Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16887 LG4 29750007 29752521 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 29750014 missense_variant p.His3Arg
T/C 29750063 synonymous_variant p.Ser19Ser
C/T 29750476 missense_variant p.Ala157Val
C/G 29750540 synonymous_variant p.Ser178Ser
A/T 29750843 synonymous_variant p.Ala279Ala
C/T 29750885 synonymous_variant p.Ser293Ser
A/C 29750919 missense_variant p.Asn305His
G/A 29750937 missense_variant p.Glu311Lys
A/T 29750941 missense_variant p.Glu312Val
G/T 29750957 synonymous_variant p.Gly317Gly
G/A 29751053 synonymous_variant p.Ala349Ala
G/A 29751104 synonymous_variant p.Leu366Leu
G/T 29751125 synonymous_variant p.Val373Val
G/A 29751221 synonymous_variant p.Gly405Gly
G/A 29751306 missense_variant p.Asp434Asn
A/G 29751415 splice_region_variant&intron_variant
G/A 29751479 intron_variant
T/C 29751510 intron_variant
C/T 29751634 intron_variant
C/A 29751697 intron_variant
G/A 29751803 intron_variant
G/T 29751852 intron_variant
C/T 29751891 missense_variant p.Arg473Trp
G/A 29751972 missense_variant p.Gly500Arg
G/A 29752109 synonymous_variant p.Pro545Pro
C/T 29752218 missense_variant p.Leu582Phe
A/G 29752413 missense_variant p.Thr647Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16887.1
MQHSHKLFPTILFLFSFFSSTLSDLSSERAALLALRSAVRGRTLLWNTTFRSPCVWPGVQCDAANATVVELHLPAVALSGELPDGVFPELPNLHTLSLRVNSLSGALPADLAACTALRNLFLQQNHFAGEVPAFLSGMTGLVRLNLASNNFSGPFPARFGNLTRLRTLFLENNRLTGSIPGLEELGELAQFNVSYNMLNGSVPKKLQTFDKDSFLGNTLCGKPLGICPWDDGGGESGVNGSSNSSGVGGGGGSVIGGGKKKGKLSGGAIAGIVVGCVVALLLVLFALIILCRSGNKTRSVDNVSNVVGLKEEPQQHGEVGIEGGNVESGGGAGGGGDSVAAAAAAAAVAAVGGNGVGGGSGGDKKLVFYGNKVKVFDLEDLLRASAEVLGKGTFGTTYKAVLEEGPVVAVKRLRDVTVSEKEFKEKIDGVGVMDHENLVPLRAYYYSRDEKLLVHDYMPMGSLSAILHGNKGAGRTPLNWEMRSDIALGAARGIEYLHSQGPSVSHGNIKSSNILLSKSYDAKVSDFGLAHLVGPSSTPNRVAGYRAPEVTDPRRVSQKADVYSFGVLLLELLTGKAPTHTLLNEEGVDLPRWVQSVVREEWSSEVFDIELLRYQNSEEEMVQLLQLAVDCVVPYPGNRPSMSQVRQRMEEFRRSSSTMKEGTQDQIHQPDLIDDLEDVSSR*


CDS Sequence:
>Vu_16887.1
ATGCAACATTCTCACAAACTCTTTCCCACCATTCTCTTTCTCTTTTCCTTCTTTTCTTCAACACTCTCCGACCTCTCGTCGGAGCGCGCGGCGCTCCTCGCCCTGCGCTCCGCCGTGCGCGGCCGTACGCTCCTCTGGAACACCACCTTCCGCTCGCCTTGCGTCTGGCCCGGCGTCCAATGCGATGCCGCCAATGCCACCGTGGTGGAGCTTCACCTCCCTGCCGTCGCTCTCTCCGGCGAGCTTCCGGACGGTGTGTTCCCGGAGCTCCCCAACCTCCACACCCTCAGCCTCCGCGTCAACTCCCTCTCTGGCGCCCTCCCGGCCGACCTTGCTGCCTGCACCGCCCTCCGCAACCTATTCCTCCAACAGAACCACTTCGCCGGCGAGGTGCCGGCGTTTCTCTCCGGCATGACTGGCCTCGTCCGGCTCAATTTGGCCTCCAACAACTTTTCCGGCCCATTTCCGGCCCGGTTCGGGAACCTCACCCGGTTGAGGACCCTTTTCCTTGAGAATAATCGGCTCACTGGTTCCATACCCGGTTTGGAGGAACTCGGTGAATTGGCTCAGTTTAATGTCTCTTACAACATGTTAAACGGTTCTGTTCCTAAAAAGTTGCAGACTTTTGATAAAGATTCGTTTTTGGGCAATACCCTTTGTGGGAAGCCACTTGGGATTTGTCCCTGGGATGATGGAGGTGGCGAGAGTGGTGTAAATGGGAGTTCAAATTCAAGTGGGGTTGGAGGAGGTGGAGGGAGTGTGATTGGAGGGGGAAAGAAGAAGGGGAAGCTTTCTGGGGGTGCAATTGCAGGGATTGTTGTTGGGTGCGTGGTGGCACTTTTGTTGGTTCTCTTTGCTTTGATTATTTTGTGTAGAAGCGGGAACAAGACTAGGAGTGTTGATAATGTTAGCAACGTGGTGGGCTTGAAGGAGGAACCTCAACAGCATGGGGAGGTGGGAATTGAGGGTGGTAATGTGGAGAGTGGTGGTGGTGCTGGTGGTGGTGGGGATTCGGTGGCCGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCAGTGGCGGCAGTGGGTGGGAATGGAGTTGGCGGTGGAAGTGGTGGAGATAAGAAGTTGGTGTTTTATGGGAATAAAGTGAAGGTGTTTGATTTGGAGGATTTGCTAAGGGCTTCTGCAGAGGTGTTGGGAAAAGGAACTTTTGGGACCACCTATAAGGCTGTTTTAGAGGAAGGGCCTGTGGTGGCTGTGAAGAGGCTGAGGGATGTGACGGTTTCGGAGAAGGAGTTTAAGGAGAAGATTGATGGGGTGGGAGTGATGGATCATGAGAATTTGGTGCCTCTCAGGGCTTACTATTATAGCAGGGACGAGAAGCTTCTTGTTCATGATTACATGCCAATGGGAAGCCTATCTGCAATTTTGCATGGAAACAAAGGAGCCGGTAGGACACCGTTGAATTGGGAAATGAGATCAGACATTGCATTAGGAGCTGCTCGTGGCATCGAGTACCTACATTCACAGGGGCCTAGTGTTTCTCATGGAAACATAAAGTCCTCCAACATCCTCCTAAGCAAATCCTATGATGCCAAGGTGTCTGATTTTGGGCTTGCACACCTTGTTGGCCCCTCATCCACACCCAACAGGGTGGCCGGCTACCGTGCCCCCGAAGTAACCGATCCACGGCGAGTTTCTCAGAAGGCTGATGTATACAGCTTTGGAGTGTTGCTCTTGGAACTTCTGACTGGAAAGGCTCCTACACATACCCTCTTGAATGAGGAAGGAGTGGACCTTCCGAGATGGGTCCAATCAGTGGTTAGAGAGGAATGGAGTTCAGAGGTGTTTGATATTGAACTCCTTAGGTATCAGAATTCTGAAGAGGAAATGGTTCAGTTGTTGCAACTTGCAGTGGATTGTGTAGTTCCATACCCTGGAAACCGCCCTTCAATGTCTCAAGTGAGACAACGCATGGAAGAGTTTCGTAGGTCTAGTAGTACCATGAAAGAGGGTACTCAAGACCAAATCCATCAACCTGATTTGATCGATGATCTAGAAGATGTGTCATCTAGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_16887::LG4:29748007-29750007(+)
CTCATTGTAAAATATTTTAAAGAAAGAATTAGTGTTTCATTTGTAATAATATATATTGTTTCATGTCTTTATTATTAGTTTCTTTTAAAATTATGATCACGTGGGTGAATTTATTTTGCATGACCAAAAATAATGCTACATGTGACATTTTATCGAAACAAGTAATGATTAATATTGTTTTTTGTTTTTCATTCTTAAAGATTGCGTTTGAAACAAATATGAAACCAATGTTTGAACCAATTCTTCCTTTTTACTCGTACATATATAGTTCATGATCTTTTAATGTATAAATATATTATTTTAATGTATCAACATACTTAACTAACCAACTGCATTATATTAATAATCTATAAAATTTAAACTACCAAGTTGTGAATTTTTAAGTATCTAATATAAATTTATAGAATTAAGTCCAACTTATAAATTTTAATTTTGAATATTGGATAAACTAATTAATGACATAAAATAAATAATGTAAAATAGCTACTAGTACAGATTACACACAACATTACCTAGAAAAAAAATGTTGTTATCTGTTGGTATGACATCATCTTATTTTGTAGATAAACGTGTGGCTTTCTTCACAAAATCAAATATATAACAAAATTTTAATATTAAAACACGTACTCATTACCAAATAAATTGATAATATTATAAATCAAATATTTCAATATTAAAACTATAACATAAAAAAATTAAAGGTGTTTATCTATACATTAATTATTTATAATTCGATTATACATTACATTATTTTATTTATTTTATCTAAATAAAAAAAACATATCATTTTCTTTACTATTGCATGAAAGGATGACCCAAATATAAAACAAAAAAAAAAGTCATACTACAAACAGTAAATTAAACACATACACCAGCAGATTATTTCTGAATCAGCAAAAATCGTACAATGATGTTTTTTAAGTATACTATAGATACGACCAATTGCATATTTTCAAAAACATTTTTAATGATGTTTTACTTTTTTTAATTAATATTTCATTAAAATCTCATGGAGATTGAAAAATTTCCGTTCAAAAATTAAAAAAAAAATTGCATCACTCACTTTACTGTGCATGTAGGGTTTCGTTTTGACAGCCTGACTCAACACACAACATTCAACATCATCCTTTAATAAATTATTTATTCTTCTTTCTTTCTAGAGTCATTTGATATTATAAGAATTTAGTTTTGTTAAATTATTATTAATATAAAATGTCGTTGTTAACTAAATAAAAATAATCAAGGCTAGAATTATAAAAAATAATTATAAAAGCCAATAACTTTTCATGTATGTCCATTCACGACGGAATGAAAAATATATTCTAATATAACTTTTAACATATTTTAAAAAAAAATTATTCATATTATCATATACGTTAATCACAATATATAAACTATTTAATAAGTTTGACCCAGTTCAAGTTTTCAATTCTTCATTCATTGTAAACTTTTTAAACCTAATTATATTATTTATTTTAAAAAAACATTTAAATTTAAATAAATGACTTTTTTCCTTAAAAAAAGTTTCCTCTTTTGATAAAAGTTATACAAAAAGAAGTTTATGAAATAGCACGAGAATCAGCTATCAGAAAAGAGGGTGGTTTAATGGAAGGTTTTCTACATTAATTAATGATCATAGTAATGAAAGGTGTCTGTTTCCTAAGTTCCTAACATATTCTAATTAAACTCTATGTTTAATCTATAAATTGTTTCAGAAAGATGTAAATAATACATATTCATAAATTCAGTCGTTTGAAGACTGATATGTGTGAAATCAAATACAAAAAGTGAGTATCTGTGTATATCTATCAACTTTTCTTCCTCTTCTTACCAACTTTCTTTCTCTCACAACATCATCGATCTAACACCAATGCAAAAATCTTGTTATTCACACGTTTTAACTTTATTTTGATGTCTCTAAAATCAAAACACACACACCAGAAAAACAGAACTACTTAGGAGTGTCTGAATTCTCAAACCAAAAGCACACATAACAACAA


Gene Sequence:
>Vu_16887(+)
ATGCAACATTCTCACAAACTCTTTCCCACCATTCTCTTTCTCTTTTCCTTCTTTTCTTCAACACTCTCCGACCTCTCGTCGGAGCGCGCGGCGCTCCTCGCCCTGCGCTCCGCCGTGCGCGGCCGTACGCTCCTCTGGAACACCACCTTCCGCTCGCCTTGCGTCTGGCCCGGCGTCCAATGCGATGCCGCCAATGCCACCGTGGTGGAGCTTCACCTCCCTGCCGTCGCTCTCTCCGGCGAGCTTCCGGACGGTGTGTTCCCGGAGCTCCCCAACCTCCACACCCTCAGCCTCCGCGTCAACTCCCTCTCTGGCGCCCTCCCGGCCGACCTTGCTGCCTGCACCGCCCTCCGCAACCTATTCCTCCAACAGAACCACTTCGCCGGCGAGGTGCCGGCGTTTCTCTCCGGCATGACTGGCCTCGTCCGGCTCAATTTGGCCTCCAACAACTTTTCCGGCCCATTTCCGGCCCGGTTCGGGAACCTCACCCGGTTGAGGACCCTTTTCCTTGAGAATAATCGGCTCACTGGTTCCATACCCGGTTTGGAGGAACTCGGTGAATTGGCTCAGTTTAATGTCTCTTACAACATGTTAAACGGTTCTGTTCCTAAAAAGTTGCAGACTTTTGATAAAGATTCGTTTTTGGGCAATACCCTTTGTGGGAAGCCACTTGGGATTTGTCCCTGGGATGATGGAGGTGGCGAGAGTGGTGTAAATGGGAGTTCAAATTCAAGTGGGGTTGGAGGAGGTGGAGGGAGTGTGATTGGAGGGGGAAAGAAGAAGGGGAAGCTTTCTGGGGGTGCAATTGCAGGGATTGTTGTTGGGTGCGTGGTGGCACTTTTGTTGGTTCTCTTTGCTTTGATTATTTTGTGTAGAAGCGGGAACAAGACTAGGAGTGTTGATAATGTTAGCAACGTGGTGGGCTTGAAGGAGGAACCTCAACAGCATGGGGAGGTGGGAATTGAGGGTGGTAATGTGGAGAGTGGTGGTGGTGCTGGTGGTGGTGGGGATTCGGTGGCCGCAGCGGCGGCGGCGGCGGCAGTGGCGGCAGTGGGTGGGAATGGAGTTGGCGGTGGAAGTGGTGGAGATAAGAAGTTGGTGTTTTATGGGAATAAAGTGAAGGTGTTTGATTTGGAGGATTTGCTAAGGGCTTCTGCAGAGGTGTTGGGAAAAGGAACTTTTGGGACCACCTATAAGGCTGTTTTAGAGGAAGGGCCTGTGGTGGCTGTGAAGAGGCTGAGGGATGTGACGGTTTCGGAGAAGGAGTTTAAGGAGAAGATTGATGGGGTGGGAGTGATGGATCATGAGAATTTGGTGCCTCTCAGGGCTTACTATTATAGCAGGGACGAGAAGCTTCTTGTTCATGATTACATGCCAATGGGAAGCCTATCTGCAATTTTGCATGGTGAGTTCAGCCTCACTTTAGTTTGATGCTATCACATGCTCAGTTTTAACATGCACATAATTCGGTTGTCTTGAATTTTTGTGGTTGTGATTTGATGTTTTCTTTGCTGTTTATGGTATGAGTTTTTTCTGTAGAACGATTTCTGCAATTTGCCTTACTGTGTTCATTTTTGGAGAATGCATAATTGACAATGGAAGAGGGAAGAGAGTGTACGTACTAGCACTCTTTAAGAATGAATCATAATTTGTTTGCATTGCATCTTATAGTTTGTGGCTTTGGCCATATCTGGACATTACATAACAGAAGTGTAACCAAATATGTAAATTGGCATAAGCTTTCAAACTCCTACACTACACAGACCTCTTTGTTGCAACTGTGTTAACATGAAATAGTGTGTCATGTCATTGATTGGCATGAACACTAGCAAAAAGAAAGAAGTTGAAGTTATAATTCTGTATCATCACAGGAAACAAAGGAGCCGGTAGGACACCGTTGAATTGGGAAATGAGATCAGACATTGCATTAGGAGCTGCTCGTGGCATCGAGTACCTACATTCACAGGGGCCTAGTGTTTCTCATGGAAACATAAAGTCCTCCAACATCCTCCTAAGCAAATCCTATGATGCCAAGGTGTCTGATTTTGGGCTTGCACACCTTGTTGGCCCCTCATCCACACCCAACAGGGTGGCCGGCTACCGTGCCCCCGAAGTAACCGATCCACGGCGAGTTTCTCAGAAGGCTGATGTATACAGCTTTGGAGTGTTGCTCTTGGAACTTCTGACTGGAAAGGCTCCTACACATACCCTCTTGAATGAGGAAGGAGTGGACCTTCCGAGATGGGTCCAATCAGTGGTTAGAGAGGAATGGAGTTCAGAGGTGTTTGATATTGAACTCCTTAGGTATCAGAATTCTGAAGAGGAAATGGTTCAGTTGTTGCAACTTGCAGTGGATTGTGTAGTTCCATACCCTGGAAACCGCCCTTCAATGTCTCAAGTGAGACAACGCATGGAAGAGTTTCGTAGGTCTAGTAGTACCATGAAAGAGGGTACTCAAGACCAAATCCATCAACCTGATTTGATCGATGATCTAGAAGATGTGTCATCTAGATGA