Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_16746 LG4 28289263 28291313 PREDICTED: probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g68400
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 28289329 missense_variant p.Thr577Ala
T/C 28289352 missense_variant p.Tyr569Cys
T/C 28289404 missense_variant p.Lys552Glu
T/C 28289434 missense_variant p.Arg542Gly
A/G 28289482 stop_lost p.Ter526Argext*?
T/A 28289491 missense_variant p.Asn523Tyr
G/C 28289726 missense_variant p.Ile444Met
T/G 28289935 upstream_gene_variant
C/T 28290091 missense_variant p.Glu351Lys
C/G 28290163 missense_variant p.Val327Leu
G/A 28290210 missense_variant p.Thr311Ile
C/T 28290301 missense_variant p.Gly281Ser
A/C 28290376 upstream_gene_variant
C/A 28290416 upstream_gene_variant
A/T 28290425 upstream_gene_variant
A/T 28290431 upstream_gene_variant
G/T 28290561 missense_variant p.Phe251Leu
C/T 28290594 synonymous_variant p.Leu240Leu
G/T 28290596 missense_variant p.Leu240Met
A/C 28290673 missense_variant p.Met214Arg
G/A 28290714 synonymous_variant p.Ala200Ala
A/T 28290747 synonymous_variant p.Pro189Pro
A/G 28290837 synonymous_variant p.Asn159Asn
T/C 28290948 synonymous_variant p.Glu122Glu
A/T 28290952 missense_variant p.Val121Glu
A/T 28290993 missense_variant p.His107Gln
T/C 28291046 missense_variant p.Asn90Asp
C/T 28291051 missense_variant p.Arg88Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_16746.1
MVLCVEIGEFFPEERDALILIRDSLNSSVNLHGNWTGPPCIDSLSRWIGITCSNWHVVQIVLEGVNLSGYLPPTFLQNITLLSQLDFRNNALFGPLPSLKNLVFLEHALLSFNHFSGSIPVEYVELTSLRVLELQENYLHGQIPPFDQPSLTSFNVSYNHLSGPIPETSVLMRFPESSYENNSDLCGEPLDKLCPIQPPAPSPAPFSAPPPFAMPPIPAVKPNNRFQAWTVAVIGAAAALILLSLIIFIAFLFRKRQTSGKEVRRDDSAGHVFGAWAKKMVASAGGSDVSERLGRLEFSNKKLPVFDLDDLLRASAEILGRGNLGITYKATLETGTVVAVKRLNHMNELSKKEFLQQIQLLGQMKHENIAEIISFYYSEEQKLVIYEFTSDGTLFELLHEGRGIGRMPLDWTTRLSIIKDIAKGLLFLHHSLPSQKVPHANLKSSNVLIHQDSKGYHSKLTDYGFLPLLPAKQNAEKLAIRRSPEFVQGKKVTRSADVYCFGIIVLEIVTGKIPGHIIGEIEETTNDLSDWVRTVVNNDWSTDILDLEILAEKEGHDEMLKLTELALECTDMTPEKRPKMSVVLMRIEEIEKMKKESD*


CDS Sequence:
>Vu_16746.1
ATGGTGTTGTGCGTTGAAATTGGGGAATTCTTTCCAGAAGAAAGAGATGCTTTGATACTCATAAGGGATTCTTTGAATTCATCTGTGAATTTGCATGGGAATTGGACAGGCCCTCCTTGTATAGACAGTCTGAGTAGGTGGATTGGAATCACTTGCTCAAATTGGCATGTTGTTCAAATTGTTCTTGAAGGAGTTAACCTTAGTGGTTATCTACCTCCCACATTTCTTCAAAACATAACTCTCTTGAGCCAACTTGACTTCAGAAATAATGCACTTTTTGGACCATTGCCAAGCCTCAAGAATTTGGTGTTTTTGGAACATGCCCTTTTATCATTCAATCATTTCTCAGGGTCAATTCCTGTGGAATATGTTGAACTTACCAGTCTGAGAGTGTTGGAGCTGCAAGAGAATTACTTACATGGTCAAATTCCACCCTTTGATCAACCATCATTGACAAGTTTCAATGTGTCATATAATCATCTGTCAGGGCCTATTCCTGAAACTTCTGTGCTGATGAGGTTCCCAGAGAGTTCTTATGAAAATAATTCAGATCTTTGTGGAGAGCCTTTGGATAAGTTATGTCCTATTCAACCTCCTGCCCCATCTCCAGCACCATTTTCTGCACCACCTCCTTTTGCTATGCCTCCAATTCCAGCAGTGAAGCCAAATAACAGGTTTCAAGCATGGACTGTTGCTGTGATTGGTGCTGCAGCTGCACTGATTCTTCTTTCTCTGATCATTTTTATTGCTTTCTTGTTTCGTAAAAGACAAACAAGTGGAAAAGAAGTAAGAAGAGATGATTCAGCTGGGCATGTTTTTGGGGCATGGGCAAAGAAGATGGTGGCTTCTGCTGGGGGCAGTGATGTTTCTGAGAGATTAGGCAGATTGGAATTTTCTAACAAGAAACTACCAGTTTTTGACTTGGATGATTTACTAAGGGCATCAGCAGAAATTCTAGGAAGAGGGAACTTAGGTATTACGTACAAAGCAACACTTGAAACTGGAACTGTTGTTGCAGTGAAGAGACTTAACCACATGAATGAACTGAGCAAGAAGGAATTTCTCCAGCAGATCCAATTGCTAGGACAGATGAAGCATGAAAATATAGCAGAAATAATCTCCTTTTATTATTCAGAGGAGCAAAAGTTGGTCATATATGAATTTACCTCTGATGGCACTTTGTTTGAACTACTACATGAGGGTAGAGGAATTGGAAGAATGCCACTTGATTGGACCACAAGACTTTCTATCATCAAAGACATAGCAAAGGGTCTTCTTTTCCTTCATCATTCCTTGCCTTCTCAAAAGGTTCCTCATGCCAACCTCAAGTCATCCAATGTCCTAATCCATCAAGATAGTAAAGGGTACCATTCCAAGCTCACGGACTATGGTTTCTTGCCTCTACTCCCAGCCAAACAGAATGCAGAAAAACTAGCCATAAGGAGGTCACCAGAATTTGTTCAAGGGAAGAAGGTAACACGCAGTGCTGATGTTTATTGCTTTGGCATCATTGTGCTAGAGATTGTAACCGGCAAAATCCCTGGCCATATCATAGGTGAAATTGAAGAAACTACCAATGATCTTTCAGATTGGGTAAGAACTGTGGTGAACAATGATTGGTCCACAGATATATTGGATTTAGAAATACTTGCAGAAAAAGAAGGCCATGATGAAATGTTAAAGCTAACAGAGTTAGCTCTAGAGTGTACTGATATGACACCAGAGAAGAGACCTAAAATGAGTGTAGTGTTGATGAGAATAGAAGAGATAGAGAAAATGAAAAAGGAGAGTGACTAA


Promoter Sequence:
>Vu_16746::LG4:28291313-28293313(-)
CTCACCCTTGCTTTGTCTGTTGTGTGGTTGTTATTTTGTGCTATGTGTTTTCTCTCGGCGATGATCATCCGGTGGATGTGAGCAGAAGGTGATGAGATGTCGGTGGAGCAGACATTAGATGGAGGATCGACTGGTGTTTGTATAATTATGAGGAAAATTTATTCCTCCATCTATCAAGTGTCTTAATGTAAGAACTCTATTATAGTTTAATGTTATAATTATTGGGATATTACACTGATGATCGATTCAAACGAGTACAATATGGAAAAAAGAATATTCATAATTCCTTGTATTGAAATTTTGTATAATAGGAGTTTCAAACAAATATGTCATGTTATTCAGTATAAGAAGGTTATTGTTAAAGTACTTATGGTTAGAATGCTTTTACGGGAGTGAGAGTGTAATAATAAAATGGACCCATACATAAAAAAAAGTTTGTTATAAATTTAAATATAAATCTAATTCTTACATTAAACATGATCTAAAATATAAAATCCATAAATCTCTTAAATAAGTTTGATTTATATCATAAGTGTCTCACACCTTTAAAGTAAAGGTAAATTTTAACTAATTTTAACATGTTTAATGAGAATTTCTAAAATACATCGACATTCAAATTTAATTATTATTTTTATATTAAGTTTCAAAGAAGAAGAATTTAAAAACAAAAGTAAATAAGATTAGTATAATTAAACAACATTATCTATTTCTTTTAAGCGGTTATTTTATACCAAATTTAAAGAAGGTGAGTGTTTAGCAATATTTTTTAATTGAAAATGACAGATTTAATGAATCCATAATCTAAAACTATGTGTCTTGAATGAATTAGTACAAAACTATTCCAATTTAATCAGTAATATCAATGAATAATATATAATAGGTTTAAAATTTAAATGTTCGAAGGGAATGTGCTCTTACTCACAGGACCTCTCTCCATCCAAGAACTTTATCTTCTAGAAATGATAAAGAGGCAAGAATTGACATTGAAAAAAAAAAAGAAATCTAAAAAAATCTCAAAGACTAAAAGGTTCTCTATGATTAAGAAATTCAATAAAATTAATATTCCATTATTCACAGTAGGTACACCAAAACAAATGTAAAAATAATAAATATGTTTCAATCCTTAAAATGATTCATTAATTATGGCATAATCAAATTAGTTAATAAATACGAACATGCGTAGCCACGAATCCACGGCGACTAATCAGTGTTTTACTTTATCTTCCACGAAACCCTTTTTTTTGTTGTTTTTTCTTAACGGATAATCACAGTTTTGTTTATGCTATAAGACCAAACTGGCACATAATGCAGCAAAAGATAAACACAACAAAATAATTTACTTTTTTATCAGTAGGAATTAAATACAGATGAATGAATTTAAAACCCTTCACAGTTACTCAGCCAACTTAATTATTGGACAATGAAATAATTCACTTTTGATTAATTTAATATGTTCTTTAATAACGAAAATTAGTTAATATATGAAAACTTACTTATAAATTGAATAAAAAAAAAAGGTAAGCAACCATGAAAATGTCCAAATTAAAGATCATTGACATTCCCTGCTTCCCACGATGTCACTATATTTGAAACAGCCAACATTTCTTATTCTTGAACAACTCAGTTACCAAATAAAAATGTGGAACATTGCATCATGCAAGATCCTATTATGAAAGCTGTCATCTTATGTAACTATAATTAATATATTATATACTCAAGTGATATAATAATGTTCACAAAGAAACTGCAAAACATTGTTCTGATCGTTCCTGTTCAACACTATGTTCGGCAACTTAGCACAAGTTTACTTTGTCAACATCGTCAAACTGTGAAATCATTGGAGACAAAAGAGGATATGATATGATTCACTCTGCTAATAATCCCTGTTTGGTTAAAAAATCCATGTCAAGTTGTTTTGAGCAATTTCATCCACCATCATGAGCTTGGCCTTTACCATAAGCTTTTTATATGTGGTCTTGTTTGTGTCATTCAAATCCAAC


Gene Sequence:
>Vu_16746(-)
ATGGTGTTGTGCGTTGAAATTGGGGAATTCTTTCCAGAAGAAAGAGATGCTTTGATACTCATAAGGGATTCTTTGAATTCATCTGTGAATTTGCATGGGAATTGGACAGGCCCTCCTTGTATAGACAGTCTGAGTAGGTGGATTGGAATCACTTGCTCAAATTGGCATGTTGTTCAAATTGTTCTTGAAGGAGTTAACCTTAGTGGTTATCTACCTCCCACATTTCTTCAAAACATAACTCTCTTGAGCCAACTTGACTTCAGAAATAATGCACTTTTTGGACCATTGCCAAGCCTCAAGAATTTGGTGTTTTTGGAACATGCCCTTTTATCATTCAATCATTTCTCAGGGTCAATTCCTGTGGAATATGTTGAACTTACCAGTCTGAGAGTGTTGGAGCTGCAAGAGAATTACTTACATGGTCAAATTCCACCCTTTGATCAACCATCATTGACAAGTTTCAATGTGTCATATAATCATCTGTCAGGGCCTATTCCTGAAACTTCTGTGCTGATGAGGTTCCCAGAGAGTTCTTATGAAAATAATTCAGATCTTTGTGGAGAGCCTTTGGATAAGTTATGTCCTATTCAACCTCCTGCCCCATCTCCAGCACCATTTTCTGCACCACCTCCTTTTGCTATGCCTCCAATTCCAGCAGTGAAGCCAAATAACAGGTTTCAAGCATGGACTGTTGCTGTGATTGGTGCTGCAGCTGCACTGATTCTTCTTTCTCTGATCATTTTTATTGCTTTCTTGTTTCGTAAAAGACAAACAAGTGGAAAAGAAGTAAGAAGAGATGATTCAGCTGGTAAGATATATCTTATGCATATCAACTCTACCATTCACTTTATTAGCAGCTTATTGCAATGCTATTTTGCAAACTTAGAATTTCCTGTAGTAAAATGCAATTTCAGGCTGATTCAGGATTTCTAAAGGTTTTGAATTGAACTCATAAATGTTTTGAATTTTCTAATATAGGGCATGTTTTTGGGGCATGGGCAAAGAAGATGGTGGCTTCTGCTGGGGGCAGTGATGTTTCTGAGAGATTAGGCAGATTGGAATTTTCTAACAAGAAACTACCAGTTTTTGACTTGGATGATTTACTAAGGGCATCAGCAGAAATTCTAGGAAGAGGGAACTTAGGTATTACGTACAAAGCAACACTTGAAACTGGAACTGTTGTTGCAGTGAAGAGACTTAACCACATGAATGAACTGAGCAAGAAGGAATTTCTCCAGCAGATCCAATTGCTAGGACAGATGAAGCATGAAAATATAGCAGAAATAATCTCCTTTTATTATTCAGAGGAGCAAAAGTTGGTCATATATGAATTTACCTCTGATGGCACTTTGTTTGAACTACTACATGGTTAGTTTTGATTCTTTCCTTCCTTAACACAAAAGAATTAACTTAAAAGTTAATACTCTAACATTCATAATCTGCTGGTGCTAGAGGGTAGAGGAATTGGAAGAATGCCACTTGATTGGACCACAAGACTTTCTATCATCAAAGACATAGCAAAGGGTCTTCTTTTCCTTCATCATTCCTTGCCTTCTCAAAAGGTTCCTCATGCCAACCTCAAGTCATCCAATGTCCTAATCCATCAAGATAGTAAAGGGTACCATTCCAAGCTCACGGACTATGGTTTCTTGCCTCTACTCCCAGCCAAACAGAATGCAGAAAAACTAGCCATAAGGAGGTCACCAGAATTTGTTCAAGGGAAGAAGGTAACACGCAGTGCTGATGTTTATTGCTTTGGCATCATTGTGCTAGAGATTGTAACCGGCAAAATCCCTGGCCATATCATAGGTGAAATTGAAGAAACTACCAATGATCTTTCAGATTGGGTAAGAACTGTGGTGAACAATGATTGGTCCACAGATATATTGGATTTAGAAATACTTGCAGAAAAAGAAGGCCATGATGAAATGTTAAAGCTAACAGAGTTAGCTCTAGAGTGTACTGATATGACACCAGAGAAGAGACCTAAAATGAGTGTAGTGTTGATGAGAATAGAAGAGATAGAGAAAATGAAAAAGGAGAGTGACTAA