAAAAAGATGGACTCTAAAAGGAAAAAAATTCTACATTATCAAAAAATTCTATATGACGATTAAAAAGAGAAACATACTTTTATTATATTGTCAGTATAATTATGGTATATAATTTAGTAAATTTTGGATAAATTCATTATCCCACTCATTAAATAAAATATCGAACTGAAATGAACTTTTATAGTAGTCTGGATTTAATTAAATCATTTAAGTTAAAAAAATTATTTTATGTTATTAAAAATTGTTATTTTTCAAGTATAAAACTAATTAAAATAATGATTTTTTAAAGTAAACCAATAAATGAAGTCATAATAAATTTATTCAAATTAATTAATTCAAAACGTGAAAATAAAATATAACGCAATTTATATAATACAATTATAAAAATGAATATCGGATTTATTAAATAATATGCATATGAGTGGGTTAGATAAAATTGGATCCAATCATAAATAAAATACAATCTAATTAAATCGAGTTGGATTTGATGAAATTAAATTATCAGATAACCTAACCCAATCAATATTATCAATAAAAATCAAATAATCAACAAAAATATTATCAACAGTATAAAACACTGTTATAATAAAGTGACATAAACTTTTTTTAATAGATAAACTGAGATTGAACAGTTAAAATAAAGAAATTAAAATGGTGAGAAACTTAAGAAAGCAAAAGTAAATAATAAGAAGTGTAGATAATGATGGAAGACAGTAAAGACAAAGTATGGATGGAGAAGAGCAATCAAACTTTGGAATCTTCATGCTCAATTTATTTATTTATTTATTTATGTTAAAAATATGTTTCTTGAAATTAATAAACTTCTATTCTAATAATTCAAACTCAATAATGTTAGAAAAATTTATAATCGTATGAGTGAAACCAATAAAATGAAATTAGTATAATTTGATGGGATATAAGGGTAAACTTAAAAGTTCAAATTTTCTGTTGATTTATTATATATATATTTTTATTAGTTAGAAGTTTTTAAAATAATAATTATAATAATTAATAAATTTAACATATAATAATGTAAAAATAACAAATAACTTTAGACTCGTTAATGAAATTAGTTAATTATGTTAAATTTTTCAAATCTTGATATTATTCCTATAATGTCCATACACTTTTAATGAAATATTGTTTTACATACAAAATAATTATCAAGTATATGATCAAATTTATTATTATTTTATACATACTTTTATTAAAATTAATTTGATTCATTAAAAATATAAGAGAACTAAAACATTACTTACAAATTTAAGTAGTTTAAGAATGATTATATCAAAAACATAAAAGAAATATATCTATTTTAAAATTCATCCATATAAATTTAGAAAAACAGTGAGTATAGTTTTTCTTTTTATTATTGTCTTGTTCTTGTAAAAGTAGCTCTTACTGTAAAAGGTAATAACATTGAGAAGAATAAGTTGTCTCAATTCATATTTTTACTTCGATTTTCCTAAATGGAAATCTTCATTGTCAAAATCCTTCTAGTTATATAGTTTTTGTTTCTGATTCAGATTTCAGATTGACTTGAAAAAGATAAACATGACTGAGAATACAGCATCATGAAGGTAGTTTATTTGGATAAGAATTTCAGTTTTTTTTTTCTAATAATTTAATAATAATAATAATAATAATAGTTAGATGTCAATGTCGAAAAGACCACATCAAGATTTTCTTGCCATGTTTTCCGCAGGCGCAGAAAATTCCAAAACAGTAGAAAGACGACAGAGATAAAACCAAAATAGAGAATAAGAAAAAGAA


Gene Sequence:
>Vu_16905(-)
GAGAGGGAAGGAAATTGAGAGAGAGAGAAATGGGGTAGGCGCAGATTGAGGAAGAGTGAGTGTATATGGGTGGTGTGGGAGCAACACTCTTTCGTGGATGGCATTCTTCGTTTCTTCCATCGATGCAATTCTATTAACTCTCACATTCACCTTCACAACAACAAAAACAACCTCAACAAAAATGCCAACAACAACGTTAACAACATTCTCCTCCTGAGAGACATTTACGTTCAAACATCTTCCTTCAACCTTCTCTCAAAGCCCCCAAACGCTCCCACTTCAAATCTTCCTCCATGGATCGTAACAAAAAGGTCCCTTTTAAACAAAATTACTTTTTTCTTCTGTGGGTTGTGAAAGATCATGCCTTTTTGTAGCTTTTCTGAGCAACGGGTGTCGTTCAAGTTTCAATCTTATTCCAATCCGTATTTTCAATTTTTGTTTTTGATTTGCTTTTGCGTCCATTTTTATTTTAACAATTAGTATTTGTAAATCATGGCAAAGAGTTATGTTTAGAATCTGGTTCAAGTTTTGTCTGAGAATATGCAAAAGGATATACCAGAGAGGTTTGATTTTATAGGTTGAAATTGATTTCATTTGGTGCTTCTTTCTGGTTATGAATCAAACTATTAGAAACTAAAGAGGTAGCATTTGGCAATTATTAAGTTAGCCTGATAATGGGTAACTTGTTCGGAATCCAAGTTATATTTTTTGATACTGTATCTGTGATTTACATCTATTACCATAGAGCTTGTAGTTGGTTGAAAGACAAGAACACGAATTAATTTATAGTACTCAAATCAAATAATATTTTCATGCTATTTGTCTGTCTCTAAATATTGATTCATCAAACAGGGAACAGGGGAGGCAGAGTTTTTTACTGAGTATGGAGAGGCAAGTAGGTATGACATCCTGGAAGTGATTGGAAAAGGGAGTTACGGTGTTGTGTGTTCTGCTGTTGACAGTCATAATGGGGAAAAAGTTGCAATAAAGAAAATCAATGATGTTTTCGAGCATGTGTCAGATGCCACACGGATCCTAAGAGAAATAAAACTCCTTCGTTTGCTTCGACATCCTGATATAGTTGAGATAAAGCACATAATGCTTCCTCCCTCCCGACGAGAGTTCAGGGATGTCTATGTTGTGTTTGAGTTGATGGAGTCTGATCTTCATCAAGTGATTAAGGCAAACGATGATCTTAGCCCTGAGCACTATCAATTTTTCTTGTACCAACTTCTTAGAGGCCTCAAATTTATACACACAGGTATACTTGTGATTAAGTACTTAACCTTTTCAGATAGCGATATTGAACCCAAACAATTGTTTTCTTACAGCAAATGTGTTTCATCGTGATTTGAAGCCAAAAAATATTCTAGCTAATGCTGATTGCAAACTAAAAATATGTGATTTCGGACTTGCTCGAGTTTCATTTAATGAGGCTCCGTCAGCTATATTCTGGACCGTAAGTATTATTGGAAATTGATTCACTTGTTATTTCTGTTCTGCTTCTGCTTTCTAAGATTTTCAGCTGAAAAGTGCAATCAAATTTATGGTTTCTGTGCCAGAATTATCCTTCTAAACATTTTGCTGACTAATTTTACGTACTCTTATTAAGGACTATGTTGCAACCCGGTGGTATCGTGCACCTGAACTATGCGGCTCCTTTTTCTCAAAAGTAAGTTTCTTGTATTCTTTCTACCTCTTTCTGTAGTTTGTGACATGTATGTTATGGCTCCAAATCTGTTTGTGCTTAATTATATGATATAGTTCAATTCTCTTGTTATACCTTTTATTTTTGAAAATTAGCTTGATGTGCATATATAATAGTACTCCCCCACATGAAAATACTTCTTGAATTTAGAGTTGATTTGTTTATATGAAATTTCAATTATTATATATGTGACACGTACATGTCATTCTGTTTTAGTTGCTTTTTCATCATCTTTTTGCAAAGATTTGAATTTGTGTACGAAATATGAAGTTGAAGAATACTTAAAAAGTATTGATATACGTGTGTAATTTTATATCCTTGCCTTTTGCAGTATACTCCCGCAATTGATATTTGGAGCATTGGATGCATATTTGCAGAAATGCTCACTGGGAAGCCATTGTTTCCAGGAAAAAATGTAGTGCACCAATTGGATCTCATAACTGACCTGCTTGGTACTCCTCCTACTGAAACCATTTCTAAGGTCAGTTTATTCAAAAATCCATTATCCATTTTTTAACATCAATAGGCAAACTTGTAACATGCTGGACTGCAGAGACTACTCAAGGTCTGAGAGGTCTAAAACAAACTTGTAACATGCTAATGGTATTAATTATAAGCTTCTGATTTTCCTGTTTTAAAACATCCATGTCTGTTCTAATGGTTACTTTATTTCCTATAGCTTGTCCTCATGTTAGTAATTTTTAATCTTAATTTCACAGATTCGAAATGAGAAGGCTAGAAGGTACCTTGGTAGCATGAGGAAAAAACAACCTATTCCATTCACCAAAAAATTTCCAAATGTAGATCCTTTGGGTCTTCATTTGCTGGAGCGATTACTTGCATTTGATCCTAAAGATCGTCCAGCAGCTGAAGAGGTTGATCTTTGGTTACCTAGATAGCTACCAAAGAGGAAATTTCGTTTGATTATGCAGATAATTTCCCAAGTTCCTTACTTCTTCTTTGTTATGCCTGTGATTGCAGGCACTAAGTGACCCTTATTTCAATGGTTTGGCCAATGTGGACCGTGAACCATCCACTCAACCCATTTCAAAGCTGGAGTTTGAGTTTGAGAGGAGAAAATTGACCAAAGATGATGTTAGAGAGTTGATTTATCGAGAGGTATGGCCACGCATTTCAATGGCTTGATATTGTCTTCTCTTTTTTGGCTTGGTAATAATGACTTTTACATTTGTACTCAACAGATTTTAGAGTATCATCCCCAGATGCTCCAAGAATATCTTCGCGGTGGAGAACAAACTAGCTTCATGTATCCAAGGTAGGGGGCATTTTATCTCCCTCTAACTCGATTTGTTTTTGAAATTTCTGATAGTGCTATCTTATTATAGTTTTTTAGGAAACTATCCCCTAAAATATCAAGTAGTTCTTGTCGTGATTTGGAACTTTTCTCATATTGTTCATAATTGAAGTAGTTTTTCCTGCTTTATAATATGTTCATGCTTCATCTTCTCAGTTCTATCAAAATCAATTCTTCTCAACTTTAAACCAAACTGGTACTTAGCAGAACTTCTACCTTAATGATTATTAGTCTGGTTCACATTTCATGCATTGTACTTGATGGTCTGAAAAACAGAATGTACTTGTTAAAATGAATCCAATCCTCCATGCTTGAACAGCCTATGCATTTGAAAAGTAATGGCTTCATGTATTTGTGAAAGCTGATGAGACTGGTAGACATGTATGTCCTTTGCTAAAGGAGATAAGATATTGAGCCAACTTTTATGATACTTGATTTGGATCCCTTACATTTATTGTTGCTGCACTGCACCAAAGTTCTGTTAGATTTTTTCTGCACAATTTCTTATAAAGAGCTATAGCCTCCACTAGCAAAACATTTAACATGCATGTCTAGTTTTTGTTTATGATTCTTGCACCTGATTTGGCATGCATGTATAGTTTTTGTTGGTTACTCTTGAGAAGCAACTGATGGTTTCTTGTCCTTTTTTTTTTCTGCATACCTCAGAACTGTGTAATGTTGGACCTTTAAAATCACTGCTTTCTTGGGATTCTAATCTGTAATTGTGTGTTATCTTGTTGCAGTGGGGTTGATCGATTCAAGCGACAGTTTGCTCATCTTGAGGAGCATTCTGGCAAAGGTGAACGAGGCACTCCATTGTTGAGGCACCATGCCTCCTTGCCTAGGTAAGTCTTTGTTAAACTTGGCAAACCTGTTCAAGTACTTGATTTGCACGTTAACAATCTTGTTCTTTTGGAGATTTATTTTATCTATATTTTTTATTACCATCATTGGTTCAAAATTATAATCTAGGGTAGTATTTATCATTACAATGTTTGTAGATGAAACTGTAGTTATGCCTACAAAACTGTCTCTGACATTATCTTTACAATGTTGGTGGATGAGACTGGTAGTTATGCCTACAAAACTGTCTCTGACATTATCTTTACAATGTTTGTGGATGAGACTGGTAGTTATGCCTACAAAACTGTCTCTGACATTATCTTTACAATGTTTGTGGATGAGACTGGTAGTTATTCCTGCAAAACTGTTATTGACATTATCTTTACAATGTTTGTAAATTGACTGTTTCAATTTACTTTTTCCAGAGAGCGAGTTCCAGCTCCCAAGGAAGAAAATAATCAAAATGATGATGGTGAAAATCCAACTGCAGCAGTTGATGAGTCAGATTCTGGAAATCCAGATGCACAAAACGGACCCTCCAAGCCAAACTGCAGTGCACGTAGCCTATTGAAGAGTGCCAGCATTAGTGGTTCAAAGTGTATAGATGTGAAAAAAAGCAATGATCAAGAGGTACCTACCTAACTCTCCTCTCAGTTGCCGTTCTTGCATTGTGTGAAGTGAAATCCAATACCAATATTTTTCTACTCTTCACTGATGTGTGTCTTTGAAGTTTCAAACCCTTTAAAAAGAAGTTTTGAAAATCCAATGCAACTATATATAAGACTTAAAAATGTAGAGTATATAGACATAGAAACATTGCCTTTAGTGAATCAAAAACTCAAAGATTCATACTACTCCAAGTTGTATGTACACTGTAGAAAACAATTCATAATTAATGACTATCATTTATATTTGATCCACCTTTTGTATGTGTGCATCATGGCCAATAATTGTTTATGATTTCTTGTTCTACCAAAGATATAGAATACCCAATTGCCTTCACTTGATCAATGTTGATTTTTGATGTTTTACTCTGAGTACATTTGTCCTTTGGTTATGTTGATCCTATTTCTTCAATATAGGAGGAGCCACTTACAGAGGTCAGTGATGAGACTCTGGATGAGTTGACAAAGGTTGCTTCCCTGCATACTTGATTCATGATTTTGATCTAACTTTCCAATGTTCCTCCCTTTACAAAAGAGAGAATGAATTGTTGCACAGAAACCTTTCACATTTTTTTGGGTGTAGAAGTTAACTGTAGGATTCTGTTGTATTTAAGTATCATTTTTTTACATCTGCAAGAAGTCATGTCAATATATATTTGTGTAATAGTAATTATTATTGCAGCACAATGTATTATATATAGTACGTATTGGAGCAAGTAGGGATTGTACCAATCACCTTAATTCTTCTTT

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