Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16859 LG4 29422365 29422883 PREDICTED: zinc-finger homeodomain protein 9-like isoform X1
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 29422444 missense_variant p.Ser27Ile
A/T 29422517 synonymous_variant p.Ala51Ala
C/T 29422557 missense_variant p.Pro65Ser
G/C 29422573 missense_variant p.Gly70Ala
A/G 29422589 synonymous_variant p.Gly75Gly
C/T 29422622 synonymous_variant p.Asp86Asp
T/C 29422704 synonymous_variant p.Leu114Leu
G/A 29422857 missense_variant p.Ala165Thr
T/A 29422859 synonymous_variant p.Ala165Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16859.1
MENSSSSSSSNSIYRECLRNHAASLGSYATDGCGEFTLDIDVSSSSLQCAACGCHRNFHRKVTCPGAMEGLQVGGSGDIMEYSGGDVGRMEMGERSSRKRFRTKFSAEQKEKMLAFAEKLGWKLQRREVDDEIERFCKSVGVTRQVFKVWMHNHKNNSNSSNSSANLSSLTQ*


CDS Sequence:
>Vu_16859.1
ATGGAAAACTCTTCATCATCTTCATCTTCAAACTCTATATATCGAGAGTGTCTCCGCAACCATGCAGCGAGTCTCGGTAGCTACGCTACCGATGGTTGCGGAGAATTCACTCTCGATATCGACGTCTCCTCTTCCTCCCTCCAGTGTGCAGCATGCGGTTGTCACCGCAACTTCCATCGCAAAGTGACGTGTCCCGGTGCGATGGAAGGTCTGCAGGTTGGAGGAAGCGGGGATATAATGGAATATTCTGGAGGAGACGTCGGAAGAATGGAGATGGGAGAGAGGAGCAGCAGGAAGAGGTTCAGGACTAAGTTCAGTGCTGAGCAGAAGGAGAAGATGTTGGCGTTTGCAGAGAAGCTGGGGTGGAAGCTGCAGAGGAGAGAGGTGGATGATGAGATAGAGAGGTTTTGTAAAAGTGTTGGAGTTACAAGACAGGTTTTCAAGGTGTGGATGCATAACCATAAGAACAACTCTAACTCATCTAATTCTTCTGCTAATCTTTCTTCCCTCACTCAGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_16859::LG4:29420365-29422365(+)
TATCTTTTCATGTTTACATATATCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTGTATGTATGTATGTATGTATATGTATGTGAGATATGAGATATGTATGTGTTATTAATTAGTGATTGAAATGCATATTTAATGAGTAAATGTGATGTGATAAACCATAATAACATTATATATTATGTAGGTACTTATGAAAGTAATTGTAGTCAATTATGATTATATAGTTTGAGTACAAAAATAAAATTATACAAATTAAAGCTAATAAAAAATATAGGTTAGATGAAAGAGTATTTCAAATTTAAATATTAAGTAGATAATAATAATTTGAATAATTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAAATGTGGTTGATCACTATATTTTATTAACCAATTTTTATAAAATGATTTATTTGTAGCGGAAGACATATATGTTATAAAAAATTGATTGTATAGAGATTATAAATAATATTTTATTTTGTTGAATGAATCAAATTAAAATATTAAAACTTAATCTATAAAAAGTCATAATTCTGTACGTTTATTTTTTTTTCTTTCTCTTCATCTCGTTAGAAAAAAATCAAATATCAATATATTGTCCATTAATTATTTTCATTGTATAATTTTCAATTCTCACAGTAGGAACTTAGGTTAGGAAAAAAAAAGTGCAACTTTGATAATAATTCTAGCAGACTTATTTTCTGGAATTTAAATATGATTGCTTCTGATATAAAATACACGTAATTTCCACATATTTTGCAAGCAACAAATGTATTTTTTGAGGAACATATTTACCGTAACAATTTTATTAAATTTCTCTACCAGAATTCATTCACATAATGAATTTTCTGGTTTCAAAAGTGAATTATTTGGCCCACACCGTTAACGGGGCCACTGGGTTTTCTTCTTATTTTGTTGGACAAAAAGGCCCCTGTCAGTGATTGAAAATGACGATTAGGGGACTCACTTAGGGGTTACAATAAGTGAACAAGCATTCACACAAACACTGCTTTCTCTTACAAAACCAAATATATATGTTTGTGATTTTGGTAATTTGAATGACCATTTGATTCCTTAGTAGATGCATGCATGTGTCTCAAACATCTTTCAAACTCTCATTCTATTATACAAACACATGCAAATTTAATTCATTAAAATTAACAAAAAAATATTTAATTAATTAGTAATGTCATAAAACTTCTATTATTAAAATACTTATAGCATTTTAGGGGATCTTTTTAGTGATTATATTTAAGGTATTTACAATTTAATTTTTTTTTCATACTCTTGTATCTACAAAATATTGCAATAAATTTCATAAAAGAAAATTAACATTACTATATCCAAAAAAAACTGTCTCTTCTAATTAAAAAAAAAATACATTTATTTGTAGACAAAACTTAGATGTATTTCTACAATTGCCTTTGTTGTTCTTCAACACTAAAAATTCTTAATATAAATAGCCCAAACTTACAAATACTTCCTAATTACACTAAAAGTATTATTTACAGATTAGAAATTGAATTACCTACATAGATGAACTTGAATTTTTCTTTTTTTTTTTTATTTGTATCCTTATGTTCCCTACACCAATGTACCCTAATTTTGAAGGGAAGTTTTTGAACATTTTCCTTTGTTGTTTTTTTACTTTAACTAGATGTAATGTTATCTTTGAGTACATATTGTCCTATGGAAAGCTTTATGTAGATGTTGGACACATTATGGAGATGTTGCCTAGTTGTATAGGACGCTAGCATGTCCACACAACGGGGAACACTGTAAATATTCTCTCCAACCATGTCCATTCATGTCATTCTCCCACCACCTTCTCTTCGTCTGCAAATAAATACTCAACCTTCCATCCTTTCACACACACCAACAACA


Gene Sequence:
>Vu_16859(+)
ATGGAAAACTCTTCATCATCTTCATCTTCAAACTCTATATATCGAGAGTGTCTCCGCAACCATGCAGCGAGTCTCGGTAGCTACGCTACCGATGGTTGCGGAGAATTCACTCTCGATATCGACGTCTCCTCTTCCTCCCTCCAGTGTGCAGCATGCGGTTGTCACCGCAACTTCCATCGCAAAGTGACGTGTCCCGGTGCGATGGAAGGTCTGCAGGTTGGAGGAAGCGGGGATATAATGGAATATTCTGGAGGAGACGTCGGAAGAATGGAGATGGGAGAGAGGAGCAGCAGGAAGAGGTTCAGGACTAAGTTCAGTGCTGAGCAGAAGGAGAAGATGTTGGCGTTTGCAGAGAAGCTGGGGTGGAAGCTGCAGAGGAGAGAGGTGGATGATGAGATAGAGAGGTTTTGTAAAAGTGTTGGAGTTACAAGACAGGTTTTCAAGGTGTGGATGCATAACCATAAGAACAACTCTAACTCATCTAATTCTTCTGCTAATCTTTCTTCCCTCACTCAGTGA