Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16750 LG4 28331801 28335136 PREDICTED: receptor-like protein kinase HSL1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 28331884 synonymous_variant p.Ser28Ser
C/T 28332154 synonymous_variant p.Asn118Asn
T/G,C 28332214 synonymous_variant p.Arg138Arg
G/T 28332313 synonymous_variant p.Leu171Leu
T/C 28332412 synonymous_variant p.Phe204Phe
C/T 28332461 synonymous_variant p.Leu221Leu
C/T 28332631 synonymous_variant p.Asn277Asn
T/C 28332871 synonymous_variant p.Asp357Asp
T/A 28333034 missense_variant p.Leu412Met
T/A 28333219 synonymous_variant p.Pro473Pro
G/A 28333221 missense_variant p.Ser474Asn
C/T 28333346 missense_variant p.Leu516Phe
T/A 28333389 stop_gained p.Leu530*
A/T 28333399 synonymous_variant p.Leu533Leu
A/T 28333437 missense_variant p.His546Leu
C/G 28333542 missense_variant p.Ser581Cys
A/T 28333584 missense_variant p.Asn595Ile
A/C 28333639 synonymous_variant p.Pro613Pro
G/A 28334020 intron_variant
G/T 28334022 intron_variant
G/T 28334141 intron_variant
A/T 28334197 intron_variant
C/T 28334224 intron_variant
T/G 28334308 intron_variant
T/G 28334464 intron_variant
A/T 28334467 intron_variant
T/A 28334472 intron_variant
A/G 28334516 intron_variant
T/C 28334526 intron_variant
T/A 28334548 intron_variant
C/A 28334554 intron_variant
G/C 28334619 intron_variant
T/G 28334689 intron_variant
C/G,A 28334695 intron_variant
T/A 28334700 intron_variant
A/G 28334748 stop_retained_variant p.Ter709Ter
G/A 28334762 missense_variant p.Arg714His
A/G 28334821 missense_variant p.Arg734Gly
C/G 28334850 synonymous_variant p.Gly743Gly
C/G 28334913 missense_variant p.Ser764Arg
C/A 28334914 missense_variant p.Gln765Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16750.1
MTISVQSCIHFSCHIFLVLFFFLVHTSSQSLNDQEHAVLLNIKQYLEDPSFLSHWNSTSSHCSWPEITCTTGSVTSLTLSHSNINKTIPSFICDLTNLTHLDFSFNLIPGDFPTPLYNCSKLEYLDLSGNNFDGQVPREIDRLGANLQYLNLGSTNFHGDVPASIGNLKQLRQLKLQFCLLNGTVAAEIDSLPNLEYLDLSSNFLFPKWKLPWNLTKFNKLKVFYLYGTNLVGEIPDNIGDMVALEKLDASKNNLTGGIPSGLFLLKNLTSLYLFQNSLSGEIPSVVDALNLVNLDLATNDLTGKIPDDFGKLQQLEWLSLSLNNLSGVIPQSLGSLPALIDFRVFFNKLSGTLPPDFGRYSKLKTFLIASNNFTGKLPDNLCYHGMLLNLSVYENKLSGELPEFLGNCSSLLDLKIHENEFSGNIPNGLWTSFNLSNFMVSHNKFTGELPKRLSWNVSRFEISYNQFSGGIPSGVSSWTNLVVFDASKNNFNGSIPKELTALPKLITLLLDQNQLTGALPSDIISWKSLVTLNLSQNQLSGQIPHAIAQLPVLSQLDLSENEFSGQVPSLSTRVTNLNLSYNHLTGRIQREFENSAYAGSFLGNSGLCSDNPALNLTLCNSGLQRTSKDSSWSIGLIICLAVAALLLALLASLLFIRFQRKRKKGLDNSWKLVSFQRVNFTESTIVSSMTDQNIIGSGGYEFVQSTRVNEKIDVFSFGVVLLELTTGKEASYGDQHSSLSEWAWRHILIGGNVEELLDKNVTEASYLNEMCTVFKLGVMCTATLPTSRPSMKDALQILQSLAEPLFYAEKCFDHYYDARPLLKSSKEAILNVDHDSE*


CDS Sequence:
>Vu_16750.1
ATGACTATATCAGTTCAATCATGTATACACTTTTCATGTCACATTTTTCTGGTTTTGTTCTTCTTCCTTGTTCACACAAGCTCCCAATCTTTGAATGATCAAGAGCATGCAGTTTTGCTTAACATAAAGCAATATCTTGAAGACCCTTCTTTCCTCTCCCATTGGAATTCAACTTCCTCTCACTGTTCATGGCCAGAGATCACATGCACCACTGGCTCAGTCACTTCCCTCACCCTCTCCCATTCCAACATCAACAAAACTATACCATCCTTCATATGTGACCTCACCAACCTCACACACCTTGACTTCAGCTTCAACCTCATCCCTGGTGACTTCCCCACACCCCTCTACAACTGCTCCAAGTTGGAGTACCTAGATCTTTCAGGGAACAACTTTGATGGCCAGGTTCCTCGTGAGATTGACCGTTTGGGTGCTAATTTGCAATATCTCAACCTTGGTTCTACCAATTTCCATGGTGATGTTCCTGCCAGTATTGGAAATTTGAAGCAACTGAGACAGCTTAAACTTCAGTTTTGCTTATTGAATGGCACTGTTGCTGCTGAGATTGATAGCTTGCCCAATCTTGAGTACTTGGATTTGTCCTCTAACTTTTTGTTTCCTAAATGGAAGTTGCCTTGGAACTTGACCAAGTTCAACAAACTGAAGGTGTTTTATTTGTATGGCACCAACTTGGTTGGGGAAATCCCAGATAACATTGGAGATATGGTGGCTTTGGAGAAGCTGGATGCATCAAAAAATAACTTAACTGGAGGAATTCCAAGTGGTTTATTCTTGCTGAAGAATCTGACCTCACTCTATCTTTTTCAAAACAGCCTCTCAGGGGAGATACCAAGTGTGGTTGATGCATTAAACTTGGTCAACCTTGATCTTGCAACGAATGATCTCACAGGGAAAATACCAGATGATTTTGGAAAACTGCAACAGCTGGAATGGTTGAGTTTGTCTTTGAATAACTTGTCAGGTGTGATACCACAAAGCTTGGGCAGTCTTCCTGCTCTCATTGATTTTCGCGTGTTTTTCAACAAGTTATCAGGTACTCTTCCTCCTGATTTTGGCCGTTACTCAAAGCTTAAAACCTTTTTGATTGCATCTAATAATTTTACGGGGAAGTTACCGGATAACCTGTGCTATCATGGGATGTTACTTAACTTGTCTGTTTATGAGAATAAGCTGAGTGGTGAGTTGCCAGAATTTCTTGGAAATTGCAGTAGTTTGCTGGACCTGAAAATTCACGAAAATGAGTTTTCTGGTAACATTCCTAATGGTCTTTGGACATCTTTCAATTTGTCAAATTTCATGGTTAGCCATAACAAGTTCACTGGTGAGCTTCCTAAAAGGCTATCTTGGAATGTTTCGAGGTTTGAGATAAGTTACAATCAGTTTTCTGGTGGAATTCCTAGTGGAGTATCATCATGGACTAATTTGGTAGTGTTTGATGCCAGTAAGAACAATTTCAATGGAAGTATTCCAAAAGAGCTAACAGCTCTTCCTAAGTTAATAACCTTGTTGCTTGATCAGAACCAACTCACTGGGGCACTTCCATCAGATATAATATCATGGAAATCCTTGGTAACTCTAAATTTGAGCCAAAACCAACTCTCTGGACAAATCCCTCATGCAATTGCTCAGTTACCTGTCCTTAGTCAGCTTGATCTATCAGAAAATGAATTCTCTGGCCAAGTTCCTTCTCTATCTACCAGAGTCACCAATCTCAATTTGTCTTATAATCATTTAACTGGGAGAATTCAAAGGGAGTTTGAAAATTCTGCGTATGCTGGTAGCTTTTTGGGCAATTCTGGTCTTTGTTCTGACAACCCAGCACTGAACCTTACCTTGTGCAATTCTGGCCTTCAAAGAACAAGCAAGGACTCATCTTGGTCTATTGGTTTGATTATATGCTTGGCGGTAGCAGCCTTGTTACTGGCCCTTTTAGCATCACTCTTGTTTATTAGATTTCAAAGAAAGAGAAAGAAAGGATTAGATAACTCTTGGAAGCTCGTTTCCTTTCAGAGGGTGAATTTCACAGAATCAACCATTGTCTCATCAATGACAGACCAAAACATTATTGGTAGTGGTGGATATGAATTTGTGCAATCAACCAGAGTTAATGAAAAGATTGACGTGTTCAGCTTTGGAGTAGTGCTATTAGAACTGACAACCGGTAAAGAAGCAAGTTATGGAGACCAACATTCATCTCTTTCAGAGTGGGCGTGGCGTCACATTCTGATTGGAGGCAATGTTGAAGAATTGCTAGACAAAAATGTCACTGAAGCCAGTTACTTAAATGAAATGTGCACTGTTTTCAAACTTGGTGTCATGTGCACTGCAACACTGCCTACCAGTAGGCCTTCCATGAAGGATGCCCTACAAATATTGCAAAGCTTAGCAGAACCATTATTTTATGCAGAGAAGTGCTTTGACCACTACTATGATGCTAGGCCCCTTCTTAAGAGTTCAAAGGAAGCTATATTGAATGTTGATCATGATAGTGAATGA


Promoter Sequence:
>Vu_16750::LG4:28329801-28331801(+)
AATTTTAATTTTTATTGAAAGTTAAAAGATAAATATATATTTAACCCATAAAATATATTATAGTTTTATAATTAAGTAATTTTAATATCTCAAGTTAAGTTGTTAACCCTTTTTGCATTATCATTAATTTCAGTTAATGGTTTAAATCACTTTAGTTTTGGAAAACTTTTTAAAGATAAGAGAGAACGTGTTAAACATTATAAGGGCAAGGTATCAATTTTTTAGAGTTAATATGTTCCAATTATATTATTTTTCACTATTAATTACACTATAATTATGAGATGACAAAGTTAGCTATAGCTTATGTGTAAAAGTATTTCAAAACAATATTAAATTTATTATGAGTTACCTTTTAAATTTCATAAAGATCTAGTGTAAAGAAAACTTAATAAAACAAACTTATAATATCAAATATATTTAATTTTAGATTTTATCCACAAAATTAATATTTCACAAAATTTATATATTAAATTCGCATTGAAAAAATTGTAATATTGAATTCTCAAAATACTTTTTATTTCATTAATATTTGTTGTGAAGATAATTTTTTCTTCAATTAATTTATACTAATGCTTAATATGAATTTATTTGAAACTCTCAATTAACTTTTTTCTTTCTAAACATAAGTTAACCAGTAAGCGAGCTGATATTAAAAATTTTAATATATGAAAAGACAAAAATAAAAGTATTTTAAATATTTTAAAAAATTAATAAAAACTCAATTAACTCTTAAGTTTTAATTATTAACCTATTATACAATTTTAAAATTATTGGTTAAATAAAAGTGAAATTAGAACAACGAATGATAGAGACTTAAATTGATTAGAAAACGAAGTTCTACTAAAATTAGAGTTAATAATCTAAAATTAGAAGAAGAAAAATTAAAACCAAAATTTATTAATAAACATTTGGAAACCAAGTATTGCAATGACAGTACAAAATAGTTATAAAAAAATAAACTTTTATATATTTTTTAAAAAAAGTAAAAAAAAAGTATTATCAAATAAATGCAAAAAGTTTTATATATATCAAAATATTACTTTTCATTTGGATTACATTATGTCGGGCTCATATTTCTACAAGTGGTAATGTATCCGTGTACACCACAGGTGGGTATATTTTCATTAAACAATTAAATAAATAAAGTCAATTTAACTCATGATCAAAGTTTGATATTTTTATACAGAAAATATATAAAGATAAAATCGAAAATAAAATCAATTTTATTTAATTATTAAAACTAAAAATTCCATTATTCTATTTTTTTAATTATTGGTTTGTGTTTCACGTCTAAAGGTCATGGTCAACGTCACTATCAAAGCATGTTGTTAATACTTTCCATCATATATAGTTTAAGATTCAGAAATGTTGATCCAAGACTATAGTATAAAAAAATACTGCATTTCGTAGAAGCTTCTCATATTTTTTATCATTACATTAATTTCCCAGCTTATAAAATCAGGACGGTGTATTCGTCACACAATTTTTTTTTTTATGATTTCTGTACTTCTTGAAATTTTAATAACTATTTTTTCTAATAAATTCCTATCCAAAGATTCATAAAAAAACAAAATTACTATCATAATTTTAAAAATTATTCATTATATTTTTAAATAAGATTTCCTTTTAGAGTCAAAGACCGATATTTTACATGGATCTTTGCAAAACATAGAAATATATGTTATTTCGTATTTATACATTCCAGAAATCGTATCCATAAGTATATACTTAAAAAGATATGGTTATCTTTTAGCACTCTTATCAAGTTATTCTTCACATGAGTTAAAAATAAAAGAATATTGTATATAAGTATCTAATATATCACAGTAACGTGTGAACGGTCTCAAAGCAAGCCAACCATTTTCGAATTTTCTGAGTACGCATTCATAACTCATCTTTATCAGTGCTGACCATCTTCTCCTCTCTCTGCAGCACCTTAACGTATTTAAACTGAACACCAGAAAAGCTTGTTTTCTCTCTCTTTTGCACATTCACCTAGA


Gene Sequence:
>Vu_16750(+)
ATGACTATATCAGTTCAATCATGTATACACTTTTCATGTCACATTTTTCTGGTTTTGTTCTTCTTCCTTGTTCACACAAGCTCCCAATCTTTGAATGATCAAGAGCATGCAGTTTTGCTTAACATAAAGCAATATCTTGAAGACCCTTCTTTCCTCTCCCATTGGAATTCAACTTCCTCTCACTGTTCATGGCCAGAGATCACATGCACCACTGGCTCAGTCACTTCCCTCACCCTCTCCCATTCCAACATCAACAAAACTATACCATCCTTCATATGTGACCTCACCAACCTCACACACCTTGACTTCAGCTTCAACCTCATCCCTGGTGACTTCCCCACACCCCTCTACAACTGCTCCAAGTTGGAGTACCTAGATCTTTCAGGGAACAACTTTGATGGCCAGGTTCCTCGTGAGATTGACCGTTTGGGTGCTAATTTGCAATATCTCAACCTTGGTTCTACCAATTTCCATGGTGATGTTCCTGCCAGTATTGGAAATTTGAAGCAACTGAGACAGCTTAAACTTCAGTTTTGCTTATTGAATGGCACTGTTGCTGCTGAGATTGATAGCTTGCCCAATCTTGAGTACTTGGATTTGTCCTCTAACTTTTTGTTTCCTAAATGGAAGTTGCCTTGGAACTTGACCAAGTTCAACAAACTGAAGGTGTTTTATTTGTATGGCACCAACTTGGTTGGGGAAATCCCAGATAACATTGGAGATATGGTGGCTTTGGAGAAGCTGGATGCATCAAAAAATAACTTAACTGGAGGAATTCCAAGTGGTTTATTCTTGCTGAAGAATCTGACCTCACTCTATCTTTTTCAAAACAGCCTCTCAGGGGAGATACCAAGTGTGGTTGATGCATTAAACTTGGTCAACCTTGATCTTGCAACGAATGATCTCACAGGGAAAATACCAGATGATTTTGGAAAACTGCAACAGCTGGAATGGTTGAGTTTGTCTTTGAATAACTTGTCAGGTGTGATACCACAAAGCTTGGGCAGTCTTCCTGCTCTCATTGATTTTCGCGTGTTTTTCAACAAGTTATCAGGTACTCTTCCTCCTGATTTTGGCCGTTACTCAAAGCTTAAAACCTTTTTGATTGCATCTAATAATTTTACGGGGAAGTTACCGGATAACCTGTGCTATCATGGGATGTTACTTAACTTGTCTGTTTATGAGAATAAGCTGAGTGGTGAGTTGCCAGAATTTCTTGGAAATTGCAGTAGTTTGCTGGACCTGAAAATTCACGAAAATGAGTTTTCTGGTAACATTCCTAATGGTCTTTGGACATCTTTCAATTTGTCAAATTTCATGGTTAGCCATAACAAGTTCACTGGTGAGCTTCCTAAAAGGCTATCTTGGAATGTTTCGAGGTTTGAGATAAGTTACAATCAGTTTTCTGGTGGAATTCCTAGTGGAGTATCATCATGGACTAATTTGGTAGTGTTTGATGCCAGTAAGAACAATTTCAATGGAAGTATTCCAAAAGAGCTAACAGCTCTTCCTAAGTTAATAACCTTGTTGCTTGATCAGAACCAACTCACTGGGGCACTTCCATCAGATATAATATCATGGAAATCCTTGGTAACTCTAAATTTGAGCCAAAACCAACTCTCTGGACAAATCCCTCATGCAATTGCTCAGTTACCTGTCCTTAGTCAGCTTGATCTATCAGAAAATGAATTCTCTGGCCAAGTTCCTTCTCTATCTACCAGAGTCACCAATCTCAATTTGTCTTATAATCATTTAACTGGGAGAATTCAAAGGGAGTTTGAAAATTCTGCGTATGCTGGTAGCTTTTTGGGCAATTCTGGTCTTTGTTCTGACAACCCAGCACTGAACCTTACCTTGTGCAATTCTGGCCTTCAAAGAACAAGCAAGGACTCATCTTGGTCTATTGGTTTGATTATATGCTTGGCGGTAGCAGCCTTGTTACTGGCCCTTTTAGCATCACTCTTGTTTATTAGATTTCAAAGAAAGAGAAAGAAAGGATTAGATAACTCTTGGAAGCTCGTTTCCTTTCAGAGGGTGAATTTCACAGAATCAACCATTGTCTCATCAATGACAGACCAAAACATTATTGGTAGTGGTGGATATGGTACAGTATATCGCATTGATGTTGGTTCAGACTATGTTGCTGTGAAAAAGATTTGGAATAACAGAAAGTTAGACAAGAAGCTTGAGAGCTCCTTCCGTGCAGAAGTTAGAATATTGAGCAACATTCGTCATACCAACATTGTGAGGTTGATGTGTTGTATCTCTAATGAAGATTCTATGCTCCTTGTATATGAGTATCTGGAAAATCTCAGCCTAGATAAGTGGCTGCATAAGAGTGTTAAACCAGGTTCAGCCAATAAAGTGGTCCTTGATTGGCCAAAGAGGTTGAAAATAGCAATAGGGGTTGCTCAGGGTTTGAGCTACATGCATCATGACTGTTTACCACCTGTTGTTCATAGAGATATAAAAACAAGCAACATCCTTCTGGATTCTCAGTTCAATGCTAAAGTTGCTGATTTTGGACTAGCTAAGTTGTTAATCAAGCCAGAGGAACTAAGCAGCATGTCAGCTGTTATTGGCTCATTTGGCTATATTGCTCCAGGTGAGTGTGACTTACAATCTTTTTGTTCCTAACTAGCAAATACTATTTCTTTTTCTTATTTAAATTTTGTGGTACTTTTGAGTAAACCTTAGATTTAGTGCCAAAATTTTAAGACTCAATTAGTTCCTGAATTACTAATTCTTCACTTCTAATGCCATCCACTTTTGTGTTTTGTGGATAAACAAGGGAAAATTTAAAATAAGAAACTAACTAGAGTGATTGATACTTATAATCTCAGTACAAAATAGAGGTTTAGACTTCTCTTTCCACTGGCATACAAGTTTACTCTCAATTTAACTTTTCATATTTGAATTGCAGAATTTGTGCAATCAACCAGAGTTAATGAAAAGATTGACGTGTTCAGCTTTGGAGTAGTGCTATTAGAACTGACAACCGGTAAAGAAGCAAGTTATGGAGACCAACATTCATCTCTTTCAGAGTGGGCGTGGCGTCACATTCTGATTGGAGGCAATGTTGAAGAATTGCTAGACAAAAATGTCACTGAAGCCAGTTACTTAAATGAAATGTGCACTGTTTTCAAACTTGGTGTCATGTGCACTGCAACACTGCCTACCAGTAGGCCTTCCATGAAGGATGCCCTACAAATATTGCAAAGCTTAGCAGAACCATTATTTTATGCAGAGAAGTGCTTTGACCACTACTATGATGCTAGGCCCCTTCTTAAGAGTTCAAAGGAAGCTATATTGAATGTTGATCATGATAGTGAATGA